Phage-host interactions remain poor

Phage-host interactions remain poorly understood in lactic acid bacteria and essentially in all Gram-positive bacteria. The aim of this study was to identify the phage genetic determinant (anti-receptor) involved in the recognition of Streptococcus thermophilus hosts. The complete genomic sequence of the lytic S. thermophilus phage DT1 was determined previously, and bioinformatic analysis indicated that orf18 might be the anti-receptor gene. The orf18 of six additional S. thermophilus phages was determined (DT2, DT4, MD1, MD2, MD4 and Q5) and compared with the orf18 of DT1. The deduced ORF18 was divided into three domains. The first domain, which contains the N-terminal part of the protein, was conserved in all seven phages. The second domain was detected in only two phages and flanked by a motif called collagen-like repeats. The second domain also contained a variable region (VR1). All seven phages had a third domain that consisted of the C-terminal section of the protein as well as another variable region (VR2). Chimeric DT1 phages were constructed by recombination; a portion of its orf18 was replaced by the corresponding section in orf18 of the phage MD4. All DT1 chimeric phages acquired the host range of phage MD4. Analysis of the orf18 in the chimeric phages revealed that host specificity in phages DT1 and MD4 resulted from VR2. This is the first report on the identification and characterization of a phage gene involved in the host recognition process of Gram-positive bacteria.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โฮสต์ phage โต้ตอบยังคงไม่ดีเข้าใจ ในแบคทีเรียกรดแลกติก และเป็นแบคทีเรียทั้งหมด จุดมุ่งหมายของการศึกษานี้ระบุ phage พันธุดีเทอร์มิแนนต์ (ต่อต้านตัวรับ) ที่เกี่ยวข้องในการรับรู้อุณหภูมิ thermophilus โฮสต์ได้ กำหนดลำดับ genomic สมบูรณ์ของ lytic S. thermophilus phage DT1 ก่อนหน้านี้ และการวิเคราะห์ผลเชิงวิวัฒนาการระบุ orf18 ที่อาจจะมียีนตัวรับป้องกัน Orf18 ของ phages thermophilus S. เพิ่มเติม 6 กำหนด (DT2, DT4, MD1, MD2, MD4 และ Q5) และเปรียบเทียบกับ orf18 ของ DT1 Deduced ORF18 ถูกแบ่งออกเป็น 3 โดเมน ครั้งแรกโดเมน ซึ่งประกอบด้วยส่วน N-เทอร์มินัลของโปรตีน มีอยู่ในทั้งหมดเจ็ด phages โดเมนที่สองที่พบใน phages เพียงสอง และขนาบข้าง ด้วยแปลนที่เรียกว่าคอลลาเจนเช่นทำซ้ำ โดเมนที่สองยังประกอบด้วยตัวแปรภูมิภาค (VR1) Phages ทั้งหมดเจ็ดมีโดเมนที่สามที่ประกอบด้วยส่วนซีนัลโปรตีนเป็นอีกตัวแปรภูมิภาค (VR2) Chimeric DT1 phages ถูกสร้าง โดย recombination ส่วนของ orf18 ถูกแทนที่ ด้วยส่วนเกี่ยวข้องใน orf18 ของ phage MD4 ทั้งหมด DT1 chimeric phages มาช่วงโฮสต์ของ phage MD4 วิเคราะห์ของ orf18 ใน chimeric phages เปิดเผย specificity ที่โฮสต์ใน phages DT1 และ MD4 เป็นผลมาจาก VR2 นี้เป็นรายงานแรกในรหัสการจำแนกยีน phage ที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการโฮสต์ของแบคทีเรีย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ปฏิสัมพันธ์ Phage เจ้าภาพยังคงเข้าใจได้ไม่ดีในแบคทีเรียกรดแลคติกและเป็นหลักในทุกแบคทีเรียแกรมบวก จุดมุ่งหมายของการศึกษาครั้งนี้คือการระบุปัจจัยทางพันธุกรรมฟาจ (การป้องกันตัวรับ) มีส่วนร่วมในการรับรู้ของ Streptococcus thermophilus เจ้าภาพ ลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ของ lytic S. thermophilus phage DT1 ถูกกำหนดไว้ก่อนหน้านี้และการวิเคราะห์ bioinformatic ชี้ให้เห็นว่าอาจจะมี orf18 ยีนต้านรับ orf18 หกเพิ่มเติม S. thermophilus phages ถูกกำหนด (DT2, DT4, MD1, MD2, MD4 และ Q5) และเมื่อเทียบกับ orf18 ของ DT1 ORF18 อนุมานได้แบ่งออกเป็นสามโดเมน โดเมนแรกซึ่งมีส่วนที่ไม่มีขั้วของโปรตีนที่ถูกอนุรักษ์ในทุกเจ็ด phages โดเมนที่สองถูกตรวจพบในเพียงสอง phages และขนาบข้างด้วยมาตรฐานที่เรียกว่าคอลลาเจนซ้ำเหมือน โดเมนที่สองยังมีตัวแปรภูมิภาค (VR1) ทั้งเจ็ด phages มีโดเมนที่สามที่ประกอบด้วยส่วน C ขั้วของโปรตีนเช่นเดียวกับภูมิภาคตัวแปรอื่น (VR2) phages ลูกผสม DT1 ถูกสร้างขึ้นโดยการรวมตัวกันอีก; เป็นส่วนหนึ่งของ orf18 มันถูกแทนที่ด้วยส่วนที่สอดคล้องกันใน orf18 ของ MD4 phage ทั้งหมด DT1 phages ลูกผสมที่ได้มาในช่วงที่โฮสต์ของ MD4 ทำลายจุลินทรีย์ การวิเคราะห์ orf18 ใน phages ลูกผสมที่แสดงให้เห็นว่าในความจำเพาะโฮสต์ phages DT1 MD4 และเป็นผลมาจาก VR2 รายงานนี้เป็นรายงานครั้งแรกในการระบุและลักษณะของยีนที่เกี่ยวข้องกับการทำลายจุลินทรีย์ในกระบวนการการรับรู้โฮสต์ของแบคทีเรียแกรมบวก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โฮสต์ของฟายังคงไม่ค่อยเข้าใจในแบคทีเรียกรดแลคติกและเป็นหลักในกรัมบวกแบคทีเรีย จุดมุ่งหมายของการศึกษานี้คือ เพื่อศึกษาว่าปัจจัยทางพันธุกรรม ( Anti receptor ) ที่เกี่ยวข้องในการรับรู้ของ Streptococcus เทอร์มอฟิลัสโยธา ลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ของเอนไซม์เอสเทอร์มอฟิลัสว่า dt1 ตั้งใจไว้ก่อนหน้านี้และการวิเคราะห์ไบโอ นฟ ์เมติก พบว่า orf18 อาจต่อต้านรีเซพเตอร์ยีน การ orf18 หกเพิ่มเติม . สีที่ได้จากธรรมชาติจตั้งใจ ( dt2 dt4 md1 md2 , , , , และ md4 Q5 ) และเมื่อเทียบกับ orf18 ของ dt1 . ได้ orf18 แบ่งออกเป็น 3 โดเมน โดเมนแรกซึ่งประกอบด้วยส่วนของกรดอะมิโนของโปรตีน เป็นป่าสงวนในทั้งหมดเจ็ดจ .โดเมนที่สองที่ตรวจพบในเพียงสองฟาจและขนาบข้างด้วยแม่ลายเรียกว่าคอลลาเจนเหมือนวนกลับมาที่เดิม โดเมนที่สองยังมีตัวแปรเขต ( vr1 ) มีทั้งหมดเจ็ดจสามโดเมนที่ประกอบด้วยส่วนของโปรตีนซึ่งเป็นอีกตัวแปรเขต ( vr2 ) ที่ถูกสร้างขึ้นโดยการ dt1 จ ;ส่วนของ orf18 ถูกแทนที่ด้วยส่วนที่เกี่ยวข้องใน orf18 ของฟา md4 . จ dt1 ทั้งหมดที่ได้รับเป็นเจ้าภาพช่วงของฟา md4 . การวิเคราะห์ orf18 ในจ เปิดเผยว่า เฉพาะเจาะจงในที่โฮสต์และจ dt1 md4 ที่เกิดจาก vr2 .นี่คือรายงานแรกในการจำแนกและลักษณะสมบัติของยีนที่เกี่ยวข้องกับฟาในโฮสต์กระบวนการรับรู้ของแบคทีเรียกรัมบวก