Base stacking in the penultimate ba

Base stacking in the penultimate base step. The stacking interactions in the 5′-GU-3′/3′-UG-5′ step have a bonus in the
thermodynamic parameters for prediction rules for consecutive terminal G·U pairs. The free energy values (ΔG37
0) are for the duplex measured in 1 M NaCl, 10 mM sodium cacodylate, and 0.1 mM
Na2EDTA, pH 7.15 Cross-strand G stacking occurs in the 5′-UG-3′/3′- GU-5′ steps, and there is a clear contrast in the sequence-dependent base-stacking. The base stacking geometries are from structures that were predicted by ROSIE41 and are consistent with all crystallography and NMR dat

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ฐานซ้อนในขั้นตอนพื้นฐาน penultimate การโต้ตอบที่ซ้อนในขั้นตอน 5′-กู-3′/3′-ยูจี-5′ มีโบนัสในการพารามิเตอร์ทางอุณหพลศาสตร์สำหรับทำนายกฎสำหรับ G· ต่อเทอร์มินัล U คู่ ค่าพลังงานอิสระ (ΔG370) ในเพล็กซ์วัด ใน 1 M NaCl, cacodylate โซเดียม 10 mM, 0.1 mMNa2EDTA, pH 7.15 G ข้ามสาระซ้อนเกิดขึ้นในขั้นตอน 5′-ยูจี-3′/3′-กู-5′ และมีความแตกต่างที่ชัดเจนในการลำดับขึ้นอยู่กับฐานซ้อน รูปทรงเรขาคณิตซ้อนที่พื้นฐานมาจากโครงสร้างที่ถูกทำนาย โดย ROSIE41 และสอดคล้องกับผลิกศาสตร์และ NMR dat ทั้งหมด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ซ้อนฐานในขั้นตอนสุดท้ายฐาน ปฏิสัมพันธ์ซ้อนใน 5'-GU-3 '/ 3- UG-5'
ขั้นตอนที่มีโบนัสในพารามิเตอร์ทางอุณหพลศาสตร์กฎทำนายสำหรับขั้วติดต่อกันG ·คู่ U ค่าพลังงาน (ΔG37
0) สำหรับเพล็กซ์ที่วัดได้ใน 1 M โซเดียมคลอไรด์, โซเดียม cacodylate 10 มิลลิและ 0.1 มิลลิ
Na2EDTA ค่า pH 7.15 ซ้อน G ข้ามสาระเกิดขึ้นใน 5'-UG-3 / 3'- GU ขั้นตอน -5 'และมีความแตกต่างที่ชัดเจนในลำดับที่ซ้อนขึ้นอยู่กับฐาน รูปทรงเรขาคณิตที่ซ้อนฐานมาจากโครงสร้างที่ได้รับการคาดการณ์โดย ROSIE41 และมีความสอดคล้องกับผลึกและ NMR ว่า

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ซ้อนฐานฐานในขั้นตอนสุดท้าย . ซ้อนปฏิสัมพันธ์ใน 5 ’ - ’ gu-3 / 3 ’ - ’ ug-5 ขั้นตอนมีโบนัสในพารามิเตอร์ thermodynamic
กฎการทำนายติดต่อกันด้วยขั้ว G u คู่ ค่าพลังงานอิสระ ( Δ g37
0 ) สำหรับสองหน้า วัดใน 1 เมตร จากนั้นนำเกลือ , โซเดียม 10 มม. และ 0.1 mm
na2edta pH 715 กรัมข้ามเส้นซ้อนเกิดขึ้นใน 5 ’ - ’ ug-3 / 3 ’ - ’ gu-5 ขั้นตอนและมีความคมชัดในลำดับเบสแบบเรียงซ้อน ฐานซ้อนโครงสร้างจากโครงสร้างที่ถูกทำนายโดย rosie41 และสอดคล้องกับพฤกษศาสตร์และ NMR ร่วมกับไม้ดัด