Phylogenetic analysis based on 16S

Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences
revealed that the three novel isolates clustered with A.
halophila ATCC 27976T and A. mortivallis DSM 44261T but
A. iraqiensis AS 4.1193T clustered with S. halophila DSM
44411T and Saccharomonospora paurometabolica YIM
90007T (Fig. 1). 16S rRNA gene sequence similarities
between strain YIM 90600T and strains YIM 90479, YIM
90480T, A. halophila ATCC 27976T, A. mortivallis DSM
44261T, A. iraqiensis AS 4.1193T, S. halophila DSM 44411T
and S. paurometabolica YIM 90007T were 100, 97.6, 96.0,
94.4, 89.6, 90.0 and 89.3 %, respectively. Sequence
similarities between strain YIM 90480T and strains A.
halophila ATCC 27976T, A. mortivallis DSM 44261T, A.
iraqiensis AS 4.1193T, S. halophila DSM 44411T and S.
paurometabolica YIM 90007T were 95.9, 93.7, 89.5, 89.9,
89.6 and 89.3 %, respectively. Sequence similarities between
strain A. iraqiensis AS 4.1193T and strains A. halophila
ATCC 27976T, A. mortivallis DSM 44261T, S. halophila
DSM 44411T and S. paurometabolica YIM 90007T were
89.5, 89.7, 99.3 and 99.1 %, respectively. These results
clearly revealed that strains YIM 90479, YIM 90480T and
YIM 90600T belong to the genus Actinopolyspora and
showed that A. iraqiensis AS 4.1193T should be assigned to
the genus Saccharomonospora. DNA–DNA relatedness
values between strain YIM 90600T and strains YIM 90479
and YIM 90480T were 100 and 46.8 %, respectively. DNA
relatedness values between A. iraqiensis AS 4.1193T and S.
halophila DSM 44411T and S. paurometabolica YIM 90007T
were 95 and 56 %, respectively. Relatedness values greater
than 70 %, the recommended threshold for the delineation
of bacterial species, indicated that strains YIM 90479 and
YIM 90600T belong to the same species of the genus
Actinopolyspora and that A. iraqiensis AS 4.1193T and S.
halophila DSM 44411T belong to the same species of the
genus Saccharomonospora (Wayne et al., 1987).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิเคราะห์ phylogenetic ตาม 16S rRNA ลำดับยีนว่า สามนวนิยายแยกจับกลุ่มกับอ.หญ้า ATCC 27976T และ A. mortivallis DSM 44261T แต่A. iraqiensis เป็น 4.1193T จับกลุ่มกับหญ้า S. DSM44411T และ Saccharomonospora paurometabolica ยิ้ม90007T (Fig. 1) 16S rRNA ยีนลำดับความเหมือนระหว่างสายพันธุ์ 90479 จิรพัฒน์จิรพัฒน์จิรพัฒน์ 90600T ต้องใช้90480T, A. หญ้า ATCC 27976T, mortivallis อ. DSM44261T, iraqiensis อ.เป็น 4.1193T, DSM หญ้า S. 44411Tและ S. paurometabolica ยิ้ม 90007T 100, 97.6, 96.094.4, 89.6, 90.0 และ 89.3% ตามลำดับ ลำดับความเหมือนระหว่างสายพันธุ์สายพันธุ์ A. และจิรพัฒน์ 90480Tหญ้า ATCC 27976T, DSM mortivallis A. 44261T อ.iraqiensis เป็น 4.1193T, DSM หญ้า S. 44411T และ s ได้paurometabolica จิรพัฒน์ 90007T ถูก 95.9, 93.7, 89.5, 89.989.6 และ 89.3% ตามลำดับ ลำดับความเหมือนระหว่างสายพันธุ์ A. iraqiensis เป็นหญ้า A. 4.1193T และสายพันธุ์ATCC 27976T, DSM A. mortivallis 44261T, S. หญ้าDSM 44411T และ S. paurometabolica จิรพัฒน์ 90007T89.5, 89.7, 99.3 และ 99.1% ตามลำดับ ผลลัพธ์เหล่านี้เปิดเผยชัดเจนที่สายพันธุ์ 90479, 90480T จิรพัฒน์จิรพัฒน์ และจิรพัฒน์ 90600T อยู่ในสกุล Actinopolyspora และพบที่อ. iraqiensis กับ 4.1193T ควรกำหนดให้สกุล Saccharomonospora Relatedness ดีเอ็นเอดีเอ็นเอค่าระหว่างต้องใช้ยิ้ม 90600T และสายพันธุ์จิรพัฒน์ 90479และยิ้ม 90480T 100 และ 46.8% ตามลำดับ ดีเอ็นเอrelatedness ค่าระหว่าง A. iraqiensis เป็น 4.1193T และ s ได้หญ้า DSM 44411T และ S. paurometabolica จิรพัฒน์ 90007Tถูก 56% และ 95 ตามลำดับ Relatedness ค่ามากขึ้นกว่า 70% ขีดจำกัดแนะนำสำหรับการ delineationพันธุ์แบคทีเรีย ระบุที่สายพันธุ์ยิ้ม 90479 และจิรพัฒน์ 90600T เป็นของชนิดเดียวกันของตระกูลนี้Actinopolyspora และ iraqiensis ที่อ. 4.1193T และ s ได้หญ้า DSM 44411T เป็นของชนิดเดียวกันของการสกุล Saccharomonospora (Wayne et al., 1987)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์วิวัฒนาการอยู่บนพื้นฐานของ 16S rRNA ลำดับยีน
เปิดเผยว่านวนิยายสามแยกคลัสเตอร์กับ A.
Halophila ATCC 27976T และ A. mortivallis 44261T DSM แต่
A. iraqiensis AS 4.1193T คลัสเตอร์กับเอส Halophila DSM
44411T และ Saccharomonospora paurometabolica YIM
90007T (รูปที่ 1). 16S rRNA ยีนคล้ายคลึงกัน
ระหว่างสายพันธุ์ YIM 90600T และสายพันธุ์ YIM 90479, YIM
90480T, A. Halophila ATCC 27976T, A. mortivallis DSM
44261T, A. iraqiensis AS 4.1193T เอ Halophila DSM 44411T
และ S. paurometabolica YIM 90007T เป็น 100, 97.6, 96.0,
94.4, 89.6, 90.0 และ 89.3% ตามลำดับ ลำดับ
ความคล้ายคลึงกันระหว่างสายพันธุ์ YIM 90480T และสายพันธุ์ A.
Halophila ATCC 27976T, A. mortivallis DSM 44261T, A.
iraqiensis AS 4.1193T เอ Halophila DSM 44411T และ S.
paurometabolica YIM 90007T เป็น 95.9, 93.7, 89.5, 89.9,
89.6 และ 89.3 % ตามลำดับ ลำดับความคล้ายคลึงกันระหว่าง
สายพันธุ์ iraqiensis A. AS 4.1193T และสายพันธุ์ A. Halophila
ATCC 27976T, A. mortivallis DSM 44261T เอ Halophila
DSM 44411T และ S. paurometabolica YIM 90007T เป็น
89.5, 89.7, 99.3 และ 99.1% ตามลำดับ ผลลัพธ์เหล่านี้
เผยให้เห็นอย่างชัดเจนว่าสายพันธุ์ YIM 90479, YIM 90480T และ
YIM 90600T เป็นสกุล Actinopolyspora และ
แสดงให้เห็นว่าเอ iraqiensis AS 4.1193T ควรจะได้รับมอบหมายให้
สกุล Saccharomonospora ดีเอ็นเอดีเอ็นเอ
ค่าระหว่างสายพันธุ์ 90600T YIM และสายพันธุ์ YIM 90,479
และ YIM 90480T เป็น 100 และ 46.8% ตามลำดับ ดีเอ็นเอ
ค่าสัมพันธ์ระหว่าง A. iraqiensis AS 4.1193T และ S.
Halophila DSM 44411T และ S. paurometabolica YIM 90007T
เป็น 95 และ 56% ตามลำดับ สัมพันธ์ค่ามากขึ้น
กว่า 70%, เกณฑ์ที่แนะนำสำหรับการวาดภาพ
ของสายพันธุ์แบคทีเรียที่ชี้ให้เห็นว่าสายพันธุ์ YIM 90,479 และ
YIM 90600T อยู่ในสปีชีส์เดียวกันของสกุล
Actinopolyspora และ iraqiensis A. AS 4.1193T และ S.
Halophila DSM 44411T เป็น สายพันธุ์เดียวกันของ
สกุล Saccharomonospora (เวย์น et al., 1987)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ลำดับเบส 16S rRNA phylogenetic ขึ้นอยู่กับยีน
พบว่าสามนวนิยายแยกเป็นกลุ่ม A .
halophila ATCC 27976t และ A . mortivallis DSM 44261t แต่
. iraqiensis เป็น 4.1193t พัวกับเอส halophila DSM
44411t saccharomonospora และ paurometabolica ยิ้ม
90007t ( รูปที่ 1 ) ลำดับเบส 16S rRNA ยีนที่คล้ายคลึงกันระหว่างสายพันธุ์และสายพันธุ์ 90600t
ยิ้มยิ้ม 90479 ยิม
90480t Ahalophila ATCC 27976t อ. mortivallis DSM
44261t อ. iraqiensis เป็น 4.1193t เอส halophila DSM 44411t
S . paurometabolica ยิ้ม 90007t จำนวน 100 , 97.6 96.0
, 94.4 , ว่า , คิด , และ 89.3 ตามลำดับ ลำดับ
ความคล้ายคลึงกันระหว่างสายพันธุ์ยิ้ม 90480t และสายพันธุ์ A
halophila ATCC 27976t อ. mortivallis DSM 44261t , A .
iraqiensis เป็น 4.1193t , S และ S .
halophila DSM 44411tpaurometabolica ยิ้ม 90007t เป็น 95.9 93.7 ร้อยละ 89.9 , , , , และ
ว่า 89.3 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ ลำดับของความคล้ายคลึงกันระหว่างสายพันธุ์ A .
iraqiensis เป็น 4.1193t และสายพันธุ์ A halophila
ATCC 27976t อ. mortivallis DSM 44261t เอส halophila
DSM 44411t และ S . paurometabolica ยิ้ม 90007t ลดลงร้อยละ 89.7 )
, , และ 99.3 97.2 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ ผลลัพธ์เหล่านี้
อย่างชัดเจนเปิดเผยว่า สายพันธุ์ 90479 ยิม ยิม 90480t และ
ยิ้ม 90600t เป็นของสกุล และพบว่า actinopolyspora
. iraqiensis เป็น 4.1193t ควรมอบหมายให้
สกุล saccharomonospora . ค่าสัมพันธ์ระหว่างความเครียดและดีเอ็นเอดีเอ็นเอ 90600t
ยิ้มและยิ้ม และยิ้ม 90480t สายพันธุ์ 90479
เป็น 100 และ 46.8 เปอร์เซ็นต์ ตามลำดับ แบ่งงานกันทำดีเอ็นเอ
ค่าระหว่าง . iraqiensis เป็น 4.1193t และ S .
halophila DSM 44411t paurometabolica ยิ้ม 90007t
.จำนวน 95 และ 56% ตามลำดับ ค่าความสัมพันธ์
กว่า 70% โดยเกณฑ์สำหรับการกำหนดชนิดของแบคทีเรีย
พบว่าสายพันธุ์และยิ้ม 90479
ยิ้ม 90600t เป็นของชนิดเดียวกันของพืชสกุล
actinopolyspora และ . iraqiensis เป็น 4.1193t และ S .
halophila DSM 44411t เป็นของชนิดเดียวกันของ
สกุล saccharomonospora et al ( เวย์น
. , 1987 )