Domesticated maize and its wild anc

Domesticated maize and its wild ancestor (teosinte) differ strikingly
in morphology and afford an opportunity to examine the
connection between strong selection and diversity in a major crop
species. The tb1 gene largely controls the increase in apical dominance
in maize relative to teosinte, and a region of the tb1 locus
5
to the transcript sequence was a target of selection during maize
domestication. To better characterize the impact of selection at a
major ‘‘domestication’’ locus, we have sequenced the upstream tb1
genomic region and systematically sampled nucleotide diversity
for sites located as far as 163 kb upstream to tb1. Our analyses
define a selective sweep of
60–90 kb 5
to the tb1 transcribed
sequence. The selected region harbors a mixture of unique sequences
and large repetitive elements, but it contains no predicted
genes. Diversity at the nearest 5
gene to tb1 is typical of that for
neutral maize loci, indicating that selection at tb1 has had a
minimal impact on the surrounding chromosomal region. Our data
also show low intergenic linkage disequilibrium in the region and
suggest that selection has had a minor role in shaping the pattern
of linkage disequilibrium that is observed. Finally, our data raise
the possibility that maize-like tb1 haplotypes are present in extant
teosinte populations, and our findings also suggest a model of tb1
gene regulation that differs from traditional views of how plant
gene expression is controlled.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บ้านข้าวโพดและบรรพบุรุษของป่า (teosinte) แตกต่างกว่าในสัณฐานวิทยา และสามารถมีโอกาสตรวจสอบการเชื่อมต่อระหว่างการเลือกที่แข็งแรงและความหลากหลายในพืชหลักสายพันธ์ ยีน tb1 ใหญ่ควบคุมการเพิ่มขึ้นของ apical ครอบงำในข้าวโพดสัมพันธ์ teosinte และขอบเขตของโลกัสโพล tb15 ลำดับเสียงบรรยายเป็นเป้าหมายของการเลือกระหว่างข้าวโพดdomestication การกำหนดลักษณะผลกระทบของตัวเลือกที่ดีกว่า การหลัก '' domestication'' โลกัสโพล เราได้เรียงลำดับ tb1 ขั้นต้นน้ำภูมิภาค genomic และความหลากหลายของนิวคลีโอไทด์ตัวอย่างอย่างเป็นระบบท่องเที่ยวอยู่เท่า kb ที่ 163 ต้นน้ำเพื่อ tb1 วิเคราะห์ของเรากำหนดกวาดงานของ 60 – 90 kb 5 tb1 ทับศัพท์ลำดับนั้น ภูมิภาคที่เลือก harbors ผสมลำดับเฉพาะและองค์ประกอบซ้ำขนาดใหญ่ แต่คาดว่า ไม่ประกอบด้วยยีน ความหลากหลายในยีน 5 ที่ใกล้ที่สุดเพื่อ tb1 เป็นที่สำหรับระบุว่า เลือกที่ tb1 loci ข้าวโพดเป็นกลาง มีการผลกระทบที่น้อยที่สุดในรอบข้างของโครโมโซม ข้อมูลของเราแสดงความเชื่อมโยง intergenic ต่ำ disequilibrium ในภูมิภาค และแนะนำว่า เลือกที่มีบทบาทรองในการกำหนดรูปแบบทิศของ disequilibrium เชื่อมโยงที่ถูกสังเกต ในที่สุด เพิ่มข้อมูลของเราความเป็นไปได้ว่า อยู่ในยัง haplotypes tb1 เช่นข้าวโพดประชากร teosinte และผลการวิจัยของเรายังแนะนำแบบของ tb1ระเบียบของยีนที่แตกต่างจากมุมมองดั้งเดิมวิธีพืชควบคุมการแสดงออกของยีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โดดเด่น ข้าวโพดเลี้ยงสัตว์ และของป่าบรรพบุรุษ ( ทิโอซินเท ) แตกต่างกันมาก
ในสัณฐานวิทยาและเท่าใดโอกาสที่จะตรวจสอบการเชื่อมต่อระหว่างการเลือกที่แข็งแกร่งและความหลากหลาย

ในพืชชนิดหลัก การ tb1 ยีนส่วนใหญ่การควบคุมการเพิ่มยอดการปกครอง
ในข้าวโพดเมื่อเทียบกับทิโอซินเท และภูมิภาคของตน tb1
5
เพื่อบันทึกลำดับคือเป้าหมายของการเลือกระหว่างข้าวโพด
ทำให้เชื่อง ดีกว่าศึกษาผลกระทบของการเลือกที่ใหญ่ 'domestication
' ' ความเชื่อ เราได้ลำดับต้นน้ำ tb1
จีโนมภูมิภาคและมีระบบเบสตัวอย่างความหลากหลาย
เว็บไซต์อยู่เท่าที่ 163 KB ต้นน้ำ tb1 .
วิเคราะห์ของเรา กำหนดกวาดงาน
60 – 90 กิโล 5
กับ tb1 การทับศัพท์
ลำดับ ภูมิภาคที่เลือกท่าเรือส่วนผสมของ
ลำดับกันและองค์ประกอบหลายขนาดใหญ่ แต่มันไม่มีทำนาย
ยีน ความหลากหลายที่ใกล้ที่สุด 5
ยีน tb1 เป็นปกติที่
เป็นกลางของข้าวโพด ที่ระบุว่า การเลือก tb1 มี
น้อยที่สุดผลกระทบในรอบระดับภาค ข้อมูล
ยังแสดงต่ำส่าการเชื่อมโยงการเก็บน้ำในภูมิภาค และแนะนำว่าเลือก
มีบทบาทรองในการสร้างแบบแผน
ของการเชื่อมโยงการเก็บน้ำที่เป็นที่สังเกต ในที่สุด , ข้อมูลยก
ความเป็นไปได้ว่าข้าวโพดเหมือน tb1 แฮปมีอยู่ในเท่าที่มีอยู่
ทิโอซินเทประชากร และผลการวิจัยของเรายังแนะนำรูปแบบของการควบคุมยีน tb1
ที่แตกต่างจากมุมมองแบบดั้งเดิมของการแสดงออกของยีนพืช

ที่ควบคุมอยู่