using the neighbour-joining method

using the neighbour-joining method with the maximum
composite likelihood model. Bootstrap analysis was performed
based on 1000 replicates. The MEGA4 package
(Tamura et al., 2007) was used for all analyses. 16S rRNA
gene sequence analysis of strain 3.1.1T indicated that it
belonged to the Lactobacillus plantarum species group,
showing sequence similarities of 98.8, 98.7, 98.9, 98.8 and
98.5% to the type strains of L. plantarum subsp. plantarum,
L. plantarum subsp. argentoratensis, Lactobacillus pentosus,
Lactobacillus paraplantarum and Lactobacillus fabifermentans,
respectively (Fig. 1). A large phylogenetic tree based on
16S rRNA gene sequences showing the relationship between
strain 3.1.1T and the type strains of all defined species within
the genus Lactobacillus is given in Supplementary Fig. S1
(available in IJSEM Online). Strain 3.1.1T showed 75.1–84%
pheS gene sequence similarities (Fig. 2), 92.8–93.6% rpoA
gene sequence similarities (Fig. 3) and 83.9–87.9% dnaK
gene sequence similarities (Fig. 4) to the type strains of all
species in the L. plantarum species group, respectively. pheS,
rpoA and dnaK gene sequence analyses (Figs 2–4) clearly
show a higher resolution than the 16S rRNA gene sequence

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โดยใช้วิธีการรวมเพื่อนบ้านสูงสุด
โอกาสรวมรุ่น ทำการวิเคราะห์เริ่มต้นระบบ
ตามเหมือนกับ 1000 แพคเกจ MEGA4
(Tamura et al., 2007) ใช้สำหรับการวิเคราะห์ทั้งหมด 16S rRNA
ที่ระบุวิเคราะห์ลำดับยีนต้องใช้ 3.1.1T
เป็นสมาชิกในกลุ่มสายพันธุ์แลคโตบาซิลลัส plantarum,
แสดงความเหมือนของลำดับ 98.8, 98.7, 98.9, 98.8 และ
98สายพันธุ์ชนิดของ L. plantarum ถั่ว plantarum, 5%
L. plantarum ถั่ว argentoratensis แลคโตบาซิลลัส pentosus,
paraplantarum แลคโตบาซิลลัสและแลคโตบาซิลลัส fabifermentans,
ตามลำดับ (Fig. 1) ตามต้นไม้ใหญ่ phylogenetic
ลำดับยีน 16S rRNA แสดงความสัมพันธ์ระหว่าง
สายพันธุ์ 3.1.1T และสายพันธุ์ของชนิดพันธุ์ทั้งหมดกำหนดภายใน
ตระกูลนี้ให้แลคโตบาซิลลัสในฟิกเสริม S1
(มีใน IJSEM ออนไลน์) สายพันธุ์ 3.1.1T พบ 75.1–84%
pheS ยีนลำดับความเหมือน (Fig. 2), 92.8 – 93.6% rpoA
ยีนลำดับความเหมือน (Fig. 3) และ 83.9 – 87.9% dnaK
ยีนลำดับความเหมือน (Fig. 4) กับสายพันธุ์ของชนิดทั้งหมด
พันธุ์ในสายพันธุ์ L. plantarum กลุ่ม ตามลำดับ pheS,
ลำดับยีน rpoA และ dnaK วิเคราะห์ (มะเดื่อ 2 – 4) ชัดเจน
แสดง 16S rRNA ยีนลำดับความละเอียดสูงกว่า

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โดยใช้วิธีการเพื่อนบ้านเข้ากับสูงสุด
รูปแบบความน่าจะเป็นคอมโพสิท การวิเคราะห์บูตได้ดำเนินการ
ตาม 1000 ซ้ำ แพคเกจ MEGA4
(ทามูระ, et al., 2007) ที่ใช้สำหรับการวิเคราะห์ทั้งหมด 16S rRNA
วิเคราะห์ลำดับยีนของสายพันธุ์ 3.1.1T ชี้ให้เห็นว่ามัน
เป็นของกลุ่มแลคโตบาซิลลัส plantarum ชนิด
แสดงให้เห็นความคล้ายคลึงกันของลำดับ 98.8, 98.7, 98.9, 98.8 และ
98.5% เป็นสายพันธุ์ชนิดของ L. plantarum subsp plantarum,
ลิตร plantarum subsp argentoratensis, แลคโตบาซิลลัส pentosus,
paraplantarum แลคโตบาซิลลัสและแลคโตบาซิลลัส fabifermentans,
ตามลำดับ (รูปที่ 1) ต้นไม้สายวิวัฒนาการขนาดใหญ่ที่อยู่บนพื้นฐานของ
16S rRNA ลำดับยีนแสดงความสัมพันธ์ระหว่าง
ความเครียดและ 3.1.1T สายพันธุ์ชนิดของสายพันธุ์ที่กำหนดไว้ภายใน
แลคโตบาซิลลัสประเภทจะได้รับในรูปเสริม S1
(ที่มีอยู่ใน IJSEM ออนไลน์) สายพันธุ์ 3.1.1T 75.1-84% แสดงให้เห็น
ความคล้ายคลึงกันตามลำดับยีน pheS (รูปที่ 2) 92.8-93.6% RPOA
คล้ายคลึงลำดับยีน (รูปที่ 3) และ 83.9-87.9% dnaK
คล้ายคลึงลำดับยีน (รูปที่ 4) เพื่อให้สายพันธุ์ชนิด ทุก
ชนิดในกลุ่ม L. plantarum ชนิดตามลำดับ pheS,
RPOA และยีน dnaK วิเคราะห์ลำดับ (ภาพที่ 2-4) อย่างชัดเจน
แสดงให้เห็นความละเอียดสูงกว่าลำดับของยีน 16S rRNA

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ใช้วิธีกับเพื่อนบ้านร่วมสูงสุด
ประกอบความน่าจะเป็นแบบ การวิเคราะห์การใช้บู
1000 ซ้ํา การ mega4 แพคเกจ
( ทามูระ et al . , 2007 ) ใช้สำหรับวิเคราะห์ข้อมูล ลำดับเบส 16S rRNA ยีนการวิเคราะห์ 3.1.1t

เครียดที่ระบุว่าเป็นของกลุ่มสปีชีส์ Lactobacillus plantarum , แสดงความคล้ายคลึงกันของลำดับ
98.8 98.7 98.9 , , , และ 98.8
985 % เป็นชนิดสายพันธุ์ของ L . plantarum subsp . plantarum
L . plantarum subsp . argentoratensis , Lactobacillus pentosus และ paraplantarum Lactobacillus , Lactobacillus fabifermentans

, ตามลำดับ ( รูปที่ 1 ) ต้นไม้ใหญ่ ซึ่งขึ้นอยู่กับลำดับเบส 16S rRNA ยีน

3.1.1t แสดงความสัมพันธ์ระหว่างความเครียดและสายพันธุ์ของชนิดทั้งหมดกำหนดชนิดภายใน
สกุลแลคโตบาซิลลัสเสริมให้ในรูปที่ S1
( ใช้ได้ใน ijsem ออนไลน์ ) สายพันธุ์ 3.1.1t พบ 75.1 – 84 %
เยื่อลำดับยีนที่คล้ายคลึงกัน ( รูปที่ 2 ) ซึ่งอยู่ 93.6 % rpoa
ลำดับยีนที่คล้ายคลึงกัน ( รูปที่ 3 ) และ 83.9 และ 87.9 % dnak
ยีน ลำดับความคล้ายคลึงกัน ( รูปที่ 4 ) ประเภทสายพันธุ์ของชนิดใน L . plantarum สายพันธุ์
กลุ่มตามลำดับ เยื่อ
,rpoa dnak ยีนและลำดับการวิเคราะห์ ( มะเดื่อ 2 – 4 ) อย่างชัดเจน
แสดงความละเอียดสูงกว่า 16S rRNA ลำดับของยีน