Figure 4.Seed shapes of cv Nipponba

Figure 4.
Seed shapes of cv Nipponbare and Koshihikari. A, Seeds; bar = 5 mm. B to G, Seed shape parameters measured by SmartGrain (>200 grains per plant). Error bars show SD; ns, not significant. Asterisks indicate significant differences: *P < ...
To detect QTLs for seed shape, we measured 127 cv Nipponbare/Koshihikari BILs developed using cv Koshihikari as the recurrent parent (Matsubara et al., 2008). The BILs showed a normal distribution, continuous variation, and transgressive segregation in all seed parameters examined (Fig. 5), suggesting the involvement of a number of QTLs in seed shape. QTL analysis detected 13 loci (Table I; Fig. 6, Supplemental Fig. S1). Two QTLs for W were detected on the short arm and the long arm of chromosome 3 near single nucleotide polymorphism (SNP) markers NIAS_Os_aa03000545 and NIAS_Os_aa03002423, respectively. The cv Nipponbare allele on the short arm decreased W and that on the long arm increased it (Table I). Three QTLs for L, AS, and PL were detected on the long arm of chromosome 7, near NIAS_Os_aa07005384. The cv Nipponbare alleles at these loci each decreased these parameters. Two QTLs for CS and LWR were identified on the long arm of chromosome 8, near NIAS_Os_aa08005493. The cv Nipponbare allele at each locus made the seeds rounder. Four QTLs were detected for L, LWR, CS, and PL on the long arm of chromosome 11, near NIAS_Os_aa11012252. The cv Nipponbare alleles increased L and PL, making the seeds more slender. We detected another QTL for W near NIAS_Os_aa01004804 on the short arm of chromosome 1 and one for PL near NIAS_Os_aa10003500 on the distal end of chromosome 10.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รูปที่ 4.
เมล็ดรูปร่างของ cv Nipponbare และ Koshihikari A เมล็ดพืช บาร์ = 5 mm. B กับ G พารามิเตอร์รูปร่างเมล็ดวัด โดย SmartGrain (> ธัญพืช 200 ต่อพืช) แถบข้อผิดพลาดแสดง SD ns ไม่สำคัญ เครื่องหมายดอกจันแสดงความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ: * P <...
สืบ QTLs สำหรับรูปร่างเมล็ด เราวัด BILs Nipponbare/Koshihikari cv 127 พัฒนาใช้ cv Koshihikari เป็นหลักการเกิดซ้ำ (บาระ et al., 2008) BILs ที่พบการแจกแจงปกติการ ความผันแปรต่อเนื่อง และแบ่งแยก transgressive ในพารามิเตอร์ทั้งหมดเมล็ดตรวจสอบ (Fig. 5), แนะนำการมีส่วนร่วมจำนวน QTLs ในรูปร่างของเมล็ด QTL วิเคราะห์ตรวจพบ 13 loci (ตารางฉัน 6 fig. ฟิกเพิ่มเติม S1) QTLs ที่สองสำหรับ W พบแขนสั้นและแขนยาวของโครโมโซม 3 ใกล้เดียวนิวคลีโอไทด์โพลีมอร์ฟิซึม (SNP) เครื่องหมาย NIAS_Os_aa03000545 และ NIAS_Os_aa03002423 ตามลำดับ ประวัติ Nipponbare allele ในแขนสั้นลดลง W และที่บนแขนยาวเพิ่ม (ตารางฉัน) พบ QTLs สาม L, AS และ PL บนแขนยาวของโครโมโซม 7 ใกล้ NIAS_Os_aa07005384 ประวัติ Nipponbare alleles ที่เหล่า loci แต่ละพารามิเตอร์เหล่านี้ที่ลดลง สอง QTLs CS และ LWR ได้ระบุบนแขนยาวของโครโมโซม 8 ใกล้ NIAS_Os_aa08005493 ประวัติ Nipponbare allele ที่แต่ละโลกัสโพลทำเมล็ดพืชสบาย QTLs ที่สี่พบ L, LWR, CS และ PL บนแขนยาวของโครโมโซม 11 ใกล้ NIAS_Os_aa11012252 ประวัติ Nipponbare alleles เพิ่ม L และ PL ทำให้เมล็ดสเลนเดอร์มากขึ้น เราตรวจพบ QTL อื่นสำหรับ W ใกล้ NIAS_Os_aa01004804 บนแขนสั้นของโครโมโซม 1 และหนึ่งสำหรับ PL ใกล้ NIAS_Os_aa10003500 ในกระดูกของโครโมโซม 10

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รูปที่ 4
รูปทรงของเมล็ดพันธุ์ Nipponbare และ Koshihikari เมล็ด; บาร์ = 5 มม B เพื่อ G, พารามิเตอร์รูปร่างเมล็ดวัดจาก SmartGrain (> 200 เมล็ดต่อต้น) แถบข้อผิดพลาดแสดง SD; ns ไม่สำคัญ ดอกจันบ่งบอกถึงความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญ: * P <...
เพื่อตรวจหา QTLs สำหรับรูปร่างเมล็ดที่เราวัด 127 พันธุ์ Nipponbare / Koshihikari Bils การพัฒนาโดยใช้พันธุ์ Koshihikari เป็นแม่กำเริบ. (Matsubara et al, 2008) Bils แสดงให้เห็นการกระจายปกติการเปลี่ยนแปลงอย่างต่อเนื่องและการแยก transgressive ในทุกพารามิเตอร์การตรวจสอบเมล็ดพันธุ์ (รูปที่ 5). แสดงให้เห็นการมีส่วนร่วมของจำนวน QTLs ในรูปทรงเมล็ด การวิเคราะห์ QTL ตรวจพบ 13 สถานะ (ตารางที่ผม. Fig. 6 เพิ่มเติมรูปที่ S1) สอง QTLs สำหรับ W ถูกตรวจพบบนแขนสั้นและแขนยาวของโครโมโซมคู่ที่ 3 อยู่ใกล้ความแตกต่างเดี่ยวเบื่อหน่าย (SNP) เครื่องหมาย NIAS_Os_aa03000545 และ NIAS_Os_aa03002423 ตามลำดับ พันธุ์อัลลีล Nipponbare บนแขนสั้นลดลง W และที่บนแขนยาวที่เพิ่มขึ้นมัน (ตารางที่ I) สาม QTLs สำหรับ L, AS, และ PL ถูกตรวจพบบนแขนยาวของโครโมโซมคู่ที่ 7 ใกล้ NIAS_Os_aa07005384 อัลลีลพันธุ์ Nipponbare ที่สถานะเหล่านี้แต่ละพารามิเตอร์เหล่านี้ลดลง สอง QTLs สำหรับลูกค้าและ LWR ถูกระบุบนแขนยาวของโครโมโซมที่ 8 ใกล้ NIAS_Os_aa08005493 พันธุ์อัลลีล Nipponbare ในแต่ละสถานที่ทำเมล็ดกลม สี่ QTLs ถูกตรวจพบสำหรับ L, LWR, CS, และ PL บนแขนยาวของโครโมโซม 11 ใกล้ NIAS_Os_aa11012252 พันธุ์อัลลีลที่เพิ่มขึ้น Nipponbare L และ PL ทำให้เมล็ดเรียวยาวมากขึ้น เราตรวจพบ QTL อีก W ใกล้ NIAS_Os_aa01004804 บนแขนสั้นของโครโมโซมที่ 1 และสำหรับ PL ใกล้ NIAS_Os_aa10003500 ที่ปลายสุดของโครโมโซมที่ 10

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รูปที่ 4 .
เมล็ดพันธุ์และรูปร่าง nipponbare โคชิฮิคาริ . เป็นเมล็ด ; บาร์ = 5 มม. B กรัม เมล็ดรูปร่างพารามิเตอร์วัดโดย smartgrain ( > 200 เม็ดต่อพืช ) แถบแสดงข้อผิดพลาด SD ; เอ็นไม่สําคัญ เครื่องหมายดอกจันระบุความแตกต่าง : * p < . . . . . . .
เพื่อตรวจหายีนสำหรับรูปร่างเมล็ดเราวัด 127 CV nipponbare / โคชิฮิคาริ bils พัฒนาโดยใช้พันธุ์โคชิฮิคาริเป็นแม่กำเริบ ( บาระ et al . , 2008 ) การ bils มีการแจกแจงปกติ การเปลี่ยนแปลงอย่างต่อเนื่องและการตรวจสอบเมล็ดพันธุ์ทั้งหมด transgressive ในพารามิเตอร์ ( รูปที่ 5 ) , การแนะนำของจำนวนของการมีส่วนร่วมรับผิดชอบในรูปร่างของเมล็ด การวิเคราะห์ QTL พบ 13 โลไซ ( โต๊ะผม ; รูปที่ 6 เสริมรูปที่ S1 )สองตำแหน่งสำหรับ W ถูกตรวจพบบนแขนสั้นและแขนยาวของโครโมโซมคู่ที่ 3 ใกล้ polymorphism ( SNP ) ซิงเกิลนิวคลีโอไทด์และเครื่องหมาย nias_os_aa03000545 nias_os_aa03002423 ตามลำดับ CV nipponbare อัลลีลบนแขนสั้นลดลง W และบนแขนยาวที่เพิ่มขึ้น ( ตารางที่ 1 ) . 3 ตำแหน่งสำหรับผมที่จะเป็น และถูกตรวจพบบนแขนยาวของโครโมโซมคู่ที่ 7 , ใกล้ nias_os_aa07005384 .CV nipponbare อัลลีลในแต่ละรูปแบบเหล่านี้ลดลง พารามิเตอร์เหล่านี้ และสองตำแหน่งสำหรับ CS lwr ถูกระบุบนแขนยาวของโครโมโซมคู่ที่ 8 , ใกล้ nias_os_aa08005493 . CV nipponbare อัลลีลในแต่ละสถานที่ ทำให้เมล็ดกลม . สี่ตำแหน่งถูกตรวจพบ L , lwr , CS , และ PL บนแขนยาวของโครโมโซมคู่ที่ 11 ใกล้ nias_os_aa11012252 . CV nipponbare อัลลีลที่จะเพิ่มขึ้น 1 ,ทำให้เมล็ดเรียวยาวขึ้น เราพบ QTL W อื่นใกล้ nias_os_aa01004804 บนแขนสั้นของโครโมโซมที่ 1 และหนึ่งสำหรับคุณ ใกล้ nias_os_aa10003500 บนส่วนปลายของโครโมโซม 10