Endopeptidase classification based

Endopeptidase classification based on catalytic mechanism and evolutionary history has proven to be invaluable to the study of proteolytic enzymes. Such general mechanistic- and evolutionary- based groupings have launched experimental investigations, because knowledge gained for one family member tends to apply to the other closely related enzymes. The serine endopeptidases represent one of the most abundant and diverse groups, with their apparently successful proteolytic mechanism having arisen independently many times throughout evolution, giving rise to the well-studied soluble chemotrypsins and subtilisins, among many others. A large and diverse family of polytopic transmembrane proteins known as rhomboids has also evolved the serine protease mechanism. While the spatial structure, mechanism, and biochemical function of this family as intramembrane proteases has been established, the cellular roles of these enzymes as well as their natural substrates remain largely undetermined. While the evolutionary history of rhomboid proteases has been debated, sorting out the relationships among current day representatives should provide a solid basis for narrowing the knowledge gap between their biochemical and cellular functions. Indeed, some functional characteristics of rhomboid proteases can be gleaned from their evolutionary relationships. Finally, a specific case where phylogenetic profile analysis has identified proteins that contain a C-terminal processing motif (GlyGly-Cterm) as co-occurring with a set of bacterial rhomboid proteases provides an example of potential target identification through bioinformatics. This article is part of a Special Issue entitled: Intramembrane Proteases.activity at such high salt concentration.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Endopeptidase จัดประเภทตามกลไกตัวเร่งปฏิกิริยา และมีพิสูจน์ประวัติวิวัฒนาการจะล้ำค่าการศึกษาของเอนไซม์ proteolytic ทั่วไปเช่นกลไกการทำ- และวิวัฒนาการ - ตามกลุ่มได้เปิดทดลองสืบสวน เนื่องจากความรู้ที่ได้รับสำหรับหนึ่งครอบครัวมีแนวโน้มที่จะ ใช้กับอีกอย่างใกล้ชิดที่เกี่ยวข้องกับเอนไซม์ Endopeptidases แถแทนหนึ่งกลุ่มหลากหลาย และอุดมสมบูรณ์มากที่สุด กลไกของ proteolytic ประสบความสำเร็จที่เห็นได้ชัดว่ามีเกิดขึ้นอย่างอิสระหลายครั้งตลอดวิวัฒนาการ ให้ขึ้น chemotrypsins studied ดีละลายและ subtilisins ในหมู่อื่น ๆ อีกมากมาย ครอบครัวขนาดใหญ่ และมีความหลากหลายของโปรตีน transmembrane polytopic เรียกว่า rhomboids นอกจากนี้ยังได้พัฒนากลไกรติเอสแถ ในขณะพื้นที่โครงสร้าง กลไก และฟังก์ชันชีวเคมีของตระกูลนี้เป็น intramembrane proteases ก่อตั้งขึ้น ด้านโทรศัพท์มือถือของเอนไซม์เหล่านี้เป็นพื้นผิวธรรมชาติของพวกเขายังคงถูกระบุเป็นส่วนใหญ่ ในขณะที่ได้รับยังคงประวัติวิวัฒนาการของ rhomboid proteases เรียงลำดับออกความสัมพันธ์ระหว่างพนักงานในวันปัจจุบันควรให้พื้นฐานแข็งจำกัดให้แคบลงช่องว่างความรู้ระหว่างหน้าที่ชีวเคมี และโทรศัพท์มือถือ แน่นอน บางลักษณะงานของ rhomboid proteases สามารถคาดจากความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการ สุดท้าย กรณีเฉพาะที่วิเคราะห์โพรไฟล์ phylogenetic ได้ระบุว่าโปรตีนที่ประกอบด้วยการเทอร์มินัล C ประมวลผลแปลน (GlyGly Cterm) เป็นที่เกิดขึ้นร่วมกับชุดของแบคทีเรีย rhomboid proteases แสดงตัวอย่างรหัสที่เป็นเป้าหมายทาง bioinformatics บทความนี้เป็นส่วนหนึ่งของปัญหาพิเศษที่ได้รับ: Intramembrane Proteases.activity ที่ความเข้มข้นเกลือดังกล่าวสูงขึ้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การแบ่ง ประเภท endopeptidase ตามกลไกการมีเครื่องฟอกไอเสียและประวัติวิวัฒนาการได้รับการพิสูจน์ว่าจะหาค่ามิได้ให้กับการศึกษาของเอ็นไซม์ proteolytic กลุ่มกลไกและวิวัฒนาการ - ซึ่งใช้โดยทั่วไปเช่นว่านั้นได้เริ่มการสอบสวนทดลองเพราะได้รับความรู้สำหรับสมาชิกคนหนึ่งในครอบครัวมีแนวโน้มที่จะใช้กับเอ็นไซม์ที่เกี่ยวข้องอื่นๆendopeptidases serine ที่เป็นหนึ่งในกลุ่มที่มีจำนวนมากและหลากหลายด้วยกลไกการ proteolytic ประสบความสำเร็จเห็นได้ชัดว่าได้เกิดขึ้นมาได้อย่างเป็นอิสระหลายครั้งตลอดทั่วทั้งพื้นที่การพัฒนาให้เป็น subtilisins และ chemotrypsins ละลายน้ำได้ดี - ศึกษาในหมู่อื่นๆอีกมากมายสำหรับครอบครัวขนาดใหญ่และที่หลากหลายของโปรตีน transmembrane polytopic รู้จักกันในชื่อ rhomboids มีวิวัฒนาการกลไก protease serine ยัง ในขณะที่ทำงานทางชีวเคมีและกลไกการปรับโครงสร้างบางส่วนของครอบครัวนี้เป็น proteases intramembrane ได้มีการกำหนดบทบาทหน้าที่ของเอ็นไซม์เซลลูลาร์เหล่านี้และ substrates ทางธรรมชาติของพวกเขายังคง undetermined ส่วนใหญ่ในขณะที่ประวัติวิวัฒนาการของ proteases rhomboid ได้รับการถกเถียงการเรียงลำดับจากความสัมพันธ์ระหว่างผู้แทนวันที่ปัจจุบันจะเป็นพื้นฐานที่ดีสำหรับการจำกัดช่องว่างความรู้ระหว่างการทำงานทางชีวเคมีและเซลลูลาร์ของพวกเขา จริงๆแล้วลักษณะงานบางส่วนของ proteases rhomboid สามารถได้รับการรวบรวมขึ้นมาได้จากความสัมพันธ์กับวิวัฒนาการของพวกเขา ในที่สุดกรณีเฉพาะที่โปรไฟล์การวิเคราะห์ phylogenetic ได้ระบุไว้ว่าโปรตีนที่มีลักษณะของความโดดเด่นการประมวลผล c - อาคารโดยสาร A ( gly , gly-cterm )เป็นความร่วมมือที่เกิดขึ้นพร้อมด้วยชุดของ proteases rhomboid เกิดจากเชื้อแบคทีเรียมีตัวอย่างของการระบุเป้าหมายทางผ่านโออินฟอร์เมติกส์, ข้อนี้เป็นส่วนหนึ่งของปัญหาพิเศษที่มีสิทธิรับ intramembrane proteases .กิจกรรมที่ความเข้มข้นสูงเช่นเกลือ