On the other hand, compounds 5b and

On the other hand, compounds 5b and 7a were modeled in the active site of COX-2 enzyme (Table 6, Fig. 4). The binding energies of −10.57 and −55.09 kcal/mol were obtained for 5b and 7a, respectively. The carboxylate fragment of 5b formed a weak hydrogen bonding interaction with Arg 120 (3.05 Å) which may be attributed to the deep entrance of hydrophobic aromatic part into the secondary pocket of COX-2 with hydrophobic interaction with Ala 516, Val 523, Val 349 and Gly On the other hand, compounds 5b and 7a were modeled in the active site of COX-2 enzyme (Table 6, Fig. 4). The binding energies of −10.57 and −55.09 kcal/mol were obtained for 5b and 7a, respectively. The carboxylate fragment of 5b formed a weak hydrogen bonding interaction with Arg 120 (3.05 Å) which may be attributed to the deep entrance of hydrophobic aromatic part into the secondary pocket of COX-2 with hydrophobic interaction with Ala 516, Val 523, Val 349 and Gly 354 and lacking the hydrogen bond pattern which was observed with COX-1. On the other hand compounds 7a produce an inverted mode of binding with COX-2 with a deep movement into the hydrophilic pocket. Unlike 5b, the amide group of 7a is able to reach the hydrophilic pocket and is involved in strong hydrogen bonding with His 90 (2.7 Å) and Gln 192 (2.47 Å) and weak hydrogen bonding with Phe 518 (3.42 Å). Such interactions are almost essential for COX-2 inhibitory activity, as exemplified by the binding interaction of SC-558, an analogue of celecoxib co-crystallized in the COX-2 active site [26]. In addition, such interaction forces the phenyl ring to adopt a specific orientation at the top of the channel. This moiety is involved in hydrophobic interaction with Trp 387, Tyr 385, Val 523, Leu 352, Ser 353, Val 349, Phe 518, and Ala 527. The lateral pocket of COX-2 would therefore be responsible for the COX-2 selectivity of 7a and contributed to stabilize the ligand–enzyme complexes (Fig. 4 and Fig. 5).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บนมืออื่น ๆ สาร 5b และ 7a ได้แบบจำลองในไซต์ใช้งานของเอนไซม์ค็อกซ์-2 (ตารางที่ 6, 4 รูป) พลังงานรวมของ −10.57 และ −55.09 กิโลแคลอรี่/โมลได้รับ 5b และ 7a ตามลำดับ ส่วน carboxylate ของ 5b เกิดไฮโดรเจนอ่อนแอพันธะกับอาร์กิวเมนต์ของค่า 120 (3.05 Å) ซึ่งอาจจะประกอบกับเข้าลึกของฝ่ามือหอมส่วนในกระเป๋ารองของ COX-2 มีปฏิสัมพันธ์แบบ Ala 516, Val 523, Val 349 และ Gly บนมืออื่น ๆ สารประกอบ 5b และ 7a ได้จำลองในไซต์งานของเอนไซม์ค็อกซ์-2 (ตารางที่ 6 , 4 รูป) พลังงานรวมของ −10.57 และ −55.09 กิโลแคลอรี่/โมลได้รับ 5b และ 7a ตามลำดับ ส่วน carboxylate ของ 5b เกิดไฮโดรเจนอ่อนแอพันธะกับอาร์กิวเมนต์ของค่า 120 (3.05 Å) ซึ่งอาจจะประกอบกับเข้าลึกของฝ่ามือหอมส่วนในกระเป๋ารองของ COX-2 มีปฏิสัมพันธ์แบบ Ala 516, Val 523, Val 349 Gly 354 และขาดรูปแบบพันธะไฮโดรเจนซึ่งสังเกต ด้วยค็อกซ์-1 บนมืออื่นๆ สารประกอบ 7a ผลิตโหมดการกลับด้านของรวมกับค็อกซ์-2 ด้วยการเคลื่อนไหวลึกลงในกระเป๋าน้ำ ซึ่งแตกต่างจาก 5b, 7a กลุ่ม amide ไม่สามารถเข้าถึงกระเป๋าน้ำ และมีส่วนร่วมในแรงไฮโดรเจนพันธะ 90 พระ (2.7 Å) และ Gln 192 (2.47 Å) และอ่อนแอไฮโดรเจนติด ด้วยเพ 518 (3.42 Å) ปฏิสัมพันธ์ดังกล่าวมีความจำเป็นสำหรับกิจกรรมยับยั้ง COX-2 เกือบจะเป็นแบบอย่าง โดยการโต้ตอบการผูกของ SC-558 อะนาล็อกของซีลีคอกซิบร่วมตกผลึกในไซต์ใช้งานค็อกซ์-2 [26] นอกจากนี้ การโต้ตอบดังกล่าวบังคับฟีนิลแหวนเพื่อนำมาใช้เป็นแนวเฉพาะที่ด้านบนของช่องทาง Moiety นี้มีส่วนเกี่ยวข้องในการโต้ตอบที่ฝ่ามือกับ Trp 387, Tyr 385, Val 523 ลิว 352, Ser 353, Val 349 เพ 518 และ Ala 527 กระเป๋าด้านข้างของ COX-2 ดังนั้นจะรับผิดชอบสำหรับวิธีค็อกซ์-2 ของ 7a และส่วนการ stabilize คอมเพล็กซ์ลิแกนด์เอนไซม์ (รูป 4 และ 5 รูป)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บนมืออื่น ๆ , สารประกอบ 5b และ 7a ถูกสร้างแบบจำลองในการใช้งานเว็บไซต์ของ COX-2 เอนไซม์ (ตารางที่ 6 รูปที่. 4) พลังงานที่มีผลผูกพันของ -10.57 และ -55.09 kcal / mol ที่ได้รับสำหรับ 5b และ 7a ตามลำดับ ส่วน carboxylate ของ 5b รูปแบบที่มีปฏิสัมพันธ์พันธะไฮโดรเจนที่อ่อนแอกับ Arg 120 (3.05 A) ซึ่งอาจนำมาประกอบกับทางเข้าลึกของชิ้นส่วนที่มีกลิ่นหอมไม่ชอบน้ำในกระเป๋ารองของ COX-2 ที่มีปฏิสัมพันธ์กับน้ำซึ่งมี Ala 516 วาล 523 วาล 349 และ Gly บนมืออื่น ๆ , สารประกอบ 5b และ 7a ถูกสร้างแบบจำลองในการใช้งานเว็บไซต์ของ COX-2 เอนไซม์ (ตารางที่ 6 รูปที่. 4) พลังงานที่มีผลผูกพันของ -10.57 และ -55.09 kcal / mol ที่ได้รับสำหรับ 5b และ 7a ตามลำดับ ส่วน carboxylate ของ 5b รูปแบบที่มีปฏิสัมพันธ์พันธะไฮโดรเจนที่อ่อนแอกับ Arg 120 (3.05 A) ซึ่งอาจนำมาประกอบกับทางเข้าลึกของชิ้นส่วนที่มีกลิ่นหอมไม่ชอบน้ำในกระเป๋ารองของ COX-2 ที่มีปฏิสัมพันธ์กับน้ำซึ่งมี Ala 516 วาล 523 วาล 349 และ Gly 354 และขาดรูปแบบพันธะไฮโดรเจนที่ถูกตั้งข้อสังเกตกับ COX-1 บนมืออื่น ๆ สารประกอบ 7A ผลิตโหมดกลับของผลผูกพันกับ COX-2 ที่มีการเคลื่อนไหวลึกลงไปในกระเป๋าที่ชอบน้ำ ซึ่งแตกต่างจาก 5b กลุ่มเอไมด์ของ 7a สามารถเข้าถึงกระเป๋า hydrophilic และมีส่วนร่วมในพันธะไฮโดรเจนที่แข็งแกร่งกับพระองค์ 90 (2.7) และ Gln 192 (2.47) และพันธะไฮโดรเจนที่อ่อนแอกับเพ 518 (3.42 A) ปฏิสัมพันธ์ดังกล่าวมีความจำเป็นเกือบ COX-2 ยับยั้งอย่างสุดขั้วกับการปฏิสัมพันธ์ผูกพันของ SC-558 อะนาล็อกของ Celecoxib ร่วมตกผลึกในการใช้งานเว็บไซต์ COX-2 [26] นอกจากนี้การมีปฏิสัมพันธ์เช่นบังคับให้แหวน phenyl เพื่อนำมาใช้ในทิศทางที่เฉพาะเจาะจงที่ด้านบนของช่อง ครึ่งหนึ่งนี้มีส่วนเกี่ยวข้องในการมีปฏิสัมพันธ์กับชอบน้ำ Trp 387, เทอร์ 385, 523 Val ลื้อ 352, 353 Ser วาล 349 เพ 518 และ 527 Ala กระเป๋าข้างของ COX-2 จึงจะเป็นผู้รับผิดชอบในการ COX-2 หัวกะทิ ของ 7a และมีส่วนในการรักษาเสถียรภาพคอมเพล็กซ์แกนด์เอนไซม์ (รูปที่. 4 และรูปที่. 5)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

บนมืออื่น ๆและอยู่ในสารประกอบ 5B 7a แบบ active site ของ cox-2 เอนไซม์ ( ตารางที่ 6 รูปที่ 4 ) พลังงานรวมของ−− 10.57 และ 55.09 กิโลแคลอรีต่อโมลสำหรับ 5B ได้ และ 68 ตามลำดับ ในส่วนของคาร์บอกซิเลต 5B รูปแบบที่อ่อนแอพันธะไฮโดรเจนปฏิสัมพันธ์กับ ARG 120 ( 3.05 Å ) ซึ่งอาจจะเกิดจากการลึกเข้า ) หอมส่วนหนึ่งเข้ากระเป๋ารองของ cox-2 กับปฏิสัมพันธ์ ) กับเอ๋ 516 Val 648 , วาลและ GLY บนมืออื่น ๆและมีสารประกอบ 5B 7a แบบในเว็บไซต์ งานของ cox-2 เอนไซม์ ( ตารางที่ 6 รูปที่ 4 ) พลังงานรวมของ−− 10.57 และ 55.09 กิโลแคลอรีต่อโมลสำหรับ 5B ได้ และ 68 ตามลำดับ ในส่วนของคาร์บอกซิเลต 5B รูปแบบที่อ่อนแอพันธะไฮโดรเจนปฏิสัมพันธ์กับ ARG 120 ( 3.05 Å ) ซึ่งอาจจะเกิดจากการลึกเข้า ) หอมส่วนหนึ่งเข้ากระเป๋ารองของ cox-2 กับปฏิสัมพันธ์ ) กับเอ๋ 516 Val 648 , วาลและ GLY และขาดพันธะไฮโดรเจนแบบแผนซึ่งสังเกตด้วย cox-1 . บนมืออื่น ๆที่ผลิตสารประกอบ 7a กลับโหมดผูกพันกับการเคลื่อนไหว cox-2 ลึกเข้าไปในกระเป๋าที่มี . ซึ่งแตกต่างจาก 5B , แร่งของงานสามารถเข้าถึงกระเป๋าน้ำและเกี่ยวข้องในแข็งแรงพันธะไฮโดรเจนกับ 90 ( 2.7 Å ) และ gln 192 ( 2.47 Å ) และอ่อนแอเกิดพันธะไฮโดรเจนกับเพ 518 ( 3.42 Å ) ปฏิกิริยาดังกล่าวเกือบจำเป็นสำหรับกิจกรรมการยับยั้ง cox-2 ตัวอย่างที่ดีของการรวม sc-558 , อะนาล็อก Celecoxib Co ตกผลึกในการใช้งานเว็บไซต์ cox-2 [ 26 ] นอกจากนี้ การบังคับ เช่น ฟีนิลแหวนมาปฐมนิเทศที่เฉพาะเจาะจงที่ด้านบนของช่อง แน่นอนนี้จะเกี่ยวข้องกับการปฏิสัมพันธ์กับ TRP ) 387 , tyr 385 , Val Leu ประมาณ 352 , 353 , วอลเพเซอร์ , 349 , 518 และเอ๋ 527 . กระเป๋าด้านข้างของ cox-2 จึงต้องรับผิดชอบในการ cox-2 ของงานและสนับสนุนการรักษาเสถียรภาพของเอนไซม์เชิงซ้อนลิแกนด์ ) ( รูปที่ 4 และรูปที่ 5 )