3.1. General resultsThe validation

3.1. General results
The validation results are given in Table 3. It is appropriate to
compare these to corresponding values of the previous research
for the small library of literature spectra. The principal value was
73% TP [12]. Here the corresponding result is 75% for the literature
sublibrary (Table 3) that is very close to the previous value. Two
other sublibraries are new in the second version.
The experimental sublibrary includes 54 ESI and MALDI product-
ion mass spectra recorded in our laboratory for 6–7 cyclic peptides.
This implies 7.7 replicate spectra available per a compound.
The last value is relatively high one that is essential for obtaining
true search results. Indeed, it is known that both the TPR and the
mean MF usually tend to rise with the number of replicate
‘unknown’ and reference spectra acquired for a unique compound
[10, p.186; 11]. It is explained by increasing a probability of matching
spectra of the same compounds. Searches performed only for
the spectral subset under consideration, i.e. when both test and
reference spectra were experimental, led to 100% TP (Table 3).
The average MF in these searches is within the range of 590–648
that is higher than the average value of 396 for the 1st rank spectra
in all the test searches.
Both ESI and MALDI fragment spectra are obviously closer to
each other in every of the two groups than between groups. The
spectral resemblance seems to be due to a similarity in experimental
conditions which are rather similar within the groups although
collision energy and partly laser shots/power are not the same.
Also, ESI product-ion mass spectra match rather well with MALDI
ones and vice versa. As the result, in all the test searches reference
spectra of these two groups may substitute for one another, retaining
high outcome of 86–95% initial TP obtained for both groups
without their elimination.
It should be supplemented that MALDI product-ion spectra are
very seldom to be entered in mass spectral libraries. To our best
knowledge, the only exclusion is the group of MALDI ToF–ToF spectra
obtained by means of high-energy collision-induced dissociation
and incorporated in MassBank [38]. Our library is the first
one containing MALDI LIFT ToF/ToF spectra (see also [39]).
Another part of the library is ‘one-dimension’ spectra. Searches
performed only within this type of data resulted in the low rate of
36% TP. We explain this low value by frequent false matching many
‘one-dimension’ spectra of different compounds because of the
same m/z of many fragment ions with the same 100% intensity of
their peaks.
Basic validation results refer to the sum of sublibraries and
searches in the entire library. The overall TPR of 70% is not very
high one. The rate is diminished due to the unconventional contribution
of defective/‘one-dimension’ data. Without that, the correct
results that are the 1st rank above-threshold matches appeared in
88% of cases (Table 3). However, incorporation of ‘one-dimension’
subset into only reference spectra set increases the rate of TP from
88% to 91% (Table 3). We think that this effect is due to rising total
probability of spectral match of the same compounds with increasing
the number of replicate spectra (see below). It is also clear that
here probable false matches

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.1 การผลทั่วไปตรวจสอบผลลัพธ์แสดงไว้ในตาราง 3 มีความเหมาะสมเปรียบเทียบกับค่าที่สอดคล้องกันของการวิจัยก่อนหน้านี้สำหรับห้องสมุดขนาดเล็กของวรรณคดีแรมสเป็คตรา ค่าหลัก73% TP [12] ที่นี่ผลที่สอดคล้องกันเป็น 75% ในวรรณคดีsublibrary (ตาราง 3) ที่มากค่าก่อนหน้านี้ สองsublibraries อื่น ๆ ได้ใหม่ในรุ่นที่สองSublibrary ทดลองรวม 54 ESI และ MALDI ผลิตภัณฑ์-บันทึกแรมสเป็คตรามวลไอออนในห้องปฏิบัติการของเราสำหรับเปปไทด์ทุกรอบ 6-7นี้หมายถึง 7.7 จำลองแรมสเป็คตรามีต่อสารประกอบค่าสุดท้ายเป็นค่อนข้างสูงที่สำคัญสำหรับการได้รับผลการค้นหาความจริง แน่นอน เป็นที่รู้จักกันที่ทั้ง TPR และMF หมายถึงมักจะมีแนวโน้มจะ เพิ่มขึ้น มีการจำลองแรมสเป็คตรา 'ไม่รู้จัก' และการอ้างอิงที่มาสำหรับสารประกอบเฉพาะ[10, p.186; 11] มีคำอธิบาย โดยการเพิ่มความน่าเป็นของการจับคู่แรมสเป็คตราสารเดียวกัน ค้นหาเฉพาะสำหรับสเปกตรัมชุดย่อยภายใต้การพิจารณา เช่นเมื่อทั้งทดสอบ และแรมสเป็คตราอ้างอิงถูกทดลอง ไฟ led 100% TP (ตาราง 3)ค่าเฉลี่ย MF ในการค้นหาเหล่านี้เป็นของ 590-648คือสูงกว่าค่าเฉลี่ยของ 396 สำหรับแรมสเป็คตราอันดับ 1ในการทดสอบค้นหาทั้งหมดแรมสเป็คตราส่วน ESI และ MALDI จะชัดใกล้กันในทุกส่วนของกลุ่มสองมากกว่าระหว่างกลุ่ม ที่รูปสเปกตรัมน่าจะเนื่องจากความคล้ายคลึงกันในการทดลองเงื่อนไขที่ค่อนข้างคล้ายกันภายในกลุ่มถึงแม้ว่าพลังงานชนและบางส่วนภาพพลังงานเลเซอร์จะไม่เหมือนกันยัง แรมสเป็คตรามวลของไอออนผลิตภัณฑ์ ESI ตรงค่อนข้างดีกับ MALDIคน และในทางกลับกัน เป็นผล ในการอ้างอิงค้นหาทดสอบทั้งหมดแรมสเป็คตราของสองกลุ่มนี้อาจทดแทนกันได้ รักษาผลสูงของ TP เริ่มต้น 86-95% ได้ทั้งกลุ่มโดยไม่มีการตัดควรเสริมแรมสเป็คตราผลิตภัณฑ์ไอออน MALDIมากแทบที่จะป้อนลงในไลบรารีมวลสเปกตรัม จะดีที่สุดความรู้ ข้อยกเว้นที่เดียวคือ กลุ่มของ MALDI ToF – ToF แรมสเป็คตรารับจาก high-energy เกิดชน dissociationและรูปใน MassBank [38] ห้องสมุดเป็นครั้งแรกหนึ่งประกอบด้วยแรมสเป็คตรา MALDI ยก ToF/ToF (ดู [39])ส่วนอื่นของห้องสมุดเป็น 'หนึ่งมิติ' แรมสเป็คตรา ค้นหาดำเนินการภายในเฉพาะข้อมูลชนิดนี้ให้ในอัตราต่ำTP. 36% เราอธิบายค่านี้ต่ำ โดยเท็จบ่อยตรงมาก'หนึ่งมิติ' แรมสเป็คตราสารต่าง ๆ เนื่องจากการเดียวกัน m/z ของประจุส่วนมาก มีความเข้ม 100% เหมือนของยอดเขาของพวกเขาตรวจสอบพื้นฐานผลลัพธ์หมายถึงผลรวมของ sublibraries และค้นหาในไลบรารีทั้งหมด TPR โดยรวม 70% ไม่มากหนึ่งสูง อัตราจะลดลงเนื่องจากสัดส่วนกระเป๋าข้อมูลบกพร่อง / 'หนึ่งมิติ' โดยที่ ถูกต้องผลลัพธ์ที่ตรงเหนือขีดจำกัดอันดับ 1 ที่ปรากฏใน88% ของกรณีและปัญหา (ตาราง 3) อย่างไรก็ตาม ประสาน 'หนึ่งมิติ'ชุดย่อยชุดแรมสเป็คตราอ้างอิงเท่านั้นเพิ่มอัตราของ TP จาก88% ถึง 91% (ตาราง 3) เราคิดว่า เป็นลักษณะพิเศษนี้เนื่องจากยอดรวมเพิ่มขึ้นน่าตรงกับสเปกตรัมของสารเดียวกันกับการเพิ่มจำนวน replicate แรมสเป็คตรา (ดูด้านล่าง) ก็ยัง ชัดว่าที่นี่ไม่น่าเป็นตรง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.1 . ผลลัพธ์ทั่วไป
ตรวจสอบผลลัพธ์จะได้รับในตารางที่ 3 มันเหมาะสม
เปรียบเทียบเหล่านี้สอดคล้องกันค่า
งานวิจัยก่อนหน้านี้สำหรับห้องสมุดขนาดเล็กของสเปกตรัมของวรรณกรรม ค่าหลัก
73% TP [ 12 ] ที่นี่ผลที่สอดคล้องกันเป็น 75% ในวรรณคดี
sublibrary ( ตารางที่ 3 ) ซึ่งอยู่ใกล้กับค่าก่อนหน้า 2
sublibraries อื่นใหม่ ในรุ่นที่สอง จำนวนรวม 54 sublibrary
-
มา ดิ ESI และผลิตภัณฑ์ไอออนมวลสเปกตรัม ที่บันทึกไว้ในแล็ปของเรา 6 – 7 เป็น เปปไทด์
นี้บาง 7.7 ทำซ้ำสเปกตรัมที่มีต่อสารประกอบ .
ค่าสุดท้ายที่ค่อนข้างสูงที่จำเป็นสำหรับการขอรับ
ผลการค้นหาจริง จริงๆแล้ว มันเป็นที่รู้จักกันว่า ทั้งด้วย
หมายถึง MF มักจะมีแนวโน้มที่จะเพิ่มขึ้นด้วยจำนวนมาก
'unknown ' และอ้างอิงสเปกตรัมที่ได้เป็นสารประกอบ
[ เฉพาะ 10 , p.186 ; 11 ] มันถูกอธิบายโดยการเพิ่มความเป็นไปได้ของการจับคู่
สเปกตรัมของสารประกอบเดียวกัน การค้นหาดำเนินการสำหรับ
ย่อยสเปกตรัมภายใต้การพิจารณา คือ เมื่อทั้งการทดสอบและการอ้างอิงเป็นแบบ
แสง LED 100% TP ( ตารางที่ 3 ) .
MF เฉลี่ยในการค้นหาเหล่านี้ภายในช่วง 590 ( 648
ที่สูงกว่าค่าเฉลี่ยของเราในอันดับที่ 1 ในการค้นหาทดสอบทั้งหมดนี้
.
2 ส่วนนี้มา ดิ ESI และเห็นได้ชัดใกล้ชิดกับแต่ละอื่น ๆ
ในทุกกลุ่มกว่ากันระหว่างกลุ่ม
เหมือนเงาน่าจะเนื่องจากความคล้ายคลึงกันในการทดลอง
เงื่อนไขที่คล้ายกัน แต่ภายในกลุ่ม ถึงแม้
พลังงานการชนและบางส่วนยิงเลเซอร์ / พลังไม่เหมือนกัน
นอกจากนี้ ESI ไอออนผลิตภัณฑ์มวลสเปกตรัมราคาค่อนข้างดี กับคนที่มา ดิ
และในทางกลับกัน ผลการค้นหาทั้งหมดทดสอบอ้างอิง
สเปกตรัมของทั้งสองกลุ่มอาจทดแทนซึ่งกันและกัน รักษา
ผลสูง 86 – 95% เริ่มต้น TP ได้ทั้งกลุ่ม
โดยไม่มีการตัดของพวกเขา .
มันควรเสริมที่ให้มา ดิผลิตภัณฑ์ไอออนเป็น
ไม่ค่อยจะถูกป้อนในมวลสเปกตรัมห้องสมุด เพื่อความรู้ที่ดีที่สุด
ของเรา ยกเว้นเพียงอย่างเดียวคือ กลุ่มของ มา ดิ tof – tof Spectra
ได้มาโดยวิธีการแห่งการการชนเหนี่ยว
และรวมอยู่ใน massbank [ 38 ] ห้องสมุดของเราเป็นครั้งแรก
หนึ่งที่มีมา ดิ ยก tof / tof สเปกตรัม ( ดู [ 39 ] )
อีกส่วนหนึ่งของห้องสมุดหนึ่งมิติ " โดย . ค้นหา
ดําเนินการภายในข้อมูลชนิดนี้ส่งผลให้อัตราดอกเบี้ยต่ำของ
36% TP เราอธิบายค่าต่ำโดยบ่อยมาก
'one-dimension เท็จจับคู่ ' สเปกตรัมของสารประกอบที่แตกต่างกันเพราะ M / Z
เดียวกันของไอออนออกมามากมายด้วยเหมือนกัน 100 % ความเข้มของ
ยอดของพวกเขาพื้นฐานการอ้างถึงผล

และผลรวมของ sublibraries ค้นหาในห้องสมุดทั้งหมด TPR โดยรวม 70% ไม่ค่อย
สูงหนึ่ง อัตราการลดลงเนื่องจากการแหกคอกบริจาค
ข้อมูลบกพร่อง / 'one-dimension ' โดยที่ ถูกต้อง
ผลลัพธ์ที่เป็นอันดับที่ 1 เกณฑ์ข้างต้นตรงกับที่ปรากฏใน
88% ของกรณี ( ตารางที่ 3 ) อย่างไรก็ตาม การรวมตัวกันของ ' '
1 มิติเป็นเพียงส่วนย่อยสเปกตรัมอ้างอิงชุดเพิ่มอัตราของ TP จาก
88% ถึง 91 เปอร์เซ็นต์ ( ตารางที่ 3 ) เราคิดว่าผลนี้เกิดจากการเพิ่มขึ้นรวม
ความน่าจะเป็นของราคาของสเปกตรัมของสารประกอบเดียวกันกับการเพิ่ม
จำนวนทำซ้ำสเปกตรัม ( ดูด้านล่าง ) ก็ยังเป็นที่ชัดเจนว่า
ตรงกับเท็จที่นี่ น่าจะเป็น