2. Materials andmethods2.1. Sequenc

2. Materials andmethods
2.1. Sequence retrieval, alignments, and expression data acquisition
In total, 69 tumor suppressor genes (the list are in Supplementary File 1) which code proteins with different molecular functions and localizations in the cell, were extracted along with their normalized mRNA expression directly from SOURCE, 2009 (Stanford Microarray) database(source.stanford.edu). This database links to microarray experimentsthat included the queried gene. Their CDS and protein sequenceswere ob-
tained from NCBI database. Because of minimizing the statistical errors,multiple alignments were performed for obtained sequences by ClustalW program(http://www.ebi.ac.uk). Twenty five tissues were selected and in each tissue the average expression level, the number of expressed genes, and the highest expressed gene were recognized.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2. วัสดุ andmethods2.1. ลำดับเรียก การจัดแนว และซื้อข้อมูลนิพจน์รวม 69 เนื้องอกตัวป้องกันไฟเกินยีน (รายชื่ออยู่ในไฟล์เสริมที่ 1) ซึ่งรหัสโปรตีน มีหน้าที่ต่างกันโมเลกุลและ localizations ในเซลล์ ถูกสกัด ด้วยนิพจน์ mRNA ของมาตรฐานโดยตรงจากแหล่ง database(source.stanford.edu) 2009 (Microarray สแตนฟอร์ด) เชื่อมโยงฐานข้อมูลนี้ไปยัง microarray experimentsthat รวมยีนสอบถาม ของซีดีและโปรตีน sequenceswere ob-tained จากฐานข้อมูล NCBI เนื่องจากการลดข้อผิดพลาดทางสถิติ จัดหลายแนวได้จัดทำลำดับได้รับ โดยโปรแกรม ClustalW (http://www.ebi.ac.uk) เลือกเนื้อเยื่อ five ยี่สิบ และในแต่ละเนื้อเยื่อระดับนิพจน์เฉลี่ย จำนวนแสดงยีน ยีนแสดงสูงสุดได้รับรู้และ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2. วัสดุ andmethods
2.1 ดึงลำดับการจัดแนวและการแสดงออกข้อมูลที่ได้มา
ทั้งหมด 69 ยีนต้านมะเร็ง (รายการที่อยู่ในไฟล์เสริม 1) ซึ่งโปรตีนรหัสกับฟังก์ชั่นที่แตกต่างกันในระดับโมเลกุลและ localizations ในเซลล์ถูกสกัดพร้อมกับแสดงออกปกติของพวกเขาโดยตรงจากแหล่งที่มา 2009 (Stanford Microarray) ฐานข้อมูล (source.stanford.edu) การเชื่อมโยงฐานข้อมูลนี้เพื่อ experimentsthat microarray รวมยีนสอบถาม CDS ของพวกเขาและโปรตีน sequenceswere สังเกตการ
tained จากฐานข้อมูล NCBI เนื่องจากการลดข้อผิดพลาดทางสถิติ, การจัดแนวหลายได้ดำเนินการสำหรับลำดับที่ได้รับจากโปรแกรม ClustalW (http://www.ebi.ac.uk) ยี่สิบ Fi เนื้อเยื่อได้รับการคัดเลือกและและในแต่ละเนื้อเยื่อระดับการแสดงออกโดยเฉลี่ยจำนวนของยีนที่แสดงออกและการแสดงออกของยีนที่แสดงออกมากที่สุดได้รับการยอมรับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2 . วิธีการวัสดุ
2.1 . ลำดับการดึงแนวร่วม และข้อมูลการแสดงออกได้มา
รวม 69 เนื้องอกเครื่องห้ามยีน ( รายชื่ออยู่ในแฟ้มเพิ่มเติม 1 ) ซึ่งรหัสโปรตีนที่มีโมเลกุลที่แตกต่างกันและฟังก์ชัน localizations ในเซลล์ ถูกสกัดพร้อมรูปของการแสดงออกโดยตรงจากแหล่ง 2009 ( Stanford microarray ) ฐานข้อมูล ( แหล่งที่มา สแตนฟอร์ด . edu ) .ฐานข้อมูลเชื่อมโยงไปยัง microarray experimentsthat รวม เนื่องจากยีน ของซีดีและโปรตีน sequenceswere OB -
tained จากฐานข้อมูล ncbi . เพราะลดข้อผิดพลาดทางสถิติ การแสดงได้หลายลำดับ โดยโปรแกรมสำหรับ clustalw ( http : / / www.ebi . ac.uk ) 20 จึงได้ถูกเลือกในเนื้อเยื่อและเนื้อเยื่อแต่ละระดับการแสดงออกโดยจํานวนแสดงออกยีน และสูงสุดแสดงออกยีนเป็นที่รู้จัก