DISCUSSIONWe have cloned and sequen

DISCUSSION
We have cloned and sequenced the three histone H3 genes from Tetrahymena thermophila. Thus, T. thermophila is one of the few eukaryotes for which the sequence of its entire histone gene family
is known (see Table 1). The T. thermophila H3 genes encode the major replication-dependent H3 and the replication-independent (replacement) variant hv2, whose predicted amino acid sequence
is very different from those of animal and plant H3 replacement variants. Phylogenetic analyses of H3 protein sequences by the neighborjoining and parsimony methods suggest that the three types of
replacement variants arose independently at least two and probably three times in eukaryotic evolution. This uncertainty is due to a puzzling change in the topology of the NJ tree caused by the addition of the A.nidulans H3 sequence. We had constructed the H3 NJ tree several times with increasingly larger data sets and found the branch order highly resistant to the addition of new sequences and uniform in its placement of animal
H3.3 and fungal H3s on the same branch (data not shown). We do not know why the addition of the Aspergillus H3 changes the placement of H3.3, since the H3s from Aspergillus and Neurospora differ at only 4 positions and at 3 of those 4 positions the Aspergillus sequence is more like the other fungal H3s than Neurospora (data not shown). Given that animal H3.3 and fungal H3s were monophyletic for all parsimony analyses carried out
on the entire H3 data set and on several different subsets, and that NJ trees constructed from the same subsets all placed H3.3 and fungal H3s on the same branch, we feel it is reasonable to conclude that H3.3 evolved after the branching of plants and animals, and thus independently of plant H3.IJJ and Tetrahymena

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สนทนาเรามีโคลน และเรียงลำดับยีนฮิสโตน H3 สามจาก Tetrahymena thermophila ดังนั้น T. thermophila เป็นหนึ่งของ eukaryotes น้อยซึ่งลำดับของยีนของทั้งฮิสโตนเรียกว่า (ดูตารางที่ 1) การเข้ารหัสยีน thermophila H3 T. H3 ขึ้นอยู่กับการจำลองแบบหลักและตัวแปร hv2 จำลองแบบอิสระ (แทน) ลำดับที่มีกรดอะมิโนที่คาดการณ์จะแตกต่างจากสัตว์และพืชแปรเปลี่ยน H3 การวิเคราะห์ลำดับโปรตีน H3 โดยวิธี neighborjoining และ parsimony phylogenetic แนะนำที่สามชนิดแทนตัวแปรอิสระเกิดครั้งที่สอง และสามอาจใน eukaryotic วิวัฒนาการ ความไม่แน่นอนนี้คือการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของต้น NJ ที่เกิดจากการเพิ่มของลำดับ A.nidulans H3 งง เราได้สร้างต้น H3 NJ หลายครั้งกับชุดข้อมูลขนาดใหญ่มาก และพบใบสาขาสูงทนทานต่อการเพิ่มของลำดับใหม่ และชุดของตำแหน่งของสัตว์H3.3 และ H3s เชื้อราในสาขาเดียวกัน (ไม่ได้แสดงข้อมูล) เราไม่รู้ว่าทำไมการเพิ่ม Aspergillus H3 เปลี่ยนตำแหน่งของ H3.3 ตั้งแต่ H3s จาก Aspergillus และ Neurospora แตกต่างกัน ที่ตำแหน่งที่ 4 และ ที่ 3 ของเหล่า 4 ตำแหน่งลำดับ Aspergillus เป็นเช่น H3s เชื้อราอื่น ๆ มากกว่า Neurospora (ไม่แสดงข้อมูล) รับสัตว์ที่ H3.3 และ H3s เชื้อราถูก monophyletic สำหรับการวิเคราะห์ parsimony ทั้งหมดที่ดำเนินการบนข้อมูลชุดทั้งหมดของ H3 และแตกย่อยหลาย และ NJ ที่ ต้นไม้ที่สร้างจากชุดย่อยเดียวกันทั้งหมดวาง H3.3 และเชื้อรา H3s ในสาขาเดียวกัน เรารู้สึกจึงสรุปว่า H3.3 พัฒนาหลังจากการแยกพืชและสัตว์ และดังนั้นจึง เป็นอิสระของพืช H3 IJJ และ Tetrahymena

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การอภิปราย
เราได้โคลนและหาลำดับยีนสามสโตน H3 จาก Tetrahymena thermophila ดังนั้น T. thermophila เป็นหนึ่งในไม่กี่ยูคาริโอที่ลำดับของครอบครัวสโตนยีนทั้ง
เป็นที่รู้จักกัน (ดูตารางที่ 1) ยีนตัน thermophila H3 เข้ารหัส H3 จำลองแบบขึ้นอยู่กับรายใหญ่และการจำลองแบบอิสระ (ทดแทน) ตัวแปร hv2 ที่มีกรดอะมิโนที่คาดการณ์ลำดับกรด
แตกต่างอย่างมากจากบรรดาสัตว์และพืชสายพันธุ์ H3 ทดแทน Phylogenetic วิเคราะห์ของ H3 โปรตีนโดย neighborjoining และประหยัดวิธีการที่แสดงให้เห็นว่าสามประเภทของ
ตัวแปรอิสระทดแทนเกิดขึ้นอย่างน้อยสองและอาจจะสามครั้งในการวิวัฒนาการ eukaryotic ความไม่แน่นอนเพราะนี่คือการเปลี่ยนแปลงที่ทำให้งงใน topology ของต้นไม้นิวเจอร์ซีย์ที่เกิดจากการเพิ่มขึ้นของลำดับ A.nidulans H3 เราได้สร้างต้นไม้ H3 นิวเจอร์ซีย์หลายครั้งด้วยชุดข้อมูลขนาดใหญ่ขึ้นและพบว่าการสั่งซื้อสาขาสูงทนต่อการเพิ่มขึ้นของลำดับใหม่และสม่ำเสมอในการจัดวางของสัตว์
H3.3 และ H3s เชื้อราในสาขาเดียวกัน (ไม่ได้แสดงข้อมูล) เราไม่ทราบว่าทำไมนอกเหนือจากเชื้อรา Aspergillus H3 มีการเปลี่ยนแปลงตำแหน่งของ H3.3 ตั้งแต่ H3s จากเชื้อรา Aspergillus และ Neurospora แตกต่างกันเพียง 4 ตำแหน่งและใน 3 ของผู้ที่ 4 ตำแหน่งลำดับ Aspergillus เป็นมากขึ้นเช่น H3s เชื้อราอื่น ๆ นอกเหนือจาก Neurospora (ไม่ได้แสดงข้อมูล) ระบุว่า H3.3 สัตว์และ H3s เชื้อราเป็นไฟย์เลติสำหรับความประหยัดทุกการวิเคราะห์ดำเนินการ
กับข้อมูล H3 ทั้งการตั้งค่าและในส่วนย่อยที่แตกต่างกันและที่ต้นไม้นิวเจอร์ซีย์สร้างจากส่วนย่อยเดียวกันทั้งหมด H3.3 วางและ H3s เชื้อราในสาขาเดียวกัน เรารู้สึกว่ามันมีเหตุผลที่จะสรุป H3.3 ที่พัฒนาหลังการแยกทางของพืชและสัตว์และทำให้เป็นอิสระจากพืชและ H3.IJJ Tetrahymena