Conclusions. Community analysis by

Conclusions. Community analysis by T-RFLP of 16S rRNA
genes proved to be a highly suitable and sensitive tool with
which to investigate the microbial community structures in
different particle size fractions and treatments. Three normalized
replicate samples of each fraction and treatment showed
comparable population profiles and grouped well in a cluster
analysis. Quantitative T-RFLP analysis has to be treated with
caution due to biases inherent to PCR amplification (53) and
variations in the copy number of the 16S rRNA gene in different
bacterial species (8). However, with awareness of these
limitations, T-RFLP analysis can be used for a semiquantitative
analysis of bacterial community structures (12, 47). In this
experiment, the microbial composition was mainly affected by
the particle size fraction and did respond to a lesser extent to
organic amendments. Therefore, our results demonstrate specific
microbe-particle associations that are affected to a smaller
extent by external factors such as fertilization or heavy metal
pollution (32). Knowledge of the microbial community structure
represents a first step toward understanding soil function
in response to the environment. In addition to community
structure, the analysis of functional genes within a given population
will greatly increase our comprehension of the role of
bacteria in soil processes important for geochemical dynamics
of elements, specifically carbon, nitrogen, and sulfur.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทสรุปของการ วิเคราะห์ชุมชน โดย T-RFLP ของ 16S rRNAยีนที่พิสูจน์แล้วว่าเป็นเครื่องมือที่เหมาะสม และสำคัญมากด้วยซึ่งการตรวจสอบโครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์ในเศษส่วนขนาดอนุภาคแตกต่างกันและการรักษา สามตามปกติจำลองตัวอย่างของแต่ละส่วนและแสดงให้เห็นว่าการรักษาประชากรเทียบโปรไฟล์ และจัดกลุ่มกันในคลัสเตอร์วิเคราะห์ มีการวิเคราะห์ T RFLP เชิงปริมาณได้รับข้อควรระวังเนื่องจากโดยธรรมชาติการขยาย PCR (53) ยอม และในจำนวนสำเนาของยีนใน rRNA 16S ในต่างแบคทีเรียสายพันธุ์ (8) อย่างไรก็ตาม ด้วยความรู้เหล่านี้สามารถใช้ข้อจำกัด การวิเคราะห์ T RFLP สำหรับแบบ semiquantitativeการวิเคราะห์โครงสร้างชุมชนจากแบคทีเรีย (12, 47) ในที่นี้ทดลอง องค์ประกอบจุลินทรีย์เป็นส่วนใหญ่ได้รับผลกระทบโดยเศษส่วนขนาดอนุภาค และไม่ตอบสนองต่อขอบเขตน้อยไปแก้ไขอินทรีย์ ดังนั้น ผลของเราแสดงให้เห็นถึงการความสัมพันธ์ของ microbe อนุภาคที่ได้รับผลกระทบจะมีขนาดเล็กขอบเขต โดยปัจจัยภายนอกเช่นการปฏิสนธิหรือโลหะหนักมลพิษ (32) ความรู้โครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์แสดงขั้นตอนการทำความเข้าใจฟังก์ชันดินที่แรกในการตอบสนองต่อสิ่งแวดล้อม นอกจากชุมชนโครงสร้าง การวิเคราะห์ยีนทำงานภายในกำหนดประชากรจะช่วยเพิ่มความเข้าใจของเราของบทบาทของแบคทีเรียในดินกระบวนการสำคัญสำหรับ geochemical dynamicsองค์ประกอบ เฉพาะคาร์บอน ไนโตรเจน และซัลเฟอร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สรุปผลการวิจัย การวิเคราะห์ชุมชนโดย T-RFLP ของ 16S rRNA
ยีนพิสูจน์แล้วว่าเป็นเครื่องมือที่เหมาะและมีความสำคัญกับการที่จะตรวจสอบโครงสร้างกลุ่มจุลินทรีย์ในเศษส่วนขนาดอนุภาคที่แตกต่างกันและการรักษา สามปกติตัวอย่างซ้ำของแต่ละส่วนและการรักษาแสดงให้เห็นโปรไฟล์ประชากรเทียบเท่าและจัดกลุ่มกันในคลัสเตอร์การวิเคราะห์ การวิเคราะห์เชิงปริมาณ T-RFLP จะต้องมีการรับการรักษาด้วยความระมัดระวังเนื่องจากการอคติโดยธรรมชาติเพื่อขยายPCR (53) และรูปแบบในจำนวนสำเนาของ16S rRNA ยีนที่แตกต่างกันในสายพันธุ์ของเชื้อแบคทีเรีย(8) แต่ด้วยความตระหนักของเหล่านี้มีข้อ จำกัด การวิเคราะห์ T-RFLP สามารถนำมาใช้สำหรับเชิงกึ่งปริมาณการวิเคราะห์โครงสร้างชุมชนแบคทีเรีย(12 47) ในการนี้การทดลององค์ประกอบของจุลินทรีย์ได้รับผลกระทบส่วนใหญ่โดยส่วนขนาดอนุภาคและไม่ตอบสนองต่อระดับที่น้อยกว่าที่จะแก้ไขอินทรีย์ ดังนั้นผลของเราแสดงให้เห็นถึงเฉพาะความสัมพันธ์ของจุลินทรีย์อนุภาคที่ได้รับผลกระทบที่จะมีขนาดเล็กในระดับจากปัจจัยภายนอกเช่นการปฏิสนธิหรือโลหะหนักมลพิษ(32) ความรู้เกี่ยวกับโครงสร้างกลุ่มจุลินทรีย์เป็นขั้นตอนแรกในการทำความเข้าใจการทำงานของดินในการตอบสนองต่อสภาพแวดล้อม นอกเหนือไปจากชุมชนของโครงสร้างการวิเคราะห์การทำงานของยีนที่อยู่ในประชากรที่ได้รับจะช่วยเพิ่มความเข้าใจของเราในบทบาทของแบคทีเรียในดินประมวลผลที่สำคัญสำหรับการเปลี่ยนแปลงธรณีเคมีของธาตุคาร์บอนโดยเฉพาะไนโตรเจนและกำมะถัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สรุป การวิเคราะห์ชุมชนโดย t-rflp ของ 16S rRNA
ยีนพิสูจน์แล้วว่าเป็นเครื่องมือที่ละเอียดอ่อนและสูงเหมาะกับ
ซึ่งศึกษาโครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์ใน
เศษส่วนขนาดอนุภาคที่แตกต่างกันและการรักษา สามรูป
เลียนแบบตัวอย่างของแต่ละส่วนและการรักษาพบว่า
โปรไฟล์ประชากรเทียบเท่า และจัดกลุ่มในการวิเคราะห์กลุ่ม

การวิเคราะห์เชิงปริมาณ t-rflp ได้ต้องปฏิบัติด้วยความระมัดระวังเนื่องจากอคติ
ในการขยาย PCR ( 53 ) และ
การเปลี่ยนแปลงจำนวนสำเนาของเบส 16S rRNA ยีนในแบคทีเรียชนิดที่แตกต่างกัน
( 8 ) อย่างไรก็ตาม ด้วยตระหนักถึงข้อ จำกัด เหล่านี้
, การวิเคราะห์ t-rflp สามารถใช้สำหรับการวิเคราะห์ย้อนหลัง
โครงสร้างชุมชนแบคทีเรีย ( 12 , 47 ) ในการทดลองนี้
,องค์ประกอบของจุลินทรีย์ส่วนใหญ่ที่ได้รับผลกระทบ โดย
ขนาดอนุภาคเศษส่วนและไม่ตอบสนองในระดับที่น้อยกว่า

แก้ไขอินทรีย์ ดังนั้น ผลของเราแสดงเฉพาะ
จุลินทรีย์ของอนุภาคสมาคมที่ได้รับผลกระทบในขอบเขตที่เล็กลงจากปัจจัยภายนอก เช่น การใส่ปุ๋ย

โลหะหนักหรือมลพิษ ( 32 ) ความรู้เกี่ยวกับโครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์
เป็นขั้นตอนแรกที่มีต่อความเข้าใจ หน้าที่ดิน
ในการตอบสนองต่อสิ่งแวดล้อม นอกจากโครงสร้างชุมชน
, การวิเคราะห์การทำงานของยีนภายในให้ประชากร
จะช่วยเพิ่มความเข้าใจของเราของบทบาทของแบคทีเรียในดินที่สำคัญ

ถึงกระบวนการเปลี่ยนแปลงองค์ประกอบเฉพาะ คาร์บอน ไนโตรเจน และกำมะถัน