ขอเชื้อไวรัสไข้หวัดนก H5N1 มีการพัฒนา มีการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรม จากปี 1996 สายพันธุ์ต้นแบบ
อย่างน้อย 10 กลุ่ม มีสายพันธุ์ที่แตกต่างกันและมีการติดเชื้อในหลายประเทศ จนถึงปัจจุบัน สายพันธุ์ H5N1 ได้ติดเชื้อในคน ในช่วงปลายปี 2003 ถึงกลางปี 2005 การติดเชื้อไวรัสไข้หวัดนก H5N1 ในมนุษย์มากที่สุดคือ เกิดจาก clade 1 สายพันธุ์ ในภูมิภาคเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ ได้แก่ เวียดนาม , ไทย , และกัมพูชา ) เริ่มต้นในปี 2004-2005 ทางภูมิศาสตร์การขยายตัวของ clade 2 H5N1 สายพันธุ์ไวรัสหมุนเวียนในหมู่สัตว์ปีกและนกป่าที่เกิดขึ้นจากเอเชียไปยังยุโรป