To understand the molecular basis u

To understand the molecular basis underlying increased triacylglycerol (TAG) accumulation in starchless (sta) Chlamydomonas reinhardtii mutants, we undertook comparative time-course transcriptomics of strains CC-4348 (sta6 mutant), CC-4349, a cell wall–deficient (cw) strain purported to represent the parental STA6 strain, and three independent STA6 strains generated by complementation of sta6 (CC-4565/STA6-C2, CC-4566/STA6-C4, and CC-4567/STA6-C6) in the context of N deprivation.Despite N starvation–induced dramatic remodeling of the transcriptome, there were relatively few differences (5 × 102) observed between sta6 and STA6, the most dramatic of which were increased abundance of transcripts encoding key regulated or rate-limiting steps in central carbon metabolism, specifically isocitrate lyase, malate synthase, transaldolase, fructose bisphosphatase and phosphoenolpyruvate carboxykinase (encoded by ICL1, MAS1, TAL1, FBP1, and PCK1 respectively), suggestive of increased carbon movement toward hexose-phosphate in sta6 by upregulation of the glyoxylate pathway and gluconeogenesis.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การเข้าใจพื้นฐานโมเลกุลต้นสะสมเพิ่ม triacylglycerol (แท็ก) ในสายพันธุ์ starchless (สตา) Chlamydomonas reinhardtii เรา undertook เปรียบเทียบหลักสูตรเวลา transcriptomics ของสายพันธุ์ CC-4348 (sta6 mutant), CC-4349 ผนังเซลล์ – ไม่ (ตามน้ำหนักจริง) ต้องใช้ purported เพื่อแสดงสายพันธุ์ STA6 โดยผู้ปกครอง และสามอิสระ STA6 สายพันธุ์สร้างขึ้น โดย complementation sta6 (CC-4565/STA6-C2, CC-4566/STA6-C4 และ CC-4567/STA6-C6) ในบริบทของมา N แม้ N – เกิดความอดอยากอย่างปรับปรุงของการ transcriptome มีค่อนข้างน้อยความแตกต่าง (5 × 102) สังเกตระหว่าง sta6 และ STA6 แตกต่างอย่างมากที่ได้เพิ่มขึ้นมากมายใบแสดงผลการเข้ารหัสคีย์ควบคุม หรือ จำกัดอัตราขั้นตอนเผาผลาญคาร์บอนกลาง โดยเฉพาะ isocitrate lyase, synthase มาลา transaldolase ฟรักโทส phosphoenolpyruvate และ bisphosphatase carboxykinase (การเข้ารหัส โดย ICL1, MAS1, TAL1, FBP1 และ PCK1 ตามลำดับ) ชี้นำของขบวนการเพิ่มคาร์บอนต่อเฮกโซสฟอสเฟตใน sta6 โดย upregulation glyoxylate ทางเดินและการสร้างกลูโคส

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เพื่อให้เข้าใจถึงพื้นฐานโมเลกุลพื้นฐานเพิ่มขึ้น triacylglycerol (TAG) สะสมใน starchless (STA) Chlamydomonas กลายพันธุ์ reinhardtii เรามารับ transcriptomics เวลาแน่นอนเปรียบเทียบสายพันธุ์ CC-4348 (กลายพันธุ์ sta6), CC-4349 เป็นผนังเซลล์ขาด (CW) สายพันธุ์ที่อ้างว่าเป็นตัวแทนของสายพันธุ์ของพ่อแม่ STA6 และสามสายพันธุ์ STA6 อิสระที่สร้างขึ้นโดย complementation ของ sta6 (CC-4565 / STA6-C2, CC-4566 / STA6-C4 และ CC-4567 / STA6-C6) ในบริบทของ N deprivati​​on.Despite ไม่มีการเปลี่ยนแปลงความอดอยากที่เกิดขึ้นอย่างมากของยีนที่มีความแตกต่างกันค่อนข้างไม่กี่คน (5 × 102) สังเกตระหว่าง sta6 STA6 และที่น่าทึ่งที่สุดที่เพิ่มขึ้นความอุดมสมบูรณ์ของยีนที่ควบคุมการเข้ารหัสที่สำคัญหรือขั้นตอนการ จำกัด อัตราการคาร์บอนกลาง การเผาผลาญโดยเฉพาะไอเลส isocitrate, เทส malate, transaldolase, bisphosphatase ฟรุกโตสและ phosphoenolpyruvate carboxykinase (เข้ารหัสโดย ICL1, MAS1, TAL1, FBP1 และ PCK1 ตามลำดับ) การชี้นำการเคลื่อนไหวของคาร์บอนที่เพิ่มขึ้นต่อ hexose ฟอสเฟตใน sta6 โดย upregulation ของทางเดิน glyoxylate และ gluconeogenesis

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เพื่อให้เข้าใจพื้นฐานระดับโมเลกุลพื้นฐานเพิ่มขึ้น triacylglycerol ( Tag ) ที่สะสมใน starchless ( STA ) คลาไมโดโมแนส reinhardtii พันธ์เรา undertook ทราน ริปโตมิกแน่นอนเวลาเปรียบเทียบสายพันธุ์ cc-4348 ( sta6 กลายพันธุ์ ) cc-4349 , เซลล์ผนัง–บกพร่อง ( CW ) ซึ่งอ้างว่าเป็นตัวแทนของผู้ปกครอง sta6 สายพันธุ์และสามอิสระ sta6 สายพันธุ์ที่สร้างขึ้นโดยเอนไซม์ของ sta6 ( cc-4565 / sta6-c2 cc-4566 / sta6-c4 , และ cc-4567 / sta6-c6 ) ในบริบทของการ แม้จะมีการเปลี่ยนแปลง N ความอดอยากและน่าทึ่งของทราน ริปโตมมีความแตกต่างกันค่อนข้างน้อย ( 5 × 102 ) สังเกต และ sta6 ระหว่าง sta6 ,ที่น่าทึ่งที่สุดที่เพิ่มขึ้นมากมายถึงคีย์ควบคุมหรือจำกัดขั้นตอนการเข้ารหัสอัตราเมแทบอลิซึมคาร์บอนกลาง โดยเฉพาะไอโซซิเตรต lyase , malate synthase transaldolase bisphosphatase , , ฟรุคโตส และฟอสโฟอีนอลไพรูเวต carboxykinase ( เข้ารหัสโดย icl1 mas1 tal1 fbp1 , , , , และ pck1 ตามลำดับ )ร่องรอยของคาร์บอนต่อเฮกโซสฟอสเฟตเพิ่มการเคลื่อนไหวใน sta6 ของทฤษฎีบทเวียนบังเกิดโดยระหว่างเส้นทาง และกลูโคนีโอเจเนซิส .