Molecular analysisComparisons with

Molecular analysis

Comparisons with 16S rRNA gene sequences from the GenBank
database revealed
that both strains Y24
T
(1,523 bp,
GenBank accession number KM243343) and H9
T
(1518 bp,
GenBank accession number KM243342) had the highest
similarity to P. hunanensis FeL05
T
. The phylogenetic tree
constructed using the neighbour-joining method (Fig. 1)
suggested that strains Y24
T
and H9
T
were members of the
genus Paenibacillus. The two new isolates and the reference
type strain P. hunanensis FeL05
T
formed a well-delineated
subclade in the phylogenetic tree, which were supported by
all of the tree-making algorithms and with relative higher
bootstrap value. The two isolates Y24
T
and H9
T
shared 16S
rRNA gene similarities with the P. hunanensis FeL05
of
96.0 and 97.0 %, respectively, while the two isolates also
shared a higher 16S rRNA gene similarity (98.4 %). The
T

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิเคราะห์ระดับโมเลกุลเปรียบเทียบกับลำดับยีนของ 16S rRNA จาก GenBankฐานข้อมูลที่เปิดเผยว่า ทั้งสองสายพันธุ์ Y24T (1,523 bpหมายเลขทะเบียนใน GenBank KM243343) และ H9T (1518 bpมีหมายเลขทะเบียนใน GenBank KM243342) ที่สูงที่สุดจากคล้ายกับ P. hunanensis FeL05T. ต้น phylogeneticสร้างขึ้นโดยใช้วิธีรวมเพื่อนบ้าน (Fig. 1)แนะนำที่สายพันธุ์ Y24T และ H9T อยู่พืชสกุล Paenibacillus แยกได้ใหม่สองและการอ้างอิงต้องใช้ชนิด P. hunanensis FeL05T รูปแบบห้องพัก delineatedsubclade ใน phylogenetic ซึ่งได้รับการสนับสนุนโดยทั้งหมด ของอัลกอริทึมทำแผนภูมิ และญาติสูงค่าเริ่มต้นระบบ ทั้งสองแยก Y24T และ H9T ร่วม 16SrRNA ยีนความคล้ายคลึงกับ P. hunanensis FeL05 ของ96.0 และ 97.0% ตามลำดับ ในขณะแยกสองยังความสูง 16S rRNA ยีนคล้าย (98.4%) ที่ใช้ร่วมกัน ที่ T

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์โมเลกุลเปรียบเทียบกับ 16S rRNA ลำดับยีนจาก GenBank ฐานข้อมูลเปิดเผยว่าทั้งสองสายพันธุ์ y24 T (1,523 bp, GenBank ภาคยานุวัติจำนวน KM243343) และ H9 T (1518 bp, GenBank ภาคยานุวัติจำนวน KM243342) ได้สูงสุดคล้ายคลึงกันที่พี hunanensis FeL05 T phylogenetic ต้นไม้สร้างขึ้นโดยใช้วิธีการที่เพื่อนบ้านเข้า (รูปที่ 1). ชี้ให้เห็นว่าสายพันธุ์ y24 T และ H9 T เป็นสมาชิกของสกุล Paenibacillus สองสายพันธุ์ใหม่และการอ้างอิงชนิดสายพันธุ์ P. hunanensis FeL05 T ที่เกิดขึ้นเป็นอย่างดี delineated subclade ในต้นไม้สายวิวัฒนาการซึ่งได้รับการสนับสนุนโดยทุกขั้นตอนวิธีการทำต้นไม้และด้วยความที่สูงขึ้นเมื่อเทียบค่าบูต ทั้งสองแยก y24 T และ H9 T ที่ใช้ร่วมกัน 16S rRNA คล้ายคลึงกับยีน P. hunanensis FeL05 ของ96.0 และ 97.0% ตามลำดับขณะที่ทั้งสองสายพันธุ์นี้ยังใช้ร่วมกันความคล้ายคลึงกันของยีน 16S rRNA ที่สูงขึ้น (98.4%) T

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ระดับโมเลกุลการวิเคราะห์เปรียบเทียบกับยีน 16S rRNA


ขนาดลำดับจากฐานข้อมูลพบว่าทั้งสองสายพันธุ์ y24

t
( 1523 /
ขนาดเข้าเบอร์ km243343 ) และ h9
t
( 1518 /
ขนาดเข้าเบอร์ km243342 ) มีความเหมือนสูงสุด
p . hunanensis fel05
T
ต้นไม้ phylogenetic
สร้างโดยใช้วิธีการเพื่อนบ้านร่วม ( รูปที่ 1 ) พบว่าสายพันธุ์ y24


T
T
h9 และเป็นสมาชิกของ
สกุล paenibacillus . ใหม่สองสายพันธุ์และชนิดอ้างอิง
เมื่อยหน้า hunanensis fel05
T
รูปแบบที่ดี
subclade delineated ใน phylogenetic ต้นไม้ ซึ่งได้รับการสนับสนุนโดย
ทั้งหมดของต้นไม้ทำให้ขั้นตอนวิธีและญาติที่สูง
บูค่า สองสายพันธุ์ y24
T

T
h9 และ 16S rRNA ยีนที่คล้ายคลึงกับหน้า


ของ hunanensis fel05 96.0 97.0 และ %ตามลำดับ ในขณะที่สองสายพันธุ์ยัง
ใช้สูงกว่าเบส 16S rRNA ยีนความเหมือน ( 98.4 % )

t