The N- and C-terminal domains of th

The N- and C-terminal domains of the OCP are joined by a
long (∼25 amino acids) peptide chain. Even though this is the
only region of the protein that is not strongly conserved, we
found that K167 and K170 in this linker are cross-linked to
ApcB K58 and ApcE K4, respectively (Table S3 of the
Supporting Information). It seems that this flexible linker could
pass conformational information from the C-terminal domain
to the buried N-terminal domains of the protein or vice versa
and thereby allow the energy coupling of 3′-hECN and
phycocyanobilins (PCBs). According to our model, PCB
pigments from APC660 are located spatially closer to the
pigment of the OCP than PCB is to ApcE. Because spatial
distance dictates the excitation energy transfer efficiency, we
hypothesize that the OCPr will preferentially quench the
excitation energy from APC660. Similar conclusions about
quenching sites were recently proposed on the basis of
spectroscopic methods and mutation studies.26,27,40 We think
that our results constitute direct structural evidence that
supports this hypothesis. There are reports showing that ApcE
(LCM) could also be the binding partner of the OCP and that
ApcE is directly involved in the OCP-mediated NPQ.23,25 Our
data do not exclude this hypothesis; however, if this were the
case, the quenching efficiency would be very low in vivo,
because of the increased spatial distance between 3′-hECN and
the terminal emitter on ApcE (Figure 3). Additionally,
nonphysiological conditions (2 M urea at pH 2.5 or 60 mM
formic acid at pH 3.0) used in the preparation of ApcE and in
the reconstitution of the ApcE−OCP complex in these two
reports could lead to unexpected results.4

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

N - และ C-เทอร์มินัลโดเมนของ OCP จะถูกรวมโดยการยาว (กรดอะมิโน ∼25) เพปไทด์สาย แม้เป็นการภูมิภาคของโปรตีนที่จะไม่ขออยู่ เราพบว่า K167 และ K170 ในตัวเชื่อมโยงข้อมูลนี้เป็น cross-linked การApcB K58 และ ApcE K4 ตามลำดับ (ตาราง S3 ของสนับสนุนข้อมูล) ดูเหมือนว่า ตัวเชื่อมโยงข้อมูลนี้มีความยืดหยุ่นสามารถส่งผ่านข้อมูล conformational จากโดเมนเทอร์มินอล Cการฝัง N-เทอร์มินัลโดเมน ของโปรตีน หรือในทางกลับกันและทำให้คลัปพลังงานของ 3′-hECN และphycocyanobilins (PCBs) ตามแบบจำลองของเรา PCBสีจาก APC660 อยู่ใกล้ spatially เพื่อรงควัตถุ OCP กว่า PCB จะ ApcE เนื่องจากพื้นที่ระยะทางบอกพลังงานในการกระตุ้นโอนประสิทธิภาพ เราhypothesize ว่า OCPr ที่จะโน้ตดับพลังงานในการกระตุ้นจาก APC660 คล้ายบทสรุปเกี่ยวกับอเมริกาชุบเมื่อเร็ว ๆ นี้ได้เสนอบนพื้นฐานของด้านวิธีการและการกลายพันธุ์ studies.26,27,40 เราคิดว่าว่า ผลของเราเป็นตรงโครงสร้างหลักฐานที่สนับสนุนสมมติฐานนี้ มีรายงานแสดงที่ ApcE(LCM) ได้คู่ผูก OCP และที่ApcE เกี่ยวข้องโดยตรงใน NPQ.23,25 OCP mediated ของเราข้อมูลรวมสมมติฐานนี้ อย่างไรก็ตาม ถ้านี้ได้กรณี quenching ประสิทธิภาพจะต่ำมากใน vivoเนื่องจากระยะห่างเพิ่มพื้นที่ระหว่าง 3′-hECN และตัวส่งเทอร์มินัลบน ApcE (3 รูป) นอกจากนี้เงื่อนไข nonphysiological (2 M ยูเรียที่ pH 2.5 หรือ 60 มม.กรดที่ pH 3.0) ใช้ ในการเตรียมการของ ApcE และreconstitution ของ ApcE−OCP ซับซ้อนในสองรายงานอาจไม่คาดคิด results.4

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

N-และโดเมน C-ขั้วของ OCP จะเข้าร่วมโดย
ยาว (~25 กรดอะมิโน) ห่วงโซ่เปปไทด์ แม้จะเป็น
ภูมิภาคเดียวของโปรตีนที่ไม่ได้รับการอนุรักษ์อย่างยิ่งที่เรา
พบว่า K167 และ K170 ในลิงเกอร์นี้จะข้ามเชื่อมโยงกับ
Apcb K58 และ Apce K4 ตามลำดับ (ตารางที่ S3 ของ
ข้อมูลประกอบการ) ดูเหมือนว่าลิงเกอร์ที่มีความยืดหยุ่นนี้อาจ
ส่งผ่านข้อมูลโครงสร้างจากโดเมน C ขั้ว
ที่จะฝังโดเมน N-ขั้วของโปรตีนหรือในทางกลับกัน
และจึงช่วยให้การมีเพศสัมพันธ์การใช้พลังงานของ 3'-hECN และ
phycocyanobilins (ซีบีเอส) ตามรูปแบบของเรา, PCB
สีจาก APC660 ตั้งอยู่เชิงพื้นที่ใกล้เคียงกับ
สีของ OCP กว่า PCB คือการ Apce เพราะอวกาศ
ระยะสั่งการอย่างมีประสิทธิภาพการถ่ายโอนพลังงานกระตุ้นที่เรา
ตั้งสมมติฐานว่า OCPr พิเศษจะดับ
พลังงานกระตุ้นจาก APC660 ข้อสรุปที่คล้ายกันเกี่ยวกับ
เว็บไซต์ดับถูกเสนอเมื่อเร็ว ๆ นี้บนพื้นฐานของ
วิธีสเปกโทรสโกและการกลายพันธุ์ studies.26,27,40 เราคิด
ว่าผลของเราเป็นหลักฐานโครงสร้างโดยตรงที่
สนับสนุนสมมติฐานนี้ มีรายงานแสดงให้เห็นว่ามี Apce
(LCM) นอกจากนี้ยังอาจจะเป็นคนที่ผูกพันของ OCP และ
Apce มีส่วนเกี่ยวข้องโดยตรงใน OCP พึ่ง NPQ.23,25 ของเรา
ข้อมูลที่ไม่ได้ยกเว้นสมมติฐานนี้; แต่ถ้าเป็น
กรณีที่มีประสิทธิภาพดับจะเป็นที่ต่ำมากในร่างกาย,
เพราะระยะทางที่เพิ่มขึ้นระหว่างอวกาศ 3'-hECN และ
อีซีแอลเทอร์ใน Apce (รูปที่ 3) นอกจากนี้
เงื่อนไข nonphysiological (2 M ยูเรียที่ pH 2.5 หรือ 60 มิลลิ
กรดที่ pH 3.0) ที่ใช้ในการจัดทำ Apce และในการ
ละลายที่ซับซ้อน Apce-OCP ในทั้งสอง
รายงานอาจนำไปสู่ ​​results.4 ที่ไม่คาดคิด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

N - ซึ่งโดเมนของ OCP จะเข้าร่วมโดย
ยาว ( ∼ 25 กรดอะมิโนโซ่เปปไทด์ . แม้ว่านี้เป็นเขตเฉพาะของ
โปรตีนที่ไม่ขอเพื่อเรา
k167 k170 ลิงเกอร์และพบว่าในนี้

และทำให้เกิด k58 apcb apce แห่ง ตามลำดับ ( ตารางที่ S3 ของ
ข้อมูลสนับสนุน ) ดูเหมือนว่าที่ยืดหยุ่นนี้อาจ
ลิงเกอร์ส่งข้อมูลหนึ่งจากโดเมนที่ถูกฝังถูก
ซึ่งโดเมนของโปรตีนหรือในทางกลับกัน
และจึงอนุญาตให้การเชื่อมต่อพลังงาน 3 ’ - hecn และ
phycocyanobilins ( PCBs ) ตามรูปแบบของเรา PCB
สีจาก apc660 ตั้งอยู่ใกล้
เปลี่ยนสีของ OCP กว่า PCB คือ apce . เพราะพื้นที่
ระยะสั่งการกระตุ้นการถ่ายโอนพลังงานประสิทธิภาพเรา
พบว่า ocpr จะ preferentially ดับ
พลังงานกระตุ้นจาก apc660 . ข้อสรุปที่คล้ายกันเกี่ยวกับ
ดับเว็บไซต์ล่าสุดที่นำเสนอบนพื้นฐานของ
วิธีการสเปกโทรสโกปีและการกลายพันธุ์ ศึกษา 26,27,40 เราคิด
ผลลัพธ์ของเราเป็นตรงโครงสร้างหลักฐาน
สนับสนุนสมมุติฐานนี้มีรายงานแสดงให้เห็นว่า apce
( LCM ) เป็นคู่ผูกพันของ OCP และ
apce จะเกี่ยวข้องโดยตรงใน OCP ( npq . 23,25 ข้อมูล
ไม่ได้ยกเว้นสมมติฐานนี้ อย่างไรก็ตาม หากมี
กรณี ดับประสิทธิภาพจะต่ำมากในร่างกาย
เพราะ , เพิ่มมิติระยะทางระหว่าง 3 ’ - hecn
terminal และอีซีใน apce ( รูปที่ 3 ) นอกจากนี้
เงื่อนไข nonphysiological ( 2 M ยูเรียที่ pH 2.5 หรือมิค 60 mm
กรดที่ pH 3.0 ) ที่ใช้ในการเตรียมการของ apce และ
การฟื้นฟูของ apce − OCP ซับซ้อนในทั้งสอง
รายงานอาจนำไปสู่ผลลัพธ์ที่ไม่คาดคิด .