Early and accurate pregnancy diagno

Early and accurate pregnancy diagnosis in dairy cattle is a prerequisite for successful herd management. However, most of the currently available methods allow an early diagnosis only approximately 30 days after insemination. Recently, circulating nucleic acids (CNAs) have been used successfully as biomarkers in prenatal diagnosis at different gestational stages in human and animals. Here we show that CNAs can also be used as markers for the detection of early pregnancy in cattle. Serum samples were collected from multiparous pregnant (N = 24) and nonpregnant (N = 16) dairy cows at different days after insemination (Days 0, 20, and 40). Isolated serum DNA was preprocessed using a modified serial analysis of gene expression technique, which generated concatemerized short sequence tags for downstream next generation sequencing. Bioinformatic analysis identified sequence tags specific for pregnant dairy cows at Day 20 after insemination. The identified CNA-tags originated from repetitive regions of the bovine genome. Tag sequences that showed increased hit counts per animal were used to design quantitative real-time polymerase chain reaction assays. These quantitative polymerase chain reaction assays were applied to CNA samples from matched pregnant (N = 12) and nonpregnant cows (N = 16) at different times after insemination (Day 0, 20, and 40). At Day 20 after insemination the quantities of the interspersed repeats Art2A and BovB were increased in the pregnant cows compared with the nonpregnant control cows (P < 0.05). The best performing CNA biomarker BovB yielded an area under the receiver operating characteristic curve of 0.76. At a defined cutoff value, the pregnant and the control groups can be distinguished with a sensitivity of 83% and specificity of 75%. These results suggest that CNAs can be used as biomarkers for the detection of early pregnancy in cattle.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การวินิจฉัยการตั้งครรภ์ก่อนกำหนด และถูกต้องในนมเป็นข้อกำหนดเบื้องต้นสำหรับการจัดการฝูงประสบความสำเร็จ อย่างไรก็ตาม ส่วนใหญ่ในปัจจุบันมีวิธีการให้การวินิจฉัยก่อนเท่านั้นประมาณ 30 วันหลังจากผสมเทียม ล่าสุด กรดนิวคลีอิกการหมุนเวียน (CNAs) ใช้สำเร็จเป็น biomarkers ในวินิจฉัยก่อนคลอดในระยะต่าง ๆ ครรภ์ในมนุษย์และสัตว์ ที่นี่เราแสดงว่า CNAs ยังสามารถใช้เป็นเครื่องหมายที่ตรวจตั้งครรภ์ช่วงในวัวควาย ตัวอย่างซีรั่มรวบรวมจาก multiparous ท้อง (N = 24) และ nonpregnant (N = 16) นมวันอื่นหลังจากผสมเทียม (วันที่ 0, 20 และ 40) ดีเอ็นเอเซรั่มแยกเป็น preprocessed ใช้วิเคราะห์ประจำปรับเปลี่ยนยีนนิพจน์เทคนิค ที่สร้างแท็ก concatemerized สั้นลำดับลำดับรุ่นถัดไปที่ปลายน้ำ ผลเชิงวิวัฒนาการวิเคราะห์ระบุลำดับแท็กเฉพาะสำหรับตั้งครรภ์นม 20 วันหลังจากผสมเทียม ระบุ CNA-แท็กมาจากแคว้นจีโนมวัวซ้ำ ลำดับป้ายที่แสดงให้เห็นว่าจำนวนเพิ่มขึ้นตีต่อสัตว์ถูกใช้ออกแบบ assays ปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสแบบเรียลไทม์เชิงปริมาณ ปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรสเชิงปริมาณเหล่านี้ถูกกับ assays เป็น CNA ตัวอย่างจากตรงท้อง (N = 12) และโค nonpregnant (N = 16) เวลาต่าง ๆ หลังจากการผสมเทียม (วันที่ 0, 20 และ 40) ใน 20 วันหลังจากผสมเทียม ปริมาณที่ interspersed ซ้ำ Art2A และ BovB ได้เพิ่มขึ้นเมื่อเทียบกับ nonpregnant ควบคุมวัววัวตั้งครรภ์ (P < 0.05) ส่วนการทำไบโอมาร์คเกอร์ CNA BovB หาพื้นที่ภายใต้รับทำเส้นโค้งลักษณะของ 0.76 ที่ตัดยอดค่ากำหนด การตั้งครรภ์และกลุ่มควบคุมสามารถแตกต่างกับความไวของ 83% และ specificity 75% ผลลัพธ์เหล่านี้แนะนำว่า CNAs สามารถใช้เป็น biomarkers ที่ตรวจตั้งครรภ์ช่วงในวัวควาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวินิจฉัยการตั้งครรภ์ก่อนและถูกต้องในวัวนมเป็นสิ่งที่จำเป็นสำหรับการจัดการฝูงที่ประสบความสำเร็จ แต่ส่วนใหญ่ของวิธีการที่มีอยู่ในปัจจุบันช่วยให้การวินิจฉัยเพียงประมาณ 30 วันหลังจากการผสมเทียม เมื่อเร็ว ๆ นี้การไหลเวียนของกรดนิวคลีอิก (CNAs) ได้รับการใช้ประสบความสำเร็จเป็น biomarkers ในการวินิจฉัยก่อนคลอดในขั้นตอนที่แตกต่างกันในขณะตั้งครรภ์ของมนุษย์และสัตว์ ที่นี่เราแสดงให้เห็นว่า CNAs ยังสามารถใช้เป็นเครื่องหมายในการตรวจหาการตั้งครรภ์ก่อนในวัว ตัวอย่างซีรั่มที่ถูกเก็บรวบรวมจาก multiparous ตั้งครรภ์ (จำนวน = 24) และตั้งครรภ์ (จำนวน = 16) โคนมที่แตกต่างกันวันหลังผสมเทียม (วันที่ 0, 20 และ 40) ซีรั่มที่แยกดีเอ็นเอถูก preprocessed โดยใช้การวิเคราะห์อนุกรมการปรับเปลี่ยนเทคนิคการแสดงออกของยีนที่สร้างแท็กลำดับสั้น concatemerized ลำดับสำหรับรุ่นต่อไปปลายน้ำ การวิเคราะห์ Bioinformatic ระบุลำดับแท็กที่เฉพาะเจาะจงสำหรับโคนมตั้งครรภ์ในช่วงวันที่ 20 หลังการผสมเทียม ระบุแท็ก CNA-มาจากภูมิภาคซ้ำของจีโนมวัว แท็กลำดับที่แสดงให้เห็นเพิ่มขึ้นนับตีต่อสัตว์ถูกนำมาใช้ในการออกแบบเชิงปริมาณแบบ real-time การตรวจวิธี Polymerase chain reaction เหล่านี้การตรวจวิธี Polymerase chain reaction เชิงปริมาณนำไปใช้กับกลุ่มตัวอย่าง CNA จากการจับคู่ตั้งครรภ์ (จำนวน = 12) และวัวตั้งครรภ์ (จำนวน = 16) ในช่วงเวลาที่แตกต่างกันหลังจากผสมเทียม (วันที่ 0, 20 และ 40) ในวันที่ 20 หลังการผสมเทียมปริมาณของ Art2A ซ้ำสลับและ BovB เพิ่มขึ้นในวัวตั้งครรภ์เมื่อเทียบกับวัวควบคุมไม่ได้ตั้งครรภ์ (p <0.05) มีประสิทธิภาพดีที่สุด biomarker CNA BovB yielded พื้นที่ภายใต้การรับเส้นโค้งลักษณะการดำเนินงาน 0.76 มูลค่าตัดกำหนดตั้งครรภ์และกลุ่มควบคุมจะประสบความสำเร็จมีความไว 83% และความจำเพาะ 75% ผลการศึกษานี้ชี้ให้เห็นว่า CNAs สามารถใช้เป็น biomarkers สำหรับการตรวจสอบของการตั้งครรภ์ในช่วงต้นวัว

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เร็วและถูกต้องวินิจฉัยการตั้งครรภ์ในโคนมเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับการจัดการฝูงสำเร็จ แต่ส่วนใหญ่ในปัจจุบันมีวิธีการช่วยให้การวินิจฉัยเพียงประมาณ 30 วัน หลังการผสมเทียม เมื่อเร็ว ๆนี้ , กรดนิวคลีอิกหมุนเวียน ( CNAS ) ได้ถูกใช้เรียบร้อยแล้ว โดยในการวินิจฉัยก่อนคลอดในครรภ์ซึ่งขั้นตอนที่แตกต่างกันในมนุษย์และสัตว์ที่นี่เราแสดงให้เห็นว่า CNAS ยังสามารถใช้เป็นเครื่องหมายสำหรับการตรวจสอบในช่วงต้นการตั้งครรภ์ในโค จากการเก็บตัวอย่างซีรั่มสูตรตั้งครรภ์ ( n = 24 ) และ nonpregnant ( n = 16 ) โคนมที่วันอื่นหลังจากผสมเทียม ( วันที่ 0 , 20 และ 40 ) เซรั่มดีเอ็นเอที่แยก preprocessed ใช้แก้ไขอนุกรมการวิเคราะห์เทคนิคการแสดงออกยีนซึ่งสร้างขึ้น concatemerized ลำดับท้ายสั้นแท็กสำหรับรุ่นต่อไปของ การวิเคราะห์ไบโอ นฟ ์เมติกระบุลำดับแท็กเฉพาะท้องโคนมที่ 20 วัน หลังการผสมเทียม ระบุแท็กซ้ำ ) ที่มาจากภูมิภาคของจีโนมวัวแท็กลำดับที่พบเพิ่มขึ้นตีนับต่อสัตว์ถูกใช้เพื่อการออกแบบเชิงปริมาณแบบปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอร์เรส ) . เหล่านี้ปริมาณการใช้ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส หรือประยุกต์ CNA ตัวอย่างจากคู่ท้อง ( n = 12 ) และวัว nonpregnant ( n = 16 ) ในช่วงเวลาที่แตกต่างกันหลังจากผสมเทียม ( วันที่ 0 , 20 และ 40 )ที่ 20 วันหลังจากการปริมาณของวิธีการทำซ้ำและ art2a bovb เพิ่มขึ้นในวัวที่ท้องเมื่อเทียบกับวัว nonpregnant ควบคุมอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ ( p < 0.05 ) ที่ดีที่สุดการปฏิบัติ CNA ไบโอมาร์คเกอร์ bovb ให้ผลพื้นที่ภายใต้โค้งลักษณะของผู้รับปฏิบัติดูแล ในการกำหนดมูลค่าตั้งครรภ์และกลุ่มควบคุมจะแตกต่างกับความไวของ 83 เปอร์เซ็นต์ และ 75% specificity ผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่า CNAS สามารถใช้เป็นแบบใหม่ของการตรวจหาต้นของการตั้งครรภ์ในโค