Trichoderma spp. are a rich source

Trichoderma spp. are a rich source of secondary metabolites (SMs). The recent publication of the
genome sequences of three Trichoderma spp. has revealed a vast repertoire of genes putatively
involved in the biosynthesis of SMs, such as non-ribosomal peptides, polyketides, terpenoids and
pyrones. Interestingly, the genomes of the mycoparasitic species Trichoderma virens and
Trichoderma atroviride are enriched in secondary metabolism-related genes compared with the
biomass-degrading Trichoderma reesei: 18 and 18 polyketide synthases compared with 11; 28
and 16 non-ribosomal peptide synthetases compared with 10, respectively. All three species
produce a special class of non-ribosomally synthesized peptides known as peptaibols, containing
non-proteinogenic amino acids (particularly a-aminoisobutyric acid). In common with other
filamentous ascomycetes, Trichoderma spp. may require siderophores (also produced by nonribosomal
peptide synthetases) to grow in iron-poor conditions and to compete with their hosts
for available iron. Two generalizations can be made about fungal SM genes: they are often found
in clusters, and many are not expressed under standard laboratory conditions. This has made it
difficult to identify the compounds. Trichoderma, in particular, interacts with other microbes in the soil and with plant roots in the rhizosphere. A detailed metabolomic–genomic study would eventually unravel the roles of many of these SMs in natural ecosystems. Novel genetic tools developed recently, combined with biological understanding of the function of SMs as toxins or signals, should lead to ‘awakening’ of these ‘silent’ clusters. Knowledge of the SM repertoire should precede application of Trichoderma strains for biocontrol: some metabolites could be toxic to plants and their consumers, and thus should be avoided. Others could be beneficial, antagonizing pathogens or inducing resistance in crop plants.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เชื้อเป็นแหล่งอุดมของ metabolites รอง (SMs) ประกาศล่าสุดของการลำดับจีโนมเชื้อสามได้เปิดเผยตัวละครมากมายของยีน putativelyเกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ของ SMs เช่นเปปไทด์ไม่ ribosomal, polyketides, terpenoids และpyrones เป็นเรื่องน่าสนใจ genomes พันธุ์ mycoparasitic Trichoderma virens และTrichoderma atroviride อุดมไปในรองที่เกี่ยวข้องกับเมแทบอลิซึมของยีนเมื่อเทียบกับการลดชีวมวล Trichoderma reesei: 18 และเมื่อเทียบกับ 11; synthases โพลีคีไทด์ 18 28และ 16 ไม่ใช่ ribosomal เปป synthetases เปรียบเทียบกับ 10 ตามลำดับ ทั้งหมดสามชนิดสร้างชั้นพิเศษของเปปไทด์สังเคราะห์ไม่ใช่-ribosomally เรียกว่า peptaibols ประกอบด้วยproteinogenic ไม่ใช่กรดอะมิโน (โดยเฉพาะอย่างยิ่งกรด a aminoisobutyric) In common with อื่น ๆfilamentous ascomycetes เชื้ออาจ siderophores (ยังผลิต โดย nonribosomalsynthetases เพปไทด์) จะเติบโตในสภาพยากจนเหล็ก และ ให้สามารถแข่งขันกับโฮสต์ของพวกเขาสำหรับเหล็กพร้อมใช้งาน Generalizations ที่สองจะเกี่ยวกับยีน SM เชื้อรา: พวกเขามักจะพบในคลัสเตอร์ และจำนวนมากจะแสดงภายใต้เงื่อนไขมาตรฐานห้องปฏิบัติการ นี้ได้ทำยากต่อการระบุสารประกอบ Trichoderma โดยเฉพาะ โต้ตอบอื่น ๆ จุลินทรีย์ในดิน และรากพืชในไรโซสเฟียร์ การศึกษา metabolomic – genomic รายละเอียดก็จะคลี่คลายบทบาทของ SMs เหล่านี้ในระบบนิเวศธรรมชาติ พัฒนาเครื่องมือทางพันธุกรรมนวนิยายล่าสุด รวมเข้าใจเกี่ยวกับชีวภาพการทำงานของ SMs เป็นสัญญาณ หรือสารพิษควรทำ 'ตื่น' กลุ่ม 'เงียบ' เหล่านี้ ความรู้เกี่ยวกับละคร SM ควรนำประยุกต์ Trichoderma สายพันธุ์ใน biocontrol: metabolites บางอาจเป็นพิษกับพืชและผู้บริโภคของพวกเขา และดังนั้นจึง ควรจะหลีกเลี่ยง ผู้อื่นอาจเป็นประโยชน์ antagonizing โรค หรือความต้านทานในพืช inducing

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เชื้อรา Trichoderma spp เป็นแหล่งที่อุดมไปด้วยสารทุติยภูมิ (SMS) สิ่งพิมพ์ล่าสุดของลำดับจีโนมในสามของเชื้อรา Trichoderma spp
ได้เปิดเผยละครใหญ่ของยีน putatively
มีส่วนร่วมในการสังเคราะห์ของ SMS เช่นเปปไทด์ที่ไม่โซมอล, polyketides, terpenoids และ
pyrones ที่น่าสนใจของจีโนมของสายพันธุ์เชื้อรา Trichoderma virens mycoparasitic
และเชื้อราTrichoderma atroviride
จะอุดมไปในยีนที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญอาหารที่สองเมื่อเทียบกับมวลชีวภาพย่อยสลายเชื้อราTrichoderma reesei: 18 และ 18 polyketide synthases เมื่อเทียบกับ 11; 28
และ 16 synthetases เปปไทด์ที่ไม่โซมอลเมื่อเทียบกับ 10 ตามลำดับ ทั้งสามสายพันธุ์ที่ผลิตชั้นพิเศษของเปปไทด์ที่ไม่ ribosomally สังเคราะห์ที่รู้จักกันเป็น peptaibols ที่มีกรดอะมิโนที่ไม่ใช่โปรตีน(โดยเฉพาะอย่างยิ่ง-aminoisobutyric กรด) ในการร่วมกันกับคนอื่น ๆascomycetes ใยเชื้อรา Trichoderma spp อาจต้องใช้ siderophores (ยังเป็นที่ผลิตโดย nonribosomal synthetases เปปไทด์) ที่จะเติบโตในสภาพเหล็กยากจนและเพื่อแข่งขันกับเจ้าภาพเหล็กที่มีอยู่ สองภาพรวมสามารถทำเกี่ยวกับยีนเชื้อราเอสเอ็มที่พวกเขามักจะพบในกลุ่มและจำนวนมากจะไม่แสดงในห้องปฏิบัติการมาตรฐาน นี้ได้ทำให้มันยากที่จะระบุสารประกอบ เชื้อรา Trichoderma โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีการโต้ตอบกับจุลินทรีย์ในดินและพืชที่มีรากบริเวณราก รายละเอียดการศึกษา metabolomic-จีโนมในที่สุดก็จะคลี่คลายบทบาทของหลาย SMS เหล่านี้ในระบบนิเวศทางธรรมชาติ เครื่องมือทางพันธุกรรมนวนิยายพัฒนาเมื่อเร็ว ๆ นี้พร้อมกับความเข้าใจทางชีวภาพของการทำงานของ SMS เป็นสารพิษหรือสัญญาณที่จะนำไปสู่ ​​'ปลุก' เหล่านี้ 'เงียบ' กลุ่ม ความรู้เกี่ยวกับเพลง SM ควรนำการประยุกต์ใช้เชื้อรา Trichoderma สายพันธุ์สำหรับควบคุมทางชีวภาพ: สารบางคนอาจเป็นพิษต่อพืชและผู้บริโภคของพวกเขาและดังนั้นจึงควรหลีกเลี่ยง อื่น ๆ ที่อาจจะเป็นประโยชน์ขุ่นข้องหมองใจเชื้อโรคหรือการกระตุ้นให้เกิดความต้านทานในพืช

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

Trichoderma spp . เป็นแหล่งที่อุดมไปด้วยสาร secondary metabolites ( SMS ) สิ่งพิมพ์ล่าสุดของ
จีโนมลำดับ 3 ไอโซเลท ได้เปิดเผยความกว้างใหญ่ของยีนที่เกี่ยวข้องในการสังเคราะห์ putatively
SMS ไม่เช่นไรโบโซมอล เปป polyketides เทอร์ปีนอยด์และ
, pyrones . น่าสนใจ จีโนมของสายพันธุ์ Trichoderma virens และ
mycoparasiticเชื้อรา atroviride อุดมสมบูรณ์ในระดับยีนที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญมวลชีวภาพเชื้อราซึ่งเทียบกับ
reesei : 18 และ 18 แต่ไม่โดยเทียบกับ 11 28
และ 16 ไม่มีไรโบโซมเปปไทด์ synthetases เมื่อเทียบกับ 10 ตามลำดับ ทั้งสามชนิด
ผลิตคลาสพิเศษที่ไม่ ribosomally เปปไทด์สังเคราะห์ที่เรียกว่า peptaibols ที่มี
ไม่ proteinogenic กรดอะมิโน ( โดยเฉพาะ a-aminoisobutyric กรด ) เหมือนกันกับแอ คไมซีตีสเส้นใยอื่น ๆ
, Trichoderma spp . อาจต้องใช้สูตร ( ที่ผลิตโดย nonribosomal
เปปไทด์ synthetases ) เติบโตในเหล็กสภาพแย่ และแข่งขันกับ
เจ้าภาพพร้อมใช้งานเหล็ก สองทั่วไปสามารถทำเรื่องเชื้อรา SM ยีน : พวกเขามักพบ
ในกลุ่มและหลายไม่ได้แสดงออกภายใต้สภาวะห้องปฏิบัติการมาตรฐาน นี้ได้ทำให้มัน
ยากที่จะระบุสารประกอบ มาใช้ โดยเฉพาะ มีการโต้ตอบกับจุลินทรีย์ในดินและรากพืชในราก . รายละเอียด metabolomic –จีโนมการศึกษาในที่สุดจะคลี่คลายบทบาทหลาย SMS เหล่านี้ในระบบนิเวศธรรมชาติ นวนิยายพันธุ เครื่องมือพัฒนา เมื่อเร็วๆ นี้รวมกับความเข้าใจทางชีวภาพของฟังก์ชัน SMS เป็นสารพิษ หรือ สัญญาณ ควรนำไปสู่ ' กระตุ้น ' เหล่านี้ ' เงียบ ' กลุ่ม ความรู้ของ SM ละครควรทําการประยุกต์ใช้เชื้อราสายพันธุ์สำหรับไบโอคอนโทรล : สารเมแทบอไลท์อาจเป็นพิษต่อพืชและผู้บริโภคของพวกเขา และดังนั้นจึง ควรหลีกเลี่ยง คนอื่น ๆอาจเป็นประโยชน์พอ จะทำให้เชื้อโรค หรือกระตุ้นความต้านทานในพืชปลูก