Cleared MSAP bands were scored usin

Cleared MSAP bands were scored using two methods modified from Noyer et al. (2005)
and Keyte et al. (2006). Firstly, only EcoRI-MspI bands were score as “1” for the presence of
bands and “0” for the absence of bands for standard AFLP analysis. Secondly, bands from both
EcoRI-MspI and EcoRI-HpaII of individuals were compared to interpret the MS-AFLP data. If
the band was present in both digestion sets, it was scored as “1” and if the band was present in
only one set, it was scored as “0”. The scored bands from both methods were analyzed separately
and in combination. Genetic similarity was estimated using a simple-matching coefficient (Sneath
and Sokal, 1973). Phylogenetic tree construction and principal component analysis (PCA) were
performed using the NTSYS-Pc computer software, version 2.2k (Rohlf, 2005). The cophenetic
values and Maxcomp command were used to measure the goodness of fit for a cluster analysis.
The polymorphic information content (PIC) of each marker was also calculated using PIC = 1 - Σ
Pi2, where Pi is the frequency of the present and absent alleles (Ott, 1991).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

MSAP วงแล้วมีคะแนนการใช้สองวิธีแก้ไขจาก Noyer et al. (2005)และ Keyte et al. (2006) ประการแรก เฉพาะ EcoRI MspI วงมีคะแนนเป็น "1" สำหรับของวงและ "0" สำหรับการขาดงานของวงสำหรับการวิเคราะห์ AFLP มาตรฐาน ประการที่สอง วงจากทั้งสองEcoRI MspI และ EcoRI-HpaII ของบุคคลเปรียบเทียบแปลข้อมูล MS AFLP ถ้าวงดนตรีมีในทั้งสองชุดย่อยอาหาร มีคะแนนเป็น "1" และถ้าเป็นวงดนตรีนำเสนอในชุดเดียว มันมีคะแนนเป็น "0" วง scored จากทั้งสองวิธีได้วิเคราะห์แยกต่างหากและร่วมกัน ความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรมถูกประเมินโดยใช้การจับคู่ง่ายสัมประสิทธิ์ (Sneathก Sokal, 1973) ทรี phylogenetic ก่อสร้างและการวิเคราะห์ส่วนประกอบหลัก (PCA)ดำเนินการโดยใช้ซอฟต์แวร์ NTSYS Pc คอมพิวเตอร์ รุ่น 2.2k (Rohlf, 2005) Copheneticค่าและคำสั่ง Maxcomp ถูกใช้เพื่อวัดความกตัญญูสำหรับวิเคราะห์แบบคลัสเตอร์เนื้อหาข้อมูล polymorphic (PIC) ของแต่ละเครื่องหมายถูกคำนวณโดยใช้ PIC ยัง = 1 - ΣPi2 ปี่อยู่ความถี่ ของปัจจุบัน และ ขาด alleles (Ott, 1991)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เคลียร์วงศปบถูกยิงใช้สองวิธีดัดแปลงมาจาก Noyer และคณะ (2005)
และ Keyte และคณะ (2006) ประการแรกเพียงวง EcoRI-MspI มีคะแนนเป็น "1" การปรากฏตัวของ
วงและ "0" สำหรับกรณีที่ไม่มีของวงสำหรับการวิเคราะห์ AFLP มาตรฐาน ประการที่สองวงจากทั้ง
EcoRI-MspI และ EcoRI-HpaII ของบุคคลที่ได้รับเมื่อเทียบกับการแปลความหมายข้อมูล MS-AFLP ถ้า
วงดนตรีในปัจจุบันทั้งสองชุดย่อยอาหารมันเป็นคะแนนเป็น "1" และถ้าวงดนตรีในปัจจุบัน
เพียงชุดเดียวก็คือคะแนนเป็น "0" วงคะแนนจากทั้งสองวิธีการวิเคราะห์แยกต่างหาก
และในการรวมกัน ความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรมเป็นที่คาดกันโดยใช้ค่าสัมประสิทธิ์ง่ายจับคู่ (Sneath
และ Sokal, 1973) ก่อสร้างต้นไม้วิวัฒนาการและการวิเคราะห์องค์ประกอบหลัก (PCA) ได้รับการ
ดำเนินการโดยใช้ NTSYS-คอมพิวเตอร์ซอฟต์แวร์คอมพิวเตอร์ 2.2k รุ่น (Rohlf, 2005) cophenetic
ค่านิยมและคำสั่ง Maxcomp ถูกนำมาใช้ในการวัดความดีของพอดีสำหรับการวิเคราะห์กลุ่ม.
เนื้อหาข้อมูล polymorphic (PIC) ของแต่ละเครื่องหมายที่คำนวณยังใช้ PIC = 1 - Σ
Pi2 ที่ Pi คือความถี่ของปัจจุบันและขาด อัลลีล (เฮเว่น, 1991)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ล้าง MSAP วงคะแนนโดยใช้สองวิธีที่ดัดแปลงจาก noyer et al . ( 2005 ) และ
keyte et al . ( 2006 ) ประการแรก เพียงโดยใช้รัดด้วยคะแนนเป็น " 1 " สำหรับการแสดงตนของ
วงและ " 0 " ขาดวงสำหรับการวิเคราะห์เทคนิคมาตรฐาน ประการที่สอง วงจากทั้ง
EcoRI และ hpaii โดยใช้ชิ้นส่วนของบุคคลเมื่อมีการตีความข้อมูล ms-aflp . ถ้า
วงดนตรีที่เป็นปัจจุบันทั้งในการย่อยชุด มันได้คะแนนเป็น " 1 " และถ้าวงดนตรีในปัจจุบันคือ
เพียงหนึ่งชุดได้คะแนนเป็น " 0 " โดยมีวงดนตรีจากทั้งสองวิธีวิเคราะห์แยก
และในการรวมกัน ความคล้ายคลึงกันทางพันธุกรรมถูกคำนวณโดยใช้ค่าตรงกันง่าย ( และสเนท
Sokal , 1973 ) สร้าง phylogenetic ต้นไม้ และการวิเคราะห์องค์ประกอบหลัก ( PCA )
การใช้คอมพิวเตอร์ 2.2k NTSYS ซอฟต์แวร์รุ่น ( rohlf , 2005 ) การ cophenetic
ค่านิยมและ maxcomp คำสั่งถูกใช้เพื่อวัดความดีของพอดีสำหรับการวิเคราะห์กลุ่ม
เนื้อหาข้อมูลที่มี ( PIC ) ของแต่ละเครื่องหมายถูกคำนวณโดยใช้ PIC = 1 - Σ
pi2 ที่ PI คือความถี่ของปัจจุบันและขาดอัลลีล ( มี , 1991 )