Pigeonpea (Cajanus cajan) is among the world’s
most important pulse crops which suffer heavy
yield losses up to 90% due to vascular wilt caused
by Fusarium udum. The disease is prevalent in
almost all pulses growing areas of the world,
including the Indian subcontinent, Iran, Peru,
Syria, Ethiopia, Mexico, Spain, Tunisia, Turkey,
and the United States (Nene et al., 1989).
Although much progress has been made in
developing pigeonpea lines with resistance to
biotic constraints and tolerance to abiotic
stresses, yield loss in these crops is very high
due to the high incidence of diseases and insectpests
(Nene and Sheila, 1990).
Fusarium wilt of pigeonpea is caused by F.
udum, which is both soil and seed borne and
difficult to eradicate as fungal chlamydospores
survive in soil up to six years even in the absence
of host plant. Biochemistry and physiology of
the Fusarium-plant interaction have been
characterised extensively, but definitive enquiry
into identification of individual molecules
essential for Fusarium pathogenesis to plants
did not begin until molecular genetic technology
became available for filamentous fungi
(Timberlake and Marshall, 1989; Bennett and
Lasure, 1991). To develop effective strategies for
management of wilt diseases, understanding of
the molecular basis of pathogenesis and
resistance mechanism is essential.
Identification of species of the genus
Fusarium is complicated on several aspects.
Morphological characteristics such as shape and
size of the macroconidia, presence or absence of
microconidia and chlamydospores, and colony
morphology are often insufficient to allow
identification at the species level. In addition,
these observations need some practices and are
difficult for the non-specialist (Windels, 1991;
Bluhm et al., 2002). Although pathogenicity
phenotypes can be useful for assessing genetic
variation in fungal pathogens; pathogenicity
markers are often limited in number and subject
to host selection (Leung et al., 1993). For
integrated management of wilt, identification of
isolates/races and developing strategy to
incorporate resistance is very important. Infallible
identification of races is critical to any resistancebreeding
programme as exact picture about the
existence of number of physiological races in
Fusarium udum is still not clear. Identification of
any isolate/race by molecular tools like DNA
fingerprinting is considered to be the most reliable
method. Furthermore, identification and
classification of the race specific donors will help
in pyramiding of resistance genes for developing
varieties resistant against multiple races of
pathogen.
A comparison at DNA sequences level
provides accurate classification of fungal species
to elucidate the evolutionary and ecological
relationships among diverse species. In recent
years, numerous DNA based methods have been
increasingly used to study variability in
pathogenic Fusarium population (Kiprop et al.,
2002; Sivaramakrishnan et al., 2002). DNA
fingerprinting has been successfully used for
Fusarium in characterisation of individual
isolates and grouping them into standard racial
classes. For breeding of resistant crop varieties,
knowledge about the pathogen races in that
particular crop area is important especially to
pyramid several resistance genes in an elite
genotype.
Gherbawy et al. (2002) used RAPD technique
for identifying Fusarium subglutinans, F.
proliferatum and F. verticillioides strains
isolated from maize in Austria. Pasquali et al.
(2003) characterised isolates of Fusarium
oxysporum pathogenic on Argyranthemum
frutescens L. using RAPD technique. Genetic
similarity between isolates of F. oxysporum f. sp.
ciceri was studied using 40 RAPD and 2 IGS
primers and results indicated that there was little
genetic variability among the isolates collected
from the different locations in India (Singh et al.,
2006). Cramer et al. (2003) reported specific RAPD
banding which distinguish among races F.
oxysporum f. sp. phaseoli and F. oxysporum f.
sp. betae. Identification of pathogenic races 0,
1B/C, 5 and 6 of F. oxysporum f. sp. ciceri has
been reported using 40 RAPD primers (Jimenez-
Gasco et al., 2004).
Simple sequence repeats have been used as
genetic markers in numerous DNA-fingerprinting
and PCR fingerprinting experiments for strain
typing of a variety of filamentous fungi and yeasts
without prior knowledge of their abundance and
Genetic diversity of Fusarium wilt races of pigeonpea 203
distribution in the investigated fungal genomes
(Meyer et al., 2003). SSR markers distinguished
the four races of F. oxysporum ciceri causing
varied levels of wilting with differential host
cultivars (Barve et al., 2001). Bogale et al. (2005)
showed that polymorphism revealed with 8 SSR
markers was sufficient for study of genetic
diversity in F. oxysporum complex.
The cluster of ribosomal DNA consists of
tandem repeat of three coding (18S, 5.8S and 28S),
and two noncoding ITS and Intergenic spacer
(IGS). Designing primers from the rDNA region
has far superior reliability compared to the use of
random non-defined probes or primers. These
markers occur in multiple copies with up to 200
copies per haploid genome arranged in tandem
repeats and are most effective in detecting
polymorphism (Yao et al., 1992). Inter Transcribed
Spacer regions have been used successfully to
generate specific primers capable of
differentiating closely related fungal species
(Bryan et al., 1996).
Taxon-selective ITS amplification has already
been used for detection of the fungal pathogens
such as Fusarium and Verticillium spp. (Nazar
et al., 1991). O’Donnell (1992) found a surprising
level of divergence for ITS sequences within the
species of F. sambucinum. Chakrabarti et al. (2000)
showed that digestion of amplified IGS region
with EcoR1 produced similar bands for both race1
and race 4 of F. oxysporum f. sp. ciceri but
individual and distinctive banding patterns were
observed for race 2 and race 3. Genetic diversity
studies could reveal the adaptive potential of
pathogenic populations and sometimes RAPD
patterns could reflect the variability of formae
speciales (Clark et al., 1998).
The aim of this study was to determine the
genetic diversity of an isolate collection of F.
udum recovered from diseased plants in wilt
affected fields of pigeonpea from seven major
pulse growing states of India using PCR based
molecular markers and estimate the genetic
relatedness.
Pigeonpea (Cajanus cajan) เป็นหนึ่งในโลกพืชชีพจรสำคัญซึ่งทุกข์หนาผลผลิตขาดทุนถึง 90% เนื่องจากเหี่ยวที่เกิดจากหลอดเลือดโดย Fusarium udum โรคนี้จะพบมากในกะพริบเกือบทุกพื้นที่ของโลก การเจริญเติบโตรวมถึงในอนุทวีปอินเดีย อิหร่าน เปรูซีเรีย เอธิโอเปีย เม็กซิโก สเปน ตูนิเซีย ตุรกีและสหรัฐอเมริกา (Nene et al., 1989)แม้ว่าความก้าวหน้ามากมีพัฒนา pigeonpea บรรทัด มีความต้านทานต่อข้อจำกัด biotic และค่าเผื่อการ abioticความเครียด การสูญเสียผลผลิตในพืชเหล่านี้จะสูงมากเนื่องจากอุบัติการณ์ของโรคและ insectpests สูง(Nene และนาง 1990)เกิดเหี่ยว fusarium ของ pigeonpea เอฟudum ซึ่งเป็นดินและเมล็ดที่แบกรับ และยากที่จะขจัดเป็น chlamydospores เชื้อราอยู่รอดในดินขึ้นถึงหกปีถึงแม้ว่าโรงงานของโฮสต์ ชีวเคมีและสรีรวิทยาของพืช Fusarium โต้ตอบได้ประสบการ์แต่ถามทั่วไปอย่างกว้างขวางเข้ารหัสของแต่ละโมเลกุลสิ่งจำเป็นสำหรับพยาธิกำเนิด Fusarium พืชไม่เริ่มจนกว่าเทคโนโลยีระดับโมเลกุลทางพันธุกรรมสำหรับเชื้อรา filamentous กลายเป็น(ทิมเบอร์เลคและมาร์แชลล์ 1989 เบนเนต และLasure, 1991) การพัฒนากลยุทธ์ที่มีประสิทธิภาพสำหรับจัดการโรคเหี่ยว ความเข้าใจของพื้นฐานระดับโมเลกุลของพยาธิกำเนิด และกลไกความต้านทานเป็นสิ่งจำเป็นรหัสของชนิดของตระกูลนี้Fusarium มีความซับซ้อนในด้านต่าง ๆลักษณะสัณฐานเช่นรูปร่าง และขนาดของ macroconidia สถานะ การขาดงานของmicroconidia และ chlamydospores และอาณานิคมสัณฐานวิทยามักไม่เพียงพอให้รหัสในระดับสปีชีส์ นอกจากนี้ข้อสังเกตเหล่านี้ต้องปฏิบัติบาง และมียากไม่ผู้เชี่ยวชาญ (Windels, 1991Bluhm และ al., 2002) แม้ว่า pathogenicityฟีจะมีประโยชน์สำหรับการประเมินพันธุกรรมความผันแปรในโรคเชื้อรา pathogenicityเครื่องหมายมักจะจำกัดจำนวนและชื่อเรื่องการเลือกโฮสต์ (เหลียง et al., 1993) สำหรับจัดการรวมการเหี่ยว การระบุแยก/การแข่งขันและพัฒนากลยุทธ์เพื่อต้านทาน incorporate เป็นสิ่งสำคัญมาก ไม่ผิดพลาดรหัสของการแข่งขันมีความสำคัญใด ๆ resistancebreedingโปรแกรมเป็นรูปภาพที่แน่นอนเกี่ยวกับการมีจำนวนในการแข่งขันสรีรวิทยาFusarium udum จะยังไม่ชัดเจน รหัสของการแยก/การแข่งขัน ด้วยเครื่องมือระดับโมเลกุลเช่นดีเอ็นเอลายพิมพ์จะพิจารณาที่จะ เชื่อถือได้มากที่สุดวิธีการ นอกจากนี้ รหัส และจัดประเภทของผู้บริจาคการแข่งขันจะช่วยใน pyramiding ของยีนต้านทานสำหรับการพัฒนาสายพันธุ์ที่ทนกับการแข่งขันของหลายการศึกษาระดับลำดับการเปรียบเทียบที่ดีเอ็นเอช่วยให้การจัดประเภทที่ถูกต้องของสายพันธุ์เชื้อราการ elucidate วิวัฒนาการ และระบบนิเวศความสัมพันธ์ระหว่างสายพันธุ์ที่หลากหลาย ในล่าสุดปี วิธีใช้ดีเอ็นเอจำนวนมากได้ขึ้นใช้ในการศึกษาความแปรผันในประชากร Fusarium pathogenic (Kiprop et al.,2002 Sivaramakrishnan และ al., 2002) ดีเอ็นเอลายพิมพ์สำเร็จใช้สำหรับFusarium ในตรวจลักษณะเฉพาะของของแต่ละบุคคลแยกและจัดเป็นมาตรฐานเชื้อชาติห้องเรียน สำหรับพันธุ์พันธุ์ พืชทนความรู้เกี่ยวกับการศึกษาในการแข่งขันที่พืชเฉพาะพื้นที่เป็นสิ่งสำคัญโดยเฉพาะอย่างยิ่งการปิรามิดหลายยีนต้านทานในตัว eliteลักษณะทางพันธุกรรมGherbawy et al. (2002) ใช้เทคนิคอาร์เอพีดีสำหรับการระบุ Fusarium subglutinans เอฟproliferatum และ F. verticillioides สายพันธุ์แยกต่างหากจากข้าวโพดในประเทศออสเตรีย Pasquali et al(2003) โรคแยกของ Fusariumoxysporum pathogenic บน Argyranthemumfrutescens L. โดยใช้เทคนิคอาร์เอพีดี ทางพันธุกรรมความคล้ายคลึงกันระหว่างแยกของ F. oxysporum f. spciceri ได้ศึกษาการใช้อาร์เอพีดี 40 และ 2 IGSไพรเมอร์และผลลัพธ์บ่งชี้ว่า มีน้อยความแปรผันทางพันธุกรรมระหว่างการแยกเก็บจากสถานต่าง ๆ ในอินเดีย (สิงห์ et al.,2006) . cramer et al. (2003) รายงานการอาร์เอพีดีแถบที่ต่างแข่งขันเอฟoxysporum f. sp. phaseoli และ F. oxysporum fsp. betae รหัสของการแข่งขัน pathogenic 01B/C, 5 และ 6 ของ F. oxysporum f. sp. ciceri ได้การรายงานโดยใช้ไพรเมอร์ 40 อาร์เอพีดี (Jimenez-Gasco et al., 2004)ทำซ้ำลำดับการใช้เป็นเครื่องหมายพันธุในจำนวนมากลายพิมพ์ดีเอ็นและ PCR ลายพิมพ์ทดลองเพื่อต้องใช้พิมพ์ของความหลากหลายของเชื้อรา filamentous yeastsไม่ มีความรู้เดิมของความอุดมสมบูรณ์ของตน และพันธุกรรม Fusarium ทูลแข่งขัน pigeonpea 203กระจายใน genomes เชื้อรา investigated(Meyer et al., 2003) เครื่องหมาย SSR ที่โดดเด่นแข่งขัน 4 F. oxysporum ciceri ก่อให้เกิดระดับแตกต่างกันของ wilting กับโฮสต์ที่แตกต่างพันธุ์ (Barve และ al., 2001) Bogale et al. (2005)พบว่าเปิดเผยกับ 8 SSR โพลีมอร์ฟิซึมเครื่องหมายก็เพียงพอสำหรับการศึกษาทางพันธุกรรมความหลากหลายใน F. oxysporum ซับซ้อนคลัสเตอร์ของ ribosomal DNA ประกอบด้วยตัวตามกันไปทำซ้ำสามเขียนโค้ด (18S, 5.8S และ 28S),ของ noncoding และสองและเป็นตัวเว้นวรรค Intergenic(IGS) ออกแบบไพรเมอร์จากภูมิภาค rDNAมีความน่าเชื่อถือเหนือกว่ามากเมื่อเปรียบเทียบกับการใช้คลิปปากตะเข้ไม่กำหนดแบบสุ่มหรือไพรเมอร์ เหล่านี้เครื่องหมายที่เกิดขึ้นในหลายมีถึง 200ต่อจีโนม haploid ที่จัดเรียงตัวตามกันไปทำซ้ำและจะมีประสิทธิภาพสูงสุดในการตรวจสอบโพลิมอร์ฟิซึม (ยาว et al., 1992) อินเตอร์ทับศัพท์ภูมิภาคเป็นตัวเว้นวรรคได้ถูกใช้เสร็จเรียบร้อยแล้วสร้างเฉพาะไพรเมอร์สามารถขึ้นต้นอย่างใกล้ชิดที่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์เชื้อรา(Bryan et al., 1996)Taxon เลือกขยายความได้แล้วใช้สำหรับตรวจโรคเชื้อราเช่น Fusarium และ Verticillium โอ (Nazarร้อยเอ็ด al., 1991) O'Donnell (1992) พบน่าแปลกใจระดับของ divergence เป็นลำดับภายในพันธุ์เอฟ sambucinum Chakrabarti et al. (2000)พบว่าการย่อยอาหารของภูมิภาค IGS เอาต์ผลิตวงเหมือนกันสำหรับทั้งสอง race1 กับ EcoR1และแข่งขัน 4 F. oxysporum f. sp. ciceri แต่รูป banding แต่ละ และโดดเด่นได้สังเกต 2 การแข่งขันการแข่งขัน 3 ความหลากหลายทางพันธุกรรมการศึกษาได้แสดงศักยภาพเหมาะสมของประชากร pathogenic และบางครั้งการอาร์เอพีดีรูปแบบสามารถสะท้อนให้เห็นถึงความแปรผันของ formaespeciales (Clark et al., 1998)จุดมุ่งหมายของการศึกษานี้เป็นการ กำหนดพันธุกรรมต่าง ๆ นี่ที่แยกกู้ udum จากพืชทั้งหลายเส้นเขตข้อมูลที่ได้รับผลกระทบของ pigeonpea จาก 7 วิชาเติบโตรัฐของอินเดียโดยใช้ PCR ตามชีพจรเครื่องหมายระดับโมเลกุลและพันธุกรรมที่ประเมินrelatedness
การแปล กรุณารอสักครู่..
ถั่วมะแฮะ (ต้น Cajanus cajan)
เป็นหนึ่งของโลกที่มีการปลูกพืชการเต้นของชีพจรที่สำคัญที่สุดที่ต้องทนทุกข์ทรมานหนักสูญเสียผลผลิตได้ถึง
90%
เนื่องจากหลอดเลือดเหี่ยวที่เกิดจากเชื้อราFusarium udum โรคนี้เป็นที่แพร่หลายในพัลส์เกือบทุกพื้นที่ที่เพิ่มขึ้นของโลกรวมทั้งอนุทวีปอินเดีย, อิหร่าน, เปรู, ซีเรีย, เอธิโอเปีย, เม็กซิโก, สเปน, ตูนิเซีย, ตุรกีและสหรัฐอเมริกา(เน et al., 1989). แม้ว่ามาก ความคืบหน้าได้รับการทำในการพัฒนาสายถั่วมะแฮะที่มีความต้านทานต่อการจำกัด สิ่งมีชีวิตและความอดทนที่จะ abiotic ความเครียด, การสูญเสียผลผลิตในพืชเหล่านี้มีสูงมากเนื่องจากการอุบัติการณ์สูงของโรคและinsectpests (เนและชีล่า, 1990). Fusarium เหี่ยวของถั่วมะแฮะเกิด โดยเอฟudum ซึ่งเป็นทั้งดินและเมล็ดพันธุ์พาหะและยากที่จะกำจัดเชื้อราเป็นchlamydospores อยู่รอดในดินได้ถึงหกปีที่ผ่านมาแม้ในกรณีที่ไม่มีของพืช ชีวเคมีและสรีรวิทยาของการทำงานร่วมกันเชื้อรา Fusarium โรงงานที่ได้รับการที่โดดเด่นอย่างกว้างขวางแต่สอบถามรายละเอียดเพิ่มเติมที่ชัดเจนลงไปในบัตรประจำตัวของแต่ละโมเลกุลที่จำเป็นสำหรับการเกิดโรคเชื้อรา Fusarium พืชยังไม่เริ่มจนกว่าเทคโนโลยีพันธุศาสตร์โมเลกุลกลายเป็นใช้ได้สำหรับเชื้อรา(ทิมเบอร์เลคและมาร์แชล 1989; เบนเน็ตต์และLasure , 1991) การพัฒนากลยุทธ์ที่มีประสิทธิภาพสำหรับการจัดการของโรคเหี่ยวความเข้าใจในพื้นฐานระดับโมเลกุลของการเกิดโรคและกลไกการต้านทานเป็นสิ่งจำเป็น. บัตรประจำตัวของสายพันธุ์ของพืชและสัตว์Fusarium มีความซับซ้อนในหลายแง่มุม. ลักษณะทางสัณฐานวิทยาเช่นรูปร่างและขนาดของ macroconidia แสดงตนหรือไม่มี ของ microconidia และ chlamydospores และอาณานิคมสัณฐานมักจะไม่เพียงพอที่จะช่วยให้การระบุในระดับสปีชีส์ นอกจากนี้ข้อสังเกตเหล่านี้จำเป็นต้องปฏิบัติที่บางและมีความยากในการที่ไม่ใช่ผู้เชี่ยวชาญ(Windels 1991;. Bluhm, et al, 2002) แม้ว่าโรคphenotypes จะมีประโยชน์สำหรับการประเมินพันธุกรรมเปลี่ยนแปลงในเชื้อโรคเชื้อรา; โรคเครื่องหมายมักจะ จำกัด จำนวนและเรื่องที่จะเป็นเจ้าภาพการเลือก(เหลียง et al., 1993) สำหรับการจัดการแบบบูรณาการเหี่ยวบัตรประจำตัวของไอโซเลท/ การแข่งขันและกลยุทธ์การพัฒนาที่จะรวมความต้านทานเป็นสิ่งสำคัญมาก ความผิดบัตรประจำตัวของการแข่งขันที่มีความสำคัญต่อ resistancebreeding ใด ๆ โปรแกรมเป็นภาพที่ถูกต้องเกี่ยวกับการดำรงอยู่ของจำนวนของการแข่งขันทางสรีรวิทยาในudum Fusarium ยังไม่ชัดเจน บัตรประจำตัวของเชื้อใด ๆ / การแข่งขันโดยเครื่องมือเช่นโมเลกุลดีเอ็นเอลายนิ้วมือจะถือเป็นที่น่าเชื่อถือที่สุดวิธีการ นอกจากนี้ประชาชนและการจัดหมวดหมู่ของการแข่งขันผู้บริจาคที่เฉพาะเจาะจงจะช่วยในpyramiding ของยีนต้านทานสำหรับการพัฒนาทนพันธุ์กับการแข่งขันหลายเชื้อโรค. การเปรียบเทียบในระดับดีเอ็นเอมีการจัดหมวดหมู่ที่ถูกต้องของสายพันธุ์ของเชื้อราเพื่ออธิบายวิวัฒนาการของระบบนิเวศและความสัมพันธ์ระหว่างสายพันธุ์ที่มีความหลากหลาย เมื่อเร็ว ๆ นี้ในปีดีเอ็นเอหลายวิธีตามที่ได้รับการใช้มากขึ้นเพื่อศึกษาความแปรปรวนในประชากรที่ทำให้เกิดโรคเชื้อราFusarium (Kiprop, et al. 2002;. Sivaramakrishnan, et al, 2002) ดีเอ็นเอลายนิ้วมือได้รับการใช้ประสบความสำเร็จสำหรับเชื้อราFusarium ในลักษณะของแต่ละสายพันธุ์และการจัดกลุ่มพวกเขาเป็นเชื้อชาติมาตรฐานชั้นเรียน สำหรับการเพาะพันธุ์ของสายพันธุ์ที่ทนต่อพืช, ความรู้เกี่ยวกับการแข่งขันการติดเชื้อในการที่พื้นที่เพาะปลูกโดยเฉพาะอย่างยิ่งเป็นสิ่งสำคัญอย่างยิ่งที่จะปิรามิดยีนต้านทานในหลายยอดจีโนไทป์. Gherbawy et al, (2002) ใช้เทคนิค RAPD สำหรับการระบุ subglutinans Fusarium เอฟproliferatum และสายพันธุ์เอฟ verticillioides ที่แยกได้จากข้าวโพดเลี้ยงสัตว์ในออสเตรีย Pasquali et al. (2003) ลักษณะสายพันธุ์ของเชื้อรา Fusarium oxysporum ที่ทำให้เกิดโรคใน Argyranthemum frutescens L. ใช้เทคนิค RAPD พันธุกรรมคล้ายคลึงกันระหว่างสายพันธุ์ของเอฟเอฟ oxysporum Sp. Ciceri ได้ศึกษาโดยใช้อาร์เอพี 40 และ 2 IGS ไพรเมอร์และพบว่ามีน้อยแปรปรวนทางพันธุกรรมของสายพันธุ์ที่เก็บรวบรวมจากสถานที่ที่แตกต่างกันในอินเดีย(Singh et al., 2006) แครมเมอ et al, (2003) รายงาน RAPD เฉพาะแถบที่แยกความแตกต่างในหมู่การแข่งขันเอฟoxysporum ฉ เอสพี phaseoli และเอฟ oxysporum f. เอสพี betae บัตรประจำตัวของการแข่งขันที่ทำให้เกิดโรค 0, 1B / C, 5 และ 6 ของเอฟเอฟ oxysporum เอสพี Ciceri ได้รับการรายงานการใช้ไพรเมอร์อาร์เอพี40 (Jimenez- Gasco et al., 2004). ซ้ำลำดับที่เรียบง่ายมีการใช้เครื่องหมายทางพันธุกรรมในดีเอ็นเอลายนิ้วมือจำนวนมากและPCR ทดลองพิมพ์ลายนิ้วมือสำหรับสายพันธุ์พิมพ์ของความหลากหลายของเชื้อราและยีสต์โดยไม่ต้องก่อนความรู้เกี่ยวกับความอุดมสมบูรณ์ของพวกเขาและความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อรา Fusarium แข่งเหี่ยวของถั่วมะแฮะ 203 การจัดจำหน่ายในการตรวจสอบจีโนมของเชื้อรา(เมเยอร์ et al., 2003) เครื่องหมาย SSR โดดเด่นในสี่ของการแข่งขันเอฟoxysporum Ciceri ก่อให้เกิดระดับที่แตกต่างกันของเหี่ยวแห้งกับโฮสต์แตกต่างพันธุ์(Barve et al., 2001) Bogale et al, (2005) แสดงให้เห็นว่าแตกต่างเปิดเผยกับ 8 SSR เครื่องหมายก็เพียงพอสำหรับการศึกษาทางพันธุกรรมความหลากหลายในเอฟ oxysporum ซับซ้อน. กลุ่มของดีเอ็นเอไรโบโซมประกอบด้วยซ้ำควบคู่สามการเข้ารหัส (18S, 5.8S และ 28S) และสอง noncoding อยและ spacer intergenic (IGS) การออกแบบไพรเมอร์จากภูมิภาค rDNA มีความน่าเชื่อถือไกลกว่าเมื่อเทียบกับการใช้งานของยานสำรวจที่ไม่ได้กำหนดแบบสุ่มหรือไพรเมอร์ เหล่านี้บ่งชี้ที่เกิดขึ้นในหลายชุดที่มีมากถึง 200 ชุดต่อจีโนมเดี่ยวจัดควบคู่ซ้ำและมีประสิทธิภาพมากที่สุดในการตรวจสอบความแตกต่าง(ยาว et al., 1992) อินเตอร์คัดลอกภูมิภาคเว้นวรรคได้รับการใช้ประสบความสำเร็จในการสร้างไพรเมอร์โดยเฉพาะความสามารถในการที่แตกต่างกันอย่างใกล้ชิดที่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์ของเชื้อรา(ไบรอัน et al., 1996). แท็กซอน-เลือกใช้เครื่องขยายเสียงที่มีอยู่แล้วถูกนำมาใช้ในการตรวจหาเชื้อโรคเชื้อราเช่นเชื้อราFusarium spp และ Verticillium (Nazar et al., 1991) ดอนเนลล์ (1992) พบว่าที่น่าแปลกใจระดับของความแตกต่างสำหรับลำดับย่อยในสายพันธุ์ของเอฟsambucinum Chakrabarti et al, (2000) แสดงให้เห็นว่าการย่อยอาหารของภูมิภาค IGS ขยายกับEcoR1 ผลิตวงดนตรีที่คล้ายกันทั้ง race1 และการแข่งขันที่ 4 ของเอฟเอฟ oxysporum เอสพี Ciceri แต่บุคคลและรูปแบบที่โดดเด่นแถบถูกตั้งข้อสังเกตสำหรับการแข่งขัน2 และการแข่งขัน 3. ความหลากหลายทางพันธุกรรมการศึกษาสามารถเปิดเผยศักยภาพการปรับตัวของประชากรที่ทำให้เกิดโรคและบางครั้งRAPD รูปแบบสามารถสะท้อนให้เห็นถึงความแปรปรวนของ formae Speciales (คลาร์ก et al., 1998). จุดมุ่งหมายของ การศึกษาครั้งนี้เพื่อศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของคอลเลกชันแยกของเอฟudum หายจากโรคพืชเหี่ยวในสาขาที่ได้รับผลกระทบของถั่วมะแฮะจากเจ็ดหลักรัฐที่เพิ่มขึ้นชีพจรของอินเดียโดยใช้วิธีPCR ตามเครื่องหมายโมเลกุลและการประเมินพันธุกรรมสัมพันธ์
การแปล กรุณารอสักครู่..
แฮะ ( มัธยมศึกษาปีที่ ) เป็นหนึ่งในที่สำคัญที่สุดของโลก
ชีพจรพืชที่ประสบความสูญเสียหนัก
ถึง 90% เนื่องจากหลอดเลือดจะทำให้
โดย Fusarium udum . เป็นโรคที่แพร่หลายในเกือบทุกพื้นที่ปลูกถั่ว
ของโลกรวมทั้งอนุทวีปอินเดีย , อิหร่าน , เปรู ,
ซีเรีย , เอธิโอเปีย , เม็กซิโก , สเปน , ตูนิเซีย , ตุรกี ,
และสหรัฐอเมริกา ( Nene et al . , 1989 ) .
ถึงแม้ว่าความคืบหน้ามากได้รับการทำในสายการพัฒนาแฮะ
และข้อจำกัดทางชีววิทยาที่มีความต้านทานต่อการสูญเสียผลผลิตในไร่
เครียด พืชเหล่านี้มีสูงมาก
เนื่องจากอุบัติการณ์สูงของโรคและ insectpests
( เนเน่ และ Sheila , 1990 ) .
Fusarium เหี่ยวผลิตเกิดจาก F .
udum ซึ่ง เป็นทั้งดินและเมล็ดพันธุ์พาหะและ
chlamydospores ยากที่จะลบล้างเป็นเชื้อราอยู่รอดในดินได้ถึง 6 ปี แม้ในกรณีที่ไม่มี
ของพืชเป็นเจ้าภาพ ชีวเคมีและสรีรวิทยา
พืช Fusarium ปฏิสัมพันธ์ได้
ลักษณะอย่างกว้างขวาง แต่ที่ชัดเจนในตัวของโมเลกุลแต่ละสอบถาม
ที่จำเป็นสำหรับ Fusarium ซึ่งพืช
ไม่เริ่มจนกว่าเทคโนโลยีพันธุศาสตร์โมเลกุล กลายเป็นใช้ได้สำหรับเส้นใยเชื้อรา
( ทิมเบอร์เลคและมาร์แชล , 1989 ;เบนเน็ตต์และ
lasure , 1991 ) ในการพัฒนากลยุทธ์ที่มีประสิทธิภาพสำหรับการจัดการของโรคเหี่ยวเขียว ความเข้าใจพื้นฐานของโมเลกุล
พยาธิสภาพ และกลไกการต้านทานเป็นสิ่งจำเป็น .
จำแนกชนิดของพืชสกุล
Fusarium ความซับซ้อนในด้านต่างๆ เช่น รูปร่าง และลักษณะทางสัณฐานวิทยา
ขนาดของ macroconidia , การแสดงหรือการขาด
microconidia chlamydospores และ ,และกลุ่มโครงสร้างมักจะไม่เพียงพอที่จะอนุญาตให้
ตัวที่ชนิดระดับ นอกจากนี้
สังเกตเหล่านี้ต้องการการปฏิบัติและ
ยากไม่ใช่ผู้เชี่ยวชาญ ( windels , 1991 ;
บลูม et al . , 2002 ) แม้ว่าการเกิด
สามารถเป็นประโยชน์สำหรับการประเมินทางพันธุกรรมของเชื้อราก่อโรคใน
; การเครื่องหมายมักจะจำกัดจำนวนและวิชา
โฮสต์เลือก ( Leung et al . , 1993 ) สำหรับการจัดการแบบรวมของเหี่ยว
,
/ การแยกเชื้อชาติและการพัฒนากลยุทธ์เพื่อ
รวมต้านทานเป็นสิ่งสำคัญมาก การแข่งมีแน่นอน
resistancebreeding ใด ๆโปรแกรมเป็นภาพที่ต้องการเกี่ยวกับ
การดำรงอยู่ของจำนวนแข่งทางสรีรวิทยา
Fusarium udum ยังไม่กระจ่าง การจำแนก
ใด ๆที่แยก / การแข่งขันโดยเครื่องมือเช่นลายโมเลกุลดีเอ็นเอ
ถือว่าเป็นวิธีที่เชื่อถือได้
ที่สุด นอกจากนี้ การกำหนดประเภทของการแข่งขันที่เฉพาะเจาะจงและ
ผู้บริจาคจะช่วยใน pyramiding ของยีนต้านทาน เพื่อพัฒนาพันธุ์ต้านทานต่อหลายเชื้อชาติ
ของเชื้อโรค การเปรียบเทียบลำดับดีเอ็นเอที่ระดับมีการจำแนกชนิดของเชื้อราที่ถูกต้อง
เพื่อศึกษาวิวัฒนาการและนิเวศวิทยา
ความสัมพันธ์ระหว่างหลากหลายชนิด ในล่าสุด
ปี ดีเอ็นเอ มากมายตามวิธีการได้รับ
ใช้มากขึ้นเพื่อศึกษาความแปรปรวนในประชากรเชื้อ Fusarium (
kiprop et al . , 2002 ; sivaramakrishnan et al . , 2002 ) ลายพิมพ์ดีเอ็นเอ
เรียบร้อยแล้ว ใช้ในลักษณะของแต่ละคน
ฟิวซาเรียมไอโซเลตและการจัดกลุ่มให้เป็นมาตรฐานเชื้อชาติ
ชั้นเรียน สำหรับการปรับปรุงพันธุ์พืชที่ทน
ความรู้เกี่ยวกับเชื้อโรคพืชโดยเฉพาะอย่างยิ่งการแข่งขันในพื้นที่สำคัญ โดยเฉพาะ
พีระมิดหลายยีนต้านทานในพันธุกรรม ยอด
.
gherbawy et al . ( 2002 ) โดยการใช้เทคนิค
Fusarium subglutinans , F .
verticillioides สายพันธุ์และ proliferatum Fที่แยกได้จากข้าวโพดในออสเตรีย pasquali et al .
( 2003 ) ลักษณะเชื้อ Fusarium oxysporum argyranthemum
ใบ frutescens L . ด้วยเทคนิค . พันธุกรรม
ความคล้ายคลึงกันระหว่างเชื้อ F . oxysporum F .
ciceri ศึกษาโดยใช้ 40 เพียง 2 igs
ชนิดพบว่ามีความผันแปรทางพันธุกรรมระหว่างไอโซ
น้อยจากสถานที่ที่แตกต่างกันในอินเดีย ( Singh et al . ,
2006 ) Cramer et al . ( 2003 ) รายงานเฉพาะแถบที่แยกความแตกต่างระหว่างเชื้อชาติด้วย
.
F . sp . และเชื้อ F . oxysporum phaseoli F .
. betae . การจำแนกชนิดของเชื้อโรค แข่ง 0
1B / c , 5 และ 6 ของ F . oxysporum F . sp . มีการรายงานการใช้ ciceri
40 RAPD primers ( เมเนซ -
แก๊สโก et al . , 2004 ) .
ทำซ้ำลำดับง่ายๆได้
เครื่องหมายพันธุกรรมในดีเอ็นเอและลายนิ้วมือและลายมากมาย
พิมพ์เมื่อยการทดลองของความหลากหลายของเชื้อราเส้นใยและยีสต์
ไม่มีความรู้ก่อนของความอุดมสมบูรณ์และความหลากหลายทางพันธุกรรมของ Fusarium เหี่ยว
การแข่งผลิต 203 ศึกษาจีโนมเชื้อรา
( Meyer et al . , 2003 ) เครื่องหมาย SSR แตกต่าง
สี่เผ่าพันธุ์ของ ciceri
F . oxysporum เป็นสาเหตุหลากหลายระดับของความแตกต่างกับค่าโฮส
พันธุ์ ( barve et al . , 2001 ) Bogale et al . ( 2005 ) พบว่า พบมี 8
-
เครื่องหมาย SSR เพียงพอสำหรับศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมใน
F . oxysporum ซับซ้อน กลุ่มของ ribosomal DNA ประกอบด้วย
ตีคู่ซ้ำ 3 นะครับ ( พบ 5.8s , และ 28s )
2 noncoding และส่า spacer
( igs )ออกแบบไพรเมอร์จาก rDNA เขต
มีความน่าเชื่อถือมากกว่าเมื่อเทียบกับการใช้
สุ่มไม่กำหนด probes หรือรองพื้น
เครื่องหมายเหล่านี้เกิดขึ้นในหลายชุดมีถึง 200 แผ่นต่อแฮพลอยด์จีโนม
จัดตีคู่ซ้ำ และมีประสิทธิภาพที่สุดในการตรวจหา
polymorphism ( เย้า et al . , 1992 ) และในช่วงระหว่างภูมิภาคได้ถูกใช้เรียบร้อยแล้ว
สร้างโดยเฉพาะความสามารถในการเชื้อราชนิดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด
( ไบรอัน et al . , 1996 ) .
ชนิดเลือกของได้
( ใช้ตรวจหาเชื้อโรคเชื้อรา Fusarium spp .
เช่นจำแนกชนิด ( นาซา
et al . , 1991 ) ดอนเนลล์ ( 1992 ) พบระดับของความแตกต่างของลำดับใจ
sambucinum ภายในชนิดของ F . . chakrabarti et al . ( 2000 )
การแปล กรุณารอสักครู่..