Respiratory quinones of strain CC-S

Respiratory quinones of strain CC-SBABM117T were extracted and separated as described by Minnikin et al. (1979) and were analysed by HPLC as described by Collins & Jones (1980). Ubiquinone 10 (Q-10) was the predominant respiratory quinone.

Polar lipids were extracted and analysed by two-dimensional TLC according to Embley & Wait (1994). The predominant polar lipids of strain CC-SBABM117T were diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol, phosphatidylcholine and phosphatidylethanolamine. Sulphoquinovosyldiacylglyceride and phosphatidylmonomethylethanolamine were not detected. The presence or absence of these lipids can be used for differentiation among the genera Pannonibacter, Stappia, Roseibium and Labrenzia (Biebl et al., 2007). One unidentified phospholipid and an unidentified glycolipid were also found as minor components (Supplementary Fig. S2).

Fatty acid methyl esters were obtained from cells cultivated on trypticase soy agar (TSA; Difco) for 48 h at 30 °C by saponification, methylation and extraction as described by Kämpfer & Kroppenstedt (1996) and were separated by GC (model 5898A; Hewlett Packard). Peaks were automatically integrated and fatty acids were identified and quantified by using the Microbial Identification standard software package MIDI (Sasser, 1990). The fatty acid profile of strain CC-SBABM117T is given in Supplementary Table S1. The high level of C19 : 0 cyclo ω8c (27.6 %) and absence of C14 : 0 3-OH differentiated strain CC-SBABM117T from the other type strains examined.

For determination of the G+C content, the DNA of strain CC-SBABM117T was prepared and degraded enzymically into nucleosides as described by Mesbah et al. (1989). The nucleoside mixture obtained was then separated by HPLC. The DNA G+C content of strain CC-SBABM117T was 62.7 mol%.

Strain CC-SBABM117T could be differentiated from all members of the genera examined (Fig. 1⇑) based on a combination of growth, morphological, chemotaxonomic and physiological characteristics (Table 1⇑ and Supplementary Table S1).

On the basis of these results, we propose that strain CC-SBABM117T represents a novel species of a new genus, for which the name Agaricicola taiwanensis gen. nov., sp. nov. is proposed

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Quinones ระบบทางเดินหายใจของสายพันธุ์ cc-sbabm117t ถูกสกัดและแยกออกจากกันตามที่อธิบาย minnikin ตอัล (1979) และได้รับการวิเคราะห์โดย hplc ตามที่อธิบายไว้โดยคอลลิน& jones (1980) โคเอนไซม์ 10 (q-10) เป็น quinone เด่นทางเดินหายใจ.

ไขมันขั้วโลกถูกสกัดและวิเคราะห์โดย tlc สองมิติตาม Embley &รอ (1994)ไขมันขั้วโลกเด่นของสายพันธุ์ cc-sbabm117t มี diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol phosphatidylcholine และ phosphatidylethanolamine sulphoquinovosyldiacylglyceride phosphatidylmonomethylethanolamine และไม่ได้รับการตรวจพบ การมีหรือไม่มีของไขมันเหล่านี้สามารถใช้สำหรับความแตกต่างในหมู่จำพวก pannonibacter, stappia roseibium และ labrenzia (Biebl et al,.2007) หนึ่งฟอสไม่ปรากฏชื่อและไม่ปรากฏชื่อ glycolipid นอกจากนี้ยังพบชิ้นส่วนเล็ก ๆ น้อย ๆ ในขณะที่ (มะเดื่อเสริม s2.)

กรดไขมันเมทิลเอสเตอร์ที่ได้รับจากเซลล์เพาะปลูกถั่วเหลืองในอาหารเลี้ยงเชื้อ trypticase. (tsa; difco) เวลา 48 ชั่วโมงวันที่ 30 องศาเซลเซียสโดยสะพอ, เมธิลและการสกัดตามที่อธิบายไว้โดยนักรบ& kroppenstedt (1996) และได้รับการแยกออกจากกันโดย GC (รุ่น 5898a; Hewlett Packard)ยอดเขาที่ถูกบูรณาการโดยอัตโนมัติและกรดไขมันที่มีการระบุและวัดโดยใช้มาตรฐานของจุลินทรีย์ตัวแพคเกจซอฟต์แวร์ midi (Sasser, 1990) รายละเอียดของกรดไขมันสายพันธุ์ cc-sbabm117t จะได้รับใน s1 ตารางเสริม ระดับสูงของ c19: 0 cyclo ω8c (27.6%) และการขาดการ c14:0 3 สายพันธุ์ที่แตกต่างโอ้ cc-sbabm117t จากสายพันธุ์ชนิดอื่น ๆ การตรวจสอบ.

สำหรับการกำหนดเนื้อหา GC, dna ของสายพันธุ์ cc-sbabm117t ได้รับการเตรียมความพร้อมและการสลายตัว enzymically เป็น nucleosides ตามที่อธิบาย Mesbah ตอัล (1989) ส่วนผสม nucleoside ได้ถูกแยกออกแล้วโดย hplc เนื้อหา dna GC ของสายพันธุ์ cc-sbabm117t เป็น 62.7% โมเลกุล.

สายพันธุ์ cc-sbabm117t อาจจะแตกต่างจากสมาชิกทุกคนในจำพวกตรวจสอบ (รูปที่ 1 ⇑) จากการรวมกันของการเจริญเติบโตก้านเคมีและสรีรวิทยาลักษณะ (ตารางที่ 1 ⇑และ s1 ตารางเสริม).

บนพื้นฐานของการเหล่านี้ ผลลัพธ์ที่เราเสนอว่าความเครียด cc-sbabm117t เป็นสายพันธุ์ใหม่ของชนิดใหม่ที่ชื่อ agaricicola taiwanensis เก็น พฤศจิกายน,เอสพี พฤศจิกายน จะเสนอ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Quinones หายใจของต้องใช้ CC SBABM117T สกัด และแยกออกเป็นอธิบายโดย Minnikin et al. (1979) และ HPLC มี analysed ตามที่อธิบายไว้ โดยคอลลินส์&โจนส์ (1980) Ubiquinone 10 (Q-10) ได้กันหายใจ quinone

ขั้วโลกโครงการสกัด และ analysed โดย TLC สองตาม Embley &รอ (1994) โครงการขั้วกันของต้องใช้ CC SBABM117T ได้ diphosphatidylglycerol, phosphatidylglycerol สำคัญ และ phosphatidylethanolamine ไม่พบ Sulphoquinovosyldiacylglyceride และ phosphatidylmonomethylethanolamine สถานะการขาดงานของโครงการเหล่านี้สามารถใช้ได้สำหรับการสร้างความแตกต่างระหว่างสกุล Pannonibacter, Stappia, Roseibium และ Labrenzia (Biebl et al., 2007) . หนึ่งไม่ฟอสโฟลิพิดและไกลโคลิพิดที่ไม่ถูกพบเป็นส่วนประกอบรอง (ฟิกเสริม S2)

กรดไขมัน methyl esters ได้รับจากเซลล์ cultivated บน trypticase ถั่วเหลือง agar (TSA Difco) สำหรับ 48 h ที่ 30 ° C โดยสะพอนิฟิ ปรับ และสกัดตามที่อธิบายไว้ โดย Kämpfer & Kroppenstedt (1996) และถูกคั่น ด้วย GC (รุ่น 5898A Hewlett Packard) ยอดถูกรวมโดยอัตโนมัติ และกรดไขมันได้ระบุ และ quantified โดยใช้แพคเกจซอฟต์แวร์มาตรฐานจุลินทรีย์รหัส MIDI (Sasser, 1990) โพรไฟล์กรดไขมันของต้องใช้ CC SBABM117T จะได้รับใน S1 ตารางเสริม ระดับสูงของ C19: 0 cyclo ω8c (27.6%) และการขาดงานของ C14: ต้อง 0 3 OH สังเกตใช้ CC SBABM117T จากสายอื่นชนิดพันธุ์ตรวจสอบ

สำหรับการกำหนดเนื้อหา G C ดีเอ็นเอของต้องใช้ CC SBABM117T ถูกเตรียม และเสื่อมโทรม enzymically เป็น nucleosides ตามที่อธิบายไว้โดย Mesbah et al. (1989) ผสม nucleoside รับถูกแล้วคั่น ด้วย HPLC เนื้อหา C G ดีเอ็นเอของต้องใช้ CC SBABM117T ถูก 62.7 mol%.

ต้องใช้ CC-SBABM117T สามารถแยกแยะได้จากสมาชิกทั้งหมดของสกุลตรวจสอบ (Fig. 1⇑) ในการเจริญเติบโต สัณฐาน chemotaxonomic และสรีรวิทยาลักษณะ (1⇑ ตารางและตารางเสริม S1) ได้

ตามผลลัพธ์เหล่านี้ เราเสนอว่า ต้องใช้ CC SBABM117T แทนพันธุ์สกุลใหม่ นวนิยายที่ชื่อ Agaricicola taiwanensis ทั่วไป nov., sp. nov มีการนำเสนอ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

quinones ระบบทางเดินหายใจการดึง CC - sbabm 117 T ก็ถูกแยกออกมาและแยกตามที่อธิบายไว้โดย minnikin et al . ( 1979 )และยังนำมาวิเคราะห์หาโดย hplc เช่นที่อธิบายไว้ใน Collins &โจนส์( 1980 ) ubiquinone 10 ( Q 10 )เป็นระบบทางเดินหายใจ quinone โดดเด่น.ไขมัน

แผน ภาพ รูปแบบทิศทางสัญญาณเสียงได้ถูกแยกออกมาและมีการวิเคราะห์โดย tlc สองมิติตาม embley &รอ( 1994 )แผน ภาพ รูปแบบทิศทางสัญญาณเสียงไขมันความโดดเด่นที่การดึง CC - sbabm 117 T เป็น diphosphatidylglycerol phosphatidylglycerol phosphatidylcholine และ phosphatidylethanolamine phosphatidylmonomethylethanolamine และ sulphoquinovosyldiacylglyceride ไม่ได้ตรวจพบ การขาดงานหรือการมีอยู่ของไขมันเหล่านี้สามารถใช้สำหรับความแตกต่างใน pannonibacter เอื้องที่ stappia roseibium และ labrenzia ( biebl et al .2007 ) หนึ่ง phospholipid ระบุไม่ได้ว่าและ glycolipid ปาริฉัตรก็พบว่าเป็นคอมโพเนนต์ย่อย(รูปประกอบด้วย S 2 )

กรดไขมัน Methyl esters ได้จากเซลล์แบตเตอรี่ได้บ่มเพาะถั่วเหลืองใน trypticase สาหร่ายทะเล( TSA ; difco )สำหรับ 48   ชั่วโมงที่ 30 ° C โดย   saponification , methylation และสกัดน้ำมันตามที่อธิบายไว้โดย kämpfer & kroppenstedt ( 1996 )และได้ถูกแยกออกจากกันโดยเฉพาะรุ่น GC (รุ่น 5898 ที่;, Hewlett Packard ,)ยอดเขาเป็นแบบอินทิเกรตโดยอัตโนมัติและกรดไขมันได้รับการระบุว่าและคำนวณออกมาเป็นรูปธรรมได้หรือโดยการใช้จุลินทรีย์การระบุแพ็คเกจซอฟต์แวร์มาตรฐาน Midi ( W 32 . Zotob . E virus Sober 1990 ) โปรไฟล์กรดไขมันที่การดึง CC - sbabm 117 T จะได้รับในตาราง S 1 เพิ่มเติม ระดับสูงของ Cyclo C 19   :   0 Ω 8 c (   27.6% )และการขาดของเมอร์เซเดส - เบนซ์ C 14    03 - โอแตกต่างกันความเมื่อยล้าถึงสำเนาถึง - sbabm 117 t จาก ประเภท อื่นๆพันธุ์ตรวจสอบ.

สำหรับการกำหนดที่ G C เนื้อหาที่ดีเอ็นเอของพันธุ์ CC - sbabm 117 T เตรียมไว้และถูกปรับระดับลง enzymically ใน nucleosides เช่นที่อธิบายไว้ใน mesbah et al . ( 1989 ) การผสมผสาน nucleoside ที่ได้รับก็แยกออกจากกันโดย hplc. แล้ว ดีเอ็นเอ G C เนื้อหาของความเมื่อยล้า CC - sbabm 117 T ที่เป็น 62.7%   Website : www . mol .

ดึง CC sbabm 117 T จะแตกต่างจากสมาชิกทั้งหมดของที่เอื้องตรวจสอบ(รูป.   1 ⇑)ที่ใช้ในการรวมตัวกันของการเติบโตขึ้นเกี่ยวกับวิชาว่าด้วยรูปร่างลักษณะ, chemotaxonomic ในทางสรีรศาสตร์และลักษณะ( ตาราง   1 ⇑เสริมและโต๊ะ: 1 )

บนพื้นฐานของเหล่านี้ให้เราเสนอให้สำเนาถึง - sbabm 117 T เป็นนวนิยายสายพันธุ์พืชใหม่,ที่ชื่อ agaricicola taiwanensis Gen .พ.ย..SP .เดือนพ.ย.)ได้ถูกนำเสนอ