Maximum-likelihood phylogenetic ana

Maximum-likelihood phylogenetic analyses were performed in raxmlGUI v. 1.3 with GTR+I+Γ model, which
was performed in jModelTest v. 2.1.4. One-hundred independent searches were performed, each starting with a
random tree. The best likelihood from each of these runs was selected as our maximum-likelihood estimate, and
statistical support for this topology was obtained by running 1000 bootstrap replicates in raxmlGUI v. 1.3.
Phylogenetic trees were modified by TreeGraph v. 2.0.47. Branches receiving ≥45% bootstrap support were
considered to be well-supported for 16S rRNA (Li et al. 2008). The outgroup Percocypris pingi (GenBank
Accession No. GQ406259) was chosen from the species closely related to the genus Onychostoma based on the
cyprinid phylogeny of Wang et al. (2012). Molecular phylogenies were used primarily to support the placement of
the newly collected specimens within the genus Onychostoma, rather than to resolve phylogenetic relationships
within the group.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความเป็นไปได้สูงสุด phylogenetic วิเคราะห์ได้ดำเนินการใน raxmlGUI v. 1.3 GTR + ฉัน +Γรุ่น ซึ่งที่ดำเนินการใน jModelTest v. 2.1.4 ดำเนินการค้นหาอิสระร้อย แต่ละเริ่มต้นด้วยการแผนภูมิการสุ่ม เลือกโอกาสที่ดีที่สุดจากเหล่านี้ทำเป็นประเมินความเป็นไปได้สูงสุดของเรา และทางสถิติสนับสนุนโทโพโลยีนี้กล่าว โดย 1000 เริ่มต้นระบบเหมือนกับใน raxmlGUI v. 1.3ต้นไม้ phylogenetic ถูกแก้ไข โดย TreeGraph v. 2.0.47 มีสาขาที่ได้รับการสนับสนุนการเริ่มต้นระบบ% ≥45ถือเป็นห้องพักได้รับการสนับสนุนสำหรับ 16S rRNA (Li et al. 2008) การ outgroup Percocypris pingi (GenBankหมายเลขทะเบียน GQ406259) ได้รับเลือกจากสายพันธุ์ที่ใกล้ชิดกับสกุล Onychostoma ตามกลุ่ม phylogeny ของวัง et al. (2012) Phylogenies โมเลกุลถูกใช้เพื่อสนับสนุนการวางspecimens รวบรวมใหม่ ในสกุล Onychostoma แทนที่ จะแก้ไขความสัมพันธ์ phylogeneticภายในกลุ่ม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โอกาสสูงสุดวิเคราะห์สายวิวัฒนาการได้ดำเนินการใน raxmlGUI v. 1.3 กับ GTR + I + รูปแบบΓซึ่ง
ได้ดำเนินการใน jModelTest v. 2.1.4 หนึ่งร้อยค้นหาอิสระได้ดำเนินการแต่ละเริ่มต้นด้วย
ต้นไม้แบบสุ่ม โอกาสที่ดีที่สุดจากแต่ละวิ่งเหล่านี้ได้รับเลือกเป็นประมาณการโอกาสสูงสุดของเราและ
การสนับสนุนทางสถิติสำหรับโครงสร้างนี้ได้โดยใช้ 1,000 บูตซ้ำใน raxmlGUI v. 1.3.
ต้นไม้ที่ถูกแก้ไขโดย TreeGraph v. 2.0.47 สาขาได้รับการสนับสนุนเงินทุน≥45% ได้รับ
การพิจารณาให้ได้รับการสนับสนุนที่ดีสำหรับ 16S rRNA (Li et al. 2008) outgroup Percocypris Pingi (GenBank
เลข GQ406259) ได้รับการคัดเลือกจากสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับสกุล Onychostoma ขึ้นอยู่กับ
เชื้อชาติ cyprinid วัง et al, (2012) phylogenies โมเลกุลถูกนำมาใช้เป็นหลักในการสนับสนุนการจัดตำแหน่งของ
ตัวอย่างที่เก็บใหม่ภายในสกุล Onychostoma มากกว่าที่จะแก้ปัญหาความสัมพันธ์ phylogenetic
ภายในกลุ่ม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ความเป็นไปได้สูงสุด ซึ่งมีการปฏิบัติใน raxmlgui V . 1.3 กับ GTR ฉันΓรูปแบบซึ่ง
ในการปฏิบัติ jmodeltest โวลต์ 2.1.4 . ร้อยค้นหาอิสระได้ แต่ละที่เริ่มต้นด้วย
ต้นไม้สุ่ม โอกาสที่ดีที่สุดจากแต่ละวิ่งเหล่านี้ ถูกเลือกเป็นโอกาสของเราสูงสุดประมาณและ
ทางสถิติสนับสนุนโครงสร้างนี้ได้โดยการใช้ซ้ำใน raxmlgui 1000 บู V 1.3 .
ต้นไม้ ซึ่งดัดแปลงโดยทรีกราฟ V 2.0.47 . สาขาที่ได้รับการสนับสนุน≥เท่ากับ 45% เป็น
ถือเป็นการสนับสนุนอย่างดีสำหรับ 16S rRNA ( Li et al . 2008 ) โดยกลุ่ม percocypris Pingi ( ขนาด
เข้าไม่gq406259 ) ได้รับเลือกจากชนิดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับสกุล onychostoma ตาม
วงศ์ปลาตะเพียนระบบเชื้อชาติของ Wang et al . ( 2012 ) โมเลกุล phylogenies ถูกใช้เป็นหลักเพื่อสนับสนุนการรวบรวมตัวอย่าง
ใหม่ภายในสกุล onychostoma มากกว่าที่จะแก้ปัญหา ซึ่งความสัมพันธ์
ภายในกลุ่ม