Smoothed FPCAWe first review the de

Smoothed FPCA

We first review the definition of genetic variant profiles.18 Let t be the position of a genetic variant within a genomic region and T be the length of the genomic region being considered. For convenience, we rescale the region [0,T] to [0,1]. Because the density of genetic variants is high, we can view t as a continuous variable in the interval [0,1]. Assume that nA cases and nG controls are sampled and sequenced. We define the genotype of the ith case as

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

FPCA ให้โค้งเรียบก่อนทบทวนนิยามของ t profiles.18 ตัวแปรทางพันธุกรรมให้เป็นตำแหน่งของตัวแปรทางพันธุกรรมภายในภูมิภาค genomic และ T เป็นความยาวของภูมิภาค genomic ที่กำลังพิจารณา เพื่อความสะดวก เรา rescale ภูมิภาค [0, T] [0,1] เนื่องจากความหนาแน่นของตัวแปรทางพันธุกรรมสูง เราสามารถดู t เป็นตัวแปรต่อเนื่องได้ในช่วง [0,1] สมมติว่า กรณีนา nG ควบคุมความ และเรียงลำดับ เรากำหนดลักษณะทางพันธุกรรมของกรณีระยะเป็น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เรียบ FPCA ก่อนอื่นเราทบทวนความหมายของความแตกต่างทางพันธุกรรม profiles.18 เสื้อให้เป็นตำแหน่งของตัวแปรทางพันธุกรรมภายในภูมิภาคจีโนมและ T เป็นความยาวของภูมิภาคจีโนมได้รับการพิจารณา เพื่อความสะดวกของเรา rescale ภูมิภาค [0, T] ไปที่ [0,1] เพราะความหนาแน่นของตัวแปรทางพันธุกรรมที่สูงเราสามารถดูทีเป็นตัวแปรอย่างต่อเนื่องในช่วง [0,1] สมมติว่ากรณี nA และการควบคุม nG เป็นตัวอย่างและติดใจ เรากำหนดจีโนไทป์ของคดี ith เป็น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เรียบ fpca

เราทบทวนนิยามของตัวแปรทางพันธุกรรม profiles.18 ให้ T เป็นตำแหน่งของตัวแปรทางพันธุกรรมภายในภูมิภาคและพันธุกรรมไม่ใช่ความยาวของจีโนมภูมิภาคได้รับการพิจารณา เพื่อความสะดวก เรา rescale ภูมิภาค [ 0 t ] [ 0.1 ] เพราะความหนาแน่นของตัวแปรทางพันธุกรรมสูง เราสามารถมองเห็น T เป็นตัวแปรอย่างต่อเนื่องในช่วงเวลา [ 0.1 ]สมมติว่า นา และกรณีของการควบคุมและตัวอย่างนี้ เรากำหนดทางพันธุกรรมของคดีอ.