6. BiodegradationIn many biodegrada

6. Biodegradation
In many biodegradation studies in the laboratory, bacterial cells which are metabolically capable of degrading or mineralizing a pollutant are added to contaminated environmental samples to determine biodegradation
of target compound(s) in the environment. Cell counts, survival, metabolic activity, spatial location and degradative capability are all important factors that provide valuable information to advance our understanding of the processes occur ring. The use of the GFP as a marker has allowed researchers to detect the added cells, and determine more precise data about cell counts, survival and spatial location than has previously been possible. In our laboratory, the GFP marker was employed to study the survival of a p-nitrophenol
(PNP)-degrading Moraxella strain in soil. The chromosomally gfp-labelled Moraxella sp. strain G21 had been constructed using a mini-Tn5-gfp suicidal plasmid (see Fig. 2) (Tresse et al., 1998). The labeled bacteria degraded up to 1440 pM PNP, both in broth and soil, to the same extent as the parent strain. Survival studies indicated that individual green fluorescent colonies of G21 were detected up to 2 weeks after inoculation in soil samples. It is noteworthy that although only 0.1% of the original inoculum was detected by plating, 58% of the radiolabelled PNP was mineralized. This suggests that not all cells were culturable, or that there may have been an indigenous population of PNP-degrading microorganisms present in the soil. Errampalli et al. (1998) detected GFP-marked Pseudomonas sp. UGI4Gr up to 13 months after inoculation into creosote contaminated soil. By inserting the mini Tn5-gfp into the chromosome of a phenanthrenedegrading bacterium, a green fluorescent mutant, Pseudomonas sp. UGI4Gr, was obtained. The gfp was stable in UGi4Gr and did not affect mineralization of C-labelled phenanthrene which verified the gfp insertion had not interfered with phenan threne-degradation genes. Colony forming units were used to enumerate GFP-marked cells from soil samples and UG14Gr colonies on solid agar plates were detected using a hand-held UV lamp. Detection of GFP-marked cells for more than a year after inoculation into soil microcosms demonstrated the GFP marker can be useful for long-term bacterial survival in soil biodegradation or studies.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

6
ย่อยสลายในการศึกษาการย่อยสลายมากมายในห้องปฏิบัติการเซลล์แบคทีเรียที่มีความสามารถในการเมตาบอลิมลสารย่อยสลายหรือ mineralizing มีการเพิ่มตัวอย่างสิ่งแวดล้อมที่ปนเปื้อนในการตรวจสอบการย่อยสลายของสารประกอบ
เป้าหมาย (s) ในสภาพแวดล้อม จำนวนเซลล์รอดกิจกรรมการเผาผลาญสถานที่เชิงพื้นที่และความสามารถในการย่อยสลายเป็นปัจจัยที่สำคัญทั้งหมดที่ให้ข้อมูลที่มีคุณค่าเพื่อความก้าวหน้าของความเข้าใจของเรากระบวนการที่เกิดขึ้นแหวน การใช้งานของ GFP เป็นเครื่องหมายได้อนุญาตให้นักวิจัยเพื่อตรวจหาเซลล์เพิ่มและกำหนดข้อมูลที่แม่นยำมากขึ้นเกี่ยวกับจำนวนเซลล์มีชีวิตอยู่รอดและสถานที่เชิงพื้นที่กว่าได้รับก่อนหน้านี้ที่เป็นไปได้ ในห้องปฏิบัติการของเรา,เครื่องหมาย GFP ถูกจ้างมาเพื่อศึกษาความอยู่รอดของ p-nitrophenol
(PNP) ความเครียด Moraxella-ย่อยสลายในดิน chromosomally GFP-labeled Moraxella SP สายพันธุ์ G21 ได้รับการสร้างขึ้นโดยใช้มินิ TN5-GFP ฆ่าตัวตายพลาสมิด (ดูรูปที่ 2.) (tresse et al. 1998) แบคทีเรียที่มีข้อความเสื่อมโทรมถึง 1440 PM PNP ทั้งในน้ำซุปและดินในระดับเดียวกับเป็นสายพันธุ์พ่อแม่การศึกษาชี้ให้เห็นว่าการอยู่รอดแต่ละโคโลนีสีเขียวเรืองของ G21 ถูกตรวจพบได้ถึง 2 สัปดาห์หลังจากการฉีดวัคซีนในตัวอย่างดิน มันเป็นที่น่าสังเกตว่าแม้เพียง 0.1% ของเชื้อเดิมที่ถูกตรวจพบโดยการชุบ, 58% ของ radiolabelled PNP ถูก mineralized นี้แสดงให้เห็นว่าไม่ทุกเซลล์เป็น culturable,หรือว่าอาจจะมีคนในท้องถิ่นประชากรของจุลินทรีย์ PNP-ย่อยสลายนำเสนอในดิน อัล errampalli et (1998) พบ GFP เครื่องหมาย SP Pseudomonas ugi4gr ถึง 13 เดือนหลังจากการฉีดวัคซีนลงไปในดินที่ปนเปื้อนสีน้ำตาล โดยการใส่มินิ TN5 GFP ลงในโครโมโซมของแบคทีเรีย phenanthrenedegrading, เรืองแสงสีเขียวกลายพันธุ์ Pseudomonas SP ugi4gr, ได้รับGFP มีเสถียรภาพใน ugi4gr และไม่ส่งผลกระทบต่อแร่ของฟีแนนทรีคติดฉลากซึ่งการตรวจสอบการแทรก GFP ไม่ได้แทรกแซง phenan ยีน threne การย่อยสลาย หน่วยการสร้างอาณานิคมถูกนำมาใช้เพื่อระบุเซลล์ GFP เครื่องหมายจากตัวอย่างดินและอาณานิคม ug14gr บนจานอาหารเลี้ยงเชื้อที่เป็นของแข็งถูกตรวจพบการใช้มือถือหลอดไฟยูวีการตรวจจับของเซลล์ GFP เครื่องหมายนานกว่าหนึ่งปีหลังจากการฉีดวัคซีนเป็นไยดินแสดงให้เห็นถึงเครื่องหมาย GFP สามารถเป็นประโยชน์เพื่อความอยู่รอดของแบคทีเรียในระยะยาวในการย่อยสลายในดินหรือการศึกษา.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

6. Biodegradation
ใน biodegradation มากศึกษาในห้องปฏิบัติการ เซลล์แบคทีเรียที่ metabolically สามารถลด หรือ mineralizing มลพิษถูกเพิ่มเข้าไปอย่างปนเปื้อนสิ่งแวดล้อมเพื่อกำหนด biodegradation
ของเป้าหมาย compound(s) ในสภาพแวดล้อม จำนวนเซลล์ รอดตาย กิจกรรมเผาผลาญ ที่ตั้งพื้นที่และความสามารถในการ degradative มีความสำคัญทั้งปัจจัยที่ให้ข้อมูลล่วงหน้าเราเข้าใจกระบวนเกิดวงแหวน ใช้ GFP ที่เป็นเครื่องหมายได้อนุญาตให้นักวิจัยตรวจพบเซลล์เพิ่ม และกำหนดข้อมูลชัดเจนยิ่งขึ้นเกี่ยวกับการตรวจนับเซลล์ อยู่รอด และที่ตั้งพื้นที่กว่าก่อนหน้านี้แล้วเป็นไปได้ ในห้องปฏิบัติการของเรา หมาย GFP ถูกจ้างศึกษาความอยู่รอดของ p-nitrophenol
(PNP) -ลดสายพันธุ์ Moraxella ในดิน มีการสร้าง chromosomally gfp labelled Moraxella sp.พันธุ์ G21 ใช้ plasmid เป็นคล้ายมินิ Tn5 gfp (ดู Fig. 2) (Tresse และ al., 1998) แบคทีเรียป้ายเสื่อมโทรมถึง 1440 น. PNP ทั้งดิน ขอบเขตเดียวกันเป็นพันธุ์หลักและซุป ศึกษาอยู่รอดระบุว่า แต่ละสีเขียวเรืองแสงอาณานิคมของ G21 พบขึ้นไป 2 สัปดาห์หลังจาก inoculation ในตัวอย่างดิน เป็นที่น่าสังเกตว่า แม้เพียง 0.1% ของ inoculum เดิมพบชุบ 58% ของ radiolabelled PNP ถูก mineralized นี้ชี้ให้เห็นว่า เซลล์ทั้งหมดไม่ถูก culturable หรือว่า อาจมีประชากรเป็นชน PNP ลดจุลินทรีย์ในดิน Errampalli et al. (1998) พบเครื่องหมาย GFP Pseudomonas sp. UGI4Gr ค่า 13 เดือนหลังจาก inoculation เป็น creosote ปนเปื้อนดิน ใส่มินิ Tn5 gfp ในโครโมโซมของแบคทีเรีย phenanthrenedegrading, sp เป็นสีเขียวเรืองแสงเต่า Pseudomonas. UGI4Gr ได้รับการ Gfp มีเสถียรภาพใน UGi4Gr และไม่มีผลต่อการ mineralization ของฟีแนนทรี C labelled นซึ่งตรวจสอบแทรก gfp ได้ไม่ติด phenan threne ย่อยสลายยีน หน่วยโคโลนีขึ้นรูปใช้ในการระบุเครื่องหมาย GFP เซลล์จากตัวอย่างดิน และตรวจพบ UG14Gr อาณานิคมบนแผ่นแข็ง agar ใช้หลอด UV มือถือ ตรวจเครื่อง GFP เซลล์มากกว่าหนึ่งปีหลังจาก inoculation เป็นดิน microcosms แสดงให้เห็นว่าเครื่องหมายการ GFP สามารถเป็นประโยชน์เพื่อความอยู่รอดระยะยาวที่แบคทีเรียในดิน biodegradation หรือศึกษาได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

6 . biodegradation
ซึ่งจะช่วยในการศึกษา biodegradation จำนวนมากในห้องทดลองที่เกิดจากเชื้อแบคทีเรียซึ่งเป็นเซลล์ metabolically มีความสามารถหรือย่ำยีศักดิ์ศรี mineralizing ที่ก่อมลพิษหลักๆลงจะถูกเพิ่มลงในตัวอย่างด้านสิ่งแวดล้อมการปนเปื้อนในการกำหนด biodegradation
ของผสมเป้าหมาย( S )ใน สภาพแวดล้อม นับถอยหลังการทำงานของเซลล์การอยู่รอดกว้างขวางมีที่ตั้งที่มีมิติและความสามารถ degradative เป็นปัจจัยที่สำคัญทั้งหมดที่ให้ข้อมูลที่เป็นประโยชน์ในการทำความเข้าใจของเราของกระบวนการที่เกิดขึ้นเสียงเรียกเข้า การใช้ gfp ที่เป็นเครื่องหมายที่ได้รับอนุญาตให้นักวิจัยสามารถตรวจหาเซลล์เพิ่มและกำหนดข้อมูลเพิ่มเติมได้อย่างแม่นยำเกี่ยวกับนับถอยหลังเซลล์ที่ตั้งที่มีมิติและความอยู่รอดมากกว่าที่เคยเป็นไปได้ก่อนหน้านี้ ในห้องปฏิบัติการของเราทำเครื่องหมาย gfp ที่ถูกนำมาใช้เพื่อการศึกษาความอยู่รอดของความเมื่อยล้า P - nitrophenol
( PnP ) - ย่ำยีศักดิ์ศรี moraxella ในดิน ความเมื่อยล้า chromosomally gfp - ป้าย moraxella sp .ที่ G 21 ได้รับการก่อสร้างด้วยการใช้มินิ - TN 5 - gfp ผู้ฆ่าตัวตาย plasmid (ดูรูปที่ 2 )( tresse et al . 1998 ). แบคทีเรียมีข้อความที่ถูกปรับระดับลงได้ถึง 1440 PnP Cap ทุ่มทั้งในดินและน้ำซุปในกรณีเดียวกันกับที่เป็นสายพันธุ์ของพ่อแม่ได้.การศึกษาความอยู่รอดระบุว่าอาณาจักรฟลูออเรสเซนต์สีเขียวของ G 21 ถูกตรวจพบได้ถึง 2 สัปดาห์หลังจากปลูกฝีในตัวอย่างดิน เป็นที่น่าสังเกตว่าแม้เพียง 0.1% ของ inoculum เดิมที่มีการตรวจพบโดยหล่อ 58% ของ PnP Cap radiolabelled นั้น mineralized โรงแรมแห่งนี้ชี้ให้เห็นว่าไม่ใช่ทั้งหมดเป็นเซลล์ culturableหรือว่าอาจมีประชากรพื้นเมืองของจุลชีพ PnP Cap - ย่ำยีศักดิ์ศรีอยู่ในดินได้. errampalli et al . ( 1998 )พบ pseudomonas gfp - ทำเครื่องหมาย SP . ugi 4 กรัมได้ถึง 13 เดือนหลังจากฉีด(วัคซีน)เข้ากับธาตุครี - โอะโซทการปนเปื้อนดิน. โดยการแทรกมินิ TN 5 - gfp เข้ากับโครโมโซมของแบคทีเรีย phenanthrenedegrading ที่ฟลูออเรสเซนต์สีเขียว mutant pseudomonas sp . ugi 4 กรัมได้.gfp ที่มีความมั่นคงใน ugi 4 กรัมและไม่มีผลกระทบต่อ mineralization ของ phenanthrene c - มีป้ายที่ได้รับการรับรองการใส่ gfp ไม่ได้ส่งผลกระทบกระเทือนกับยีน phenan threne - การเสื่อม สภาพ . ชุดสร้างอาณานิคมได้ถูกใช้เพื่อระบุเซลล์ gfp - ทำเครื่องหมายจากดินและตัวอย่าง UG 14 กรัมอาณานิคมบนแผ่นสาหร่ายทะเลเนื้อแข็งถูกตรวจพบการใช้หลอดไฟ UV แบบมือถือได้การตรวจจับของเซลล์ gfp - ทำเครื่องหมายสำหรับมากกว่าหนึ่งปีหลังจากปลูกฝีลงในดิน microcosms แสดงให้เห็นเครื่องหมาย gfp ที่สามารถเป็นประโยชน์สำหรับการอยู่รอดเกิดจากเชื้อแบคทีเรียระยะยาวในการศึกษาหรือ biodegradation ดิน.