Signaling pathways and transcriptio

Signaling pathways and transcription factors. Genes of
the highly conserved TGF-b, Wnt, EGF, and JAK/STAT
signaling pathways, all utilized in development, have undergone
several aphid-specific duplications and losses. Multiple paralogs of
Dpp(4 paralogs), Medea(5), Mad(2), Domeless(4), STAT(2), Argos(4),
andArmadillo(2) are found in the pea aphid genome. These gene
expansions are of particular note because duplications of genes
that encode the components of signaling pathways are rare in
animals [82]. Conversely, we identified aphid lineage-specific gene
losses for several TGF-bligands (BMP10, Maverick, and Alp23),
Wnt ligands (Wnt6, Wnt10), andSprouty(RTK signaling inhibitor).
The pea aphid genome contains 640 putative sequence-specific
transcription factors. Most of the transcription factor families are
similar in size and composition to those of other insects. However,
the pea aphid genome encodes significantly more zinc-fingercontaining proteins than other insects with sequenced genomes.
Although the number of bHLH encoding genes is similar to other
insects, orthologs of the achaete-scutegenes, which are required for
neurogenesis and bristle development inDrosophilaand are found
in other (holometabolous) insect genomes, were not found. All
Hox complex genes are present, butHox3 (zen)andftz, which have
evolved non-homeotic functions in insects, are highly divergent
from the orthologs of other species.
Juvenile hormone (JH). JH has been implicated in
regulating aphid reproductive polyphenism [83,84]. The main
enzymes responsible for the synthesis and degradation of JH
are present in the pea aphid genome, and several of these
developmental genes are methylated [37], supporting the hypothesis that methylation could play a role in the developmental
plasticity of aphids as it does in other insects (Table 3). The pea
aphid apparently lacks other JH associated proteins such as
hexamerins, which constitute a class of JH binding proteins
implicated in many physiological processes including caste
regulation of lower termites [85].
Mitosis, meiosis and cell cycle. Aphids exhibit plasticity in
meiosis and the cell cycle, allowing for both sexual reproduction
and parthenogenesis. Most genes involved in meiosis and the cell
cycle in vertebrates and yeasts are present in the pea aphid
genome, while other sequenced insect genomes show lineagespecific losses of individual genes or gene family members [86].
While genes known to regulate the transition from G1 (growth) to
S (DNA replication) phases of the cell cycle in metazoans are
present in aphids (Figure 11A), the pea aphid genome also
contains lineage-specific duplications of several mitotic regulators,
such as Cdk1, Polo, Wee1, Cdc25, and Aurora(Figure 11B). In
addition, the pea aphid genome contains lineage-specific
duplications of several mitosis-related genes, including Smc6
(structural maintenance of chromosomes 6) and Topo2(DNA
Topoisomerase 2). These genes are single copy in other insects
with sequenced genomes but duplicated in the Crustacean,
Daphnia pulex, which is also capable of both sexual and asexual
reproduction [87].
Neuropeptides, biogenic amines, and their receptors.
Neuropeptides and biogenic amines are cell-to-cell signalin

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิถีการส่งสัญญาณและปัจจัยการถอดความ ยีนของ
อนุรักษ์สูง TGF-B, wnt, EGF และ jak / สถิติ
ทุลักทุเลสัญญาณทั้งหมดที่ใช้ในการพัฒนาได้เกิดการซ้ำซ้อนกันเพลี้ยเฉพาะ
หลายและการสูญเสีย paralogs หลาย DPP
(4 paralogs) Medea (5), บ้า (2), domeless (4) สถิติ (2), อาร์กอส (4), andarmadillo
(2) ที่พบในจีโนมของเพลี้ยอ่อนถั่ว ยีนเหล่านี้
ขยายเป็นพิเศษหมายเหตุเพราะซ้ำซ้อนกันของยีน
ที่เข้ารหัสส่วนประกอบของเซลล์ส่งสัญญาณเป็นของหายากในสัตว์
[82] ตรงกันข้ามเราระบุยีนเชื้อสายเฉพาะเพลี้ยสูญเสีย
หลาย bligands-TGF (bmp10 ไม่ฝักใฝ่ฝ่ายใดและ alp23)
แกนด์ wnt (wnt6, wnt10) andsprouty (RTK ยับยั้งการส่งสัญญาณ).
จีโนมเพลี้ยอ่อนถั่วมี 640 ลำดับสมมุติ เฉพาะ
ถอดความปัจจัย ส่วนใหญ่ของครอบครัวถอดความปัจจัยเป็น
ที่คล้ายกันในขนาดและองค์ประกอบกับพวกแมลงอื่น ๆ แต่
จีโนมเพลี้ยถั่ว encodes โปรตีนสังกะสี fingercontaining อย่างมีนัยสำคัญมากกว่าแมลงอื่น ๆ ที่มีจีโนมติดใจ.
แม้ว่าจำนวนของยีน bHLH การเข้ารหัสคล้ายกับแมลง
อื่น ๆ orthologs ของ scutegenes achaete ซึ่งจำเป็นสำหรับการ
neurogenesis และโกรธ indrosophilaand พัฒนาจะพบว่า
อื่น ๆ ในจีโนมของแมลง (holometabolous) ไม่พบ ทั้งหมด
hox ยีนที่ซับซ้อนในปัจจุบัน buthox3 (เซน) andftz ซึ่งได้
พัฒนาฟังก์ชั่นที่ไม่ homeotic ในแมลงเป็น
ที่แตกต่างกันอย่างมากจาก orthologs ของสายพันธุ์อื่น ๆ .
เยาวชนฮอร์โมน (JH) JH ได้รับส่วนเกี่ยวข้องในการ
polyphenism สืบพันธุ์ควบคุมเพลี้ย [83,84]
หลักเอนไซม์ที่รับผิดชอบในการสังเคราะห์และการสลายตัวของ JH
มีอยู่ในจีโนมของเพลี้ยอ่อนถั่วและอีกหลายยีนเหล่านี้มีพัฒนาการ
เมทิลเลชั่น [37] ที่สนับสนุนสมมติฐานที่ว่าเมธิลสามารถมีบทบาทในการปั้น
พัฒนาการของเพลี้ยมันไม่ ในแมลงอื่น ๆ (ตารางที่ 3) เพลี้ย
ถั่วอื่น ๆ เห็นได้ชัดว่าขาดโปรตีน JH ที่เกี่ยวข้องเช่น hexamerins
ซึ่งประกอบด้วยชั้นของโปรตีนที่มีผลผูกพัน JH
ส่วนเกี่ยวข้องในกระบวนการทางสรีรวิทยาหลายคนรวมทั้งกฎระเบียบ
วรรณะของปลวกลดลง [85].
วงจรเซลล์เซลล์ชนิดหนึ่งและโทรศัพท์มือถือ เพลี้ยปั้นแสดงในเซลล์ชนิดหนึ่ง
และวงจรมือถือเพื่อให้สามารถ
สืบพันธุ์ทั้งสองเพศและพาร์ธิ ยีนส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องกับการแบ่งเซลล์ชนิดหนึ่งและเซลล์วงจร
ในสัตว์ที่มีกระดูกสันหลังและยีสต์ที่มีอยู่ในถั่วเพลี้ย
จีโนมขณะที่อื่น ๆ ติดใจจีโนมของแมลงแสดงการสูญเสีย lineagespecific ของยีนของแต่ละบุคคลหรือสมาชิกในครอบครัวของยีน [86].
ในขณะที่ยีนที่รู้จักกันในการควบคุมการเปลี่ยนจาก G1 (เจริญเติบโต) เพื่อ s
ขั้นตอน (คัดลอกดีเอ็นเอ) ของวงจรเซลล์ใน metazoans เป็น
ในปัจจุบันเพลี้ยอ่อน (11a รูป), จีโนมเพลี้ยอ่อนถั่วยังมี
ซ้ำซ้อนกันเชื้อสายเฉพาะของหน่วยงานกำกับดูแลทิคส์หลาย
เช่น Cdk 1, โปโล,Wee1, cdc 25 และออโรร่า (11b รูป) นอกจาก
จีโนมเพลี้ยอ่อนถั่วมีซ้ำซ้อนกัน
เชื้อสายเฉพาะของยีนที่เกี่ยวข้องกับเซลล์หลายแห่งรวมถึง smc6
(การบำรุงรักษาโครงสร้างของโครโมโซม 6) และ topo2 (DNA topoisomerase
2) ยีนเหล่านี้เป็นสำเนาเดียวในแมลงอื่น ๆ
กับจีโนมติดใจ แต่ซ้ำในสัตว์น้ำที่มีเปลือกแข็ง,
Daphnia pulex,ซึ่งยังเป็นความสามารถในการสืบพันธุ์ทั้งสอง
ทางเพศและไม่อาศัยเพศ [87]. neuropeptides
biogenic amines และผู้รับ. neuropeptides
และเอมีน biogenic เป็นเซลล์ไปยังเซลล์-signalin

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มนต์ signaling และปัจจัย transcription ยีนของ
สูงนำ TGF b, Wnt, EGF กับจักร/สถิติ
สัญญาณมีระดับมนต์ ทั้งหมดที่ใช้ในการพัฒนา
duplications aphid เฉพาะหลายและขาดทุน Paralogs หลายของ
Dpp(4 paralogs), Medea(5), Mad(2), Domeless(4), STAT(2), Argos(4),
andArmadillo(2) อยู่ในจีโนม aphid ดอกอัญชัญ ยีนเหล่านี้
ขยายมีเฉพาะตั๋วเนื่องจาก duplications ของยีน
ที่เข้ารหัสส่วนประกอบของสัญญาณหลักไม่ค่อยพบใน
สัตว์ [82] ในทางกลับกัน เราระบุยีนเฉพาะลินเนจ aphid
สูญเสียหลาย TGF-bligands (BMP10, Maverick และ Alp23),
Wnt ligands (Wnt6, Wnt10), andSprouty(RTK signaling inhibitor).
จีโนม aphid ดอกอัญชัญประกอบด้วย 640 putative ลำดับเฉพาะ
ปัจจัย transcription ส่วนใหญ่ของครอบครัวปัจจัย transcription
คล้ายกันในขนาดและองค์ประกอบกับแมลงอื่น ๆ อย่างไรก็ตาม,
จีโนม aphid ชัญจแมปมาก fingercontaining สังกะสีโปรตีนมากกว่าแมลงอื่น ๆ ด้วยตามลำดับ genomes.
แม้ว่าหมายเลข bHLH เข้ารหัสยีนคล้ายกัน
แมลง orthologs achaete-scutegenes ที่จำเป็นสำหรับ
พบ inDrosophilaand พัฒนา neurogenesis และพองขน
ใน genomes แมลงอื่น ๆ (holometabolous) ไม่พบ ทั้งหมด
ยีน Hox ซับซ้อนอยู่ butHox3 andftz (เซน) ซึ่งมี
evolved ไม่ใช่-homeotic ฟังก์ชันในแมลง มีขันติธรรมสูง
จาก orthologs ของชนิดอื่น ๆ
เยาวชนฮอร์โมน (JH) JH มีการเกี่ยวข้องใน
ควบคุม aphid สืบพันธุ์ polyphenism [83,84] หลัก
เอนไซม์การสังเคราะห์และย่อยสลายของ JH
อยู่ในจีโนม aphid ดอกอัญชัญ และหลาย ๆ อย่าง
ยีนพัฒนาเป็น methylated [37] , สนับสนุนสมมติฐานการปรับที่สามารถมีบทบาทในการพัฒนา
plasticity aphids เป็นมันไม่ในแมลงอื่น ๆ (ตาราง 3) ถั่ว
aphid เห็นได้ชัดว่าขาดโปรตีน JH ที่เกี่ยวข้องอื่น ๆ เช่น
hexamerins ซึ่งเป็นชั้นของโปรตีนรวม JH
เกี่ยวข้องในกระบวนการสรีรวิทยาต่าง ๆ รวมทั้งวรรณะ
ระเบียบล่างปลวก [85] .
ไมโทซิส ไมโอซิส และรอบเซลล์ Aphids แสดง plasticity ใน
ไมโอซิสและรอบเซลล์ ช่วยให้การสืบพันธุ์ทั้งสองเพศ
parthenogenesis และ ยีนในไมโอซิสและเซลล์ส่วนใหญ่
รอบใน vertebrates และ yeasts แสดงใน aphid ชัญ
จีโนม ขณะ genomes แมลงอื่น ๆ ตามลำดับ [86] ครอบครัวสูญเสีย lineagespecific ของยีนแต่ละยีนแสดง
ขณะที่ยีนจะควบคุมการเปลี่ยนแปลงจาก G1 (เติบโต) ไป
ระยะ S (จำลองดีเอ็นเอ) ของวงจรเซลล์ metazoans จะ
แสดงใน aphids (เลข 11A), จีโนม aphid ชัญยัง
ประกอบด้วย duplications ลินเนจเฉพาะของหน่วยงานกำกับต่าง ๆ mitotic ดูแล,
เช่น Cdk1 โปโล Wee1, Cdc25 และออโรรา (รูปที่ 11B) ใน
เพิ่ม จีโนม aphid ดอกอัญชัญประกอบด้วยเฉพาะคนเชื้อสาย
duplications ของหลายที่เกี่ยวข้องกับไมโทซิส รวม Smc6
(การบำรุงรักษาโครงสร้างของ chromosomes 6) และ Topo2 (DNA
Topoisomerase 2) ยีนเหล่านี้เป็นสำเนาเดียวในแมลงอื่น ๆ
กับ genomes ตามลำดับแต่ซ้ำในครัสเตเชียน,
Daphnia pulex ซึ่งเป็นความสามารถในทางเพศ และ asexual
ซ้ำ [87] .
Neuropeptides, biogenic amines กของ receptors
Neuropeptides และ biogenic amines เป็นเซลล์เซลล์ signalin

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ส่งสัญญาณเส้นทางเดินเท้าและปัจจัยการถอดสคริปต์
tgf ยีนของพื้นที่เป็นอย่างสูงที่ - b wnt egf และจากอ.พระ/สถานะ(
ซึ่งจะช่วยส่งสัญญาณเส้นทางเดินเท้าทั้งหมดเพื่อประโยชน์ในการพัฒนาได้รับความเสียหายและ
หลายตัวเพลี้ย - เฉพาะ duplications หลายคน paralogs ของ
DPP ( 4 paralogs ) medea ( 5 )บ้า( 2 ) domeless ( 4 )สถานะ(( 2 )ยูลิซิ( 4 )
andarmadillo ( 2 )พบยีนในตัวเพลี้ยถั่วลันเตาที่ ยีน
ตามมาตรฐานเหล่านี้การขยายมีบันทึกไว้ด้วยว่า:เป็นพิเศษเนื่องจาก duplications ของยีนที่เข้ารหัสส่วนประกอบ
ซึ่งจะช่วยส่งสัญญาณเส้นทางเดินเท้าที่หาชมได้ยากใน
สัตว์[ 82 ] ในทางกลับกันโพรเซสเซอร์ที่เราพบว่าตัวเพลี้ยพงศ์ - เฉพาะยีน
ซึ่งจะช่วยสร้างความเสียหายหลาย tgf - bligands ( bmp10 , Maverick ,และเทือกเขา 23 ),
wnt ligands ( wnt6 , wnt 10 ), andsprouty ( rtk ส่งสัญญาณยาป้องกัน)..
ที่ถั่วลันเตาเพลี้ยยีนประกอบด้วย 640 สมมุติตามลำดับ - เฉพาะ
การถอดสคริปต์ปัจจัย. การถอดสคริปต์ครอบครัวปัจจัยที่มี
ซึ่งจะช่วยในการเขียนเหมือนกันและขนาดเพื่อแมลงอื่นๆผู้ที่ แต่ถึงอย่างไรก็ตาม,
ที่ถั่วลันเตาเพลี้ยยีนเข้ารหัสอย่างมีนัยสำคัญมากสังกะสี - fingercontaining โปรตีนมากกว่าแมลงอื่นๆด้วยอักษรเรียงลำดับ\ genomes .
แม้ว่าจำนวนของการเข้ารหัส bhlh ยีนมีความคล้ายคลึงกับแมลงอื่นๆ
, orthologs ของ achaete - scutegenes ,ซึ่งจำเป็นสำหรับ
neurogenesis และแบบยืดหดได้ indrosophilaand พัฒนา genomes แมลงในอื่นๆ( holometabolous )พบ
ไม่พบ คอมเพล็กซ์ยีน
few ทั้งหมดมี buthox 3 ( ZEN ) andftz ซึ่งมี
ซึ่งจะช่วยพัฒนาการทำงานไม่ใช่ - homeotic ในแมลงเป็นอย่างผิดแผกแตกต่างไปจาก orthologs
ซึ่งจะช่วยให้ฮอร์โมนของสายพันธุ์อื่นๆ.
เยาวชน( JH ) ตอบ:ได้รับการมีส่วนเกี่ยวข้องใน polyphenism คัดตัวเพลี้ย
ซึ่งจะช่วยควบคุม 83,84 [] ที่สำคัญ
ตามมาตรฐานเอ็นไซม์ที่รับผิดชอบในการสังเคราะห์และการเสื่อม สภาพ ของตอบ:
อยู่ในถั่วเขียวที่เพลี้ยยีนยีนและการพัฒนาการของเหล่านี้หลาย
ซึ่งจะช่วยเป็นเมทิลแอลกอฮอล์[ 37 ]สนับสนุนสมมุติฐานที่ว่า methylation ไม่สามารถแสดงบทบาทที่
ซึ่งจะช่วยในการพัฒนาการของ aphids ลักษณะปั้นง่ายที่มันไม่ในแมลงอื่นๆ(โต๊ะ 3 ) ถั่วลันเตา
เพลี้ยที่เห็นได้ชัดว่าขาดโปรตีนที่เกี่ยวข้องตอบ:อื่นๆเช่น
hexamerinsซึ่งถือเป็นระดับที่ของตอบ:มีผลผูกพันโปรตีน
มีส่วนเกี่ยวข้องในกระบวนการผลิตในทางสรีรศาสตร์จำนวนมากรวมถึงชั้น
ซึ่งจะช่วยจัดระเบียบของปลวกต่ำกว่า[ 85 ].
mitosis รอบเซลล์และ meiosis . aphids จัดแสดงนิทรรศการในลักษณะปั้นง่าย
meiosis และขี่จักรยานเซลล์ซึ่งจะช่วยให้การผลิตซ้ำทางเพศ
และ parthenogenesis ทั้งสอง ยีนมีส่วนเกี่ยวข้องมากที่สุดใน meiosis และเซลล์
ขี่จักรยานใน vertebrates yeasts และที่อยู่ในถั่วเขียวที่เพลี้ย
ยีน,ในขณะที่คนอื่นๆและแมลง genomes อักษรเรียงลำดับ\ lineagespecific แสดงความเสียหายของแต่ละบุคคลยีนยีนหรือสมาชิกในครอบครัว[ 86 ].
ในขณะที่ยีนที่มีชื่อเสียงในการควบคุมการเปลี่ยนผ่านจาก G 1 (หรือมีอัตราการเติบโต)เพื่อ
S (ดีเอ็นเอจำลองแบบ)ระยะของการให้บริการข้อมูลของสถานีฐานใน metazoans มี
ใน aphids (รูปที่ 11 ),ถั่วเขียวเพลี้ยยีนที่ยัง
ประกอบด้วยพันธุ์ - เฉพาะ duplications ของหลายหน่วยงาน mitotic ,
เช่น cdk1 ,โปโล,เล็ก 1 CDC 25 และแสง(รูปที่ 11 b ) ใน
นอกจากนี้ยังยีนตัวเพลี้ยถั่วลันเตาที่มีเชื้อสาย - เฉพาะ
duplications mitosis ของยีนที่เกี่ยวข้องกับหลายคนซึ่งรวมถึง SMC : 6
(การบำรุงรักษาเชิงโครงสร้างของโครโมโซม 6 )และ TOPO 2 (ดีเอ็นเอ
topoisomerase 2 ) ยีนนี้มีสำเนาเอกสารเพียงหนึ่งในแมลงอื่นๆพร้อมด้วย
genomes อักษรเรียงลำดับ\แต่ซ้ำในกุ้งที่ pulex
daphniaซึ่งยังสามารถรองรับของทางเพศและ asexual
คุณภาพ [ 87 ]..
neuropeptides amines biogenic ทั้งสองและกระตุ้นเส้นประสาทรับความรู้สึกปวดของพวกเขา.
neuropeptides และ amines biogenic มี signalin เซลล์ - การบริการข้อมูลของสถานีฐาน