Bacillus sp. are commonly investigated and commercialized as plant
growth-promoting bacteria (PGPB/PGPR) for several crops (Broggini
et al., 2005; Idris et al., 2007; Laux et al., 2003; Ramirez and Kloepper,
2010; Zhang et al., 2010). The major difficulties in evaluation the effect
of species of bacilli is that some are systematically closely related to each
other and can be identify solely by detailed analysis of their 16S rRNA
gene or only by other genes within species (Borriss, 2011). For example,
strains of two closely related bacilli, Bacillus subtilis and Bacillus
amyloliquefaciens can be either saprophytic, common PGPB, or both
(Calvo et al., 2014; Kloepper et al., 2004; Pérez-García et al., 2011;
Tumbarski et al., 2014). Colonization with one species of PGPB can be
masked by saprophytic rhizosphere dwellers of the other species. Consequently,
a failure in inoculation with a successful laboratory-proven
strain cannot specifically pinpoint a deficiency in colonization capacity
of the strain as a PGPB or to a technical failure in the inoculation method
or to micro-environmental conditions. This genetic relatedness among
bacilli creates major difficulties in building molecular detection tools,
such as fluorescence in situ hybridization (FISH) for monitoring colonization
of the PGPB after application. FISH probes specific for bacilli species
are not available and the available probes are for clusters of several
species of bacilli (http://probebase.csb.univie.ac.at/pb_results/2/).
Bacillus SP จะถูกตรวจสอบโดยทั่วไปและในเชิงพาณิชย์เป็นพืช
แบคทีเรียส่งเสริมการเจริญเติบโต (PGPB / PGPR) สำหรับพืชหลาย (Broggini
et al, 2005;. ไอดริส et al, 2007;. Laux et al, 2003;. รามิเรซและ Kloepper,
2010; Zhang et al, ., 2010) ความยากลำบากที่สำคัญในการประเมินผลกระทบ
ของสายพันธุ์ของแบคทีเรียคือว่าบางส่วนจะเป็นระบบที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับแต่ละ
อื่น ๆ และสามารถระบุ แต่เพียงผู้เดียวโดยการวิเคราะห์รายละเอียดของ 16S rRNA ของพวกเขา
ที่ถ่ายทอดทางพันธุกรรมหรือยีนโดยเฉพาะสายพันธุ์อื่น ๆ ภายใน (Borriss 2011) ยกตัวอย่างเช่น
สายพันธุ์ของสองแบคทีเรียที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดเชื้อ Bacillus subtilis และ Bacillus
amyloliquefaciens สามารถเป็นได้ทั้ง saprophytic, PGPB ทั่วไปหรือทั้งสอง
(Calvo et al, 2014;. Kloepper et al, 2004;.. Perez-García et al, 2011;
Tumbarski et al., 2014) การล่าอาณานิคมกับหนึ่งในสายพันธุ์ของ PGPB สามารถ
หลอกลวงโดยอาศัยอยู่ในบริเวณราก saprophytic ของสายพันธุ์อื่น ๆ ดังนั้น
ความล้มเหลวในการฉีดวัคซีนที่มีห้องปฏิบัติการพิสูจน์ความสำเร็จ
สายพันธุ์ไม่สามารถระบุเฉพาะการขาดความสามารถในการล่าอาณานิคม
ของความเครียดเป็น PGPB หรือความล้มเหลวในทางเทคนิควิธีการฉีดวัคซีน
หรือเงื่อนไขไมโครสิ่งแวดล้อม นี้ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของ
แบคทีเรียสร้างความยากลำบากที่สำคัญในการสร้างเครื่องมือตรวจจับโมเลกุล
เช่นการเรืองแสงในแหล่งกำเนิดพันธุ์ (FISH) สำหรับการตรวจสอบการตั้งรกราก
ของ PGPB หลังจากการประยุกต์ใช้ ยานสำรวจปลาที่เฉพาะเจาะจงสำหรับสายพันธุ์แบคทีเรีย
จะไม่สามารถใช้ได้และยานสำรวจที่มีอยู่มีการกระจุกหลาย
สายพันธุ์ของแบคทีเรีย (http://probebase.csb.univie.ac.at/pb_results/2/)
การแปล กรุณารอสักครู่..

Bacillus sp . มักใช้ในเชิงพาณิชย์เป็นต้นส่งเสริมการเจริญเติบโตของแบคทีเรีย ( pgpb / มีแนวโน้ม ) สำหรับพืชหลายชนิด ( brogginiet al . , 2005 ; ดริส et al . , 2007 ; ลักซ์ et al . , 2003 ; และ kloepper รามิเรซ ,2010 ; Zhang et al . , 2010 ) ปัญหาหลักในการประเมินผลชนิดของเชื้อคือ บางระบบที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับแต่ละอื่น ๆ และสามารถระบุ แต่เพียงผู้เดียวโดยการวิเคราะห์รายละเอียดของ 16S rRNA ของพวกเขายีน หรือยีนอื่น ๆโดยเฉพาะภายในชนิด ( borriss , 2011 ) ตัวอย่างเช่นสองสายพันธุ์ของเชื้อ Bacillus subtilis และเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด , เชื้อamyloliquefaciens ได้โดยกินสิ่งที่เน่าเปื่อยทั่วไป pgpb หรือทั้งสอง( calvo et al . , 2014 ; kloepper et al . , 2004 ; เปเรซกาโอ การ์ซีอา et al . , 2011 ;tumbarski et al . , 2010 ) การล่าอาณานิคมกับชนิด pgpb สามารถโดยกินสิ่งที่เน่าเปื่อยในหน้ากากโดยรากของสายพันธุ์อื่น ๆ จากนั้นล้มเหลวในการประสบความสำเร็จในปฏิบัติการพิสูจน์โดยเฉพาะสายพันธุ์ที่ไม่สามารถระบุขาดความสามารถในการล่าอาณานิคมของสายพันธุ์เป็น pgpb หรือความล้มเหลวทางเทคนิคในการใช้วิธีหรือสภาพแวดล้อมจุลภาค สัมพันธ์ระหว่างพันธุกรรมนี้เชื้อจะสร้างปัญหาหลักในการสร้างเครื่องมือตรวจจับโมเลกุลเช่นเรืองแสงใน situ hybridization ( FISH ) เพื่อตรวจสอบการล่าอาณานิคมของ pgpb หลังจากการประยุกต์ใช้ ปลาวัดเฉพาะเชื้อชนิดจะไม่สามารถใช้ได้ และใช้ได้สำหรับกลุ่มของหลาย ๆ ชื่อว่าสายพันธุ์ของเชื้อ ( http : / / probebase . csb . univie . ac.at / pb_results / 2 / )
การแปล กรุณารอสักครู่..
