Escherichia coli is a Gram-negative

Escherichia coli is a Gram-negative straight rod, which either uses peritrichous flagella for mobility or is nonmotile. It is a facultatively anaerobic chemoorganotroph capable of both respiratory and fermentative metabolism. E.coli serves a useful function in the body by suppressing the growth of harmful bacterial species and by synthesising appreciable amounts of vitamins. It is an important component of the biosphere. It colonizes the lower gut of animals and survives when released to the natural environment, allowing widespread dissemination to new hosts. Pathogenic E.coli strains are responsible for infection of the enteric, urinary, pulmonary and nervous systems. Comparison of 20 E.coli/Shigella strains shows the core genome to be about 2000 genes while the pan-genome has over 18,000 genes. There are multiple, striking integration hotspots that are conserved across the genomes, corresponding to regions of abundant and parallel insertions and deletions of genetic material.This strain is an avian pathogenic E.coli (APEC), and was isolated from the lung of a chicken with colisepticemia. E.coli APEC O1 is an O1:K1:H7 strain belonging to phylogroup B2 and was chosen for sequencing as it possesses traits characteristics of E.coli which cause disease outside of the intestinal tract i.e. APEC and UPEC (uropathogenic E.coli) strains. It is highly virulent in chickens. It is closely related to E.coli UTI89, a UPEC strain of E.coli (ECOUT). It contains 4 plasmids, pAPEC-O1-ColBM, pAPEC-O1-R, pAPEC-O1-Cryptic1 and pAPEC-O1-Cryptic2. Plasmid pAPEC-O1-ColBM is an F-type plasmid that produces colicins B and M and encodes a putative virulence cluster. Plasmid pAPEC-O1-R encodes resistance to eight antimicrobial agents. The cryptic plasmids are somewhat related to Yersinia-type plasmids and do not confer any apparent phenotypes. (HAMAP: ECOK1)

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Escherichia coli เป็นแบคทีเรียแกรมลบตรงแกน ซึ่งใช้ peritrichous flagella เคลื่อน หรือเป็น nonmotile ได้ Chemoorganotroph facultatively ไม่ใช้ความสามารถในการเผาผลาญ fermentative และทางเดินหายใจได้ ระบบรองรับฟังก์ชันมีประโยชน์ในร่างกาย โดยเมื่อเจริญเติบโตของเชื้อแบคทีเรียชนิดเป็นอันตราย และยอดเห็น synthesising ของวิตามิน ส่วนประกอบสำคัญของชีวบริเวณได้ Colonizes ลำไส้ต่ำกว่าสัตว์ และ survives เมื่อนำออกใช้ในสภาพแวดล้อมธรรมชาติ อนุญาตให้เผยแพร่อย่างแพร่หลายเพื่อโฮสต์ใหม่ สายพันธุ์ระบบอุบัติมีหน้าที่ในการติดเชื้อของระบบ enteric ท่อปัสสาวะ ระบบทางเดินหายใจ และประสาท เปรียบเทียบสายพันธุ์ E.coli/Shigella 20 แสดงกลุ่มหลักที่เป็น ยีนประมาณ 2000 ในขณะที่กลุ่มแพนมียีนมากกว่า 18000 มีหลาย โดดเด่นฮอตสปอรวมที่อยู่ใน genomes ที่สอดคล้องกับพื้นที่อุดมสมบูรณ์ และขนานแทรกและการลบของวัสดุทางพันธุกรรมต้องใช้นี้เป็นนกอุบัติระบบ (เอเปค), และถูกแยกจากปอดของไก่ colisepticemia ระบบเอเปค O1 จะต้องใช้ O1:K1:H7 เป็นของ phylogroup B2 และถูกเลือกให้เป็นลำดับ ตามที่มันมีลักษณะลักษณะของระบบซึ่งทำให้เกิดโรคนอกทางเดินลำไส้เช่นเอเปคและสายพันธุ์ UPEC (ระบบ uropathogenic) Virulent สูงในไก่ได้ มันมีสัมพันธ์ใกล้ชิดกับระบบ UTI89 ต้องใช้ UPEC ของระบบ (ECOUT) มันประกอบด้วย 4 plasmids, pAPEC-O1-ColBM, pAPEC-O1-R, pAPEC-O1-Cryptic1 และ pAPEC-O1-Cryptic2 มี plasmid ชนิด F ที่สร้าง colicins B และ M และจแมปคลัสเตอร์ putative virulence plasmid pAPEC-O1-ColBM ได้ Plasmid pAPEC-O1-R จแมปทนต่อจุลินทรีย์แทน 8 Plasmids ระทมค่อนข้างเกี่ยวข้องกับชนิด Yersinia plasmids และประสาทฟีใด ๆ ชัดเจน (HAMAP: ECOK1)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เชื้อ Escherichia coli เป็นก้านตรงแกรมลบซึ่งทั้งใช้ peritrichous flagella สำหรับการเคลื่อนย้ายหรือ nonmotile มันเป็นแบบไม่ใช้ออกซิเจน chemoorganotroph facultatively ความสามารถในการเผาผลาญทั้งทางเดินหายใจและการหมัก E.coli ให้บริการฟังก์ชั่นที่มีประโยชน์ในร่างกายโดยการยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อแบคทีเรียชนิดที่เป็นอันตรายและการประเมิน synthesising ปริมาณของวิตามิน มันเป็นองค์ประกอบที่สำคัญของชีวมณฑล มันอาณานิคมลำไส้ลดลงของสัตว์และมีชีวิตอยู่เมื่อปล่อยให้สภาพแวดล้อมทางธรรมชาติที่ช่วยให้การเผยแพร่อย่างกว้างขวางไปยังโฮสต์ใหม่ สายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรคอีโคไลมีความรับผิดชอบในการติดเชื้อของลำไส้ปัสสาวะปอดและระบบประสาท เปรียบเทียบ 20 E.coli / สายพันธุ์ Shigella แสดงให้เห็นจีโนมหลักที่จะประมาณ 2000 ยีนในขณะที่จีโนมกระทะมีมากกว่า 18,000 ยีน มีหลายจุดที่โดดเด่นบูรณาการที่มีการอนุรักษ์ทั่วจีโนมซึ่งสอดคล้องกับภูมิภาคของการแทรกความอุดมสมบูรณ์และแบบขนานและการลบความเครียด material.This ทางพันธุกรรมเป็นนกที่ทำให้เกิดโรคอีโคไล (เอเปค) และถูกแยกออกจากปอดของไก่ที่มี กับ colisepticemia E.coli เอเปค O1 เป็น O1: K1: H7 สายพันธุ์ที่อยู่ในประเภท phylogroup B2 และเป็นทางเลือกสำหรับการจัดลำดับในขณะที่มันมีลักษณะลักษณะของอีโคไลที่ก่อให้เกิดโรคที่ด้านนอกของลำไส้เช่น APEC และ UPEC (uropathogenic E.coli) สายพันธุ์ . มันเป็นความรุนแรงอย่างมากในไก่ มันเป็นเรื่องที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับ E.coli UTI89, ความเครียด UPEC ของ E.coli (ECOUT) มันมี 4 พลาสมิด, pAPEC-O1-ColBM, pAPEC-O1-R-pAPEC O1-Cryptic1 และ pAPEC-O1-Cryptic2 พลาสมิด pAPEC-O1-ColBM เป็นพลาสมิด F-ชนิดที่ผลิต colicins บีและ M และถอดรหัสคลัสเตอร์รุนแรงสมมุติ พลาสมิด pAPEC-O1-R ถอดรหัสความต้านทานต่อยาต้านจุลชีพแปด พลาสมิดที่เป็นความลับจะค่อนข้างที่เกี่ยวข้องกับพลาสมิด Yersinia ชนิดและไม่ได้หารือ phenotypes ชัดเจนใด ๆ (HAMAP: ECOK1)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

อีโคไล เป็นแบคทีเรียแกรมลบตรงแกนซึ่งใช้ peritrichous แฟลกเจลลาสำหรับการเคลื่อนไหวหรือ nonmotile . มันเป็น facultatively ไร้ความสามารถของ chemoorganotroph ทั้งทางเดินหายใจและวิศวกรรมเคมี การเผาผลาญ E.coli ซึ่งเป็นฟังก์ชันที่มีประโยชน์ในร่างกายโดยการปราบปรามการเจริญเติบโตของแบคทีเรียชนิดที่เป็นอันตราย และสังเคราะห์ชดช้อย ปริมาณของวิตามินมันเป็นองค์ประกอบที่สำคัญของชีวมณฑล . มัน colonizes ล่างลำไส้ของสัตว์และมีชีวิตอยู่เมื่อปล่อยธรรมชาติ ให้มีการเผยแพร่ไปยังโฮสต์ใหม่ เชื้อโรค อี. โคไล สายพันธุ์ รับผิดชอบต่อการติดเชื้อของทางเดินปัสสาวะ ระบบปอด และประสาท การเปรียบเทียบของ 20 .สายพันธุ์เชื้อชิเกลลา / แสดงหลักพันธุกรรมจะประมาณ 2000 ยีนในขณะที่กะทะจีโนมมีมากกว่า 18 , 000 ยีน มีหลายจุดที่โดดเด่นที่สามารถบูรณาการทั่วทั้งจีโนมซึ่งสอดคล้องกับภูมิภาคที่อุดมสมบูรณ์และขนานใหม่ลบของและพันธุกรรม สายพันธุ์นี้เป็นชนิดที่ก่อโรคในสัตว์ปีก ( เอเปค )และถูกแยกออกจากปอดของไก่กับ colisepticemia . E.coli เอเปค 01 เป็น 01 : K1 : H7 สายพันธุ์ที่เป็นของ phylogroup B2 และถูกเลือกสำหรับการเป็น ครอบครองลักษณะลักษณะของ E.coli ซึ่งก่อให้เกิดโรคนอกระบบลำไส้ เช่น เอเปกและ upec ( uropathogenic E.coli ) สายพันธุ์ มันเป็นอย่างสูงที่รุนแรงในไก่ มันเป็นที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับ uti89 E.coli ,เป็น upec ของเชื้อ E.coli ( ecout ) ประกอบด้วย 4 เพื่อ papec-o1-colbm papec-o1-r papec-o1-cryptic1 , และ , papec-o1-cryptic2 . พลาสมิด papec-o1-colbm เป็นประเภทพลาสมิดที่สร้าง colicins B และ M และการเข้ารหัสซึ่งกลุ่มโรค . พลาสมิดต้านทานสารต้านจุลชีพ papec-o1-r Intel ตัวแทน 8พลาสมิดที่คลุมเครือค่อนข้างที่เกี่ยวข้องกับเยอซิเนียพลาสมิดชนิดและไม่ปรึกษาใด ๆปรากฏฟีโนไทป์ . ( hamap : ecok1 )