The human gastrointestinal tract ha

The human gastrointestinal tract harbors a highly diverse microbial community, which plays important roles in host nutrition, immunology, health, and disease. In addition to Bacteroides spp. and the Clostridium coccoides cluster, the Clostridium leptum cluster (3) is one of the most predominant populations in the human fecal microflora (2, 6, 11, 12, 30). Including species that belong to the genera Clostridium, Eubacterium, andRuminococcus, the C. leptum cluster contains numerous butyrate-producing and fibrolytic species (6, 22). The metabolic activities of these organisms have a significant effect on the health of the human colon. Members of this cluster are highly oxygen sensitive (22) and difficult to culture (9), so the development of molecular methods to specifically study the diversity of this population and to monitor changes in the cluster after intervention is critical.
Probes (17, 27, 29) and primers (18) specific for the C. leptum group have been designed and used to enumerate this population by fluorescent in situ hybridization (FISH), dot blot hybridization, and real-time PCR. However, these group-specific methods can provide information only on the abundance of the whole population in the human fecal microflora, and they provide few details concerning the composition of the population at the species level.
Another way to study the diversity of this group is to use fingerprinting approaches, such as PCR-based denaturing/temperature gradient gel electrophoresis (DGGE/TGGE). Due to their obvious strengths, including high sensitivity, high resolution, and high throughput, group-specific PCR-based DGGE-TGGE techniques have been developed for Bacteroides spp. (21), Bifidobacterium spp. (23, 26), and bacteria related to Lactobacillus (13, 34) in the human gut microbial community. However, to the best of our knowledge, no study has used fingerprinting techniques to determine the composition of the C. leptumsubgroup in the human fecal flora despite its abundance and important functions.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ระบบทางเดินอาหารของมนุษย์สถิตกลุ่มจุลินทรีย์ที่มีความหลากหลายสูงซึ่งมีบทบาทสำคัญในด้านโภชนาการเจ้าภาพภูมิคุ้มกันสุขภาพและโรค นอกเหนือจากเอสพีพี Bacteroides และกลุ่ม Clostridium coccoides, กลุ่ม leptum Clostridium (3) เป็นหนึ่งในประชากรที่โดดเด่นมากที่สุดในจุลินทรีย์อุจจาระของมนุษย์ (2, 6, 11, 12, 30) รวมทั้งสายพันธุ์ที่อยู่ในจำพวก Clostridium, Eubacterium, andRuminococcus, กลุ่มซี leptum butyrate มีการผลิตจำนวนมากและสายพันธุ์ fibrolytic (6, 22) กิจกรรมการเผาผลาญอาหารของสิ่งมีชีวิตเหล่านี้มีผลกระทบต่อสุขภาพของลำไส้ใหญ่ของมนุษย์ สมาชิกของกลุ่มนี้เป็นอย่างสูงที่มีความละเอียดอ่อนออกซิเจน (22) และยากที่จะวัฒนธรรม (9) เพื่อพัฒนาวิธีการโมเลกุลเฉพาะศึกษาความหลากหลายของประชากรนี้และเพื่อติดตามการเปลี่ยนแปลงในคลัสเตอร์หลังจากการแทรกแซงเป็นสิ่งสำคัญ.
พร็อบ (17, 27 , 29) และไพรเมอร์ (18) ที่เฉพาะเจาะจงสำหรับกลุ่ม leptum ซีได้รับการออกแบบและใช้ในการระบุประชากรกลุ่มนี้โดยการเรืองแสงในแหล่งกำเนิดพันธุ์ (FISH) dot blot hybridization และ PCR เรียลไทม์ แต่วิธีการเหล่านี้เฉพาะกลุ่มสามารถให้ข้อมูลเฉพาะในความอุดมสมบูรณ์ของประชากรทั้งหมดในจุลินทรีย์อุจจาระมนุษย์และพวกเขาให้รายละเอียดบางอย่างที่เกี่ยวข้องกับองค์ประกอบของประชากรในระดับสายพันธุ์.
วิธีการที่จะศึกษาความหลากหลายของกลุ่มนี้ก็คือ ที่จะใช้วิธีการพิมพ์ลายนิ้วมือเช่น denaturing PCR-based / อุณหภูมิลาดข่าวคราว (DGGE / TGGE) เนื่องจากจุดแข็งที่ชัดเจนของพวกเขารวมทั้งความไวสูงความละเอียดสูงและการส่งผ่านสูงตาม PCR กลุ่มเฉพาะเทคนิค DGGE-TGGE ได้รับการพัฒนาเอสพีพี Bacteroides (21), Bifidobacterium spp (23, 26) และแบคทีเรียที่เกี่ยวข้องกับแลคโตบาซิลลัส (13, 34) ในทางเดินอาหารของมนุษย์กลุ่มจุลินทรีย์ แต่ที่ดีที่สุดของความรู้ของเราไม่มีการศึกษาได้ใช้เทคนิคการพิมพ์ลายนิ้วมือเพื่อตรวจสอบองค์ประกอบของ leptumsubgroup ซีในพืชอุจจาระของมนุษย์แม้จะมีความอุดมสมบูรณ์และฟังก์ชั่นที่สำคัญ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มนุษย์ระบบทางเดินอาหารสถิตสูงหลากหลายของชุมชนที่มีบทบาทในด้านโภชนาการ , โฮสต์วิทยาภูมิคุ้มกัน , สุขภาพและโรค นอกจาก bacteroides และ Clostridium spp . coccoides กลุ่ม , Clostridium leptum กลุ่ม ( 3 ) เป็นหนึ่งในประชากรที่เด่นที่สุดในไมโครอุจจาระมนุษย์ ( 2 , 6 , 11 , 12 , 30 )รวมถึงชนิดที่เป็นของจำพวก Clostridium eubacterium andruminococcus , , , leptum ที่มีหลายกลุ่ม ซีบิวการผลิตและ fibrolytic สายพันธุ์ ( 6 , 22 ) กิจกรรมการสลายของสิ่งมีชีวิตเหล่านี้จะมีผลต่อสุขภาพของลำไส้ใหญ่ของมนุษย์ สมาชิกของกลุ่มนี้มีออกซิเจนที่สําคัญ ( 22 ) และ ยากที่จะ และวัฒนธรรม ( 9 )ดังนั้นการพัฒนาวิธีการโมเลกุลโดยเฉพาะศึกษาความหลากหลายของประชากรนี้ และในการตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในกลุ่มหลังการทดลองมี .
) ( 17 , 27 , 29 ) และไพรเมอร์ ( 18 ) โดยเฉพาะในกลุ่ม C . leptum ได้รับการออกแบบ และใช้ในการระบุประชากรนี้เรืองแสงใน situ hybridization ( FISH ) dot blot hybridization และ PCR แบบเรียลไทม์ อย่างไรก็ตามวิธีการเฉพาะกลุ่มนี้สามารถให้ข้อมูลเฉพาะในความอุดมสมบูรณ์ของประชากรทั้งหมดในอุจจาระมนุษย์จุลินทรีย์ และให้รายละเอียดบางอย่างเกี่ยวกับองค์ประกอบของประชากรในระดับสปีชีส์ .
อีกทางเพื่อศึกษาความหลากหลายของกลุ่มนี้คือการใช้ลายพิมพ์ดีเอ็นเอวิธี เช่น PCR ตามี่ / อุณหภูมิลาดเจลอิเล็กโตรโฟเรซิสการทดลอง / tgge )เนื่องจากจุดแข็งของพวกเขาอย่างชัดเจน รวมทั้งความไวสูง ความละเอียดสูง และสูง throughput , โดยเฉพาะกลุ่มตาม dgge-tgge เทคนิคได้ถูกพัฒนาขึ้นเพื่อ bacteroides spp . ( 21 ) , Bifidobacterium spp . ( 23 , 26 ) , และแบคทีเรียที่เกี่ยวข้องกับแลคโตบาซิลลัส ( 13 , 34 ) ในลำไส้ของมนุษย์ ชุมชน อย่างไรก็ตาม ในการที่ดีที่สุดของความรู้ของเราไม่มีการศึกษาได้ใช้เทคนิคลายพิมพ์เพื่อตรวจสอบองค์ประกอบของ leptumsubgroup C ในฟลอร่าอุจจาระมนุษย์แม้จะมีความอุดมสมบูรณ์และฟังก์ชันสำคัญ