Manitoba, Winnipeg, Canada in 2011. For the identification of homozygous
plants, leaf tissue samples from each BnFUS3 TILLING
mutant lines were flash frozen in liquid nitrogen and stored
at 80 C. Genomic DNA was extracted from each of the sampled
tissues using the cetyltrimethylammonium bromide (CTAB)
method (Keb-Llanes et al., 2002). The DNA was suspended in
50 ml TE buffer and its concentration was determined by a Nano
Drop spectrophotometer. Samples were adjusted to a final concentration
of 150 ng/ml H2O. Genomic DNA samples were then
amplified using primers bn36-4R and bn36-5L (Supplementary
Table 1). The PCR products were purified using the QIAquick PCR
Purification kit (Qiagen Gm bH, Hilden, Germany) and sequence
analysis was conducted by Macrogen USA. The homozygous mutations
were detected with the primer, bn36-4R for the M1 and M3
lines and bn36-2R for the M2 line. On the basis of the sequence
analysis, the homozygous mutant plants were selected and grown
in separate pots and covered with selfing bags to prevent crosspollination.
Nucleotide sequences were translated into amino acid
sequences using the ExPASy Proteomics Server (http://expasy.org/
tools/dna.html). The conserved domains and structure of the gene
were identified using the NCBI (The National Center for Biotechnology
Information) Search for Conserved Domains within a Protein
Sequence (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.
cgi). The plants were grown to maturity, at which point the seeds
from each individual plant derived from the independent mutant
lines were collected and grown for further investigation.
แมนิโทบา , วินนิเพก , แคนาดา ในปี 2011 สำหรับการจำแนกชนิดพืช ส่วน
ใบตัวอย่างเนื้อเยื่อจากแต่ละ bnfus3 tilling
สายกลายพันธุ์เป็นแฟลชแช่แข็งในไนโตรเจนเหลวและเก็บไว้
ที่ 80 C สกัดดีเอ็นเอจากตัวอย่างเนื้อเยื่อแต่ละ
ใช้ cetyltrimethylammonium โบรไมด์ ( ctab )
วิธีเก็บแอลลาเนส et al . , 2002 ) ดีเอ็นเอที่ถูกระงับใน
บัฟเฟอร์ TE 50 ml และความเข้มข้นของถูกกำหนดโดยนาโน
วางวัสดุ ตัวอย่างการนำไป
ความเข้มข้นสุดท้าย 150 ng / ml H2O จีโนมดีเอ็นเอตัวอย่างแล้ว
bn36-4r ขยายใช้ไพรเมอร์ และ bn36-5l ( เสริม
ตารางที่ 1 ) ที่เพิ่มปริมาณการใช้เชื้อบริสุทธิ์ qiaquick
ฟอก Kit ( QIAGEN ( BH , ฮิลเดน , เยอรมนี ) และลำดับ
การวิเคราะห์ดำเนินการโดย macrogen สหรัฐอเมริกาตรวจพบการกลายพันธุ์แบบ
ด้วยไพรเมอร์ bn36-4r สำหรับ M1 และ M3
เส้น bn36-2r สำหรับ M2 และบรรทัด บนพื้นฐานของการวิเคราะห์ลำดับยีนกลายพันธุ์
, พืชที่ปลูกในกระถางแยก
และคลุมด้วยถุงผสมเพื่อป้องกัน crosspollination .
เบสถูกแปลเป็นลำดับกรดอะมิโน
ลำดับการใช้ expasy แสดงเซิร์ฟเวอร์ ( http : / / expasy . org /
เครื่องมือ HTML / DNA ) การอดออมโดเมนและโครงสร้างของยีน
ถูกระบุโดยใช้ ncbi ( ศูนย์สารสนเทศเทคโนโลยีชีวภาพ
แห่งชาติ ) ค้นหาเพื่อโดเมนภายในโปรตีน
ลำดับ ( http : / / www.ncbi . nlm . NIH . gov / โครงสร้าง / Commission / wrpsb .
CGI ) พืชที่ปลูกเพื่อเก็บเกี่ยว ที่จุดเมล็ด
จากแต่ละต้นที่ได้มาจากการเก็บรวบรวมสายพันธุ์กลายพันธุ์
อิสระและโต เพื่อทำการสืบสวนต่อไป
การแปล กรุณารอสักครู่..
