the alternative bulk (Mackay and Ca

the alternative bulk (Mackay and Caligari 2000).
Further saturation of cassava genome with more
markers, most especially the SNP markers being
currently developed and validated may therefore lead
to detection of QTLs linked to EB in the three
populations as well as detection of more linked QTLs
in the remaining six populations.
Collard et al. (2005) stated that QTLs accounting for
more than 10 %of phenotypic variation (R2) are major
QTLs. In this study, seven of the nine QTLs to which
the markers are linked explained for 16 % or more of
the phenotypic variation indicating that the seven
markers are linked to major QTLs associated with EB
in cassava. As noted in earlier study by Gomez et al.
(2009), BSA also allowed identification of QTLs
linked to EB in cassava by allowing analysis in absence
of a linkage map and by reducing the effort required to
identify linkage of the markers with EB in this study.
Five SSR markers identified in this study were
found on the existing cassava genomic map (a genetic
linkage map of a cassava backcross based on a B1P2
family and SSR markers) (Akinbo 2008) and are in the
same region of QTLs identified by Okogbenin (2004)
in his study. Also, two of the nine markers (SSRY 250
and ESTs[SSRY 47]) are on linkage group 7 while
SSRY 63, SSRY 106 and SSRY 239 are on linkage
groups 8, 12 and 19, respectively. The remaining four
markers are yet to be placed on any existing cassava
genomic map. The different locations of the identified
QTLs (as indicated by the linkage groups on which the
associated markers are located) on the cassava genetic
map is indicative of the polygenic nature of the trait
studied as also observed by Okogbenin (2004).
Higher correlation coefficients were observed
between the genotypic and phenotypic data at bulk
opening stage than what was observed when the
candidate markers were tested among other genotypes
in each population. This indicates that there was more
noise among the remaining genotypes which lied
between the two extremes (contrasting bulks) in the
rank based on fresh root yield and other traits
associated with EB in each population. The fact that
Table 7 Correlation and
regression coefficients
between candidate markers
used for marker-assisted
selection and fresh root
yield (t/ha) of individuals in
each population
Population Molecular
marker
Correlation
coefficients at bulk
opening stage
Percent
variation
explained
Correlation between genotypic
and phenotypic data during
MAS
COB1 SSRY250 0.3 7.5 0.26
COB3 NS323 0.3 9.1 0.35
SSRY106 0.4 18.1 -0.02
COB6 ESTs 292 0.4 16.0 -0.24
SSRY 239 0.5 20.8 0.26
COB7 ESTs 7 0.5 24.2 -0.16
COB8 NS 194 0.4 17.0 0.19
ESTs 47 0.4 18.5 -0.10
COB9 SSRY 63 0.5 24.0 0.15
EARLY LATE
P1
P2
COB-6-1
COB-6-3
COB-6-4
COB-6-6
COB-6-10
COB-6-31
COB-6-41
COB-6-48
COB-6-51
COB-6-66
COB-6-2
COB-6-5
COB-6-7
COB-6-20
COB-6-23
COB-6-46
COB-6-63
EB
LB
F1 Individuals
Fig. 1 Polyacrylamide electrophoresis gel showing bands of
individuals in the contrasting bulks of population COB-6, and
their parents using molecular marker SSRY239. P1 TMS97/
2205, P2 NR 8083, EB Early bulking pool, LB Late bulking
pool, Early early bulking individuals, Late Late bulking
individuals
242 Euphytica (2014) 195:235–244
123

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

กลุ่มอื่น (แมคเคย์และ Caligari 2000)เพิ่มเติมความเข้มของกลุ่มมันสำปะหลังมีมากขึ้นเครื่องหมาย เครื่องหมาย SNP โดยเฉพาะอย่างยิ่งการปัจจุบันได้รับการพัฒนา และตรวจสอบอาจนำดังนั้นการตรวจสอบของ QTLs กับ EB ในสามประชากรรวมทั้งตรวจ QTLs ที่เชื่อมโยงมากขึ้นในประชากร 6 ที่เหลือCollard et al. (2005) ระบุที่ QTLs บัญชีสำหรับกว่า 10% ของไทป์ (R2) เป็นหลักQTLs ในการศึกษานี้ เจ็ด QTLs เก้าที่เครื่องหมายเชื่อมโยง explained 16% หรือมากกว่าไทป์ที่แสดงที่เจ็ดเครื่องหมายเชื่อมโยงกับ QTLs ที่สำคัญเกี่ยวข้องกับ EBในมันสำปะหลัง เป็นตามในก่อนหน้านี้ศึกษาโดยเมซ et al(2009), บีเอสเอยังอนุญาตให้ใช้รหัสของ QTLsเชื่อมโยงกับ EB ในมันสำปะหลัง โดยให้วิเคราะห์ในการขาดงานแผนที่เชื่อมโยง และลดความพยายามที่ต้องการระบุความเชื่อมโยงของเครื่องหมาย ด้วย EB ในการศึกษานี้เครื่องหมาย SSR 5 ที่ระบุในการศึกษานี้ได้พบแผนที่ที่มีอยู่มันสำปะหลัง genomic (แบบทางพันธุกรรมแผนที่เชื่อมโยงการไหม้มันสำปะหลังตาม B1P2ครอบครัวและเครื่องหมาย SSR) (Akinbo 2008) และในการตนของ QTLs ที่ระบุ โดย Okogbenin (2004)ในการศึกษาของเขา ยัง สองเครื่องหมาย 9 (SSRY 250และ ESTs [SSRY 47]) อยู่ในกลุ่มการเชื่อมโยง 7 ในขณะที่SSRY 63, SSRY 106 และ SSRY 239 อยู่บนความเชื่อมโยงกลุ่ม 8, 12 และ 19 ตามลำดับ สี่ที่เหลือเครื่องหมายยังสามารถวางในมันสำปะหลังที่มีอยู่ใด ๆแผนที่ genomic ตำแหน่งต่าง ๆ ของการระบุQTLs (ตามที่ระบุ โดยกลุ่มเชื่อมโยงซึ่งการเครื่องหมายที่เกี่ยวข้องอยู่) ในมันสำปะหลังพันธุกรรมแผนที่จะส่อลักษณะ polygenic ของการติดศึกษาสังเกตเป็นยัง โดย Okogbenin (2004)ค่าสัมประสิทธิ์สหสัมพันธ์สูงสุภัคระหว่างข้อมูลไทป์ และจีโนไทป์ที่จำนวนมากเปิดเวทีกว่าสิ่งที่สังเกตเมื่อการเครื่องหมายผู้สมัครทดสอบระหว่างศึกษาจีโนไทป์อื่น ๆในแต่ละประชากร บ่งชี้ว่า มีเพิ่มเติมเสียงระหว่างการศึกษาจีโนไทป์ที่เหลือที่โกหกระหว่างสุดสอง (ห้อง bulks) ในการตำแหน่งตามผลผลิตรากสดและลักษณะอื่น ๆเกี่ยวข้องกับ EB ในประชากรแต่ละ ความจริงที่ตาราง 7 ความสัมพันธ์ และสัมประสิทธิ์ถดถอยระหว่างเครื่องหมายผู้สมัครใช้เครื่องช่วยเลือกและรากสดผลตอบแทน (t/ฮา) ของแต่ละบุคคลประชากรแต่ละประชากรระดับโมเลกุลเครื่องหมายความสัมพันธ์ของสัมประสิทธิ์ที่จำนวนมากเปิดเวทีเปอร์เซ็นต์การเปลี่ยนแปลงอธิบายความสัมพันธ์ระหว่างจีโนไทป์และข้อมูลไทป์ในระหว่างมาสCOB1 SSRY250 0.3 7.5 0.26COB3 NS323 0.3 9.1 0.35SSRY106 0.4 18.1-0.02COB6 ESTs 292 0.4 16.0-0.24SSRY 239 0.5 20.8 0.26COB7 ESTs 7 0.5 24.2-0.16COB8 NS 194 0.4 17.0 0.19ESTs 47 0.4 18.5-0.10COB9 SSRY 63 0.5 24.0 0.15ต้นสายP1P 2COB-6-1COB-6-3COB-6-4COB-6-6COB-6-10COB-6-31COB-6-41COB-6-48COB-6-51COB-6-66COB-6-2COB-6-5COB-6-7COB-6-20COB-6-23COB-6-46COB-6-63EBปอนด์บุคคล F1Fig. 1 Polyacrylamide electrophoresis เจแสดงแถบของบุคคลใน bulks แตกต่างกันของประชากร COB-6 และปกครองโดยใช้โมเลกุลเครื่องหมาย SSRY239 P1 TMS97 /2205, p 2 NR 8083, EB ก่อนเปรียบเทียบสระว่ายน้ำ ปอนด์สายเปรียบเทียบสายเคยช่วงแรก ๆ การเปรียบเทียบบุคคล สาย สระว่ายน้ำแต่ละบุคคล195:235 Euphytica (2014) 242-244123

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

กลุ่มทางเลือก ( และไอ caligari 2000 ) .
ความอิ่มเพิ่มเติมของจีโนมมันสำปะหลังกับเครื่องหมายมากกว่า

เครื่องหมาย SNP ส่วนใหญ่โดยเฉพาะการพัฒนาในปัจจุบันและตรวจสอบ ดังนั้นจึงอาจนำไปสู่การตรวจหายีนที่เชื่อมโยงกับ
3
EB ในประชากร รวมทั้งการตรวจหายีนที่เชื่อมโยงมากขึ้นในอีกหก

ตามจำนวนประชากร ผู้สื่อข่าว et al . ( 2548 ) ระบุว่า บัญชีสำหรับ
รับผิดชอบมากกว่า 10% ของการเปลี่ยนแปลงฟีโนไทป์ ( R2 ) เป็นยีนหลัก

ในการศึกษานี้ เจ็ดเก้า รับผิดชอบ ซึ่ง
เครื่องหมายเชื่อมโยงอธิบายสำหรับ 16 % หรือมากกว่าของฟีโนไทป์เปลี่ยนแปลงแสดงว่า
7
เครื่องหมายเชื่อมโยงกับยีนหลักที่เกี่ยวข้องกับ EB
ในมันสำปะหลัง ตามที่ระบุไว้ก่อนหน้านี้การศึกษาโดย Gomez et al .
( 2009 ) , ( ไม่ได้ระบุตำแหน่ง
เชื่อมโยงไปยัง EB ในมันสำปะหลัง โดยให้วิเคราะห์ในขาด
ของการเชื่อมโยงแผนที่และโดยการลดความพยายามต้อง
ระบุการเชื่อมโยงเครื่องหมายกับ EB ในการศึกษา .
5 เครื่องหมาย SSR ระบุในการศึกษาครั้งนี้พบว่าในจีโนมมันสำปะหลัง
ที่มีอยู่แผนที่ ( แผนที่พันธุกรรม
เชื่อมโยงมันสำปะหลัง ( ขึ้นอยู่กับ ครอบครัวและ b1p2
เครื่องหมาย SSR ) ( akinbo 2008 ) และอยู่ใน
พื้นที่รับผิดชอบ โดยระบุ okogbenin เดียวกัน ( 2004 )
ในการศึกษาของเขา และอีกสองในเก้าเครื่องหมาย ( ssry 250
[ 47 ] และ ฐานข้อมูล ssry ) ในการเชื่อมโยงกลุ่ม 7 ในขณะที่
ssry 63 , ssry 106 และ ssry 239 ในการเชื่อมโยง
กลุ่ม 8 , 12 และ 19 ตามลำดับ เหลือสี่
เครื่องหมายจะยังถูกวางไว้บนจีโนมมันสำปะหลัง
ที่มีอยู่ใด ๆ แผนที่ สถานที่ที่แตกต่างกันในการระบุ
ตำแหน่ง ( แสดงโดยเชื่อมโยงกลุ่มที่
เกี่ยวข้องเครื่องหมายอยู่ในมันสำปะหลังพันธุ
แผนที่บ่งบอกถึงธรรมชาติของสันดาน
polygenic ศึกษายังพบโดย okogbenin ( 2004 ) พบว่าค่าสัมประสิทธิ์สหสัมพันธ์

สูงระหว่างผู้ป่วยและข้อมูลฟีโนไทป์ที่เปิดเวทีเป็นกลุ่ม
กว่าอะไร สังเกตเมื่อ
เครื่องหมายของผู้สมัครทดสอบ
พันธุ์อื่น ๆ ในแต่ละประชากร นี้บ่งชี้ว่ามีมากกว่านี้
เสียงระหว่างที่เหลือพันธุ์ซึ่งโกหก
ระหว่างสองขั้ว ( ตัดกันใน bulks )
อันดับขึ้นอยู่กับผลผลิตหัวสดและคุณลักษณะอื่น ๆที่เกี่ยวข้องกับ EB
ในแต่ละประชากร ความจริงที่โต๊ะ 7
)


ระหว่างผู้สมัครเครื่องหมายสัมประสิทธิ์ถดถอยใช้ดีเอ็นเอเครื่องหมายช่วยเลือกและผลผลิตสด

( t / ฮา ) ของบุคคลในแต่ละกลุ่มประชากร




) โดยเครื่องหมายโมเลกุลที่เป็นกลุ่ม



เปิดเวทีและการเปลี่ยนแปลงความสัมพันธ์ระหว่างผู้ป่วยและอธิบาย



cob1 ข้อมูลฟีโนไทป์ใน Mas ssry250 0.3 7.5 ,
cob3 ns323 0.3 ก่อน ssry106 0.4 และ 0.02 0.35
-
cob6 ฐานข้อมูล 292 0.4 16.0 - 0.24

ssry 239 , 0.5 ล.cob7 ฐานข้อมูล 7 0.5 24.2 - 0.16
cob8 NS 194 0.4 ร้อยละ 0.19
ฐานข้อมูล 47 0.4 18.5 - 0.10
cob9 ssry 63 0.5 24.0 0.15

P1 P2

ต้นสาย cob-6-1 cob-6-3




cob-6-4 cob-6-6 cob-6-10 cob-6-31



cob-6-41 cob-6-48 cob-6-51 cob-6-66 cob-6-2




cob-6-5 cob-6-7 cob-6-20 cob-6-23


cob-6-46 cob-6-63 EB


รูปที่ 1 ปอนด์ F1 บุคคลอะคริลาไมด์เจลอิเล็กแสดงแถบ
บุคคลในด้าน cob-6 bulks ของประชากร และการใช้ ssry239
พ่อแม่เครื่องหมายโมเลกุล tms97 /
0 P1 , P2 ( 8083 EB ต้น bulking น้ําปอนด์สายพะรุงพะรัง
น้ําเช้าตรู่ bulking บุคคลสายพะรุงพะรัง

242 บุคคล euphytica ( 2014 ) 195:235 – 244
123