Simple sequence repeat markers are co-dominant, PCRbased
markers that are easy to generate, highly polymorphic
and effectively used to detect genetic variation based on
repeat-lengths. In 1999, the first SSR markers for mungbean
were reported by Yu et al. (1999) based on a search of the
GenBank database
, revealing six SSR sequences with five
different types of motifs, including di-, tri-, and tetra-nucleotide
repeats (AT)n/(TA)n, (ATT)n/(AAT)n, (GGC)n/(GCC)n,
(AGGG)n/(AGGG)n and (CTTT)n/(AAAG)n, in a total
length of 67.1 kb. Moreover, using 5
1
anchored degenerate
primers isolated by a library-enrichment protocol, 23 and 15
microsatellites consisting of di-nucleotide and tetra-nucleotide
sequences were revealed, with an observed heterozygosity
of 0 to 0.9048 and 0 to 0.561, respectively (Kumar et al.,
2002a,b). Gwag et al. (2006) identified seven polymorphic
microsatellite loci based on polymorphism screening of 93
designed primer pairs in a panel of 10 mungbean accessions.
These markers were characterized which produced 2–5 alleles
in 34 mungbean accessions with the observed and expected
heterozygosity values from 0 to 0.088 and from 0.275 to
0.683, respectively. Compared to other legume crops, a few
SSR markers are available for mungbean. The success of
generating a genome map of black gram based on adzuki
markers (due to their close phylogenetic relationship) has
led to the use of adzuki bean SSR markers in mungbean
(Sangiri et al., 2007). Of the 78 adzuki markers examined,
27 were useful for screening polymorphisms in mungbean.
Nineteen primers designed based on these markers positioned
เครื่องหมายซ้ำลำดับที่เรียบง่ายจะร่วมเด่น, PCRbased
เครื่องหมายที่ง่ายต่อการสร้าง polymorphic สูง
และ e FF ใช้ ectively ในการตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมอยู่บนพื้นฐานของ
การทำซ้ำ-ยาว ในปี 1999 แรกเครื่องหมาย SSR สำหรับถั่วเขียว
ได้รับรายงานจาก Yu et al, (1999) ตามการค้นหาของที่
ฐานข้อมูลของ GenBank
เผยหกลำดับ SSR กับ Fi ได้
di ประเภท FF ต่างกันของลวดลายรวมทั้งดิ, ไตรและ Tetra เบื่อหน่าย
ซ้ำ (at) n / (TA) n (ATT) n / (AAT) n (GGC) n / (GCC) n,
(AGGG) n / (AGGG n) และ (CTTT) n / (AAAG) n ในการรวม
ความยาวของ 67.1 KB นอกจากนี้ยังใช้ 5
1
?
ทอดสมอเลว
ไพรเมอร์ที่แยกจากโปรโตคอลห้องสมุดเพิ่มปริมาณ 23 และ 15
ไมโครประกอบด้วย di-เบื่อหน่ายและ Tetra เบื่อหน่าย
ลำดับถูกเปิดเผยกับ heterozygosity สังเกต
ของ 0-.9048 และ 0-.561 ตามลำดับ (มาร์ et al.,
2002a, B) กวัก et al, (2006) Fi ระบุเอ็ดเจ็ด polymorphic
ตำแหน่งไมโครขึ้นอยู่กับการตรวจคัดกรองความแตกต่างจาก 93
ออกแบบมาคู่ไพรเมอร์ในแผง 10 สายถั่วเขียวได้.
เครื่องหมายเหล่านี้มีลักษณะซึ่งผลิต 2-5 อัลลีล
ใน 34 สายถั่วเขียวที่มีข้อสังเกตและคาดว่า
ค่า heterozygosity 0-.088 และ 0.275 ที่จะจาก
0,683 ตามลำดับ เมื่อเทียบกับพืชตระกูลถั่วอื่น ๆ ไม่กี่
เครื่องหมาย SSR ที่ใช้ได้สำหรับถั่วเขียว ความสำเร็จของ
การสร้างแผนที่จีโนมของกรัมสีดำอยู่บนพื้นฐานของ adzuki
เครื่องหมาย (เนื่องจากความสัมพันธ์ของพวกเขาใกล้ phylogenetic) ได้
นำไปสู่การใช้ adzuki ถั่วเครื่องหมาย SSR ในถั่วเขียว
(Sangiri et al., 2007) 78 เครื่องหมาย adzuki ตรวจสอบ
27 มีประโยชน์สำหรับการคัดกรองความหลากหลายในถั่วเขียว.
เก้าไพรเมอร์ได้รับการออกแบบบนพื้นฐานของเครื่องหมายเหล่านี้ในตำแหน่ง
การแปล กรุณารอสักครู่..
เครื่องหมายทำซ้ำลำดับอย่างง่ายคือ เด่น pcrbased ,เครื่องหมายที่ง่ายต่อการสร้าง จำนวนสูงและ E ff ectively ใช้ในการตรวจสอบความแปรปรวนทางพันธุกรรมตามความยาวซ้ำ ใน 1999 , จึงตัดสินใจเดินทางได้รับเครื่องหมายถั่วเขียวรายงานโดย ยู et al . ( 1999 ) บนพื้นฐานของการค้นหาของขนาดฐานข้อมูลเผย 6 ลำดับด้วยจึงได้ชี้นำดิ ff erent ประเภทของลวดลาย รวมถึง di - , tri - และเตตร้านิวคลีโอไทด์ซ้ำ ( at ) n / ( TA ) n , ( ATT ) n / ( AAT ) n , ( ggc ) n / ( GCC ) n( aggg ) n / N ( aggg ) และ ( cttt ) n / N ( aaag ) ในทั้งหมดความยาวเท่ากับ KB นอกจากนี้ การใช้ 51การทอดสมอไพรเมอร์ที่ห้องสมุดเสริมโปรโตคอล , 23 และ 15ไมโครแซเทลไลต์ประกอบด้วยลำดับเบสนิวคลีโอไทด์ เตตร้า ดิลำดับถูกเปิดเผย กับการตรวจสอบเฉพาะที่0 ถึง 0.9048 และ 0 ถึง 0.561 ตามลำดับ ( Kumar et al . ,2002a , B ) กวัง et al . ( 2006 ) identi จึงเอ็ดเจ็ดจำนวนใช้รูปแบบตามการคัดกรอง 93 )ออกแบบไพรเมอร์คู่ในแผง 10 สายพันธุ์ถั่วเขียวเครื่องหมายเหล่านี้มีลักษณะที่ผลิต 2 – 5 อัลลีลใน 34 ตัวอย่างเปรียบเทียบกับถั่วเขียวและคาดหวังเฉพาะที่ค่าจาก 0 ถึง 0.088 และจาก 0.275 เพื่อ0.683 ตามลำดับ เมื่อเทียบกับพืชถั่วอื่น ๆไม่กี่SSR markers มีถั่วเขียว ความสำเร็จของการสร้างแผนที่จีโนมของกรัมสีดำขึ้นอยู่กับ adzukiเครื่องหมาย ( เนื่องจากความสัมพันธ์ใกล้ชิดของพวกเขาซึ่งได้นำไปสู่การใช้ถั่วแดงถั่วเขียวที่ได้รับเครื่องหมาย( sangiri et al . , 2007 ) ของ 78 adzuki เครื่องหมายตรวจสอบ27 เป็นประโยชน์ในการคัดกรองความหลากหลายในถั่วเขียว19 ออกแบบไพรเมอร์จากเครื่องหมายเหล่านี้วาง
การแปล กรุณารอสักครู่..