ที่คาดการณ์ไว้ แต่เว็บไซต์ phosphor

ที่คาดการณ์ไว้ แต่เว็บไซต์ phosphorylation ยืนยันใน YBX1 ตามที่อธิบายไว้ข้างต้นน้อยมากในเว็บไซต์ phosphorylation YBX1 ได้รับการยืนยันในร่างกาย อย่างไรก็ตามตามที่แสดงในตารางที่ 2 เว็บไซต์ที่มีศักยภาพหลายได้รับการระบุโดยการวิเคราะห์ MS แต่ยังไม่ได้รับการยืนยันจากในร่างกายทดลอง. กลุ่มวิจัยหลายดำเนินการ MS วิเคราะห์เพื่อระบุพื้นผิวของไคเนสส์ต่างๆและปัจจัยโทรศัพท์มือถืออื่น ๆ ใน proteomes ของ มนุษย์ปกติเช่นเดียวกับเซลล์มะเร็ง ยกตัวอย่างเช่น Blasius et al, MS ใช้การวิเคราะห์เพื่อระบุพื้นผิวของเซลล์วงจรด่านไคเนส 1 (Chk1) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการควบคุมกระบวนการโทรศัพท์มือถือเช่นการจำลองดีเอ็นเอเซลล์และการตอบสนองต่อการทำลาย DNA หนึ่งของพื้นผิว Chk1 phosphorylates เป็น 80 ธ รีโอนี (T80) ซึ่งมีอยู่ในโดเมนของ CSD YBX1.39 กฎระเบียบของ YBX1 โดย Chk1 ดูเหมือนว่าเป็นไปได้ตั้งแต่ฟังก์ชั่นของทั้งสอง Chk2 YBX1 และส่วนใหญ่จะเป็นที่คล้ายกันและเป็นไปได้ว่าบาง Chk1 ออกแรง ของผลกระทบผ่านการโพสต์การปรับเปลี่ยน translationally YBX1 อย่างไรก็ตามการทำงานของ T80 ก็ยังไม่ได้รับการยืนยันในร่างกาย. ความก้าวหน้าล่าสุดสามารถมองเห็นได้ในการศึกษาโดยชาร์ตอัล ในการศึกษานี้มีปริมาณขนาดใหญ่ของการศึกษา MS phosphoproteome ในมะเร็งปากมดลูกเซลล์ HeLa ได้รับอนุญาตสำหรับประชาชนทั่วโลกของโปรตีน modifications.40 ท่ามกลางโปรตีนต่างๆที่มีการแก้ไขหลายเว็บไซต์นอกจากนี้ยังพบอยู่ใน YBX1 (ตารางที่ 2) ทุกเว็บไซต์ phosphorylation ที่ถูกระบุไว้ในการศึกษาครั้งนี้เป็นส่วนใหญ่ใน A / P และโดเมน CTD ส่วนใหญ่ของเว็บไซต์เหล่านี้ไม่เคยมีการกำหนดไว้ก่อน ดังนั้นการศึกษาครั้งนี้จะเปิดพื้นที่ที่กว้างขวางของการวิจัยเพื่อสำรวจความสำคัญของเว็บไซต์เหล่านี้ในการสนับสนุนที่จะเป็นมะเร็งปากมดลูก. มันเป็นที่น่าสังเกตว่าเว็บไซต์เหล่านี้จนกว่าจะได้รับการยืนยันจากการทดลองในร่างกายพวกเขาเป็นเพียงเว็บไซต์ที่มีศักยภาพ อย่างไรก็ตามข้อมูลเหล่านี้จะเป็นแนวทางในความพยายามใด ๆ ในอนาคตเพื่อให้เข้าใจบทบาทของการปรับเปลี่ยนการโพสต์แปลในการควบคุม YBX1

Ubiquitylation

Ubiquitylation is a type of post-translational modification that controls various cellular processes through proteasomal degradation of target proteins. As listed in Table 2, some potential ubiquitylation sites have been identified on YBX1. Notably, three studies employed genome wide mass spectrometric proteomics to scan for ubiquitylation in the genome and found several sites on YBX1.41, 42 and 43 Chibi et al identified that retinoblastoma binding protein 6 (RBBP6), an E3 ubiquitin ligase, interacts with YBX1, leading to ubiquitylation and proteasomal degradation of YBX1.44 Thus, dysregulation of ubiquitylation may alter YBX1 function and further contribute to its oncogenic capability, and hence is worth exploring in future in vivo studies.

Acetylation

In 2009, Choudhary et al carried out a study using MS analysis to scan for global lysine acetylation sites in whole cell lysates from human acute myeloid leukemia cell lines. Among the 3600 lysine (K) acetylation sites found on 1750 proteins, one of them was K81 in the CSD domain of YBX1. Current evidence suggests that lysine acetylation is important for functions and interactions of various genes including p53.45 It is also known that p53 and YBX1 interact with each other and that nuclear localization of YBX1 can be regulated only by functional but not mutant p53.2 and 46 Therefore, it would be worthwhile to confirm K81 acetylation in vivo, and to explore whether it affects the interaction between YBX1 and p53 or other proteins in the cell, and further, how the acetylation may modulate cell function in vivo.

Methylation

Methylation of proteins occurring at lysine and arginine (R) is also one of the most critical post-translational modifications seen in nature. Methylation of proteins has been implicated in a number of cellular processes like gene transcription, DNA damage and repair, protein translocation etc. As shown in Table 2, YBX1 is methylated at residues R199, 200 and 239 using immunoaffinity purification of methylated peptides followed by MS analysis. 47 Interestingly, previous work from our laboratory also showed that the transcription factor NF-κB is methylated on K218/221 and R30 of its p65 subunit. 48, 49 and 50 Since we found that YBX1 is a direct activator of NF-κB, 29 it would be interesting to further examine whether methylation of YBX1 plays an important role in regulating the interaction between YBX1 and NF-κB, contributing to dysfunction of these two proteins in cancer. This possibility further justifies the necessity of confirming the methylation sites of YBX1 in vivo.

Perspective
Post-translational modification is an important way to regulate protein function. Different sites on a single protein allow for triggering varied functions of the same protein, depending on the cellular requirements and/or environmental stimuli. This allows for fine-tuning of the protein function. YBX1 has emerged as one of the proteins substantially post-translationally modified, as identified by advanced mass spectrometric proteomics (Table 1 and Table 2). This vast amount of information makes post-translational modification of YBX1 an exciting research area for further exploration.

Based on the fact that many post-translational modification sites have been identified on YBX1, while few were confirmed in vivo, an obvious and immediate task that scientists are facing is to confirm most if not all of the identified sites in vivo. If confirmed, the important biological role of each modified site can be further examined in cancer or other YBX1 related diseases. Another daunting task once the modification site is confirmed is that efforts need to be put into the discovery of the enzymes that may catalyze these specific modifications. Often, enzymes are better targets in the development of drugs to treat cancer. Furthermore, as cutting edge technologies emerge at an amazing pace, it should not come as a major surprise that more post-translational modification sites will be discovered on YBX1 in the near future. Moreover, post-translational modification of proteins is often cellular-context dependent. It is not difficult to imagine that quite different modifications of YBX1 could be identified in different types of cancer and disease states. These unique post-translational modifications of YBX1 could represent a disease-specific signature which may help with diagnosis and treatment of that specific disease.

To conclude, understanding the fascinating state of post-translational modification of YBX1 will not only lead to a better understanding of the mechanisms underlying biological processes regulated by YBX1, but will also help to develop effective pathway-specific therapeutic strategies against YBX1 in different types of cancer and YBX1-related diseases.

Conflicts of interest
All authors have none to declare.

Acknowledgment
We sincerely thank Ms. Lisa King at the Department of Pharmacology and Toxicology at Indiana University for her professional help with editing this review. This research is supported by grants 4186265 (American Cancer Society) and 23-862-07 and 036433730102 (Indiana University) to TL.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ที่คาดการณ์ไว้แต่เว็บไซต์ phosphorylation ยืนยันใน YBX1 ตามที่อธิบายไว้ข้างต้นน้อยมากในเว็บไซต์ phosphorylation YBX1 ได้รับการยืนยันในร่างกายอย่างไรก็ตามตามที่แสดงในตารางที่ 2 เว็บไซต์ที่มีศักยภาพหลายได้รับการระบุโดยการวิเคราะห์นางสาวแต่ยังไม่ได้รับการยืนยันจากในร่างกายทดลอง กลุ่มวิจัยหลายดำเนินการนางสาววิเคราะห์เพื่อระบุพื้นผิวของไคเนสส์ต่างๆและปัจจัยโทรศัพท์มือถืออื่นๆ ใน proteomes นั้น ๆ มนุษย์ปกติเช่นเดียวกับเซลล์มะเร็งยกตัวอย่างเช่น Blasius et al, MS ใช้การวิเคราะห์เพื่อระบุพื้นผิวของเซลล์วงจรด่านไคเนส 1 (Chk1) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในกหนึ่งของพื้นผิวารควบคุมกระบวนการโทรศัพท์มือถือเช่นการจำลองดีเอ็นเอเซลล์และการตอบสนองต่อการทำลายดีเอ็นเอเป็น 80 ธรีโอนี (T80) ซึ่งมีอยู่ในโดเมนของ CSD YBX1.39 กฎระเบียบของ YBX1 โดย Chk1 ดูเหมือนว่าเป็นไปได้ตั้งแต่ฟังก์ชั่นของทั้งสอง Chk2 YBX1 แ phosphorylates Chk1ละส่วนใหญ่จะเป็นที่คล้ายกันและเป็นไปได้ว่าบาง Chk1 ออกแรงของผลกระทบผ่านการโพสต์การปรับเปลี่ยน translationally YBX1 อย่างไรก็ตามการทำงานของ T80 ก็ยังไม่ได้รับการยืนยันในร่างกาย ความก้าวหน้าล่าสุดสามารถมองเห็นได้ในการศึกษาโดยชาร์ตอัลในการศึกษานี้มีปริมาณขนาดใหญ่ของการศึกษานางสาว phosphoproteome ในมะเร็งปากมดลูกเซลล์ HeLa ได้รับอนุญาตสำหรับประชาชนทั่วโลกของโปรตีน modifications.40 ท่ามกลางโปรตีนต่างๆที่มีการแก้ไขหลายเว็บไซต์นอกจากนี้ยังพบอยู่ใน YBX1 (ตารางที่ 2) ทุกเว็บไซต์ phosphorylation ที่ถูกระบุไว้ในการศึกษาครั้งนี้เป็นส่วนใหญ่ใน A / P และโดเมน CTD ส่วนใหญ่ของเว็บไซต์เหล่านี้ไม่เคยมีการกำหนดไว้ก่อนดังนั้นการศึกษาครั้งนี้จะเปิดพื้นที่ที่กว้างขวางของการวิจัยเพื่อสำรวจความสำคัญของเว็บไซต์เหล่านี้ในการสนับสนุนที่จะเป็นมะเร็งปากมดลูก มันเป็นที่น่าสังเกตว่าเว็บไซต์เหล่านี้จนกว่าจะได้รับการยืนยันจากการทดลองในร่างกายพวกเขาเป็นเพียงเว็บไซต์ที่มีศักยภาพอย่างไรก็ตามข้อมูลเหล่านี้จะเป็นแนวทางในความพยายามใดๆ ในอนาคตเพื่อให้เข้าใจบทบาทของการปรับเปลี่ยนการโพสต์แปลในการควบคุม YBX1UbiquitylationUbiquitylation เป็นชนิดของการแก้ไข post-translational ที่ควบคุมกระบวนการต่าง ๆ โทรศัพท์มือถือผ่าน proteasomal การสลายตัวของโปรตีนเป้าหมาย ตามที่ปรากฏในตารางที่ 2 ได้รับการระบุบางไซต์ ubiquitylation อาจเกิดขึ้นบน YBX1 3 การศึกษาทำงานไปยังโปรตีโอมากกว้างโดยรวม spectrometric และมิกส์ที่ต่าง ๆ กลุ่มสแกน ubiquitylation ในกลุ่มนี้ และพบหลายเว็บไซต์บน YBX1.41, 42 และ 43 Chibi et al ระบุว่า retinoblastoma ผูกโปรตีน 6 (RBBP6), เป็น E3 ubiquitin ligase โต้ตอบกับ YBX1 นำไปสู่การสลายตัวที่ ubiquitylation และ proteasomal ของดังนี้ YBX1.44, dysregulation ubiquitylation อาจเปลี่ยนฟังก์ชัน YBX1 และช่วยเพิ่มเติม ความสามารถของ oncogenic ยวด และดังนั้น เที่ยวศึกษาในอนาคตในสัตว์ทดลองAcetylationในปี 2009, Choudhary et al ดำเนินการศึกษาใช้ MS วิเคราะห์หาไซต์ acetylation ทั่วโลกแอล-ไลซีนในเซลล์ทั้งหมด lysates จากบรรทัดของเซลล์มะเร็งเม็ดชนิดไมอิลอยด์เฉียบพลันมนุษย์เลือดขาว ระหว่างแอล-ไลซีน 3600 ไซต์ acetylation (K) พบในโปรตีน 1750 หนึ่งของพวกเขาถูก K81 ในโดเมน CSD ของ YBX1 ปัจจุบันหลักฐานแนะนำว่า acetylation ไลซีนเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการทำงาน และโต้ตอบของยีนต่าง ๆ ที่รวมทั้ง p53.45 ที่เป็นที่รู้จักว่า p53 และ YBX1 โต้ตอบกับแต่ละอื่น ๆ และแปลว่านิวเคลียร์ของ YBX1 ที่สามารถกำหนดเท่านั้น โดย p53.2 ทำงาน แต่ไม่กลายพันธุ์และ 46 ดังนั้น มันจะคุ้มค่ายืนยัน K81 acetylation ในสัตว์ทดลอง และสำรวจว่ามีผลกระทบต่อการโต้ตอบระหว่าง YBX1 และ p53 หรือโปรตีนอื่น ๆ ในเซลล์ และเพิ่มเติม วิธีการ acetylation อาจ modulate ฟังก์ชัน cell ในสัตว์ทดลองปรับปรับของโปรตีนที่เกิดขึ้นที่แอล-ไลซีนและอาร์จินีน (R) ก็ปรับเปลี่ยน post-translational สำคัญที่สุดที่เห็นในธรรมชาติอย่างใดอย่างหนึ่ง ปรับของโปรตีนมีการเกี่ยวข้องในจำนวนเซลล์กระบวนการ transcription ของยีน ความเสียหายของดีเอ็นเอ และซ่อมแซม การสับเปลี่ยนโปรตีนเป็นต้น ดังแสดงในตารางที่ 2, YBX1 เป็น methylated ที่ตก R199, 200 และ 239 ใช้ฟอก immunoaffinity ของเปปไทด์ methylated ตามการวิเคราะห์ MS 47 เป็นเรื่องน่าสนใจ งานก่อนหน้านี้จากห้องปฏิบัติการของเรายังพบว่าตัว transcription methylated NF κB K218/221 และ R30 p65 ย่อยของ 48, 49 และ 50 เนื่องจากเราพบว่า YBX1 activator โดยตรงของ NF-κB, 29 มันจะน่าสนใจเพิ่มเติม ตรวจสอบว่าปรับ YBX1 มีบทบาทสำคัญในการควบคุมการโต้ตอบระหว่าง YBX1 และ NF κB การเอื้อต่อการผิดปกติของโปรตีนเหล่านี้สองในโรคมะเร็ง โอกาสนี้เพิ่มเติมจัดชิดการยืนยันไซต์ปรับของ YBX1 ในสัตว์ทดลองมุมมองPost-translational แก้ไขเป็นวิธีการที่สำคัญเพื่อกำหนดฟังก์ชันของโปรตีน ไซต์ต่าง ๆ บนโปรตีนเดียวอนุญาตให้สำหรับการเรียกฟังก์ชันแตกต่างกันของโปรตีนเหมือนกัน ขึ้นอยู่กับความต้องการโทรศัพท์มือถือหรือสิ่งเร้าสิ่งแวดล้อม นี้ช่วยให้การปรับจูนเพื่องานโปรตีน YBX1 ได้ผงาดขึ้นเป็นหนึ่งของโปรตีนที่มาก post-translationally แก้ไข เป็นระบุขั้นสูงโดยรวม spectrometric โปรตีโอมิกส์ (ตารางที่ 1 และตารางที่ 2) ข้อมูลนี้จำนวนมากทำให้การปรับเปลี่ยน YBX1 post-translational พื้นที่วิจัยตื่นเต้นสำหรับการสำรวจเพิ่มเติมตามในข้อเท็จจริงที่ได้รับการระบุหลายไซต์ปรับเปลี่ยน post-translational ใน YBX1 ในขณะที่ไม่กี่ได้ยืนยันในสัตว์ทดลอง การงานที่ชัดเจน และทันทีที่นักวิทยาศาสตร์กำลังเผชิญคือการ ยืนยันส่วนใหญ่ถ้าไม่ทั้งหมดของเว็บไซต์ที่ระบุในสัตว์ทดลอง ถ้ายืนยัน ชีวภาพบทบาทสำคัญของแต่ละไซต์ปรับเปลี่ยนสามารถเพิ่มเติมตรวจมะเร็งหรือ YBX1 อื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับโรค อีกงานที่ยุ่งยากเมื่อยืนยันไซต์ปรับเปลี่ยนเป็นว่า ความพยายามที่ต้องใส่เข้าในการค้นพบเอนไซม์ที่อาจสถาบันเหล่านี้ปรับเปลี่ยนเฉพาะ มักจะ เอนไซม์ได้ดีกว่าเป้าหมายในการพัฒนายาเพื่อรักษาโรคมะเร็ง นอกจากนี้ เป็นเทคโนโลยีการตัดขอบออกในจังหวะตื่นตาตื่นใจ มันไม่ควรมาเป็นประหลาดใจใหญ่ว่า ไซต์ปรับเปลี่ยนเพิ่มเติม post-translational จะค้นพบ YBX1 ในอนาคต นอกจากนี้ แก้ไข post-translational ของโปรตีนได้มักจะขึ้นอยู่กับบริบทมือถือ ไม่ยากที่จะจินตนาการว่า สามารถระบุแก้ไขค่อนข้างแตกต่างกันของ YBX1 ในอเมริกาโรคมะเร็งและโรคชนิดต่าง ๆ ปรับเปลี่ยนเหล่านี้ post-translational เฉพาะของ YBX1 จะเป็นลายเซ็นเฉพาะโรคซึ่งอาจช่วยให้ มีการตรวจวินิจฉัยและรักษาโรคที่เฉพาะเจาะจงเพื่อสรุป เข้าใจรัฐปรับเปลี่ยน post-translational ของ YBX1 น่าจะไม่เท่านำไปสู่การเข้าใจกลไกต้นแบบกระบวนการทางชีวภาพที่กำหนด YBX1 แต่จะยังช่วยพัฒนาประสิทธิภาพเฉพาะทางเดินกลยุทธ์รักษากับ YBX1 ชนิดต่าง ๆ ของโรคมะเร็งและโรคที่เกี่ยวข้องกับ YBX1ความขัดแย้งทางผลประโยชน์ผู้เขียนได้ไม่ประกาศยอมรับเราขอแสดงความนับถือขอบคุณคุณลิซ่าคิงที่ภาควิชาเภสัชวิทยาและพิษวิทยาที่มหาวิทยาลัยอินดีแอนาสำหรับการช่วยเหลือของเธอมืออาชีพแก้ไขตรวจทานนี้ งานวิจัยนี้ได้รับการสนับสนุน โดยให้ 4186265 (สมาคมโรคมะเร็งอเมริกัน) และ 23-862-07 และ 036433730102 (มหาวิทยาลัยอินดีแอนา) กับ TL

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ที่คาดการณ์ไว้ แต่เว็บไซต์ phosphorylation ยืนยันใน YBX1 phosphorylation YBX1 ได้รับการยืนยันในร่างกายอย่างไรก็ตามตามที่แสดงในตารางที่ 2 นางสาว กลุ่มวิจัยหลายดำเนินการ MS ๆ ใน proteomes ของมนุษย์ปกติเช่นเดียวกับเซลล์มะเร็งยกตัวอย่างเช่น Blasius, et al, MS 1 (Chk1) ดีเอ็นเอหนึ่งของพื้นผิว Chk1 phosphorylates เป็น 80 ธ รีโอนี (T80) ซึ่งมีอยู่ในโดเมนของ CSD YBX1.39 กฎระเบียบของ YBX1 โดย Chk1 Chk2 YBX1 Chk1 ออกแรง translationally YBX1 อย่างไรก็ตามการทำงานของ T80 ก็ยังไม่ได้รับการยืนยันในร่างกาย MS phosphoproteome ในมะเร็งปากมดลูกเซลล์ HeLa modifications.40 YBX1 (ตารางที่ 2) ทุกเว็บไซต์ phosphorylation A / P และโดเมน CTD ๆ YBX1 Ubiquitylation Ubiquitylation เป็นประเภทของการปรับเปลี่ยนการโพสต์แปลที่ควบคุมเซลล์กระบวนการต่างๆผ่านการย่อยสลายของโปรตีน proteasomal เป้าหมาย ตามที่ระบุไว้ในตารางที่ 2, บางเว็บไซต์ ubiquitylation ที่อาจเกิดขึ้นได้รับการระบุใน YBX1 ยวดสามการศึกษาการจ้างงานมวลกว้างจีโนมโปรตีน spectrometric เพื่อสแกนหา ubiquitylation ในจีโนมและพบว่าหลายเว็บไซต์บน YBX1.41, 42 และ 43 Chibi et al, ระบุว่า retinoblastoma โปรตีน 6 (RBBP6) ซึ่งเป็นลิกาเซ E3 ubiquitin, มีปฏิสัมพันธ์กับ YBX1 ที่นำไปสู่การย่อยสลายและ ubiquitylation proteasomal ของ YBX1.44 ดังนั้น dysregulation ของ ubiquitylation อาจปรับเปลี่ยนฟังก์ชั่น YBX1 และยังนำไปสู่ความสามารถในการถ่ายทอดและด้วยเหตุนี้มีมูลค่าการสำรวจในอนาคตในร่างกายการศึกษา. acetylation ในปี 2009 Choudhary et al, ดำเนินการศึกษา โดยใช้การวิเคราะห์ MS เพื่อสแกนหาเว็บไซต์ acetylation ไลซีนโลกใน lysates เซลล์ทั้งจากมะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิดเฉียบพลันมนุษย์สายพันธุ์เซลล์ ท่ามกลาง 3600 ไลซีน (K) เว็บไซต์ acetylation ที่พบในโปรตีน 1750 หนึ่งในนั้นคือ K81 ในโดเมน CSD ของ YBX1 ปัจจุบันมีหลักฐานแสดงให้เห็นว่า acetylation ไลซีนเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการทำงานและการมีปฏิสัมพันธ์ของยีนต่าง ๆ รวมทั้ง p53.45 นอกจากนี้ยังเป็นที่รู้จักกันว่า p53 และ YBX1 โต้ตอบกับแต่ละอื่น ๆ และที่แปลนิวเคลียร์ YBX1 สามารถควบคุมการทำงานโดยเฉพาะการกลายพันธุ์ แต่ไม่ p53.2 และ 46 ดังนั้นมันจะคุ้มค่าที่จะยืนยัน acetylation K81 ในร่างกายและในการสำรวจว่าจะมีผลกระทบต่อการทำงานร่วมกันระหว่าง YBX1 และ p53 หรือโปรตีนในเซลล์และต่อไปวิธี acetylation อาจปรับเปลี่ยนการทำงานของเซลล์ในร่างกาย. Methylation Methylation ของโปรตีน ที่เกิดขึ้นในไลซีนและอาร์จินี (R) ยังเป็นหนึ่งในที่สำคัญที่สุดการปรับเปลี่ยนการโพสต์แปลเห็นในธรรมชาติ methylation ของโปรตีนที่มีส่วนเกี่ยวข้องในจำนวนของเซลล์กระบวนการเช่นการถอดรหัสยีนเสียหายของดีเอ็นเอและซ่อมแซมโยกย้ายโปรตีน ฯลฯ ดังแสดงในตารางที่ 2 YBX1 เป็น methylated ที่ตกค้าง R199, 200 และ 239 โดยใช้ฟอก immunoaffinity ของเปปไทด์สารตามด้วย MS การวิเคราะห์ 47 ที่น่าสนใจในการทำงานก่อนหน้านี้จากห้องปฏิบัติการของเรายังพบว่าการถอดความปัจจัย NF-κBเป็น methylated ใน K218 / 221 และ R30 ของหน่วยย่อยของ p65 48, 49 และ 50 เนื่องจากเราพบว่า YBX1 เป็นกระตุ้นโดยตรงของ NF-κB 29 มันจะน่าสนใจเพื่อตรวจสอบว่า methylation ของ YBX1 มีบทบาทสำคัญในการควบคุมการทำงานร่วมกันระหว่าง YBX1 และ NF-κBที่เอื้อต่อความผิดปกติของ ทั้งสองโปรตีนในการรักษามะเร็ง ความเป็นไปได้ต่อไปนี้จะ justifies ความจำเป็นของการยืนยันเว็บไซต์ methylation ของ YBX1 ในร่างกาย. มุมมองการปรับเปลี่ยนโพสต์แปลเป็นวิธีที่สำคัญในการควบคุมการทำงานของโปรตีน เว็บไซต์ที่แตกต่างกันในโปรตีนเดียวอนุญาตให้มีการเรียกฟังก์ชั่นที่แตกต่างกันของโปรตีนเหมือนกันขึ้นอยู่กับความต้องการโทรศัพท์มือถือและ / หรือสิ่งเร้าสิ่งแวดล้อม ซึ่งช่วยให้การปรับจูนการทำงานของโปรตีน YBX1 ได้กลายเป็นหนึ่งของโปรตีนอย่างมีนัยสำคัญการแก้ไขโพสต์ translationally ที่ระบุไว้โดยโปรตีน spectrometric มวลขั้นสูง (ตารางที่ 1 และตารางที่ 2) ซึ่งจำนวนเงินที่มากมายของข้อมูลที่ทำให้การปรับเปลี่ยนการโพสต์แปลของ YBX1 พื้นที่วิจัยที่น่าตื่นเต้นสำหรับการตรวจสอบข้อเท็จจริงต่อไป. อยู่บนพื้นฐานของความจริงที่ว่าหลายเว็บไซต์การปรับเปลี่ยนการโพสต์แปลได้รับการระบุใน YBX1 ในขณะที่บางคนได้รับการยืนยันในร่างกายเป็นงานที่เห็นได้ชัดและในทันทีที่ นักวิทยาศาสตร์กำลังเผชิญคือการยืนยันมากที่สุดหากไม่ได้ทั้งหมดของเว็บไซต์ที่ระบุไว้ในร่างกาย หากได้รับการยืนยันบทบาททางชีวภาพที่สำคัญของการปรับเปลี่ยนแต่ละเว็บไซต์สามารถตรวจสอบต่อไปในการเกิดโรคมะเร็งหรือโรคอื่น ๆ ที่ YBX1 ที่เกี่ยวข้อง อีกงานที่น่ากลัวเมื่อเว็บไซต์ของการปรับเปลี่ยนได้รับการยืนยันว่ามีความพยายามคือจะต้องมีการใส่ลงไปในการค้นพบเอนไซม์ที่อาจกระตุ้นการปรับเปลี่ยนเฉพาะเหล่านี้ บ่อยครั้งที่เอนไซม์เป็นเป้าหมายในการพัฒนาที่ดีขึ้นของยาเสพติดในการรักษามะเร็ง นอกจากเป็นเทคโนโลยีที่ทันสมัยโผล่ออกมาที่ก้าวที่น่าตื่นตาตื่นใจก็ไม่ควรมาเป็นแปลกใจที่สำคัญที่เว็บไซต์การปรับเปลี่ยนเพิ่มเติมการโพสต์แปลจะถูกค้นพบบน YBX1 ในอนาคตอันใกล้ นอกจากนี้ยังมีการปรับเปลี่ยนการโพสต์แปลของโปรตีนมักจะเป็นโทรศัพท์มือถือขึ้นอยู่กับบริบท มันไม่ได้เป็นเรื่องยากที่จะจินตนาการว่าการปรับเปลี่ยนที่แตกต่างกันของ YBX1 สามารถระบุได้ในรูปแบบที่แตกต่างกันของโรคมะเร็งและโรค เหล่านี้มีการปรับเปลี่ยนการโพสต์แปลเป็นเอกลักษณ์ของ YBX1 จะเป็นตัวแทนของลายเซ็นเฉพาะโรคซึ่งอาจช่วยในการวินิจฉัยและการรักษาโรคเฉพาะที่. เพื่อสรุปความเข้าใจรัฐที่น่าสนใจของการปรับเปลี่ยนการโพสต์แปลของ YBX1 ไม่เพียง แต่จะนำไปสู่ความเข้าใจที่ดีขึ้นของ กลไกกระบวนการทางชีวภาพต้นแบบควบคุมโดย YBX1 แต่ยังจะช่วยในการพัฒนาที่มีประสิทธิภาพทางเดินเฉพาะกลยุทธ์การรักษากับ YBX1 ในประเภทต่างๆของโรคมะเร็งและ YBX1 ที่เกี่ยวข้องกับโรค. ขัดแย้งทางผลประโยชน์ที่ผู้เขียนทั้งหมดไม่มีการประกาศ. รับทราบเราขอขอบคุณนางสาวลิซ่า King ที่ภาควิชาเภสัชวิทยาและพิษวิทยาที่มหาวิทยาลัยอินเดียนาเพื่อช่วยมืออาชีพของเธอกับการแก้ไขความคิดเห็นนี้ งานวิจัยนี้ได้รับการสนับสนุนโดยทุนอุดหนุน 4186265 (American Cancer Society) และ 23-862-07 และ 036433730102 (Indiana University) เพื่อ TL

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ที่คาดการณ์ไว้แต่เว็บไซต์ฟอสโฟริเลชันยืนยันใน ybx1 ตามที่อธิบายไว้ข้างต้นน้อยมากในเว็บไซต์ฟอสโฟริเลชัน ybx1 ได้รับการยืนยันในร่างกายอย่างไรก็ตามตามที่แสดงในตารางที่ 2นางสาวแต่ยังไม่ได้รับการยืนยันจากในร่างกายทดลอง .กลุ่มวิจัยหลายดำเนินการ MS จะวิเคราะห์เพื่อระบุพื้นผิวของไคเนสส์ต่างๆและปัจจัยโทรศัพท์มือถืออื่น the proteomes ของมนุษย์ปกติเช่นเดียวกับเซลล์มะเร็งยกตัวอย่างเช่นเบลเซียส et al ,นางสาวใช้การวิเคราะห์เพื่อระบุพื้นผิวของเซลล์วงจรด่านไคเนส 1 ( chk1 ) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการควบคุมกระบวนการโทรศัพท์มือถือเช่นการจำลองดีเอ็นเอเซลล์และการตอบสนองต่อการทำลายหนึ่งของพื้นผิว chk1 phosphorylates เป็น 80 โดยดีเอ็นเอ( t80 ) ซึ่งมีอยู่ในโดเมนของ CSD ybx1 .39 กฎระเบียบของ ybx1 โดย chk1 ดูเหมือนว่าเป็นไปได้ตั้งแต่ฟังก์ชั่นของทั้งสอง chk2 ybx1 และส่วนใหญ่จะเป็นที่คล้ายกันและเป็นไปได้ว่าบาง chk1 ออกแรงของผลกระทบผ่านการโพสต์การปรับเปลี่ยน translationally ybx1t80 ก็ยังไม่ได้รับการยืนยันในร่างกาย .ความก้าวหน้าล่าสุดสามารถมองเห็นได้ในการศึกษาโดยชาร์ตอัลในการศึกษานี้มีปริมาณขนาดใหญ่ของการศึกษา MS phosphoproteome ในมะเร็งปากมดลูกเซลล์ Hela ได้รับอนุญาตสำหรับประชาชนทั่วโลกของโปรตีนการปรับเปลี่ยน40 ท่ามกลางโปรตีนต่างๆที่มีการแก้ไขหลายเว็บไซต์นอกจากนี้ยังพบอยู่ใน ybx1 ( ตารางที่ 2 ) ทุกเว็บไซต์ฟอสโฟริเลชันที่ถูกระบุไว้ในการศึกษาครั้งนี้เป็นส่วนใหญ่ใน / p และโดเมน CTDดังนั้นการศึกษาครั้งนี้จะเปิดพื้นที่ที่กว้างขวางของการวิจัยเพื่อสำรวจความสำคัญของเว็บไซต์เหล่านี้ในการสนับสนุนที่จะเป็นมะเร็งปากมดลูก .มันเป็นที่น่าสังเกตว่าเว็บไซต์เหล่านี้จนกว่าจะได้รับการยืนยันจากการทดลองในร่างกายพวกเขาเป็นเพียงเว็บไซต์ที่มีศักยภาพอย่างไรก็ตามข้อมูลเหล่านี้จะเป็นแนวทางในความพยายามใดไม่มีybx1



ubiquitylation ubiquitylation เป็นประเภทหนึ่งของการควบคุมกระบวนการต่าง ๆที่ไปรษณีย์ - แปลแก้ไขเซลล์เป้าหมายผ่าน proteasomal การสลายตัวของโปรตีน ตามที่ระบุไว้ในตารางที่ 2 บางเว็บไซต์ ubiquitylation ศักยภาพที่ได้รับการระบุใน ybx1 . โดยเฉพาะสามการศึกษาจีโนมกว้างใช้มวลความโปรตีโอมิกส์เพื่อสแกน ubiquitylation ในจีโนมมนุษย์ และพบหลายเว็บไซต์บน ybx1.41 , 42 และ 43 Chibi et al ระบุว่าโปรตีนเรติโนบลาสโตมา 6 ( rbbp6 ) E3 ข้างนอกไลเกส มีการโต้ตอบกับ ybx1 , ผู้นำ ubiquitylation และการย่อยสลาย proteasomal ของ ybx1.44 ปานdysregulation ของ ubiquitylation อาจปรับเปลี่ยนฟังก์ชัน ybx1 และเพิ่มเติม ส่งผลให้ความสามารถใน oncogenic ของมันและด้วยเหตุนี้มีมูลค่าการสำรวจในอนาคตการศึกษาในสัตว์

ทิเลชัน

ใน 2009 , choudhary et al ดำเนินการศึกษาโดยใช้การวิเคราะห์ MS สแกนทั่วโลกซีนทิเลชันเว็บไซต์ใน lysates จากมนุษย์ทั้งเซลล์มะเร็งเม็ดเลือดขาวเฉียบพลันชนิดไมอิลอยด์เซลล์เส้นระหว่าง 3600 lysine ( K ) เว็บไซต์ทิเลชันพบ 1750 โปรตีน หนึ่งในนั้นคือ k81 ใน CSD โดเมนของ ybx1 . หลักฐานปัจจุบันแสดงให้เห็นว่าซีนทิเลชันเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการทำงานและปฏิสัมพันธ์ของยีนต่างๆ รวมถึง p53.45 เป็นที่รู้จักกันว่ากิจกรรม ybx1 และโต้ตอบกับแต่ละอื่น ๆและการนิวเคลียร์ของ ybx1 สามารถถูกควบคุมโดยเฉพาะการทำงานแต่ไม่กลายพันธุ์ของโปรตีน p532 46 ดังนั้นมันจะคุ้มค่าที่จะยืนยัน k81 ทิเลชันในสัตว์ทดลอง และดูว่ามันมีผลต่อการปฏิสัมพันธ์ระหว่าง ybx1 มะเร็งหรือโปรตีนอื่น ๆและในเซลล์ และ เพิ่มเติม วิธีอะซิทิเลชันอาจจะปรับการทำงานของเซลล์ในร่างกาย ร่างกาย



เมทิลเลชันของโปรตีนที่เกิดขึ้นในไลซีน และอาร์จินีน ( R ) ยังเป็นหนึ่งในที่สำคัญที่สุดไปรษณีย์ - แปลแก้ไขเห็นในธรรมชาติ เมทิลเลชันของโปรตีนเข้าไปพัวพัน กับจำนวนของกระบวนการโทรศัพท์มือถือเช่นยีนถอดความ ความเสียหายของดีเอ็นเอและซ่อมแซมโยกย้ายโปรตีน ฯลฯ ดังแสดงในตารางที่ 2 ybx1 เป็น methylated r199 ที่ตกค้าง ,200 และ 239 ใช้ immunoaffinity methylated เปปไทด์บริสุทธิ์ตามการวิเคราะห์ MS 47 ทั้งนี้ ก่อนหน้างานจากห้องปฏิบัติการของเรา นอกจากนี้ยังพบว่าปัจจัยการถอดความ NF - κ B คือ methylated บน k218 / และ r30 ของ p65 1 . 48 , 49 และ 50 เนื่องจากเราพบว่า ybx1 เป็นโดยตรงกิจกรรมของ NF - κ Bมันอาจจะน่าสนใจที่จะเพิ่มเติม ศึกษาว่า ร่างกายของ ybx1 มีบทบาทสำคัญในการควบคุมการปฏิสัมพันธ์ระหว่าง ybx1 และ NF - κ B เกิดความผิดปกติของโปรตีนทั้งสองเหล่านี้ในมะเร็ง เป็นไปได้นี้เพิ่มเติม justifies ความยืนยันจากเว็บไซต์ของ ybx1

มุมมองในสิ่งมีชีวิตการโพสต์แปลเป็นวิธีที่สำคัญในการควบคุมการทำงานของโปรตีน เว็บไซต์ที่แตกต่างกันในโปรตีนเดี่ยวให้เรียกฟังก์ชันที่หลากหลายของโปรตีนเดียวกันขึ้นอยู่กับความต้องการโทรศัพท์มือถือและ / หรือสิ่งกระตุ้นทางสิ่งแวดล้อม นี้จะช่วยให้สำหรับการปรับจูนของฟังก์ชันโปรตีน ybx1 มีชุมนุมเป็นหนึ่งในโปรตีนมาก โพสต์ translationally ดัดแปลงตามที่ระบุโดยขั้นสูงมวลความโปรตีโอมิกส์ ( ตารางที่ 1 และตารางที่ 2 ) จำนวนที่มากมายของข้อมูล ทำให้การไปรษณีย์ - แปลของ ybx1 พื้นที่การวิจัยที่น่าตื่นเต้นสำหรับการสำรวจเพิ่มเติม

ขึ้นอยู่กับความจริงที่ว่าเว็บไซต์การไปรษณีย์ - แปลหลายได้รับการระบุใน ybx1 , ในขณะที่ไม่กี่ชนิดที่ได้รับการยืนยัน ,งานที่ชัดเจน และทันทีที่นักวิทยาศาสตร์กำลังเผชิญอยู่ ยืนยัน ส่วนใหญ่ถ้าไม่ทั้งหมดของการระบุไซต์ในสิ่งมีชีวิต ถ้ายืนยันบทบาททางชีวภาพที่สำคัญของแต่ละการแก้ไขเว็บไซต์ที่สามารถตรวจสอบเพิ่มเติมใน ybx1 โรคมะเร็งหรือโรคอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้อง .อีกหนึ่งงานที่น่ากลัวเมื่อการปรับเปลี่ยนเว็บไซต์ได้รับการยืนยันเป็นความพยายามที่ต้องใส่เข้าไปในการค้นพบของเอนไซม์ที่เร่งการปรับเปลี่ยนเฉพาะเหล่านี้ มักจะ , เอนไซม์ดีกว่าเป้าหมายในการพัฒนายารักษาโรคมะเร็ง ซึ่งเป็นเทคโนโลยีการตัดขอบออกที่ก้าวน่าพิศวงมันไม่ควรมาเป็นแปลกใจที่สำคัญที่เว็บไซต์การไปรษณีย์ - แปลเพิ่มเติมจะถูกค้นพบใน ybx1 ในอนาคตอันใกล้ นอกจากนี้ การเปลี่ยนแปลงของโปรตีนมักจะเป็นมือถือไปรษณีย์ - แปลบริบทขึ้นอยู่กับ มันไม่ยากที่จะจินตนาการว่า การปรับเปลี่ยนค่อนข้างแตกต่างกันของ ybx1 สามารถที่ระบุไว้ในประเภทที่แตกต่างกันของโรคมะเร็งและโรคของสหรัฐอเมริกาสิ่งเหล่านี้ คือ เอกลักษณ์ของการไปรษณีย์ - แปล ybx1 อาจหมายถึงลายเซ็น disease-specific ซึ่งอาจช่วยในการวินิจฉัยและการรักษาที่เฉพาะเจาะจงของโรค .

สรุปเข้าใจสภาพที่น่าสนใจของการไปรษณีย์ - แปลของ ybx1 ไม่เพียงแต่จะนำไปสู่ความเข้าใจของกลไกการควบคุมโดยกระบวนการทางชีวภาพ ybx1 เป็นต้น ,แต่จะช่วยพัฒนาศักยภาพทางกลยุทธ์กับเฉพาะผู้ ybx1 แตกต่างกันไปตามชนิดของมะเร็งและโรคที่เกี่ยวข้อง ybx1

ความขัดแย้ง
ทั้งหมดผู้เขียนไม่มีการประกาศยอมรับ


ขอขอบคุณคุณลิซ่า กษัตริย์ที่ภาควิชาเภสัชวิทยาและพิษวิทยาที่มหาวิทยาลัยอินดีแอนาสำหรับมืออาชีพช่วยให้กับการแก้ไขนี้ ทบทวน .งานวิจัยนี้ได้รับการสนับสนุนโดยการอนุญาต 4186265 ( อเมริกันมะเร็งสังคม ) และ 23-862-07 และ 036433730102 ( มหาวิทยาลัยอินดีแอนา ) tl.