The CYP2A6*4 allele, characterized

The CYP2A6*4 allele, characterized as the whole deletion of this gene, is closely associated with nicotine dependence, cancer susceptibility, and drug responsiveness. It has long been a significant challenge for pharmacogenetics scientists to develop a reliable method to detect this molecular variant due to its high homology with its homologous genes CYP2A6 and CYP2A3 in the clinical setting. Here, we introduce a quantitative real-time PCR assay that specifically amplifies CYP2A6 by designing a specific set of primers and the probe, which effectively prevent the amplification of the CYP2A7 and CYP2A13 alleles. CYP2A6 gene copy numbers were normalized to albumin (ALB) which was co-amplified simultaneously in a single-tube duplex reaction and at a setting as the internal reference gene. The established assay was validated with a selection of previously genotyped DNA samples, which harbored none, one or two CYP2A6 gene copies. The results were in complete concordance with previously published data and no overlap between the three groups was observed. Further analysis of a cohort of 120 samples revealed high specificity and sensitivity of this assay as demonstrated by the agreement of determined gene copy numbers in all of the cases. In conclusion, this novel assay allows reliable and sensitive detection of the CYP2A6 gene deletion, which will be useful for pharmacogenetics studies and routine clinical settings.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

CYP2A6 * 4 allele มีลักษณะเป็นการลบทั้งหมดของยีนนี้ มีสัมพันธ์ใกล้ชิดกับนิโคตินพึ่งพา มะเร็งภูมิไวรับ และการตอบสนองของยา มันยาวแล้วความท้าทายที่สำคัญสำหรับนักวิทยาศาสตร์เภสัชพันธุศาสตร์เพื่อพัฒนาวิธีการเชื่อถือได้เพื่อตรวจสอบตัวแปรนี้โมเลกุลเนื่องจากเป็น homology สูงกับยีนของ homologous CYP2A6 และ CYP2A3 การทางคลินิก ที่นี่ เราแนะนำตัวเชิงปริมาณแบบเรียลไทม์ PCR assay ที่เฉพาะกำลังโคจรอยู่ CYP2A6 ซึ่ง ด้วยการออกแบบชุดของไพรเมอร์และโพรบ ที่มีประสิทธิภาพป้องกันการขยายของ alleles CYP2A7 และ CYP2A13 เฉพาะ หมายเลขสำเนายีน CYP2A6 ได้ตามปกติให้ albumin (ALB) ซึ่งได้ร่วมขยายพร้อมกัน ในปฏิกิริยาที่สองหลอดเดียว และการตั้งค่าเป็นการอ้างอิงภายในยีน ทดสอบสร้างถูกตรวจสอบ ด้วยการเลือกก่อนหน้านี้ genotyped ดีเอ็นเอตัวอย่าง ที่ harbored ไม่มีหนึ่ง หรือสอง CYP2A6 ย่อย ๆ ก็ในสมบูรณ์สอดคล้องกับข้อมูลที่ประกาศแล้วก่อนหน้านี้ และไม่ทับซ้อนกันระหว่างสามกลุ่มที่สังเกต วิเคราะห์เพิ่มเติมของ cohort 120 อย่างเปิดเผย specificity สูงและความไวของการทดสอบนี้เป็นโดยข้อตกลงจำนวนสำเนายีนกำหนดในทุกกรณี เบียดเบียน วิเคราะห์นวนิยายนี้ได้ตรวจเชื่อถือได้ และที่สำคัญการ CYP2A6 ยีนลบ ซึ่งจะเป็นประโยชน์สำหรับการศึกษาเภสัชพันธุศาสตร์และการตั้งค่าทางคลินิกประจำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

CYP2A6 * 4 อัลลีล, ลักษณะเป็นลบทั้งหมดของยีนนี้มีความเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับการพึ่งพานิโคตินไวต่อโรคมะเร็งและการตอบสนองของยาเสพติด มันมีมานานความท้าทายที่สำคัญสำหรับนักวิทยาศาสตร์ Pharmacogenetics ในการพัฒนาวิธีการที่เชื่อถือในการตรวจสอบความแตกต่างในระดับโมเลกุลนี้เนื่องจากการที่คล้ายคลึงกันสูงที่มีความคล้ายคลึงกันของยีน CYP2A6 และ CYP2A3 ในการตั้งค่าทางคลินิก ที่นี่เราแนะนำแบบ real-time PCR ทดสอบเชิงปริมาณที่เฉพาะขยาย CYP2A6 โดยการออกแบบชุดเฉพาะของไพรเมอร์และการสอบสวนซึ่งมีประสิทธิภาพป้องกันการขยายของอัลลีล CYP2A7 และ CYP2A13 ยีน CYP2A6 ตัวเลขสำเนาถูกนัยอัลบูมิ (ALB) ซึ่งร่วมขยายพร้อมกันในหลอดเดียวปฏิกิริยาเพล็กซ์และการตั้งค่าเป็นยีนอ้างอิงภายใน การทดสอบที่จัดตั้งขึ้นได้รับการตรวจสอบด้วยการเลือก genotyped ก่อนหน้านี้ตัวอย่างดีเอ็นเอซึ่งเก็บงำใครคนหนึ่งหรือสองชุดยีน CYP2A6 ผลการวิจัยพบในสอดคล้องสมบูรณ์ด้วยข้อมูลที่เผยแพร่ก่อนหน้านี้และทับซ้อนกันระหว่างกลุ่มที่สามเป็นที่สังเกต การวิเคราะห์ต่อไปของกลุ่มตัวอย่าง 120 เปิดเผยความจำเพาะสูงและความไวของการทดสอบนี้แสดงให้เห็นว่าตามข้อตกลงของยีนที่กำหนดจำนวนสำเนาในทุกกรณี สรุปได้ว่าการทดสอบนี้จะช่วยให้การตรวจสอบนวนิยายที่เชื่อถือได้และมีความละเอียดอ่อนของการลบยีน CYP2A6 ซึ่งจะเป็นประโยชน์สำหรับการศึกษาและการตั้งค่า Pharmacogenetics ประจำคลินิก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โดย 1.14% * 4 ซึ่งมีลักษณะเป็นการลบทั้งหมดของยีนนี้เป็นอย่างใกล้ชิดที่เกี่ยวข้องกับการเกิดมะเร็ง นิโคติน และการตอบสนองของยา มันมีความท้าทายทางด้านเภสัชพันธุศาสตร์นักวิทยาศาสตร์พัฒนาวิธีที่เชื่อถือได้เพื่อตรวจสอบตัวแปรระดับโมเลกุลนี้เนื่องจากตัวสูงกับโฮโมโลกัสของยีน และ cyp2a3 1.14% ในการตั้งค่าทางคลินิกที่นี่เราแนะนำเชิงปริมาณแบบ PCR assay ที่เฉพาะเจาะจงเพิ่มขึ้น 1.14% โดยการออกแบบชุดเฉพาะของไพรเมอร์และการสอบสวนซึ่งมีประสิทธิภาพป้องกันการเพิ่มปริมาณของ cyp2a7 และ cyp2a13 อัลลีลเป็นปกติที่จะคัดลอกหมายเลข 1.14% ยีนอัลบูมิน ( AL ) ซึ่งบริษัทขยายพร้อมกันในหลอดเดียวและสองปฏิกิริยาในการตั้งค่าเป็นยีนอ้างอิงภายใน ก่อตั้งขึ้นโดยได้รับการตรวจสอบกับการเลือกก่อนหน้านี้ genotyped ดีเอ็นเอ ซึ่งยอมรับไม่มี หนึ่งหรือสอง 1.14% ยีนชุดผลการวิจัยสอดคล้องพร้อมด้วยการตีพิมพ์ก่อนหน้านี้ข้อมูลและไม่ทับซ้อนกันระหว่าง 3 กลุ่ม คือ สังเกต การวิเคราะห์ต่อไปของเพื่อนร่วมงาน 120 ตัวอย่าง พบความจำเพาะสูงและความไวของการทดสอบนี้แสดงให้เห็นโดยสัญญาระบุสำเนาของยีนตัวเลขในทุกกรณี สรุปวิธีใหม่นี้ช่วยให้ความน่าเชื่อถือและไวตรวจจับของยีนลบ 1.14% , ซึ่งจะเป็นประโยชน์สำหรับการศึกษาเภสัชพันธุศาสตร์และการตั้งค่าทางคลินิก
ตามปกติ