The population structure of Magnapo

The population structure of Magnaporthe oryzae from green foxtail (Setaria viridis) in Japan was examined by DNA fingerprint analyses using the transposable elements MGR586 and MAGGY as probes. Fifteen M. oryzae isolates from green foxtail were collected from 11 Japanese prefectures so that a macrogeographic population of this pathogen is represented. All the 15 isolates were sorted into distinct haplotypes by DNA fingerprint analyses with both probes. Furthermore, similarities between the DNA fingerprint profiles of the 15 isolates were exclusively low; i.e., if lineages are arbitrarily established based on greater than 70% similarities in isolates, the 15 isolates could be categorized into 13 distinct lineages by DNA fingerprinting with both probes. We also examined the MGR586 DNA fingerprint variations of this pathogen in 9 microgeographic populations each of which contained 20 to 24 isolates collected from a 1 m2 or 50 m2 area. In all the 9 populations, more than 2 haplotypes, which shared less than 70% similarities, were identified in the DNA fingerprint profiles. These results suggested that M. oryzae isolates from the green foxtail in Japan possessed a complex lineage structure, even at the microgeographic scale.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โครงสร้างประชากรของ oryzae Magnaporthe จากจิ้งจอกสีเขียว (setaria ดิ) ในประเทศญี่ปุ่นได้รับการตรวจสอบโดยการวิเคราะห์ลายนิ้วมือดีเอ็นเอใช้องค์ประกอบ transposable mgr586 และ maggy เป็นฟิวส์ สิบห้าเมตร oryzae แยกจากจิ้งจอกสีเขียวถูกเก็บรวบรวมจาก 11 จังหวัดของญี่ปุ่นเพื่อให้ประชากร macrogeographic เชื้อโรคนี้จะเป็นตัวแทนของทั้งหมด 15 สายพันธุ์ที่ถูกจัดเรียงเป็น haplotypes ที่แตกต่างจากการวิเคราะห์ดีเอ็นเอลายนิ้วมือที่มีการตรวจทั้ง นอกจากความคล้ายคลึงกันระหว่างรูปแบบลายนิ้วมือดีเอ็นเอของ 15 สายพันธุ์ต่ำเฉพาะ; เช่นถ้า lineages มีการจัดตั้งพลขึ้นอยู่กับความคล้ายคลึงกันมากขึ้นกว่า 70% ในสายพันธุ์,15 สายพันธุ์อาจจะแบ่งออกเป็น 13 lineages แตกต่างกันโดยการพิมพ์ลายนิ้วมือดีเอ็นเอด้วยยานสำรวจทั้ง เรายังตรวจสอบ mgr586 รูปแบบลายนิ้วมือดีเอ็นเอของเชื้อก่อโรคนี้ในประชากร microgeographic 9 ซึ่งแต่ละที่มี 20-24 แยกเก็บจาก 1 ม. 2 หรือ 50 m2 พื้นที่ ในทุก 9 ประชากรมากกว่า 2 พบ haplotype ซึ่งคล้ายคลึงกันที่ใช้ร่วมกันน้อยกว่า 70%ถูกระบุไว้ในโปรไฟล์ดีเอ็นเอลายนิ้วมือ ผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่าเมตร oryzae แยกจากจิ้งจอกสีเขียวในประเทศญี่ปุ่นมีโครงสร้างที่ซับซ้อนเชื้อสายแม้ในระดับ microgeographic

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โครงสร้างประชากรของ Magnaporthe แห้งระดับต่าง ๆ จาก (Setaria viridis) สวนภูเขาเขียวในญี่ปุ่นถูกตรวจสอบ โดยการวิเคราะห์ลายนิ้วมือดีเอ็นเอโดยใช้องค์ประกอบ transposable MGR586 และ maggy เครื่องเป็น probes 15 เมตร isolates แห้งระดับต่าง ๆ จากสวนภูเขาสีเขียวถูกเก็บรวบรวมจาก 11 จังหวัดในญี่ปุ่นเพื่อให้ประชากร macrogeographic การศึกษานี้จะถูกแสดง ทั้งหมด 15 isolates เรียงเป็น haplotypes ที่แตกต่างกัน โดยดีเอ็นเอลายนิ้วมือวิเคราะห์พร้อมทั้งคลิปปากตะเข้ นอกจากนี้ ความคล้ายคลึงระหว่างประวัติลายนิ้วมือดีเอ็นเอของ 15 isolates ได้เฉพาะต่ำ เช่น ถ้าเชื้อชาติถูกสร้างขึ้นโดย ยึดมากกว่า 70% ความเหมือนกันใน isolates สามารถแบ่งเป็นเชื้อชาติที่แตกต่างกัน 13 15 isolates ด้วยลายพิมพ์ดีเอ็นเอมีทั้งคลิปปากตะเข้ นอกจากนี้เรายังตรวจสอบรูปแบบลายนิ้วมือดีเอ็นเอ MGR586 ของการศึกษานี้ในประชากร microgeographic 9 ซึ่งประกอบด้วยการรวบรวมจาก 1 m2 หรือ 50 m2 พื้นที่ isolates 20-24 ในทั้งหมดที่ 9 ประชากร haplotypes มากกว่า 2 ที่ใช้ร่วมกันน้อยกว่า 70% ความเหมือน ได้ระบุในประวัติลายนิ้วมือดีเอ็นเอ ผลลัพธ์เหล่านี้แนะนำว่า ม. isolates แห้งระดับต่าง ๆ จากสวนภูเขาเขียวในญี่ปุ่นต้องมีโครงสร้างซับซ้อนลินเนจ แม้ที่ระดับ microgeographic

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โครงสร้างประชากรของ oryzae magnaporthe จากสีเขียวหญ้าพวงมาลัย( viridis setaria )ในประเทศญี่ปุ่นโดยการวิเคราะห์ตรวจสอบลายนิ้วมือดีเอ็นเอโดยใช้ส่วนประกอบที่สแตนดาร์ดชาร์เตอร์ด transposable 586 maggy และเป็นการสอบถาม สิบห้า oryzae m .แยกจากหญ้าพวงมาลัยสีเขียวจะถูกรวบรวมจาก 11 จังหวัดต่างๆเช่นญี่ปุ่นดังนั้นที่ประชากร macrogeographic ของเชื้อนี้จะแสดงทั้งหมด 15 ที่แยกเป็นเรียงลงใน haplotypes ที่แตกต่างกันโดยการวิเคราะห์ดีเอ็นเอลายนิ้วมือด้วยการสอบถามทั้งสอง ยิ่งไปกว่านั้นความคล้ายคลึงกันระหว่างส่วนกำหนดค่าลายนิ้วมือดีเอ็นเอของ 15 แยกที่อยู่ในระดับต่ำโดยเฉพาะนั่นคือหากมีรากฐานชี้ขาดขึ้นอยู่กับความคล้ายคลึงกันมากกว่า 70% ในแยก15 ที่แยกไม่สามารถแบ่งออกเป็น 13 สายที่แตกต่างกันโดย fingerprinting ดีเอ็นเอด้วยการสอบถามทั้งสอง นอกจากนั้นเรายังตรวจสอบลายนิ้วมือดีเอ็น เอ 586 ความแตกต่างของสแตนดาร์ดชาร์เตอร์ดของเชื้อนี้อยู่ใน 9 ประชากร microgeographic ซึ่งแต่ละแห่งมีอยู่ 20 ถึง 24 แยกเก็บรวบรวมจากพื้นที่ 1 m 2 หรือ 50 ม. 2 ใน 9 ประชากรทั้งหมดมากกว่า 2 haplotypes ใช้ร่วมกันซึ่งไม่น้อยกว่า 70% ความคล้ายคลึงกันได้รับการระบุว่าเป็นลายนิ้วมือดีเอ็นเอที่ส่วนกำหนดค่า ผลการทดสอบนี้แนะนำว่า oryzae m .แยกจากหญ้าพวงมาลัยสีเขียวในประเทศญี่ปุ่นมีโครงสร้างคือคอมเพล็กซ์ที่มีขนาดใหญ่ได้ microgeographic ที่