DGGE condition. The DGGE was perfor

DGGE condition. The DGGE was performed
using the D-GENE System (Bio-Rad, USA) DGGE
equipment. Equal amounts of DNA were loaded onto
8% (w/v) polyacrylamide gels (40% acrylamide/bissolution, 37.5:1) with denaturing gradients ranging
40%–60% for the bacterial DNA and 25%–40% for the
fungal DNA. The gels were run at 60
◦C and 80 V
for 16 h. The digital images of the gels were analyzed
using image analysis, thereby quantifying the bands
(Quantity One 4.6.3, Bio-Rad). The relative intensity
of a band was expressed as the ratio between the intensity of that band and the total intensity of all bands
in that lane.
DNA sequencing. The DGGE bands were excised and the DNA from each band was eluted in 50
μL of sterile water, overnight at 4
◦
C. OneμL of each
eluted DNA band was re-amplified using the conditions described above. PCR products were analyzed

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

DGGE เงื่อนไขการ ทำการ DGGEใช้ระบบยีน D (Bio Rad สหรัฐอเมริกา) DGGEอุปกรณ์ จำนวนเท่าของดีเอ็นเอถูกโหลดลงใน8% (w/v) polyacrylamide gels (40% อะคริลา ไมด์/bissolution, 37.5:1) ด้วยการไล่ระดับสีตั้งแต่ denaturing40% – 60% ในดีเอ็นเอจากแบคทีเรียและ 25%-40% สำหรับการDNA ของเชื้อรา เจถูกเรียกใช้ที่ 60◦C และ 80 Vสำหรับ 16 h ภาพดิจิตอลของเจได้วิเคราะห์ใช้วิเคราะห์ภาพ quantifying วงดนตรีจึง(ปริมาณหนึ่ง 4.6.3, Bio Rad) ความเข้มสัมพัทธ์ของวงที่แสดงเป็นอัตราส่วนระหว่างความเข้มของวงที่รวมความเข้มของแถบทั้งหมดในเลนนั้นลำดับดีเอ็นเอ วง DGGE ถูก excised และดีเอ็นเอจากแต่ละวงมี eluted ใน 50ΜL กระบอกน้ำ ค้างคืนที่ 4◦C. OneμL ของแต่ละeluted วงดีเอ็นเอถูกใหม่ขยายโดยใช้เงื่อนไขที่อธิบายไว้ข้างต้น ผลิตภัณฑ์ PCR ได้วิเคราะห์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สภาพ DGGE DGGE
ได้ดำเนินการโดยใช้ระบบD-GENE (Bio-Rad สหรัฐอเมริกา) DGGE
อุปกรณ์ ปริมาณที่เท่ากันของดีเอ็นเอถูกโหลดลง
8% (w / v) เจลอะคริเลต (ริลาไมด์ 40% / bissolution 37.5: 1) ที่มีการไล่ระดับสี denaturing ตั้งแต่
40% -60% ในดีเอ็นเอของเชื้อแบคทีเรียและ 25% -40%
ในดีเอ็นเอของเชื้อรา. เจลวิ่งที่ 60
◦Cและ 80 V
16 ชั่วโมง
ภาพดิจิตอลของเจลที่ถูกวิเคราะห์โดยใช้การวิเคราะห์ภาพจึงปริมาณวง
(จำนวนหนึ่ง 4.6.3, Bio-Rad) ความเข้มของญาติของวงดนตรีที่แสดงเป็นอัตราส่วนระหว่างความเข้มของวงดนตรีที่และความรุนแรงรวมของวงดนตรีทั้งหมดในช่องทางที่. ลำดับดีเอ็นเอ วง DGGE ถูกตัดและ DNA จากแต่ละวงที่ถูกชะ 50 ไมโครลิตรน้ำหมันค้างคืนที่ 4 ◦ซี OneμLของแต่ละวงดีเอ็นเอชะเป็นอีกครั้งที่การขยายการใช้เงื่อนไขที่กล่าวไว้ข้างต้น ผลิตภัณฑ์ PCR วิเคราะห์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การทดลองเงื่อนไข ในการทดลองการใช้ระบบ d-gene
( สหรัฐอเมริกาไบแรด ) อุปกรณ์การทดลอง

เท่ากับจํานวนเงินของดีเอ็นเอที่ถูกโหลดไปยัง
8 % ( w / v ) โพลีอะคริลาไมด์เจล ( 40% อะคริลาไมด์ / bissolution 37.5:1 ี่ , ) ไล่ตั้งแต่
40% และ 60% สำหรับดีเอ็นเอแบคทีเรียและ 25% และ 40% สำหรับ
ดีเอ็นเอของเชื้อรา เจลเป็นวิ่งที่ 60 องศาเซลเซียสและ 80 V

◦ 16 ชั่วโมง ภาพดิจิตอลของเจลวิเคราะห์
โดยใช้การวิเคราะห์ภาพ งบค่าวงดนตรี
( ปริมาณหนึ่ง 4.6.3 ชีวภาพราด ) เทียบความเข้ม
ของวงจะแสดงเป็น อัตราส่วนระหว่างความเข้มของวงดนตรีและความรุนแรงทั้งหมดของทุกวง

ในช่องทางที่ การจัดลำดับดีเอ็นเอ การทดลองที่รัดตัดและดีเอ็นเอจากตัวอย่างในแต่ละวง 50
μลิตรน้ำหมัน , ค้างคืนที่ 4
◦
C หนึ่งμ l
แต่ละตัวอย่างของแถบดีเอ็นเอได้อีกครั้งโดยใช้เงื่อนไขที่อธิบายไว้ข้างต้น ผลิตภัณฑ์ PCR วิเคราะห์