2. Methods
2.1. Data source
2.1.1. Cholera data
The Department of Clinical Microbiology receives stool
samples that are sent for culture of common enteric pathogens.
Stool samples of patients coming to the Emergency
department or admitted with a history of passing watery and
frequent stools were registered for a culture with hanging drop
which were then processed for V.cholerae. This data was
extracted from laboratory records between January 2000 and
December 2010.
2.1.2. Environmental factors
The local climatic variables that were included in this study
such asmonthly meanmaximum temperature (degree Celsius),
monthly total rainfall (mm) and relative humidity at 1730 h IST
(%) were obtained from the records of Regional Meteorological
Department, Chennai for the period of January 2000 – December
2010. Private drinking water-supply information of Vellore City
was also collected from suppliers. The year of establishment
and their daily production in Liter were collected.
2.2. Statistical methods
The analyses considered V.cholerae O1 and V.cholerae O139
as V.cholerae or cholera counts. Seasonal auto regressive
integrated moving average (SARIMA) models were fitted in
order to control for seasonal effect on the cases.12,13 In
addition, it was assumed that there was an autocorrelation
amongst the numbers reported between months. As the
numbers of cases reported started declining from 2005
onwards, the analyses were done for two strata of time
periods, that is, 2000–2004 and 2005–2010. The simple auto
regressive (AR) model was performed for the second period
observations. However, this was validated using segmented
time series analyses. Using this method we also estimated
the average difference between the two time periods and the
rate of change after the segment period. Auto correlation
function (ACF) and partial auto correlation function (PACF)
graphs were plotted against time to find the parameters for
SARIMA model.2,12
Poisson harmonic regression (PHR) model with sine and
cosine function was used to find the average peak time at which
the maximum number of V.cholerae cases were reported.2,14,15
2. Methods2.1. Data source2.1.1. Cholera dataThe Department of Clinical Microbiology receives stoolsamples that are sent for culture of common enteric pathogens.Stool samples of patients coming to the Emergencydepartment or admitted with a history of passing watery andfrequent stools were registered for a culture with hanging dropwhich were then processed for V.cholerae. This data wasextracted from laboratory records between January 2000 andDecember 2010.2.1.2. Environmental factorsThe local climatic variables that were included in this studysuch asmonthly meanmaximum temperature (degree Celsius),monthly total rainfall (mm) and relative humidity at 1730 h IST(%) were obtained from the records of Regional MeteorologicalDepartment, Chennai for the period of January 2000 – December2010. Private drinking water-supply information of Vellore Citywas also collected from suppliers. The year of establishmentand their daily production in Liter were collected.2.2. Statistical methodsThe analyses considered V.cholerae O1 and V.cholerae O139as V.cholerae or cholera counts. Seasonal auto regressiveintegrated moving average (SARIMA) models were fitted inorder to control for seasonal effect on the cases.12,13 Inaddition, it was assumed that there was an autocorrelationamongst the numbers reported between months. As thenumbers of cases reported started declining from 2005onwards, the analyses were done for two strata of timeperiods, that is, 2000–2004 and 2005–2010. The simple auto
regressive (AR) model was performed for the second period
observations. However, this was validated using segmented
time series analyses. Using this method we also estimated
the average difference between the two time periods and the
rate of change after the segment period. Auto correlation
function (ACF) and partial auto correlation function (PACF)
graphs were plotted against time to find the parameters for
SARIMA model.2,12
Poisson harmonic regression (PHR) model with sine and
cosine function was used to find the average peak time at which
the maximum number of V.cholerae cases were reported.2,14,15
การแปล กรุณารอสักครู่..

2. วิธีการ
2.1 แหล่งข้อมูล
2.1.1 ข้อมูลอหิวาตกโรคกรมจุลชีววิทยาคลินิกได้รับอุจจาระตัวอย่างที่ถูกส่งสำหรับวัฒนธรรมของแบคทีเรียที่พบบ่อย. ตัวอย่างอุจจาระของผู้ป่วยมาถึงฉุกเฉินแผนกหรือเข้ารับการรักษาที่มีประวัติของการส่งผ่านน้ำและอุจจาระบ่อยได้รับการจดทะเบียนวัฒนธรรมที่มีที่แขวนอยู่ลดลงซึ่งเป็นประมวลผลแล้วสำหรับเชื้อ V. cholerae ข้อมูลนี้ถูกดึงออกมาจากห้องปฏิบัติการบันทึกระหว่างเดือนมกราคม 2000 และเดือนธันวาคม 2010 2.1.2 ปัจจัยสิ่งแวดล้อมตัวแปรภูมิอากาศในท้องถิ่นที่ถูกรวมอยู่ในการศึกษาครั้งนี้เช่นอุณหภูมิmeanmaximum asmonthly (องศาเซลเซียส) ปริมาณน้ำฝนรวมรายเดือน (mm) และความชื้นสัมพัทธ์ที่ 1,730 ชั่วโมง IST (%) ที่ได้รับจากบันทึกอุตุนิยมวิทยาภูมิภาคกรมเจนไนสำหรับระยะเวลาของการมกราคม 2000 ธันวาคม - ปี 2010 ข้อมูลการดื่มน้ำประปาภาคเอกชนของเมืองเวลลอยังถูกเก็บรวบรวมจากซัพพลายเออร์ ปีของการจัดตั้งและการผลิตในชีวิตประจำวันของพวกเขาในการเก็บรวบรวมลิตร. 2.2 วิธีการทางสถิติการวิเคราะห์พิจารณาเชื้อ V. cholerae O1 และ O139 เชื้อ V. cholerae เป็นเชื้อ V. cholerae หรือนับอหิวาตกโรค ฤดูกาลอัตโนมัติถอยหลังย้ายรวมเฉลี่ย (SARIMA) รุ่นพอดีในเพื่อที่จะควบคุมสำหรับผลของฤดูกาลในcases.12,13 ในนอกจากนี้มันก็สันนิษฐานว่ามีอัตหมู่ตัวเลขที่มีการรายงานระหว่างเดือน ในฐานะที่เป็นหมายเลขของกรณีรายงานเริ่มลดลงจาก 2005 เป็นต้นไปวิเคราะห์ได้ทำสองชั้นของเวลาระยะเวลา, ที่อยู่, 2000-2004 และ 2005-2010 อัตโนมัติง่ายถอยหลัง (AR) รูปแบบการดำเนินการสำหรับงวดที่สองสังเกต อย่างไรก็ตามนี่คือการตรวจสอบการใช้แบ่งเวลาการวิเคราะห์ชุด ใช้วิธีนี้เรายังคาดความแตกต่างเฉลี่ยระหว่างสองช่วงเวลาและอัตราการเปลี่ยนแปลงหลังจากช่วงเวลาส่วน ความสัมพันธ์อัตโนมัติฟังก์ชั่น (ACF) และบางส่วนฟังก์ชั่นความสัมพันธ์อัตโนมัติ (PACF) กราฟถูกพล็อตกับเวลาที่จะหาพารามิเตอร์สำหรับSARIMA model.2,12 Poisson ถดถอยฮาร์โมนิ (PHR) รุ่นที่มีซายน์และฟังก์ชั่นโคไซน์ถูกใช้ในการหาเวลาเฉลี่ยสูงสุดที่จำนวนสูงสุดของผู้ป่วยมีเชื้อ V. cholerae reported.2,14,15
การแปล กรุณารอสักครู่..
