2.2.5. Genotypic characterization o

2.2.5. Genotypic characterization of isolates
As a prerequisite, DNA was extracted using the DNeasy Blood and Tissue kit using lysostaphin to obtain bacterial lysis. Hence, isolates were genotypically confirmed as S. aureus by means of multiplex-PCR and simultaneous detection of
23S rDNA and nuc .
Strains were further characterized by spa-typing according to Harmsen et al. (2003), and in some cases multi-locus-sequence-typing (MLST) . In addition, a commercially available microarray kit (Identibac S. aureus Genotyping, Alere Technologies GmbH, Jena, Germany) was applied.
This array covers 333 target sequences corresponding to approximately 185 distinct genes and their allelic variants.
These include among others species-specific controls, genes encoding for relevant antibiotic resistance determinants
and virulence factors (SE encoding genes) as well as agr group and capsule typing markers.
The array was performed according to the manufacturer's instructions and analysis of the array profiles based on
the presence or absence of the enquired genes was done with Bionumerics Software

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.2.5 คุณสมบัติจีโนไทป์ของแยกเป็นช่วงเวลา ดีเอ็นเอที่สกัดโดยใช้ชุด DNeasy เลือดและเนื้อเยื่อที่ใช้ lysostaphin รับ lysis แบคทีเรีย ดังนั้น แยกถูก genotypically ยืนยันเป็น S. หมอเทศข้างลายโดยใช้ PCR ล็กและตรวจสอบพร้อม23S rDNA และ nucสายพันธุ์ได้เพิ่มเติมลักษณะ โดยพิมพ์สปาตาม Harmsen et al. (2003), และ ในบางกรณี multi-locus-ลำดับพิมพ์ (MLST) นอกจากนี้ มีการใช้ชุดใช้ได้ในเชิงพาณิชย์ microarray (Identibac S. หมอเทศข้างลาย Genotyping, Alere เทคโนโลยี GmbH, Jena เยอรมนี) อาร์เรย์นี้ครอบคลุมถึง 333 เป้าหมายลำดับที่สอดคล้องกับประมาณ 185 ยีนแตกต่างกันและตัวแปรของ allelic รวมถึงหมู่คนอื่น ๆ ควบคุม species-specific ยีนที่เข้ารหัสสำหรับดีเทอร์มิแนนต์ต้านทานยาปฏิชีวนะที่เกี่ยวข้องและ virulence ปัจจัย (ตะวันออกเฉียงใต้เข้ารหัสยีน) กลุ่มกลุ่มและแคปซูลที่พิมพ์เครื่องหมาย ทำตามคำแนะนำของผู้ผลิตและการวิเคราะห์ค่าอาร์เรย์ตามอาร์เรย์สถานะการขาดงานของยีน enquired ทำกับซอฟต์แวร์ Bionumerics

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.2.5 ลักษณะทางพันธุกรรมของเชื้อเป็นจำเป็นดีเอ็นเอถูกสกัดโดยใช้ DNeasy เลือดและเนื้อเยื่อโดยใช้ชุด lysostaphin ที่จะได้รับเชื้อแบคทีเรียสลาย
ดังนั้นสายพันธุ์ได้รับการยืนยัน genotypically เป็นเชื้อ S. aureus โดยใช้วิธีการหลาย-PCR และการตรวจสอบพร้อมกันของ
23S rDNA และ NUC.
สายพันธุ์มีลักษณะต่อไปโดยสปาการพิมพ์ตาม Harmsen et al, (2003), และในบางกรณีหลายสถานที่ลำดับการพิมพ์ (MLST) นอกจากนี้ชุด microarray ใช้ได้ในเชิงพาณิชย์ (Identibac เชื้อ S. aureus Genotyping, Alere เทคโนโลยี GmbH, เจ, เยอรมนี) ถูกนำมาใช้.
อาร์เรย์นี้ครอบคลุม 333 ลำดับเป้าหมายที่สอดคล้องกับประมาณ 185 ยีนที่แตกต่างกันและตัวแปร allelic ของพวกเขา.
เหล่านี้รวมถึงหมู่คนอื่น ๆ ชนิดที่เฉพาะเจาะจง
ควบคุมยีนสำหรับปัจจัยต้านทานยาปฏิชีวนะที่เกี่ยวข้องและปัจจัยความรุนแรง(SE เข้ารหัสยีน) เช่นเดียวกับกลุ่มเกษตรศาสตรและแคปซูลเครื่องหมายการพิมพ์. อาเรย์ที่ได้รับการดำเนินการตามคำแนะนำของผู้ผลิตและการวิเคราะห์ของโปรไฟล์อาร์เรย์ที่ขึ้นอยู่กับการมีหรือไม่มีของสอบถามยีนทำด้วย Bionumerics ซอฟแวร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.2.5 . การศึกษาคุณสมบัติของเชื้อ
เป็นเบื้องต้น ดีเอ็นเอถูกสกัดโดยใช้เลือดและเนื้อเยื่อ dneasy kit ใช้ไลโซ ตฟินเพื่อขอรับการสลายแบคทีเรีย . ดังนั้น ไอโซเลท genotypically ยืนยัน aureus S . โดยใช้เทคนิค multoplex PCR และการตรวจหา
rDNA และ 23s nuc พร้อมกัน
สายพันธุ์เพิ่มเติม โดดเด่นด้วยสปาพิมพ์ตาม harmsen et al . ( 2003 )และในบางกรณีหลายสถานที่ลำดับการพิมพ์ ( mlst ) นอกจากนี้ ชุด microarray ในเชิงพาณิชย์ ( identibac S . aureus ส่งเสริมเทคโนโลยี alere GmbH , เยนา , เยอรมนี ) คือใช้
array นี้ครอบคลุมถึง 333 เป้าหมายลำดับสอดคล้องกับประมาณ 185 แตกต่างกันและยีนของ allelic แปร
เหล่านี้รวมถึงการควบคุมเผ่าพันธุ์ - เฉพาะในหมู่คนอื่น ๆ ,ยีนเข้ารหัสที่เกี่ยวข้องปัจจัย
ต้านทานยาปฏิชีวนะความรุนแรงปัจจัย ( เซการเข้ารหัสยีน ) รวมทั้งกลุ่ม . และแคปซูลพิมพ์เครื่องหมาย
อาร์เรย์แสดงตามคําแนะนําของผู้ผลิตและการวิเคราะห์ของเรย์โปรไฟล์ตาม
การแสดงตนหรือการขาดตรวจสอบยีนก็ทำ bionumerics ซอฟต์แวร์