5.2. Molecular structureThe first t

5.2. Molecular structure
The first task for the computational work is to determine the
optimized geometries of the studied molecule. The optimized
molecular structure of DBA with the numbering scheme of the
atoms obtained from Gauss View program [20] along with experimental
structure is shown in Fig. 2. The optimized structural
parameters such as bond lengths, bond angles and dihedral angles
of DBA for monomer and dimer are determined by B3LYP method
with 6-31G(d,p) as basis set were compared with experimental
parameters obtained from the electron diffraction studies [16]
shown in Table 1. The dimeric conformation of DBA molecule is
shown in Fig. S1 (Supplementary information). The molecular
structure is stabilized by intermolecular and intramolecular
CAHO hydrogen bonds of 2.506 Å and 2.478 Å respectively between
oxygen atom of C@O group and hydrogen atom of alkene
group. Then, in order to test the effect of intermolecular interactions,
the DBA dimer formed by CAHO intermolecular hydrogen
bonds are investigated by theoretical methods. The computed
value of H20O58AC57, H21O58AC57 bond distances and
C5AH21O58 bond angles are 2.506, 2.424 Å and 174.2,
respectively. The geometry of the molecule under investigation is
considered by possessing C1 point group symmetry. The structure
is monoclinic of the space group C2/c, a = 28.4700(19),
b = 5.8108(3), c = 7.7929(5) Å, b = 100.163 with Z = 8. The optimized
structure is planar as it is evident from the dihedral angles
C4AC12AC13AC14 = 0.1 or C4AC12AC13AC18 = 179.9 and
C1AC5AC6AC11 = 180.0 or C1AC5AC6AC7 = 0.0 shown in Table
1. But the experimental structure is nonplanar i.e., the structure is
in three different planes due to the site occupancy (presence of carbon
and hydrogen atoms), as shown in Fig. 2 as it is evident from
the measured dihedral angles C4AC12AC13AC18 = 162.5(5),
H21AC5AC6AC7 = 154.0(4). From the theoretical values it is
found that most of the optimized bond lengths are slightly greater
than the experimental values and is due to the different molecular
state. Although the differences, calculated geometrical parameters
represent a good approximation and they can be used as foundation
to calculate the other parameters, such as vibrational frequencies
and thermodynamics properties.
The C2@O3 (1.232 Å-monom

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

5.2 ระดับโมเลกุลโครงสร้างงานแรกสำหรับการทำงานหนัก ๆ มีการ ตรวจสอบการปรับรูปทรงเรขาคณิตของโมเลกุลศึกษา ที่เหมาะสมโครงสร้างโมเลกุลของ DBA มีโครงร่างลำดับเลขของการอะตอมที่ได้จากโปรแกรมดู Gauss [20] พร้อมกับการทดลองโครงสร้างแสดงในรูป 2 โครงสร้างที่เหมาะสมพารามิเตอร์เช่นความยาวพันธะ มุมพันธะ และมุม dihedralของ DBA สำหรับน้ำยาและผลิตของ dimer จะถูกกำหนด โดยวิธี B3LYPกับ 6-31G(d,p) เป็นชุดพื้นฐานถูกเปรียบเทียบกับการทดลองพารามิเตอร์ที่ได้จากการศึกษาการเลี้ยวเบนของแสงอิเล็กตรอน [16]แสดงในตารางที่ 1 เป็นโครงสร้าง dimeric ของโมเลกุล DBAแสดงในรูป S1 (ข้อมูล) ในโมเลกุลโครงสร้างที่เสถียร ด้วย intermolecular และ intramolecularCAHO ไฮโดรเจนพันธบัตร 2.506 Åและ 2.478 Åตามลำดับระหว่างออกซิเจนอะตอมของอะตอมไฮโดรเจนและกลุ่ม C@O ของแอลคีนกลุ่ม แล้ว เพื่อทดสอบผลของปฏิสัมพันธ์ intermolecularผลิตของ dimer DBA ที่เกิดจากไฮโดรเจน intermolecular CAHOพันธบัตรเป็นการตรวจสอบ โดยวิธีการทฤษฎี การคำนวณค่าของ H20O58AC57, H21O58AC57 พันธบัตรระยะ และมีมุมพันธะ C5AH21O58 2.506, 2.424 Å และ 174.2ตามลาดับ เรขาคณิตของโมเลกุลระหว่างการตรวจสอบพิจารณา โดยมี C1 จุดกลุ่มสมมาตร โครงสร้างมี monoclinic ของกลุ่มพื้นที่ C2/c การ = 28.4700(19)b = 5.8108(3), c = 7.7929(5) Å b = 100.163 กับ Z = 8 ที่เหมาะสมโครงสร้างเป็นระนาบจะเห็นจากมุม dihedralC4AC12AC13AC14 = 0.1 หรือ C4AC12AC13AC18 = 179.9 และC1AC5AC6AC11 = 180.0 หรือ C1AC5AC6AC7 = 0.0 ที่แสดงในตาราง1. แต่โครงสร้างการทดลอง nonplanar เช่น โครงสร้างเป็นในสาม ต่างบินการพักไซต์ (สถานะของคาร์บอนและอะตอมไฮโดรเจน), ดังที่แสดงในรูป 2 จะเห็นได้จากมุม dihedral วัด C4AC12AC13AC18 = 162.5(5)H21AC5AC6AC7 = 154.0(4) จากค่าทางทฤษฎีพบว่า ส่วนใหญ่ของความยาวพันธะที่เหมาะสมมากกว่าการทดลองค่า และเนื่องจากความต่างระดับโมเลกุลสถานะ แม้ว่าความแตกต่าง คำนวณทางเรขาคณิตพารามิเตอร์แสดงการประมาณที่ดี และสามารถนำไปใช้เป็นพื้นฐานการคำนวณพารามิเตอร์อื่น ๆ เช่นความถี่การดับและอุณหพลศาสตร์คุณสมบัติC2@O3 การ (1.232 Å-monom

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

5.2 โครงสร้างโมเลกุล
งานแรกสำหรับการทำงานการคำนวณคือการกำหนด
รูปทรงเรขาคณิตที่ดีที่สุดของโมเลกุลศึกษา เพิ่มประสิทธิภาพ
โครงสร้างโมเลกุลของ DBA กับจำนวนโครงการของ
อะตอมที่ได้รับจากเกาส์โปรแกรมดู [20] พร้อมกับการทดลอง
โครงสร้างที่แสดงในรูป 2. โครงสร้างการเพิ่มประสิทธิภาพ
พารามิเตอร์เช่นความยาวพันธะมุมพันธบัตรและมุมไดฮีดรั
ของ DBA สำหรับโมโนเมอร์และ dimer จะถูกกำหนดโดยวิธี B3LYP
กับ 6-31G (d P) เป็นพื้นฐานในการตั้งค่าที่ถูกเมื่อเทียบกับการทดลอง
พารามิเตอร์ที่ได้รับจากการศึกษาอิเล็กตรอนเลนส์ [16]
ที่แสดงในตารางที่ 1 โครงสร้างของ dimeric DBA โมเลกุล
ที่แสดงในรูป S1 (ข้อมูลเพิ่มเติม) โมเลกุล
โครงสร้างจะมีความเสถียรโดยโมเลกุลและ intramolecular
พันธบัตร CAHO ไฮโดรเจน 2.506 และ 2.478 ตามลำดับระหว่าง
อะตอมออกซิเจนของกลุ่ม O C @ และไฮโดรเจนอะตอมของแอลคีน
กลุ่ม จากนั้นเพื่อทดสอบผลกระทบของการมีปฏิสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุลที่
dimer DBA ที่เกิดขึ้นจาก CAHO โมเลกุลไฮโดรเจน
พันธบัตรจะถูกตรวจสอบโดยวิธีการทางทฤษฎี คำนวณ
ค่าของ H20O58AC57, H21O58AC57 ระยะทางพันธบัตรและ
C5AH21O58 มุมพันธบัตร 2.506, 2.424 และ 174.2,
ตามลำดับ รูปทรงเรขาคณิตของโมเลกุลภายใต้การสอบสวนจะ
พิจารณาโดยเจ้าของ C1 กลุ่มจุดสมมาตร โครงสร้าง
เป็น monoclinic ของกลุ่มพื้นที่ C2 / C, A = 28.4700 (19),
B = 5.8108 (3), C = 7.7929 (5) A, B = 100.163 กับ Z = 8. เพิ่มประสิทธิภาพ
โครงสร้างระนาบตามที่มันเป็น เห็นได้ชัดจากมุมไดฮีดรั
C4AC12AC13AC14 = 0.1 หรือ C4AC12AC13AC18 = 179.9 และ
C1AC5AC6AC11 = 180.0 หรือ C1AC5AC6AC7 = 0.0 แสดงในตารางที่
1 แต่โครงสร้างการทดลองเป็นเช่น nonplanar โครงสร้างเป็น
ในสามระนาบแตกต่างกันเนื่องจากอัตราการเข้าพักเว็บไซต์ (การปรากฏตัวของคาร์บอน
และไฮโดรเจนอะตอม) ดังแสดงในรูป 2 มันเป็นที่เห็นได้ชัดจากการ
วัดมุมไดฮีดรั C4AC12AC13AC18 = 162.5 (5),
H21AC5AC6AC7 = 154.0 (4) จากค่าทางทฤษฎีมันจะ
พบว่าส่วนใหญ่ของการเพิ่มประสิทธิภาพความยาวพันธะมีมากขึ้นเล็กน้อย
กว่าค่าการทดลองและมีกำหนดจะโมเลกุลที่แตกต่างกัน
ของรัฐ แม้ว่าความแตกต่างจากการคำนวณค่าพารามิเตอร์ทางเรขาคณิต
แทนประมาณการที่ดีและพวกเขาสามารถนำมาใช้เป็นพื้นฐาน
ในการคำนวณค่าพารามิเตอร์อื่น ๆ เช่นการสั่นความถี่
และอุณหพลศาสตร์คุณสมบัติ.
C2 @ O3 (1.232 A-monom