The present study was conducted to

The present study was conducted to identify and characterize the thermophilic bacteria isolated from various hot springs in Turkey by using phenotypic and genotypic methods including fatty acid methyl ester and rep-PCR profilings, and 16S rRNA sequencing. The data of fatty acid analysis showed the presence of 17 different fatty acids in 15 bacterial strains examined in this study. Six fatty acids, 15:0 iso, 15:0 anteiso, 16:0, 16:0 iso,17:0 iso, and 17:0 anteiso, were present in all strains. The bacterial strains were classified into three phenotypic groups based on fatty acid profiles which were confirmed by genotypic methods such as 16S rRNA sequence analysis and rep-PCR genomic fingerprint profiles. After evaluating several primer sets targeting the repetitive DNA elements of REP, ERIC, BOX and (GTG)5, the (GTG)5 and BOXA1R primers were found to be the most reliable technique for identification and taxonomic characterization of thermophilic bacteria in the genera of Geobacillus, Anoxybacillus and Bacillus spp. Therefore, rep-PCR fingerprinting using the (GTG)5 and BOXA1R primers can be considered as a promising genotypic tool for the identification and characterization of thermophilic bacteria from species to strain level.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การศึกษาปัจจุบันได้ดำเนิน การระบุลักษณะของแบคทีเรีย thermophilic ที่แยกต่างหากจากน้ำพุร้อนต่าง ๆ ในตุรกีโดยวิธีฟีโนไทป์ และจีโนไทป์รวมทั้งกรดไขมันเอส methyl profilings แทน-PCR และลำดับ 16S rRNA ข้อมูลการวิเคราะห์กรดไขมันพบว่าสถานะของกรดไขมันแตกต่างกัน 17 ใน 15 สายพันธุ์แบคทีเรียในการศึกษานี้ กรดไขมัน 6, iso 15:0, anteiso 15:0, iso 16:0, 16:0, 17:0 iso และ 17:0 anteiso อยู่ในสายพันธุ์ทั้งหมด สายพันธุ์แบคทีเรียถูกแบ่งเป็นสามกลุ่มไทป์ตามโพรไฟล์กรดไขมันซึ่งได้รับการยืนยัน โดยวิธีจีโนไทป์เช่นวิเคราะห์ 16S rRNA และโพรไฟล์ genomic ลายนิ้วมือแทน PCR หลังจากประเมินหลายพื้นตั้งเป้าหมายองค์ประกอบดีเอ็นเอซ้ำของตัวแทน เอริค กล่อง และ (GTG) 5 (GTG) 5 และไพรเมอร์ BOXA1R พบเป็น เทคนิคเชื่อถือได้มากที่สุดสำหรับการระบุและจำแนกอนุกรมวิธานของแบคทีเรีย thermophilic ในสกุลของโอ Geobacillus, Anoxybacillus และคัด ดังนั้น ตัวแทน PCR (GTG) โดยใช้ลายพิมพ์ 5 และไพรเมอร์ BOXA1R ถือได้ว่าเป็นเครื่องมือว่าจีโนไทป์ในการระบุและจำแนกชนิดแบคทีเรีย thermophilic ระดับต้องใช้ได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การศึกษาครั้งนี้ได้ดำเนินการในการระบุและลักษณะของแบคทีเรียทนร้อนที่แยกได้จากน้ำพุร้อนต่าง ๆ ในตุรกีโดยใช้ฟีโนไทป์และวิธีการทางพันธุกรรมรวมทั้งเมทิลเอสเตอร์ของกรดไขมันและ profilings ตัวแทน-PCR และลำดับ 16S rRNA ข้อมูลของการวิเคราะห์กรดไขมันที่แสดงให้เห็นการปรากฏตัวของกรดไขมันที่แตกต่างกัน 17 ใน 15 สายพันธุ์แบคทีเรียที่ตรวจสอบในการศึกษาครั้งนี้ หกกรดไขมัน 15: 0 ISO, 15: 0 anteiso, 16: 0, 16: 0 ISO, 17: 0 ISO, และ 17: 0 anteiso อยู่ในปัจจุบันในทุกสายพันธุ์ สายพันธุ์แบคทีเรียที่ถูกแบ่งออกเป็นสามกลุ่มฟีโนไทป์ขึ้นอยู่กับรูปแบบของกรดไขมันที่ได้รับการยืนยันโดยวิธีทางพันธุกรรมเช่น 16S rRNA วิเคราะห์ลำดับและตัวแทน-PCR โปรไฟล์ลายนิ้วมือจีโนม หลังจากการประเมินชุดไพรเมอร์หลายกำหนดเป้​​าหมายองค์ประกอบดีเอ็นเอซ้ำ REP, ERIC, BOX และ (GTG) 5 (GTG) 5 และไพรเมอร์ BOXA1R พบว่ามีเทคนิคที่น่าเชื่อถือมากที่สุดสำหรับการระบุและลักษณะทางอนุกรมวิธานของแบคทีเรียทนร้อนในจำพวกของ Geobacillus, Anoxybacillus และ Bacillus spp ดังนั้นการพิมพ์ลายนิ้วมือตัวแทน-PCR โดยใช้ (GTG) และไพรเมอร์ 5 BOXA1R ถือได้ว่าเป็นเครื่องมือที่มีแนวโน้มทางพันธุกรรมสำหรับการระบุและลักษณะของแบคทีเรียทนร้อนจากสายพันธุ์สายพันธุ์ระดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาและวิเคราะห์แบคทีเรีย และที่แยกได้จากน้ำพุร้อนต่างๆในตุรกีโดยใช้คุณสมบัติและวิธีการทางพันธุกรรม ได้แก่ เมทิลเอสเทอร์ของกรดไขมัน และตัวแทนจาก profilings และ 16S rRNA ลำดับ . ข้อมูลการวิเคราะห์กรดไขมัน พบมี 17 แตกต่างกันกรดไขมันใน 15 แบคทีเรียตรวจสอบในการศึกษานี้6 กรดไขมัน 15:0 ISO , 15:0 anteiso 16:0 , 16:0 17:0 , ISO , ISO , และ 17:0 anteiso เป็นปัจจุบันในทุกสายพันธุ์ สายพันธุ์แบคทีเรียออกเป็น 3 กลุ่มตามลักษณะปรากฏของกรดไขมันซึ่งได้รับการยืนยันโดยวิธีทางพันธุกรรม รูปแบบ เช่น เบส 16S rRNA ลำดับการวิเคราะห์และตรวจลายนิ้วมือตัวแทนที่มีโปรไฟล์หลังจากประเมินหลายๆองค์ประกอบดีเอ็นเอไพรเมอร์ชุดเป้าหมายของตัวแทน เอริค และกล่อง ( GTG ) 5 ( GTG ) 5 และ boxa1r ไพรเมอร์ พบว่ามีเทคนิคที่น่าเชื่อถือที่สุดสำหรับการกำหนดลักษณะและอนุกรมวิธานของแบคทีเรียในสกุล geobacillus anoxybacillus และ Bacillus spp . , ดังนั้นตัวแทนจากลายนิ้วมือโดยใช้ 5 ไพรเมอร์ และ boxa1r ( GTG ) ถือได้ว่าเป็นเครื่องมือในการศึกษาแนวโน้มสำหรับการจำแนกและคุณสมบัติของเทอร์โมฟิลิกแบคทีเรียจากสายพันธุ์ระดับความเครียด