Samples from Tunisia comprise incoming raw sewage to WWTPs sampled in three locations between 2011 and 2014. The first location was a WWTP treating water equivalent to 20,000 inhabitants corresponding to three towns in a pre-desert area (very warm in summer and low yearly rainfall) in South Tunisia (WWTP 1) with contribution of waste from tourist facilities. The second and third locations were municipal medium-load WWTP in a metropolitan area in North Tunisia (WWTP 2 and WWTP 3), the origin of its treated influents being domestic. Concerning animal wastewater samples, these were collected from one abattoir slaughtering mostly sheep and to lesser extent cattle (SLH1). SLH samples were collected in two different periods and were considered as two different set of samples. The first one corresponds to samples collected in 2011 (SLH1.1) and the second in 2014 (SLH1.2) (Fig. 1). Samples from Spain comprise incoming raw sewage to a WWTP treating water equivalent to 500,000 inhabitants in the area of Barcelona between 2011 and 2014 and wastewater from farms from different animals (cattle, poultry and pigs), from the same origin and showed similar microbiological contents as previously described The fecal load of the samples studied as measured by the concentration of somatic coliphages (Jebri et al., 2012) was similar for samples from Tunisia and Spain showing fecal loads as reported in the Barcelona area for these types of sample (Muniesa et al., 2012). The samples were collected in sterile conditions, frozen at − 80 °C and stored in dry ice until laboratory analysis. In total, 26 samples were used for total DNA extraction and 28 for DNA extraction from the viral (phage) fraction, followed by quantification by real-time qPCR.
 
ตัวอย่างจากตูนิเซีย ประกอบด้วยวัตถุดิบเพื่อ wwtps สิ่งปฏิกูลเข้ามาเก็บตัวในสถานที่สามระหว่าง 2011 และปี 2014 สถานที่แรกคือ wwtp รักษาน้ำเท่ากับ 20 , 000 คน ที่สอดคล้องกับสามเมืองในพื้นที่ก่อนทะเลทราย ( อุ่นมากในฤดูร้อนปริมาณน้ำฝนรายปีต่ำ ) ในภาคใต้ตูนิเซีย ( wwtp 1 ) กับผลงานของขยะจากนักท่องเที่ยวสิ่งอำนวยความสะดวกสถานที่ที่สองและสาม คือ wwtp โหลดปานกลาง เทศบาล ในเขตภาคเหนือ ตูนิเซีย ( wwtp 2 และ wwtp 3 ) , ต้นกำเนิดของการรักษา influents การภายในประเทศ เกี่ยวกับตัวอย่างน้ำเสีย สัตว์เหล่านี้ถูกรวบรวมจากโรงฆ่าสัตว์ การฆ่าแกะและวัวส่วนใหญ่น้อยกว่าขอบเขต ( slh1 )ตัวอย่างการเก็บรวบรวมฝาก 2 ช่วงเวลาที่แตกต่างกัน และถือว่าเป็นสองชุดที่แตกต่างกันของตัวอย่าง คนแรกที่สอดคล้องกับจำนวนใน 2011 ( slh1.1 ) และครั้งที่สองในปี 2014 ( slh1.2 ) ( รูปที่ 1 ) ตัวอย่างจากสเปนประกอบด้วยสิ่งปฏิกูลเข้ามาดิบเพื่อรักษาน้ำ wwtp เท่ากับ 500 ,000 คน ในพื้นที่ของ บาร์เซโลน่า ระหว่างปี 2554 และปี 2014 และน้ำเสียจากฟาร์มจากสัตว์ต่าง ๆ ( โค สัตว์ปีก และสุกร ) จากแหล่งเดียวกัน และมีเนื้อหาทางจุลชีววิทยาที่คล้ายกันก่อนหน้านี้อธิบายโหลด ) จากกลุ่มตัวอย่างที่ศึกษาเป็นวัดโดยปริมาณโซมาติก coliphages ( jebri et al . ,2012 ) คือคล้ายๆตัวอย่างจาก ตูนิเซีย และสเปนแสดงโหลด ) รายงานว่า ในพื้นที่ บาร์เซโลนา เหล่านี้ประเภทของตัวอย่าง ( muniesa et al . , 2012 ) โดยเก็บตัวอย่างในภาวะปลอดเชื้อ แช่แข็งที่อุณหภูมิ 80 องศา C −และเก็บไว้ในที่แห้งแข็งจนห้องปฏิบัติการวิเคราะห์ ในทั้งหมด 26 ตัวอย่างที่ใช้สำหรับการสกัดดีเอ็นเอทั้งหมดและ 28 สำหรับการสกัดดีเอ็นเอจากไวรัส ( ฟา ) เศษส่วน ,ตามด้วยปริมาณโดย qpcr แบบเรียลไทม์
การแปล กรุณารอสักครู่..
