Genotypic and phenotypic analyses
The DNA genome was isolated by following the DNA
extraction procedure for blood samples (GeNet Bio, Daejeon,
Korea). NanoDrop 2000c UV-Vis Spectrophotometer
(Thermo Fisher Scientific Inc., Waltham, MA, USA) was
used to quantify and to check the quality of extracted DNA.
Then, the DNA samples were stored in the refrigerator at –
20°C to maintain DNA quality for further analyses. Total of
131 highly polymorphic microsatellite (MS) markers and 8
SNP markers were used to genotype F0 and F1 samples. A
total of 27 chromosomes (26 autosomes+Z chromosome)
have been covered with the total map length of 2,729.4 centi
Morgan (cM) and the average distance between markers was
19.64 cM. These MS markers were selected from the Ark
Database (http://www.thearkdb.org/arkdb/) to be genotyped
that previously described by Seo et al. (2013). In addition, 8
SNP markers were selected from our candidate genes SNPs
data that generated by direct sequencing and genotyped using
PCR-RFLP and Fluidigm Genotyping Technology. Detailed
information on genetic linkage map was reported by Seo et
al. (2015b). Four markers on Z chromosome covering 113.3
cM were not used for QTL analysis; i.e., a total of 135 DNA
markers covering 26 autosomes were used in this study.
Phenotypic measured in current study was body weight
and growth rate traits. Body weights were observed and
recorded at every two weeks from hatch to slaughter age at
20 weeks of age. Weight of half carcass was also measured
when slaughter process and evisceration were totally
completed.
พันธุกรรมและฟีโนไทป์วิเคราะห์
จีโนมดีเอ็นเอที่แยกได้โดยทำตามดีเอ็นเอ
ขั้นตอนการสกัดตัวอย่างเลือด (จำพวกไบโอเจิน,
เกาหลี) NanoDrop 2000c UV-Vis Spectrophotometer
(Thermo Fisher Scientific อิงค์ Waltham, MA, USA) ได้รับการ
. ใช้ปริมาณและตรวจสอบคุณภาพของดีเอ็นเอที่สกัด
จากนั้นตัวอย่างดีเอ็นเอที่ถูกเก็บไว้ในตู้เย็นที่ -
20 ° C เพื่อรักษาดีเอ็นเอ ที่มีคุณภาพสำหรับการวิเคราะห์ต่อไป ทั้งหมด
131 polymorphic สูงไมโคร (MS) เครื่องหมายและ 8
เครื่องหมาย SNP ถูกนำมาใช้เพื่อ genotype F0 และตัวอย่าง F1
ทั้งหมด 27 โครโมโซม (26 autosomes + Z โครโมโซม)
ได้รับการคุ้มครองที่มีความยาวรวมแผนที่ 2,729.4 centi
มอร์แกน (CM) และระยะทางเฉลี่ยระหว่างเครื่องหมายเป็น
19.64 cM เหล่านี้เครื่องหมาย MS ได้รับเลือกจากอา
ฐานข้อมูล (http://www.thearkdb.org/arkdb/) ที่จะ genotyped
ที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้โดย Seo et al, (2013) นอกจากนี้ 8
เครื่องหมาย SNP ได้รับเลือกจากยีนของเรา SNPs
ข้อมูลที่สร้างขึ้นโดยลำดับโดยตรงและ genotyped ใช้
PCR-RFLP และ Fluidigm เทคโนโลยี Genotyping รายละเอียด
ข้อมูลเกี่ยวกับแผนที่การเชื่อมโยงทางพันธุกรรมที่ถูกรายงานโดย Seo et
al, (2015b) สี่เครื่องหมายบนโครโมโซม Z ครอบคลุม 113.3
เซนติเมตรไม่ได้ใช้ในการวิเคราะห์ QTL; คือทั้งหมด 135 ดีเอ็นเอ
เครื่องหมายครอบคลุม 26 autosomes ถูกนำมาใช้ในการศึกษานี้.
ฟีโนไทป์วัดในการศึกษาในปัจจุบันเป็นน้ำหนักของร่างกาย
และการเจริญเติบโตลักษณะอัตรา น้ำหนักตัวถูกตั้งข้อสังเกตและ
บันทึกไว้ในทุกสองสัปดาห์จากการฆ่าฟักอายุ
20 สัปดาห์ของอายุ น้ำหนักของครึ่งซากยังเป็นวัด
เมื่อกระบวนการการฆ่าและชำแหละถูกทั้งหมด
แล้วเสร็จ
การแปล กรุณารอสักครู่..
