A pH-titration 2D NMR study of Esch

A pH-titration 2D NMR study of Escherichia coli transhydrogenase domain III with bound NADP+ or NADPH has been carried out, in
which the pH was varied between 5.4 and 12. In this analysis, individual amide protons served as reporter groups. The apparent pKa values of
the amide protons, determined from the pH-dependent chemical shift changes, were attributed to actual pKa values for several titrating
residues in the protein. The essential Asp392 is shown to be protonated at neutral pH in both the NADP+ and NADPH forms of domain III,
but with a marked difference in pKa not only attributable to the charge difference between the substrates. Titrating residues found in loop D/
a5 point to a conformational difference of these structural elements that is redox-dependent, but not pH dependent. The observed apparent
pKa values of these residues are discussed in relation to the crystal structure of Rhodospirillum rubrum domain III, the solution structure of E.
coli domain III and the mechanism of intact proton-translocating transhydrogenase.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การไทเทรต pH 2D NMR ศึกษาของ Escherichia coli transhydrogenase เมน III กับ NADP หรือ NADPH การดำเนินการ ใน
ซึ่ง pH แตกต่างกันระหว่าง 5.4 และ 12 ในการวิเคราะห์นี้ โปรตอน amide ละเสิร์ฟเป็นโปรแกรมรายงานกลุ่ม ค่า pKa ชัด
โปรตอน amide กำหนดจากนั้นกะเคมีขึ้นอยู่กับค่า pH ถูกบันทึกค่า pKa จริงสำหรับหลาย titrating
ในโปรตีนที่ตกค้าง Asp392 จำเป็นจะแสดงเป็น protonated ที่ค่า pH เป็นกลางในรูปแบบโดเมน III, NADP และ NADPH
แต่ pKa ค่าความแตกต่างระหว่างพื้นผิวไม่รวมเฉพาะต่างเครื่องกัน ตก titrating พบในลูป D /
a5 ส่อ conformational ความแตกต่างขององค์ประกอบโครงสร้างเหล่านี้ที่ขึ้นอยู่กับการ redox แต่ไม่ค่า pH ขึ้นอยู่ การสังเกตชัด
ค่า pKa ของตกค้างเหล่านี้จะกล่าวถึงเกี่ยวกับโครงสร้างผลึกของ Rhodospirillum rubrum เมน III โครงสร้างโซลูชันของ E.
โดเมน coli III และกลไกของ transhydrogenase translocating โปรตอนเหมือนเดิม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ค่า pH ไตเตรทศึกษา 2D NMR ของโดเมน Escherichia coli transhydrogenase III กับ NADP + ผูกพันหรือ NADPH ได้รับการดำเนินการในการ
ที่พีเอชที่แตกต่างกันระหว่าง 5.4 และ 12 ในการวิเคราะห์นี้โปรตอนเอไมด์แต่ละคนทำหน้าที่เป็นกลุ่มนักข่าว ค่า pKa ชัดเจนของ
โปรตอนเอไมด์, คำนวณจากค่า pH ขึ้นอยู่กับการเปลี่ยนแปลงการเปลี่ยนแปลงทางเคมีที่ถูกประกอบกับค่า pKa จริงสำหรับหลายวิเคราะห์การ
ตกค้างในโปรตีน ที่สำคัญ Asp392 จะแสดงให้เห็นว่าโปรโตเนตที่ pH เป็นกลางทั้งใน NADP + และ NADPH รูปแบบของโดเมน III,
แต่มีความแตกต่างในการทำเครื่องหมาย pKa ไม่เพียง แต่ส่วนที่เป็นค่าใช้จ่ายแตกต่างระหว่างพื้นผิว วิเคราะห์การตรวจพบสารตกค้างในวง D /
จุด a5 ความแตกต่างของโครงสร้างองค์ประกอบโครงสร้างเหล่านี้ที่เป็นปฏิกิริยาขึ้นอยู่กับ แต่ไม่ได้ขึ้นอยู่กับค่าความเป็นกรด ที่สังเกตเห็นได้ชัด
ค่า pKa ของเหลือเหล่านี้ถูกกล่าวถึงในส่วนที่เกี่ยวกับโครงสร้างผลึกของ Rhodospirillum rubrum โดเมน III, โครงสร้างการแก้ปัญหาของ E.
coli โดเมน III และกลไกการบาดเจ็บโปรตอน translocating transhydrogenase

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

อ ไทเทรต 2D NMR ศึกษาของ Escherichia coli transhydrogenase โดเมน III กับผูกพัน nadp หรือ nadph ได้ดําเนินการใน
ซึ่งมีค่าระหว่าง pH 5.4 และ 12 ในการวิเคราะห์บุคคล และโปรตอนในฐานะกลุ่มนักข่าว มีความชัดเจนและค่า
โปรตอน พิจารณาจาก pH ขึ้นอยู่กับสารเคมีที่เปลี่ยนแปลงคือ ประกอบกับค่า pKa จริงหลาย titrating
ตกค้างในโปรตีน ที่สำคัญ คือ asp392 เป็น protonated ที่ Ph เป็นกลาง ทั้งในและ nadp nadph รูปแบบโดเมน 3
แต่ด้วยเครื่องหมายความแตกต่างในความไม่เพียง แต่จากค่าความแตกต่างระหว่างท titrating พบตกค้างในห่วง D /
A5 จุดความแตกต่างในองค์ประกอบเหล่านี้เป็นโครงสร้างที่เป็นแบบไฟฟ้า แต่ไม่ด่างจัด และค่า pKa ชัดเจน
ตกค้างสิ่งเหล่านี้จะกล่าวถึงในความสัมพันธ์กับโครงสร้างผลึกของโรโด ปริลลัม rubrum โดเมน III , การแก้ปัญหาโครงสร้างของ E . coli โดเมน
3 และกลไกของโปรตอน translocating เหมือนเดิม transhydrogenase .