2.3. Detection of WSSV by PCRFor de

2.3. Detection of WSSV by PCR
For detection of WSSV, a nested PCR reaction was done with
primer pairs (IK1 and IK2, IK3 and IK4) as described by Umesha
et al [15]. A second set of primers was also used for the detection of
WSSV using primers and PCR conditions as described by Kimura
et al. [4] (Table 1). To eliminate the incidence of false reactions, a
template free reagent control, a known negative control and a
known positive control were run in all the reactions. The PCR
amplified products were analysed in 1.5% agarose gels containing
ethidium bromide at a concentration of 0.5mg/mL and visualized
under UV transilluminator.
3. Results
3.1. Detection of WSSV in crustaceans from aquaculture ponds
Out of 308 samples collected from cultured ponds, 118 (38%)
were positive by first step PCR while 207 (67%) were positive by
nested PCR (Table 2). The lowest incidence of WSSV was found in
mud crab (Scylla serrata) were the infection was presentin only 33%
of the samples. Two Metapenaeus spp., (Metapenaeus dobsoni and
Metapenaeus monoceros) that are not usually cultured but might
have entered the aquaculture ponds during water exchange are
found to carry WSSV in 15/28 (54%) and 22/32 (71%) of samples,
respectively.
The farm wise prevalence of WSSV is given in Table 3. The
maximum percentage of infected individuals was detected in Farm
No. 5 by both first step PCR and nested PCR. In Farm No. 5, 44/73
(60%) of the samples were positive by first step PCR and 61/73
(84%) samples were positive by nested PCR. After 10 days of
collection of samples, Farm No. 5 had an outbreak of WSSV
infection and an emergency harvest was done. The lowest
incidence of WSSV was found in Farm No. 1 with only 49% of
the samples infected by nested PCR.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.3 การตรวจสอบของตรวจด้วย PCRสำหรับการตรวจจับตรวจ ทำปฏิกิริยา PCR ซ้อนกันด้วยคู่ไพรเมอร์ (IK1 และ IK2, IK3 และ IK4) ตามที่อธิบายไว้โดย Umeshaet al [15] ชุดสองของไพรเมอร์ยังใช้สำหรับการตรวจจับตรวจโดยใช้ PCR เงื่อนไขและไพรเมอร์ที่อธิบาย โดยระร้อยเอ็ด [4] (ตารางที่ 1) เพื่อลดอุบัติการณ์ของปฏิกิริยาเท็จ การแม่น้ำยาฟรีควบคุม ควบคุมลบทราบและรู้จักควบคุมบวกถูกเรียกใช้ในปฏิกิริยาทั้งหมด การ PCRขยายผลิตภัณฑ์นำมาวิเคราะห์ใน 1.5% agarose เจลที่ประกอบด้วยโบรไมด์ ethidium ที่ความเข้มข้น 0.5 mg/mL และมองเห็นภายใต้ UV transilluminator3. ผลลัพธ์3.1. ตรวจการตรวจในกุ้งจากบ่อเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำจากตัวอย่าง 308 ที่รวบรวมจากบ่ออ่าง 118 (38%)เป็นบวก โดย PCR ขั้นตอนแรกในขณะที่ 207 (67%) บวกด้วยซ้อนกัน PCR (ตาราง 2) อุบัติการณ์ต่ำสุดของการตรวจพบในโคลนปู (ปู) มีการติดเชื้อคือ presentin เพียง 33%ตัวอย่าง สอง Metapenaeus ออกซิเจน, (Metapenaeus dobsoni และโฮ Metapenaeus) ที่ไม่ปกติอ่าง แต่อาจใส่สัตว์น้ำที่เป็นบ่อในช่วงเปลี่ยนน้ำพบว่ามีตรวจ 15/28 (54%) และ 22/32 (71%) ของตัวอย่างตามลาดับส่วนปัญญาฟาร์มของตรวจถูกกำหนดในตารางที่ 3 การเปอร์เซ็นต์สูงสุดของผู้ติดเชื้อที่พบในฟาร์มหมายเลข 5 ทั้งขั้นตอน PCR และ PCR ซ้อนแรก ในฟาร์มเลขที่ 5, 44/73(60%) ตัวอย่างดี โดย PCR ขั้นตอนแรกและ 61/73ตัวอย่าง (84%) บวก ด้วย PCR ซ้อนกันได้ หลังจาก 10 วันคอลเลกชันของตัวอย่าง ฟาร์มเลขที่ 5 มีการระบาดของการตรวจมีทำเชื้อและการเก็บเกี่ยวฉุกเฉิน ต่ำที่สุดอุบัติการณ์ของการตรวจพบในฟาร์มเลข 1 เพียง 49%ตัวอย่างการติดเชื้อ โดย PCR ซ้อนกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.3 การตรวจหาตัวแดงดวงขาวโดยวิธี PCR
ในการตรวจหาตัวแดงดวงขาวปฏิกิริยา PCR ที่ซ้อนกันทำด้วย
คู่ไพรเมอร์ (IK1 และ IK2, IK3 และ IK4) ตามที่อธิบาย Umesha
et al, [15] ชุดที่สองของไพรเมอร์ยังถูกนำมาใช้สำหรับการตรวจสอบของ
ตัวแดงดวงขาวโดยใช้ไพรเมอร์และเงื่อนไข PCR ตามที่อธิบายไว้โดยคิมูระ
, et al [4] (ตารางที่ 1) เพื่อขจัดอุบัติการณ์ของการเกิดปฏิกิริยาที่ผิดพลาดที่เป็น
แม่แบบของการควบคุมสารฟรีที่รู้จักกันในการควบคุมเชิงลบและ
ควบคุมบวกที่รู้จักกันวิ่งในปฏิกิริยาทั้งหมด PCR
ผลิตภัณฑ์ขยายถูกนำมาวิเคราะห์ใน 1.5% agarose เจลที่มี
โบรไมด์ ethidium ที่ความเข้มข้น 0.5mg / มิลลิลิตรและมองเห็น
ภายใต้ transilluminator UV.
3 ผลการค้นหา
3.1 การตรวจหาตัวแดงดวงขาวในกุ้งจากบ่อเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำ
จาก 308 ตัวอย่างที่เก็บรวบรวมจากบ่อเพาะเลี้ยง, 118 (38%)
เป็นบวกโดยขั้นตอนแรก PCR ในขณะที่ 207 (67%) เป็นบวกโดย
ที่ซ้อนกัน PCR (ตารางที่ 2) อุบัติการณ์ต่ำสุดของตัวแดงดวงขาวถูกพบใน
ปูทะเล (Scylla serrata) มีการติดเชื้อได้รับการ presentin เพียง 33%
ของกลุ่มตัวอย่าง สอง Metapenaeus spp. (Metapenaeus dobsoni และ
Metapenaeus ยูนิคอร์น) ที่มักจะไม่เลี้ยง แต่อาจ
ได้ป้อนบ่อเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำในระหว่างการแลกเปลี่ยนน้ำ
ที่พบในการดำเนินการตัวแดงดวงขาวใน 15/28 (54%) และ 22/32 (71%) ของกลุ่มตัวอย่าง ,
ตามลำดับ.
ความชุกฉลาดฟาร์มของตัวแดงดวงขาวจะได้รับในตารางที่ 3
เปอร์เซ็นต์สูงสุดของผู้ติดเชื้อถูกตรวจพบในฟาร์ม
เลขที่ 5 โดยทั้งสองขั้นตอนแรก PCR และ PCR ที่ซ้อนกัน ในฟาร์มฉบับที่ 5, 44/73
(60%) ของกลุ่มตัวอย่างเป็นบวกโดยขั้นตอนแรก PCR และ 61/73
(84%) กลุ่มตัวอย่างเป็นบวกโดยวิธี PCR ที่ซ้อนกัน หลังจาก 10 วันของการ
เก็บตัวอย่าง, ฟาร์มฉบับที่ 5 มีการระบาดของโรคตัวแดงดวงขาว
ติดเชื้อและการเก็บเกี่ยวฉุกเฉินได้ทำ ต่ำสุด
อุบัติการณ์ของตัวแดงดวงขาวถูกพบในฟาร์มครั้งที่ 1 ที่มีเพียง 49% ของ
กลุ่มตัวอย่างที่ติดเชื้อโดยวิธี PCR ที่ซ้อนกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.3 การตรวจหาดีเอ็นเอ ีโดยการตรวจหาปฏิกิริยา PCR ี , ซ้อนกันเสร็จแล้วไพรเมอร์คู่ ( ik1 ik2 ik3 และ , และ umesha ik4 ) ตามที่อธิบายไว้โดยal ) [ 15 ] ชุดที่สองของไพรเมอร์ก็ยังใช้สำหรับการตรวจสอบของีใช้ไพรเมอร์และ PCR เงื่อนไขตามที่อธิบายไว้โดย คิมูระet al . [ 4 ] ( ตารางที่ 1 ) เพื่อลดอุบัติการณ์ของการเกิดปฏิกิริยาการปลอมแม่แบบการควบคุมสารเคมีฟรี รู้จักควบคุมและลบรู้จักบวกควบคุมใช้ในปฏิกิริยาทั้งหมด pcrขยายผลิตภัณฑ์วิเคราะห์ 1.5 % เจล ( ที่มีโบรไมด์คู่ที่ความเข้มข้น 0.5mg/ml และภาพปรากฏการณ์ภายใต้แสงยูวี transilluminator .3 . ผลลัพธ์3.1 . การตรวจหาในกุ้งจากบ่อเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำีจากการเก็บตัวอย่างจาก 308 ในบ่อเลี้ยง , 118 ( 38 % )เป็นบวก โดยขั้นตอนแรก PCR ในขณะที่ 207 ( 67% ) มีค่าเป็นบวก โดยด้วยวิธี PCR ( ตารางที่ 2 ) อุบัติการณ์ต่ำสุดของี ถูกพบในปูทะเล ( ปูทะเล ) มีการติดเชื้อเป็น presentin เพียง 33 เปอร์เซ็นต์ของตัวอย่าง สอง metapenaeus spp . ( metapenaeus dobsoni และmetapenaeus กลุ่มดาวยูนิคอร์น ) ที่มักจะไม่เลี้ยง แต่อาจเข้าบ่อเพาะเลี้ยงสัตว์น้ำในการแลกเปลี่ยนเงินตราพบพาี 15 / 28 ( 54% ) และ 22 / 32 ( 71% ) ของตัวอย่างตามลำดับฟาร์มปัญญาความชุกของีให้ในตารางที่ 3 ที่เปอร์เซ็นต์สูงสุดของบุคคลที่ติดเชื้อที่ตรวจพบในฟาร์มหมายเลข 5 โดยทั้งสองขั้นตอนแรกด้วยวิธี PCR และ PCR ในฟาร์มไม่ 5 , 44 / 73( 60% ) ของตัวอย่างที่เป็นบวก โดยวิธี PCR ขั้นตอนแรกและ 61 / 73( 84% ) จำนวนบวกด้วย PCR หลังจาก 10 วันคอลเลกชันของตัวอย่าง ฟาร์ม เบอร์ 5 มีการระบาดของีการติดเชื้อและการเก็บเกี่ยวฉุกเฉินนั้น ถูกที่สุดอุบัติการณ์ของีพบในฟาร์มที่ 1 มีเพียง 49 % ของตัวอย่างเชื้อพันธุกรรม PCR