Phylogenetic relationships of dung

Phylogenetic relationships of dung beetles in the tribe Onthophagini, including the species-rich, cosmopolitan
genus Onthophagus, were inferred using whole mitochondrial genomes. Data were generated
by shotgun sequencing of mixed genomic DNA from >100 individuals on 50% of an Illumina MiSeq flow
cell. Genome assembly of the mixed reads produced contigs of 74 (nearly) complete mitogenomes. The
final dataset included representatives of Onthophagus from all biogeographic regions, closely related genera
of Onthophagini, and the related tribes Onitini and Oniticellini. The analysis defined four major clades
of Onthophagini, which was paraphyletic for Oniticellini, with Onitini as sister group to all others. Several
(sub)genera considered as members of Onthophagus in the older literature formed separate deep lineages.
All New World species of Onthophagus formed a monophyletic group, and the Australian taxa are confined
to a single or two closely related clades, one of which forms the sister group of the New World species.
Dating the tree by constraining the basal splits with existing calibrations of Scarabaeoidea suggests
an origin of Onthophagini sensu lato in the Eocene and a rapid spread from an African ancestral stock into
the Oriental region, and secondarily to Australia and the Americas at about 20–24 Mya. The successful
assembly of mitogenomes and the well-supported tree obtained from these sequences demonstrates
the power of shotgun sequencing from total genomic DNA of species pools as an efficient tool in
genus-level phylogenetics.

2016 Elsevier Inc. All rights reserved.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความสัมพันธ์ของผลของด้วงมูลในเผ่า Onthophagini รวมทั้งสายพันธุ์รวย เชื้อชาติสกุล Onthophagus ถูกสรุปใช้ genomes ยลทั้งหมด ข้อมูลที่สร้างขึ้นโดยปืนลูกซองลำดับของดีเอ็นเอออกผสมจาก > 100 คน 50% ของการไหล Illumina MiSeqเซลล์ กลุ่มชุมนุมของอ่านผสมผลิต contigs ของ mitogenomes (เกือบ) ทั้งหมด 74 การชุดข้อมูลขั้นสุดท้ายรวมตัวแทนของ Onthophagus จากทุกภูมิภาค biogeographic สกุลที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดOnthophagini และชนเผ่าที่เกี่ยว Onitini และ Oniticellini การวิเคราะห์กำหนด clades หลักสี่ของ Onthophagini, paraphyletic สำหรับ Oniticellini กับ Onitini เป็นน้องสาวซึ่ง กลุ่มคนอื่น ๆ ทั้งหมด หลายสกุล (sub) ถือว่าเป็นสมาชิกของ Onthophagus ในวรรณคดีเก่าเกิดเชื้อชาติลึกแยกต่างหากทุกสายพันธุ์ของโลกใหม่ของ Onthophagus เกิดกลุ่ม monophyletic และเหลืองออสเตรเลียถูกคุมขังเดียวหรือสองที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด clades หนึ่งซึ่งรูปแบบน้องสาวกลุ่มพันธุ์โลกใหม่หาคู่ต้นไม้ โดย constraining แยกฐาน ด้วยการสอบเทียบที่อยู่ของ Scarabaeoidea แนะนำจุดเริ่มต้นของลาแอ Onthophagini Eocene และพิดที่แพร่กระจายจากสต็อกของบรรพบุรุษแอฟริกาในภูมิภาคตะวันออก และเชื่อมไป ยังออสเตรเลียและอเมริกาที่เกี่ยวกับเมียะ 20 – 24 การประสบความสำเร็จอธิบายประกอบ mitogenomes และต้นไม้ได้รับการสนับสนุนอย่างดีจากลำดับเหล่านี้พลังของลำดับปืนลูกซองจากดีเอ็นเอออกรวมชนิดน้ำเป็นเครื่องมือในวงศ์วานวิวัฒนาการระดับสกุล2016 Elsevier Inc. สงวนลิขสิทธิ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการของด้วงมูลสัตว์ในเผ่า Onthophagini รวมทั้งชนิดที่อุดมไปด้วยความเป็นสากล
สกุล Onthophagus, ถูกอ้างถึงโดยใช้จีโนมทั้งหมดยล ข้อมูลที่ถูกสร้างขึ้น
โดยลำดับปืนลูกซองของดีเอ็นเอการชื่นชมจาก> 100 คนใน 50% ของการไหล Illumina MiSeq
มือถือ ประกอบจีโนมของผสมที่ผลิตอ่าน contigs 74 (เกือบ) สมบูรณ์ mitogenomes
ชุดสุดท้ายรวมถึงตัวแทนของ Onthophagus จากทุกภูมิภาคชีวภูมิศาสตร์จำพวกเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด
ของ Onthophagini และชนเผ่าที่เกี่ยวข้อง Onitini และ Oniticellini การวิเคราะห์กำหนดสี่ clades ที่สำคัญ
ของ Onthophagini ซึ่งเป็น paraphyletic สำหรับ Oniticellini กับ Onitini เป็นกลุ่มน้องสาวคนอื่น ๆ ทั้งหมด หลาย
(ย่อย) จำพวกถือว่าเป็นสมาชิกของ Onthophagus ในวรรณคดีเก่ารูป lineages ลึกแยกต่างหาก.
ทุกสายพันธุ์ใหม่ของโลก Onthophagus กลายเป็นกลุ่มไฟย์เลติและแท็กซ่าออสเตรเลียจะถูกคุมขัง
ที่เดียวหรือสอง clades เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดซึ่งหนึ่งในรูปแบบ กลุ่มสาวของสายพันธุ์ใหม่ของโลก.
ออกเดทต้นไม้โดย constraining แยกฐานที่มีการสอบเทียบที่มีอยู่ของ Scarabaeoidea แสดงให้เห็น
จุดเริ่มต้นของ Onthophagini วงศ์ใน Eocene และแพร่กระจายอย่างรวดเร็วจากสต็อกของบรรพบุรุษแอฟริกันเข้ามาใน
ภูมิภาคเอเชียตะวันออกและครั้งที่สองไปยังประเทศออสเตรเลียและ อเมริกาอยู่ที่ประมาณ 20-24 ม ที่ประสบความสำเร็จ
การชุมนุมของ mitogenomes และต้นไม้ที่ดีได้รับการสนับสนุนที่ได้รับจากลำดับเหล่านี้แสดงให้เห็นถึง
พลังของปืนลูกซองจากลำดับดีเอ็นเอทั้งหมดของสระว่ายน้ำสปีชีส์ในฐานะที่เป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพใน
phylogenetics ประเภทระดับ.
? 2016 เอลส์อิงค์สงวนลิขสิทธิ์