ene.In silico analysis of the genom

ene.
In silico analysis of the genomic region in the vicinity of
Xa33 for putatively expressed genes. Based on the fine mapping
analysis, the SSR marker RMWR7.1 was located at a genetic
distance of 0.9 cM on one side of the gene and RMWR7.6 was
located on the other side of the gene at a genetic distance of
1.2 cM (Fig. 1). The intervening genomic region, consisting of
≈49 kb of sequence, was downloaded from the Japonica genome
sequence database (http://rise.genomics.org.cn) and analyzed for
the presence of putative genes using the software FGENESH
(http://www.softberry.com). The functionality of the genes was
analyzed using the BLAST-P tool (1), available online at http://
www.ncbi.nlm.nih.gov. Eight genes were observed to be present
in the genomic region flanked by RMWR7.1 and RMWR7.6. Of
the eight genes identified in the region, one gene encoding serine
threonine kinase, one encoding putative transposon protein and
mutator protein, one encoding ribose-5-phosphate isomerase
subfamily, one encoding domain of unknown function 295, one
encoding DNA repair/transcription protein Mms-19-like protein,
two encoding base inhibitor 1 (which belongs to a protein superfamily), and one encoding a hypothetical protein with no putative
conserved domain were detected. The details of the genes along
with their size in base pairs, amino acids, and their putative
functions are given in Table 3

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ศัตรูวิเคราะห์รูปดอกไม้ของภูมิภาคออกบริเวณXa33 สำหรับยีนที่แสดงออก putatively คะแนนเฉลียจากการแม็ปดีวิเคราะห์ เครื่องหมาย SSR RMWR7.1 เป็นเป็นทางพันธุกรรมระยะห่าง 0.9 ซม.ด้านหนึ่งของยีนและ RMWR7.6ตั้งอยู่บนอีกด้านหนึ่งของยีนที่ระยะทางพันธุกรรม1.2 ซม. (รูปที่ 1) แทรกแซงออกภูมิภาค ประกอบด้วย≈49 kb ลำดับการดาวน์โหลดจากจีโน Japonicaลำดับฐานข้อมูล (http://rise.genomics.org.cn) และวิเคราะห์ความการปรากฏตัวของ putative ยีนโดยใช้ซอฟต์แวร์ FGENESH(http://www.softberry.com) แก้ไขการทำงานของยีนวิเคราะห์โดยใช้เครื่อง P ระเบิดมือ (1), บริการออนไลน์ที่ http://www.ncbi.nlm.nih.gov. แปดยีนถูกตั้งข้อสังเกตในการนำเสนอในภูมิภาคออกโดย RMWR7.1 และ RMWR7.6 ของระบุในภูมิภาค รอบเส้นใยประสาทเข้ารหัสยีนหนึ่งยีนแปดไคเนสรีทรีโอนีน หนึ่งรหัส putative transposon โปรตีน และโปรตีน mutator หนึ่งรหัส isomerase น้ำตาล-5-ฟอสเฟตวงศ์ย่อย หนึ่งรหัสโดเมนของฟังก์ชันที่ไม่รู้จัก 295 หนึ่งการเข้ารหัสโปรตีนซ่อมแซม/ถอดรหัสดีเอ็นเอโปรตีนเช่น Mms 19สองรหัสยับยั้งฐาน 1 (ซึ่งเป็นของใน superfamily โปรตีน), และหนึ่งในการเข้ารหัสโปรตีนสมมุติที่ไม่มี putativeตรวจพบโดเมนภัต รายละเอียดของยีนตามกับขนาดของพวกเขาในคู่เบส กรดอะมิโน และของ putativeฟังก์ชันที่ถูกกำหนดในตารางที่ 3

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ene.
ในการวิเคราะห์ silico ของภูมิภาคจีโนมในบริเวณใกล้เคียงของ
Xa33 ยีนแสดง putatively บนพื้นฐานของการทำแผนที่ดี
วิเคราะห์เครื่องหมาย RMWR7.1 SSR ตั้งอยู่ที่พันธุกรรม
ระยะทางประมาณ 0.9 เซนติเมตรด้านใดด้านหนึ่งของยีนและ RMWR7.6 ถูก
ตั้งอยู่ในด้านอื่น ๆ ของยีนที่ระยะทางพันธุกรรมของ
1.2 เซนติเมตร (รูปที่ 1). แทรกแซงภูมิภาคจีโนมประกอบด้วย
≈49กิโลไบต์ลำดับดาวน์โหลดจาก Japonica จีโนม
ฐานข้อมูลลำดับ (http://rise.genomics.org.cn) และวิเคราะห์
การปรากฏตัวของยีนสมมุติใช้ FGENESH ซอฟต์แวร์
(http: / /www.softberry.com) การทำงานของยีนที่ได้รับการ
วิเคราะห์โดยใช้เครื่องมือระเบิด P (1) พร้อมใช้งานออนไลน์ได้ที่ http: //
www.ncbi.nlm.nih.gov แปดยีนถูกตั้งข้อสังเกตที่จะนำเสนอ
ในภูมิภาคจีโนมขนาบข้างด้วย RMWR7.1 และ RMWR7.6 ของ
ยีนแปดระบุในภูมิภาคหนึ่งยีนซีรีน
ธ รีโอนีไคเนสซึ่งเป็นหนึ่งในการเข้ารหัสโปรตีนสมมุติ transposon และ
โปรตีน Mutator หนึ่งเข้ารหัสน้ำตาล-5-ฟอสเฟต isomerase
อนุวงศ์หนึ่งโดเมนการเข้ารหัสของฟังก์ชั่นที่ไม่รู้จัก 295 ซึ่งเป็นหนึ่งใน
การเข้ารหัสซ่อมแซมดีเอ็นเอ / โปรตีนถอดความ MMS-19 เหมือนโปรตีน
เข้ารหัสสองฐานยับยั้ง 1 (ซึ่งเป็นโปรตีนที่ superfamily) และการเข้ารหัสโปรตีนสมมุติสมมุติที่ไม่มี
โดเมนป่าสงวนถูกตรวจพบ รายละเอียดของยีนพร้อม
กับขนาดของพวกเขาในฐานคู่กรดอะมิโนและสมมุติของพวกเขา
ฟังก์ชั่นจะได้รับในตารางที่ 3

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในในการวิเคราะห์โครงข่ายของพื้นที่ที่มีบริเวณxa33 สำหรับ putatively แสดงออกยีน ตามแผนที่ก็ได้การวิเคราะห์ , SSR Marker rmwr7.1 อยู่ในพันธุกรรมระยะทาง 0.9 ซม. ด้านหนึ่งของยีนและ rmwr7.6 คือที่อยู่ในด้านอื่น ๆของยีนที่ระยะทางพันธุกรรมของ1.2 ซม. ( รูปที่ 1 ) จีโนม แทรกแซง เขต ประกอบด้วย≈ 49 KB ของลําดับ ก็ดาวน์โหลดได้จากการศึกษาจีโนมฐานข้อมูลลำดับ ( http://rise.genomics.org.cn ) และวิเคราะห์สำหรับการใช้ซอฟต์แวร์ fgenesh การแสดงออกยีน( http : / / www.softberry . com ) การทำงานของยีนคือวิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ blast-p เครื่องมือ ( 1 ) พร้อมใช้งานแบบออนไลน์ได้ที่ http : / /www.ncbi.nlm.nih.gov แปดยีนที่พบเป็นปัจจุบันในจีโนมของภูมิภาคและขนาบข้างด้วย rmwr7.1 rmwr7.6 . ของแปดยีนระบุในภูมิภาค ยีนเป็นตัวเข้ารหัสไคเนสโปรตีนกรดอะมิโนทรีโอนีน , การเข้ารหัสและ ? ? ? ? ?โปรตีน mutator , การเข้ารหัส ribose-5-phosphate ไอโซเมอเรสsubfamily หนึ่งโดเมนของฟังก์ชันการเข้ารหัสที่เป็นหนึ่งการซ่อมแซมดีเอ็นเอ / ถอดความโปรตีนโปรตีน mms-19-like การเข้ารหัสซึ่งการเข้ารหัสฐานสอง ( ซึ่งเป็นโปรตีนซูเปอร์แฟมิลี ) และโปรตีนซึ่งสมมุติที่ไม่มีการเข้ารหัสอนุรักษ์ โดเมนถูกตรวจสอบ รายละเอียดของยีนตามกับขนาดของพวกเขาในคู่เบสของกรดอะมิโน กรดอะมิโน และฟังก์ชันจะได้รับในโต๊ะ 3