3.4. Phenotyping
Phenotyping strategies allocate resources to collect the
phenotypes. The number of phenotypes that can be
collected in breeding schemes is often limited by the same
two reasons as genotyping. First, there are not the
resources to phenotype all animals for the traits in the
total-merit index. These resources not only include costs,
but also our capacity to measure well-defined phenotypes.
Second, there are diminishing marginal returns as more
resources are allocated to phenotyping (Hayes et al.,
2009b; Okeno et al., in press). Diminishing marginal
returns become more pronounced when a priori information,
often in the form of genotypings and pedigree
information, is available. When this information is available,
animals can be phenotyped based on criteria that
include genetic merit and genetic relationships. In addition
to these two limitations, phenotyping strategies can have
the added constraint that only some animals can be
phenotyped for all traits in the total-merit index. Some
traits, including sex-specific traits, may not be expressed
by all animals, while other traits, such as slaughter traits
and longevity, cannot be phenotyped on the same individuals
for logistical reasons. This constraint complicates
breeding schemes that use genomic information because it
leads to multiple reference populations and selection
candidates that are only phenotyped for some, if any, of
the index traits. Clearly, phenotyping strategies are vital
for breeding schemes using genomic information.
The limitations and constraints to phenotyping bring
about three interrelated trade-offs that phenotyping strategies
need to tackle. First, a trade-off can exist between
traits. Allocating resources to phenotype animals for a trait
M. Henryon et al. / Livestock Science 166 (2014) 38–47 41
in the total-merit index leaves fewer resources to phenotype
the remaining index traits. Second, a trade-off can
exist within traits when allocating phenotypes to selection
candidates and reference animals. This trade-off resembles
those for genotyping with the exception that phenotypes
are not used to constrain parental relationships. Third,
a trade-off can exist between animals for those traits that
cannot be phenotyped on the same individual for logistical
reasons. Phenotyping animals for one, or some, of these
traits leave fewer animals that can be phenotyped for the
other traits. With these trade-offs operating, it was not
surprising that Okeno et al. (in press) realised different
rates of genetic gain by simply changing the criterion used
to allocate phenotypings to individuals in a simulated
breeding scheme. Therefore, in any breeding scheme, there
is an allocation of available phenotypings that maximises
long-term genetic gain. As for genotyping strategies,
schemes with ad hoc phenotyping strategies are probably
not maximising long-term genetic gains.
3.4 phenotyping
กลยุทธ์ phenotyping จัดสรรทรัพยากรในการเก็บรวบรวม
phenotypes จำนวน phenotypes
ที่สามารถเก็บในรูปแบบการเพาะพันธุ์จะถูกจำกัด
โดยมักจะเหมือนกันด้วยเหตุผลสองประการเป็นgenotyping แรกมีไม่ได้เป็นทรัพยากรที่จะฟีโนไทป์สัตว์ทุกลักษณะในดัชนีรวมบุญ ทรัพยากรเหล่านี้ไม่เพียง แต่รวมค่าใช้จ่าย, แต่ยังความสามารถของเราในการวัด phenotypes ที่ดีที่กำหนด. ประการที่สองมีผลตอบแทนลดลงเล็กน้อยเป็นมากกว่าทรัพยากรที่จัดสรรให้ phenotyping (เฮย์ส, et al. 2009b. Okeno, et al, ในการกด) ลดลงเล็กน้อยผลตอบแทนที่กลายเป็นเด่นชัดมากขึ้นเมื่อมีข้อมูลเบื้องต้น, มักจะอยู่ในรูปแบบของ genotypings และสายเลือดข้อมูลที่มีอยู่ เมื่อได้รับข้อมูลนี้สามารถใช้ได้, สัตว์สามารถ phenotyped ตามเกณฑ์ที่รวมถึงการทำบุญทางพันธุกรรมและความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม นอกจากนี้ทั้งสองข้อ จำกัด กลยุทธ์ phenotyping สามารถมีข้อจำกัด เพิ่มว่ามีเพียงสัตว์บางชนิดสามารถphenotyped สำหรับทุกลักษณะในดัชนีรวมบุญ บางลักษณะรวมทั้งลักษณะทางเพศที่เฉพาะเจาะจงอาจจะไม่ได้แสดงออกโดยสัตว์ทั้งหมดในขณะที่ลักษณะอื่นๆ เช่นลักษณะการฆ่าและยืนยาวไม่สามารถphenotyped กับบุคคลเดียวกันด้วยเหตุผลจิสติกส์ ข้อ จำกัด นี้มีความซับซ้อนแผนการเพาะพันธุ์ที่ใช้ข้อมูลจีโนมเพราะมันจะนำไปสู่การอ้างอิงหลายประชากรและการเลือกผู้สมัครที่ได้รับการphenotyped เฉพาะสำหรับบางคนถ้ามีลักษณะดัชนี เห็นได้ชัดว่ากลยุทธ์ phenotyping มีความสำคัญสำหรับแผนการปรับปรุงพันธุ์โดยใช้ข้อมูลจีโนม. ข้อ จำกัด และข้อ จำกัด ที่จะนำมา phenotyping ประมาณสามความสัมพันธ์ทางการค้าที่ไม่ชอบว่ากลยุทธ์ phenotyping ต้องการที่จะแก้ไขปัญหา ประการแรกการออกสามารถอยู่ระหว่างลักษณะ การจัดสรรทรัพยากรสัตว์ฟีโนไทป์สำหรับลักษณะเมตร Henryon et al, ปศุสัตว์ / วิทยาศาสตร์ 166 (2014) 38-47 41 ในดัชนีรวมบุญใบทรัพยากรน้อยลงไปยังฟีโนไทป์ลักษณะดัชนีที่เหลือ ประการที่สองการออกสามารถอยู่ในลักษณะการจัดสรรเมื่อ phenotypes การเลือกผู้สมัครและสัตว์อ้างอิง การปิดนี้คล้ายกับที่สำหรับ genotyping ยกเว้นว่า phenotypes ไม่ได้นำมาใช้เพื่อ จำกัด ความสัมพันธ์ของผู้ปกครอง ประการที่สามการออกสามารถอยู่ระหว่างสัตว์ลักษณะที่ไม่สามารถphenotyped ในแต่ละเดียวกันสำหรับจิสติกส์ด้วยเหตุผล phenotyping สัตว์สำหรับหนึ่งหรือบางส่วนของเหล่านี้ลักษณะปล่อยให้สัตว์น้อยที่สามารถphenotyped สำหรับลักษณะอื่นๆ เหล่านี้ไม่ชอบการค้าการดำเนินงานมันก็ไม่น่าแปลกใจที่ Okeno et al, (ในข่าว) ตระหนักถึงความแตกต่างของอัตรากำไรทางพันธุกรรมโดยเพียงแค่การเปลี่ยนเกณฑ์ที่ใช้ในการจัดสรรphenotypings ให้กับประชาชนในการจำลองรูปแบบการเพาะพันธุ์ ดังนั้นในโครงการเพาะพันธุ์ใด ๆ ที่มีคือการจัดสรรphenotypings ใช้ได้ที่เพิ่มกำไรทางพันธุกรรมในระยะยาว สำหรับกลยุทธ์ genotyping, แผนกับเฉพาะกิจกลยุทธ์ phenotyping อาจจะไม่ได้การเพิ่มระยะยาวกำไรทางพันธุกรรม
การแปล กรุณารอสักครู่..