YB-1 is a major mRNP protein partic

YB-1 is a major mRNP protein participating in the regulation of transcription and translation of a wide range of eukaryotic genes in many organisms probably due to its influence on mRNA packing into mRNPs. While the functional properties of YB-1 are extensively studied, little is known about its structural properties. In the present work we focused on studying its secondary structure, rigidity of its tertiary structure, compactness, and oligomerization in vitro by using far UV-CD, DSC, one-dimensional 1H NMR, SAXS, sedimentation and FPLC. It was shown that only the cold shock domain within the entire YB-1 chain has a well-packed tertiary structure undergoing cooperative heat and cold denaturation transitions. In contrast, the rest of the YB-1 molecule is not rigidly packed and consists of PP II-like helical secondary structure elements and coil-like regions. At the same time, the overall dimension of the protein molecule is unexpectedly small. The polypeptide chains of YB-1 have a high tendency to form oligomers at neutral pH, while the extent and structural organization of the oligomers depend on protein concentration and ionic strength varying from compact monomeric units up to high molecular weight oligomers. These oligomers in solution are unstable and dissociate upon protein concentration decrease.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

YB 1 คือ โปรตีน mRNP หลักการมีส่วนร่วมในการควบคุมของราชบัณฑิตยสถานและแปลของ eukaryotic ยีนในสิ่งมีชีวิตมากคงเนื่องจากอิทธิพลของ mRNA ที่บรรจุลงใน mRNPs ในขณะที่สมบัติเชิงหน้าที่ของ YB 1 ได้ศึกษาอย่างกว้างขวาง น้อยมีชื่อเสียงเกี่ยวกับคุณสมบัติของโครงสร้าง งานปัจจุบัน เราเน้นศึกษาโครงสร้างรอง ความแข็งแกร่ง ของโครงสร้างระดับตติยภูมิ compactness, oligomerization ในหลอดโดยไกล UV-ซีดี DSC, one-dimensional 1H NMR, SAXS ตกตะกอน และ FPLC เป็นแสดงว่า เฉพาะโดเมนช็อกเย็นภายในห่วงโซ่ YB 1 ทั้งมีโครงสร้างระดับตติยภูมิที่บรรจุระหว่างสหกรณ์ความร้อนและการเปลี่ยน denaturation เย็น ในทางตรงกันข้าม ส่วนเหลือของโมเลกุล YB 1 rigidly ไม่มีการรวบรวมไว้ และประกอบด้วยองค์ประกอบโครงสร้างรองเช่น PP II helical และขดเหมือนภูมิภาค ในเวลาเดียวกัน ขนาดโดยรวมของโมเลกุลโปรตีนมีขนาดเล็กโดยไม่คาดคิด โซ่ polypeptide YB 1 มีแนวโน้มสูงที่จะฟอร์ม oligomers ค่า pH เป็นกลาง ในขณะที่ขอบเขตและโครงสร้างองค์กรของ oligomers ขึ้นอยู่กับความเข้มข้นโปรตีนและ ionic แรงแตกต่างจากหน่วย monomeric กระชับถึง oligomers น้ำหนักโมเลกุลสูง Oligomers ในโซลูชันนี้จะไม่เสถียร และ dissociate เมื่อลดความเข้มข้นของโปรตีน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

YB-1 เป็นโปรตีนที่สำคัญ mRNP มีส่วนร่วมในการควบคุมการถอดความและแปลความหลากหลายของยีนในสิ่งมีชีวิต eukaryotic จำนวนมากอาจเป็นเพราะอิทธิพลของ mRNA บรรจุลง mRNPs ในขณะที่คุณสมบัติการทำงานของ YB-1 มีการศึกษาอย่างกว้างขวางเล็ก ๆ น้อย ๆ เป็นที่รู้จักกันเกี่ยวกับคุณสมบัติของโครงสร้าง ในการทำงานในปัจจุบันที่เรามุ่งเน้นในการศึกษาโครงสร้างทุติยภูมิของความแข็งแกร่งของโครงสร้างตติยแน่นและ oligomerization ในหลอดทดลองโดยใช้ไกล UV-CD, DSC, หนึ่งมิติ 1H NMR, SAXS ตกตะกอนและ FPLC มันแสดงให้เห็นว่ามีเพียงโดเมนช็อกเย็นภายในทั้ง YB-1 ห่วงโซ่มีโครงสร้างในระดับอุดมศึกษาที่มีความร่วมมือระหว่างการบรรจุความร้อนและเย็น denaturation เปลี่ยน ในทางตรงกันข้ามส่วนที่เหลือของ YB-1 โมเลกุลที่ไม่ได้บรรจุอย่างเหนียวแน่นและประกอบด้วยองค์ประกอบรองโครงสร้างขดลวดพีพีครั้งที่สองเหมือนและภูมิภาคขดเหมือน ในขณะเดียวกันมิติโดยรวมของโมเลกุลโปรตีนที่มีขนาดเล็กอย่างไม่คาดคิด polypeptide โซ่ของ YB-1 มีแนวโน้มสูงที่จะสร้าง oligomers ที่ pH เป็นกลางในขณะที่ขอบเขตและโครงสร้างขององค์กร oligomers ขึ้นอยู่กับความเข้มข้นของโปรตีนและความแรงของอิออนที่แตกต่างกันจากหน่วยงานที่มีขนาดกะทัดรัด monomeric ถึง oligomers น้ำหนักโมเลกุลสูง oligomers เหล่านี้ในการแก้ปัญหาที่มีความไม่แน่นอนและแยกตัวออกเมื่อความเข้มข้นของโปรตีนลดลง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

yb-1 เป็นหลัก mrnp โปรตีนเข้าร่วมในระเบียบของการถอดความและแปลของหลากหลายของยีนในสิ่งมีชีวิต eukaryotic หลายอาจเนื่องมาจากอิทธิพลของ mRNA ที่บรรจุใน mrnps . ในขณะที่คุณสมบัติการทำงานของ yb-1 อย่างกว้างขวางศึกษาน้อยเป็นที่รู้จักกันเกี่ยวกับคุณสมบัติของโครงสร้าง . ในงานปัจจุบันเราเน้นการศึกษาโครงสร้างทุติยภูมิความแข็งแกร่งของโครงสร้างตติย compactness และโอลิโกเมอไรเซซันในหลอดทดลองโดยใช้ไกล uv-cd DSC , มิติ , 1H NMR , saxs ตะกอน และ fplc . มันเป็นเพียงความหนาวตกใจโดเมนภายในห่วงโซ่ yb-1 ทั้งหมดได้เป็นอย่างดีจัดการสหกรณ์และการเปลี่ยนโครงสร้างตติยความร้อน ( เย็น ในทางตรงกันข้ามส่วนที่เหลือของโมเลกุล yb-1 ไม่ rigidly บรรจุและประกอบด้วย PP 2 ชอบองค์ประกอบโครงสร้างและม้วนเกลียวแบบภูมิภาค ในเวลาเดียวกัน , ขนาดโดยรวมของโปรตีนโมเลกุลเล็กอย่างไม่คาดคิด โดยโพลีเปปไทด์ของ yb-1 มีแนวโน้มสูงที่จะสร้างหน่วยที่ pH เป็นกลางในขณะที่ขอบเขตและโครงสร้างของหน่วยขึ้นอยู่กับความเข้มข้นของโปรตีนและความแรงของไอออนที่แตกต่างจากวิธีกระชับหน่วยขึ้นสูงน้ำหนักโมเลกุลหน่วย . เหล่านี้หน่วยในสารละลายที่ไม่เสถียรและแยกตามระดับความเข้มข้นโปรตีนลดลง