Active site requiring nickel in jac

Active site requiring nickel in jack-beans and several bacteria.[6] However, in vitro activation also has been achieved with manganese and cobalt[7]
Molecular weight: 480 kDa or 545 kDa for jack- bean Urease (calculated mass from the amino acid sequence). 840 amino acids per molecule, of which 90 are cysteines.[8]
Optimum pH: 7.4
Optimum Temperature: 60 degrees Celsius
Enzymatic specificity: urea and hydroxyurea
Inhibitors: heavy metals (Pb− & Pb2+)
Bacterial ureases are composed of three distinct subunits, one large (α 60–76kDa) and two small (β 8–21 kDa, γ 6–14 kDa) commonly forming (αβγ)3 trimers stoichiometry with a 2-fold symmetric structure (note that the image above gives the structure of the asymmetric unit, one-third of the true biological assembly), they are cysteine-rich enzymes, resulting in the enzyme molar masses between 190 and 300kDa.[8]

An exceptional enzyme is the urease of Helicobacter species, which is composed of two subunits, α(26–31 kDa)-β(61–66 kDa), and has been shown to form a supramolecular dodecameric complex.[9] of repeating α-β subunits, each coupled pair of subunits has an active site, for a total of 12 active sites.[9] (alpha_{12}eta_{12}). It plays an essential function for survival, neutralizing gastric acid by allowing urea to enter into periplasm via a proton-gated urea channel.[10] The presence of urease is used in the diagnosis of Helicobacter species.

All bacterial ureases are solely cytoplasmic, except for Helicobacter pylori urease, which along with its cytoplasmic activity, has external activity with host cells. In contrast, all plant ureases are cytoplasmic.[8]

Fungal and plant ureases are made up of identical subunits (~90 kDa each), most commonly assembled as trimers and hexamers. For example, Jack Bean urease has two structural and one catalytic subunit. The α subunit contains the active site, it is composed of 840 amino acids per molecule (90 cysteines), its molecular mass without Ni(II) ions amounting to 90.77 kDa. The mass of the hexamer with the 12 nickel ions is 545.34 kDa. It is structurally related to the (αβγ)3 trimer of bacterial ureases. Other examples of homohexameric structures of plant ureases are those of soybean, pigeon pea and cotton seeds enzymes.[8]

It is important to note, that although composed of different types of subunits, ureases from different sources extending from bacteria to plants and fungi exhibit high homology of amino acid sequences.[8]

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไซต์ใช้งานที่ต้องใช้นิกเกิลในถั่วแจ็คและแบคทีเรียต่าง ๆ [6] อย่างไรก็ตาม เปิดใช้งานการเพาะเลี้ยงยังได้รับความกับแมงกานีสโคบอลต์ [7]น้ำหนักโมเลกุล: 480 kDa หรือ 545 kDa สำหรับยูแจ็คถั่ว (มวลที่คำนวณได้จากลำดับกรดอะมิโน) กรดอะมิโนที่ 840 ต่อโมเลกุล 90 กำลัง cysteines [8]ค่า pH ที่เหมาะสม: 7.4อุณหภูมิสูงสุด: 60 องศาเซลเซียสเอนไซม์ในระบบ specificity: ยูเรียและ hydroxyureaInhibitors: โลหะหนัก (Pb− และ Pb2 +)Ureases แบคทีเรียจะประกอบด้วยสามหมด subunits หนึ่งใหญ่ (α 60 – 76kDa) และขนาดเล็ก 2 (β 8 – 21 kDa γ 6 – 14 kDa) ขึ้นรูป (αβγ) 3 trimers stoichiometry ด้วยโครงสร้างสมมาตร 2-fold (หมายเหตุว่า รูปข้างต้นช่วยให้โครงสร้างของหน่วย asymmetric หนึ่งในสามของแอสเซมบลีชีวภาพจริง) ทั่วไป มี cysteine อุดมไปด้วยเอนไซม์ ในฝูงสบเอนไซม์ระหว่าง 190 และ 300kDa [8]มีเอนไซม์พิเศษยูพันธุ์กระเพาะ ซึ่งประกอบด้วย 2 subunits, α(26–31 kDa) β(61–66 kDa) และได้รับการแสดงเพื่อ dodecameric supramolecular ที่ซับซ้อน ได้ [9] ของซ้ำ subunits α-β คู่ละ coupled subunits มีไซต์ใช้งานอยู่ จำนวน 12 ใช้งานไซต์ [9] (alpha_{12}eta_{12 }) มันเล่นฟังก์ชันจำเป็นเพื่อความอยู่รอด neutralizing กรดในกระเพาะอาหาร โดยให้ยูเรียเข้า periplasm ผ่านช่องยูเรีย gated โปรตอน [10] ยูก็ใช้ในการวินิจฉัยชนิดกระเพาะUreases ทั้งหมดแบคทีเรีย cytoplasmic เท่านั้น ยกเว้นกระเพาะ pylori ยู ซึ่งรวมทั้งกิจกรรมของ cytoplasmic มีกิจกรรมภายนอกเซลล์โฮสต์ ได้ ในทางตรงกันข้าม ureases โรงงานทั้งหมดมี cytoplasmic [8]เชื้อราและพืช ureases มีเหมือน subunits (~ 90 kDa แต่ละ), มากที่สุดประกอบเป็น trimers และ hexamers ตัวอย่าง ยูแจ็คถั่วมีสองโครงสร้างและตัวเร่งปฏิกิริยาย่อยหนึ่ง ย่อยαประกอบด้วยใช้ ประกอบด้วยกรดอะมิโน 840 ต่อโมเลกุล (90 cysteines) มวลโมเลกุลที่ไม่ Ni(II) กันเกิน 90.77 kDa มวลของ hexamer ด้วยกัน 12 นิกเกิล เป็น 545.34 kDa Structurally มีการเกี่ยวข้องกับ (αβγ) 3 trimer ureases แบคทีเรีย ตัวอย่างอื่น ๆ ของโครงสร้าง homohexameric ของพืช ureases มีของเอนไซม์เมล็ดถั่วเหลือง ถั่วนกพิราบ และฝ้าย [8]โปรดทราบ ว่า แม้ว่าส่วนประกอบชนิดต่าง ๆ ของ subunits, ureases จากแหล่งต่าง ๆ ที่ขยายจากแบคทีเรียพืชและเชื้อราแสดง homology สูงลำดับกรดอะมิโนได้ [8]

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เว็บไซต์ที่ใช้งานต้องนิกเกิลในถั่วแจ็คและแบคทีเรียหลาย [6] อย่างไรก็ตามในหลอดทดลองยืนยันการใช้งานนอกจากนี้ยังได้รับการประสบความสำเร็จกับแมงกานีสและโคบอลต์ [7].
น้ำหนักโมเลกุล: 480 กิโลดาลตันหรือ 545 กิโลดาลตันสำหรับถั่ว Jack- ยูรีเอส (มวลคำนวณจากอะมิโน ลำดับกรด) กรดอะมิโน 840 ต่อโมเลกุลซึ่งมี 90 cysteines [8].
ค่า pH ที่เหมาะสม: 7.4
อุณหภูมิที่เหมาะสม: 60 องศาเซลเซียส
เอนไซม์จำเพาะ: ยูเรียและ hydroxyurea
ยับยั้ง: โลหะหนัก (Pb- และ Pb2 +)
ureases แบคทีเรียที่มีองค์ประกอบของสามหน่วยย่อยที่แตกต่างกัน หนึ่งขนาดใหญ่ (α 60-76kDa) และสองขนาดเล็ก (β 8-21 กิโลดาลตัน, γ 6-14 กิโลดาลตัน) โดยทั่วไปการขึ้นรูป (αβγ) 3 Trimers ปริมาณสารสัมพันธ์กับ 2 เท่าโครงสร้างสมมาตร (โปรดทราบว่าภาพดังกล่าวข้างต้นจะช่วยให้โครงสร้างของ หน่วยอสมมาตรหนึ่งในสามของการชุมนุมทางชีวภาพจริง) พวกเขามีเอนไซม์ cysteine ​​ที่อุดมไปด้วยส่งผลให้มวลโมเลกุลเอนไซม์ระหว่าง 190 และ 300kDa. [8] เอนไซม์ที่โดดเด่นเป็นยูรีเอสสายพันธุ์ Helicobacter ซึ่งประกอบด้วยสองหน่วยย่อย , α (26-31 กิโลดาลตัน) -β (61-66 กิโลดาลตัน) และได้รับการแสดงในรูปแบบที่ซับซ้อน dodecameric supramolecular. [9] หน่วยย่อยของการทำซ้ำαβ-แต่ละคู่คู่ของหน่วยย่อยมีเว็บไซต์ที่ใช้งานสำหรับ รวมของ 12 เว็บไซต์ที่ใช้งาน. [9] ( alpha_ {12} beta_ {12}) มันเล่นฟังก์ชั่นที่จำเป็นเพื่อความอยู่รอด neutralizing กรดในกระเพาะอาหารโดยการอนุญาตให้ยูเรียที่จะเข้าสู่ periplasm ผ่านทางช่องยูเรียโปรตอนรั้วรอบขอบชิด. [10] การปรากฏตัวของยูรีเอสถูกนำมาใช้ในการวินิจฉัยโรคของสายพันธุ์ Helicobacter. ทั้งหมด ureases แบคทีเรียเป็นคนเดียวที่นิวเคลียสยกเว้น สำหรับเชื้อ Helicobacter pylori urease ซึ่งพร้อมกับกิจกรรมนิวเคลียสของกิจกรรมภายนอกที่มีเซลล์โฮสต์ ในทางตรงกันข้าม ureases โรงงานทั้งหมดที่มีนิวเคลียส. [8] ureases เชื้อราและโรงงานถูกสร้างขึ้นจากหน่วยย่อยเหมือนกัน (~ 90 กิโลดาลตันในแต่ละ) ประกอบมากที่สุดเป็น Trimers และ hexamers ตัวอย่างเช่นถั่วแจ็คยูรีเอสมีสองโครงสร้างและหนึ่ง subunit ตัวเร่งปฏิกิริยา subunit αมีเว็บไซต์ที่ใช้งานก็จะประกอบไปด้วยกรดอะมิโน 840 ต่อโมเลกุล (90 cysteines) มวลโมเลกุลโดยไม่ Ni (II) ไอออนจำนวน 90.77 กิโลดาลตัน มวลของ hexamer กับ 12 ไอออนนิกเกิลเป็น 545.34 กิโลดาลตัน มันเป็นเรื่องที่เกี่ยวข้องกับการก่อสร้าง (αβγ) 3 trimer ureases ของแบคทีเรีย ตัวอย่างอื่น ๆ ของโครงสร้างของ homohexameric ureases โรงงานเป็นของถั่วเหลืองถั่วมะแฮะและเมล็ดฝ้ายเอนไซม์. [8] มันเป็นสิ่งสำคัญที่จะต้องทราบว่าถึงแม้จะประกอบด้วยประเภทที่แตกต่างกันของหน่วยย่อย, ureases จากแหล่งที่มาที่แตกต่างกันยื่นออกมาจากแบคทีเรียและเชื้อราพืชจัดแสดง ที่คล้ายคลึงกันสูงของลำดับกรดอะมิโน. [8]

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ใช้งานเว็บไซต์ที่ต้องการและนิกเกิลในแจ็คถั่วหลายแบคทีเรีย [ 6 ] อย่างไรก็ตาม ในการเปิดใช้งานยังได้ประสบกับแมงกานีส โคบอลต์ [ 7 ]
น้ำหนักโมเลกุล : 480 กิโลดาลตันหรือ 545 สำหรับแจ็ค - ถั่วที่มี ( คำนวณมวลจากลำดับกรดอะมิโน ) เป็นกรดอะมิโน 1 โมเลกุล ซึ่ง 90 cysteines [ 8 ]
พีเอชที่เหมาะสม : อุณหภูมิสูงสุด 7.4

: 60 องศาเซลเซียสเอนไซม์เฉพาะเจาะจง :ปุ๋ยยูเรีย และ hydroxyurea
การโลหะหนัก ( ตะกั่ว−&แบบเคลื่อนที่ )
ureases แบคทีเรียประกอบด้วย 3 หน่วยย่อยที่แตกต่างกัน หนึ่งขนาดใหญ่ ( α 60 – 76kda ) และขนาดเล็ก ( บีตา 8 – 21 kDa γ 6 – 14 กิโลดาลตัน ) ที่ขึ้นรูป ( αβγ ) 3 trimers ปริมาณสัมพันธ์กับถึงโครงสร้างสมมาตร ( หมายเหตุ ภาพข้างต้นจะช่วยให้โครงสร้างของหน่วย หนึ่งในสามของการประกอบทางชีวภาพจริง )พวกเขาจะอุดมไปด้วยกรดอะมิโน เอนไซม์ เอนไซม์ที่เกิดขึ้นในฟันกรามมวลระหว่าง 190 และ 300kda [ 8 ]

มีเอนไซม์พิเศษคือที่มีของ Helicobacter ชนิด ซึ่งประกอบด้วยสองหน่วยย่อยα ( 26 - 31 ) , ( 61 ) - บีตา– 66 kDa ) และได้ถูกแสดงในรูปแบบ dodecameric supramolecular ซับซ้อน [ 9 ] เหมือนแอลฟาบีตาหน่วย แต่ละหน่วยมีคู่คู่ของเว็บไซต์ใช้งานรวมเป็น 12 เว็บไซต์ปราดเปรียว [ 9 ] ( alpha_ { 12 } beta_ { 12 } มันเล่นฟังก์ชั่นที่จำเป็นสำหรับการอยู่รอด , การ neutralizing กรดในกระเพาะอาหารโดยให้ยูเรียเพื่อเข้าสู่ periplasm ทางโปรตอน gated ยูเรียช่อง [ 10 ] การปรากฏตัวของที่มีใช้ในการวินิจฉัยโรคที่เกิดจากแบคทีเรียสายพันธุ์

ureases ทั้งหมดแต่เพียงผู้เดียวนี้ ยกเว้นที่มี Helicobacter pylori ,ซึ่งเข้ากับกิจกรรมนี้ได้จัดกิจกรรมภายนอกของเซลล์โฮสต์ ในทางตรงกันข้าม ureases พืชทั้งหมดนี้ [ 8 ]

ราและพืช ureases ถูกสร้างขึ้นด้วยหน่วยย่อยที่เหมือนกัน ( ~ 90 ) แต่ละ ) , มักประกอบขึ้นเป็น trimers และ hexamers . ตัวอย่างเช่นที่มีแจ็คถั่วมี 2 โครงสร้างและหนึ่งหน่วยเร่งปฏิกิริยา . การαซึ่งมีเว็บไซต์ที่ใช้งานมันประกอบด้วย 840 กรดอะมิโนต่อโมเลกุล ( 90 cysteines ) ของโมเลกุลไอออนมวล โดยผมเป็น 90.77 กิโลดาลตัน มวลของเฮกเซอเมอร์กับ 12 นิกเกิลไอออน คือ 545.34 กิโลดาลตัน มันเป็นโครงสร้างที่เกี่ยวข้องกับ ( αβγ ) 3 ไตรเมอร์ของแบคทีเรีย ureases . ตัวอย่างอื่น ๆของ homohexameric โครงสร้างของ ureases พืชพวกถั่วเหลือง ถั่วนกพิราบและเมล็ดฝ้ายเอนไซม์ [ 8 ]

มันเป็นสิ่งสำคัญที่จะต้องทราบว่าแม้ว่าประกอบด้วยประเภทที่แตกต่างกันของหน่วย ureases , จากแหล่งข้อมูลที่แตกต่างกันขยายจากแบคทีเรียสู่พืชและเชื้อรามี homology สูงของกรดอะมิโน [ 8 ]