Analysis of sequences in the fragme

Analysis of sequences in the fragments of the 16S-23S rRNA intergenic spacer region by the ribosome spacer PCR (RS-PCR) can differentiate strains of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). We compared this technique with pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) for typing MRSA strains and its application during an investigation of an outbreak. A total of 180 isolates of MRSA collected from various hospital laboratories within the United Kingdom and elsewhere were typed by PFGE and RS-PCR. PFGE identified 17 different types among the 180 strains examined, and RS-PCR generated 13 different types. PFGE could detect minor genetic variations among the isolates and could identify the variants which were not discriminated by RS-PCR. Four unique strain types detected by PFGE were not detected by RS-PCR. When applied to typing the outbreak-related strains from the vascular surgery unit at the General Infirmary at Leeds, the results of RS-PCR were identical to those of PFGE. Our results have shown that RS-PCR is a rapid, inexpensive technique that is highly reproducible and almost as discriminatory as PFGE for typing MRSA isolates and should be useful in the local investigation of MRSA outbreaks.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิเคราะห์ลำดับในบางส่วนของภาค 16S 23S rRNA เป็นตัวเว้นวรรค intergenic โดยที่ไรโบโซมเป็นตัวเว้นวรรค PCR (RS-PCR) สามารถแยกความแตกต่างสายพันธุ์ของหมอเทศข้างลาย Staphylococcus ทน methicillin (MRSA) เราเปรียบเทียบเทคนิคนี้กับ electrophoresis ฟิลด์สูงเจ (PFGE) สำหรับการพิมพ์สายพันธุ์ MRSA และการประยุกต์ในระหว่างการสอบสวนการระบาดของโรค จำนวน 180 แยกของ MRSA ที่รวบรวมจากห้องปฏิบัติการโรงพยาบาลต่าง ๆ ในสหราชอาณาจักร และอื่น ๆ ได้พิมพ์ PFGE และ RS-PCR PFGE ระบุ 17 แตกต่างระหว่างสายพันธุ์ 180 ที่ตรวจสอบ และ RS-PCR สร้าง 13 ชนิด PFGE สามารถตรวจพบความแตกต่างทางพันธุกรรมรองในการแยก และสามารถระบุตัวแปรที่ไม่ถูก discriminated โดย RS PCR ไม่พบชนิดต้องใช้เฉพาะสี่ที่ตรวจพบ โดย PFGE โดยอาร์ PCR เมื่อใช้พิมพ์สายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องกับการระบาดของโรคจากหน่วยผ่าตัดหลอดเลือดที่ Infirmary ทั่วไปที่ลีดส์ ผลลัพธ์ของ RS-PCR ได้เหมือนกับของ PFGE ผลของเราได้แสดงว่า RS PCR เป็นเทคนิคที่รวดเร็ว ราคาไม่แพงที่จำลองสูง และเกือบเป็นโจ่งแจ้งเป็น PFGE สำหรับพิมพ์ MRSA ที่แยกได้ และควรจะเป็นประโยชน์ในท้องถิ่นของการแพร่ระบาดของ MRSA

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์ลำดับในชิ้นส่วนของ 16S-23S rRNA spacer intergenic ภูมิภาคโดย spacer PCR ไรโบโซม (RS-PCR) สามารถแยกความแตกต่างของสายพันธุ์ methicillin ทน Staphylococcus aureus (MRSA) เราเมื่อเทียบกับเทคนิคนี้กับข่าวคราวชีพจรสนาม (PFGE) สำหรับการพิมพ์สายพันธุ์เชื้อ MRSA และการประยุกต์ใช้ในระหว่างการสอบสวนของการระบาดเป็นนักการ ทั้งหมด 180 สายพันธุ์ของเชื้อ MRSA ที่เก็บได้จากห้องปฏิบัติการของโรงพยาบาลต่าง ๆ ภายในสหราชอาณาจักรและที่อื่น ๆ ที่ถูกพิมพ์โดย PFGE และ RS-PCR PFGE ระบุ 17 ชนิดที่แตกต่างกันในหมู่ 180 สายพันธุ์ที่ตรวจสอบได้และ RS-PCR สร้าง 13 ชนิดที่แตกต่างกัน PFGE สามารถตรวจพบการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมเล็กน้อยในหมู่ไอโซเลทและสามารถระบุสายพันธุ์ที่ไม่ได้ถูกเลือกปฏิบัติโดย RS-PCR สี่ชนิดสายพันธุ์ที่ไม่ซ้ำกันที่ตรวจพบโดย PFGE ไม่พบ RS-PCR เมื่อนำไปใช้กับการพิมพ์สายพันธุ์ที่ระบาดของโรคที่เกี่ยวข้องจากหน่วยผ่าตัดหลอดเลือดที่โรงพยาบาลทั่วไปที่ลีดส์ผลของ RS-PCR เป็นเหมือนกันกับของ PFGE ผลของเราแสดงให้เห็นว่า RS-PCR เป็นอย่างรวดเร็วเทคนิคที่ราคาไม่แพงเป็นอย่างสูงที่สามารถทำซ้ำได้และเกือบจะเป็นการเลือกปฏิบัติเป็น PFGE สำหรับการพิมพ์แยกเชื้อ MRSA และควรจะมีประโยชน์ในการตรวจสอบในท้องถิ่นของการระบาดเชื้อ MRSA

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ลำดับในชิ้นส่วนของ 16s-23s rRNA ส่า spacer ภูมิภาคโดย PCR spacer ไรโบโซม ( rs-pcr ) สามารถแยกสายพันธุ์ของ methicillin-resistant Staphylococcus aureus ( MRSA ) เราเทียบเทคนิคนี้กับการเจลอิเลคโตรโฟเรซีส ฟิลด์ ( PFGE ) พิมพ์เชื้อ สายพันธุ์ และการประยุกต์ใช้ในการสอบสวนการระบาดรวม 180 เชื้อ MRSA ที่รวบรวมจากห้องปฏิบัติการโรงพยาบาลต่าง ๆ ภายในสหราชอาณาจักร และที่อื่นๆ กำลังพิมพ์โดย PFGE และ rs-pcr . PFGE ระบุ 17 ชนิดของ 180 สายพันธุ์ ตรวจสอบ และสร้าง rs-pcr 13 ชนิดที่แตกต่างกัน PFGE สามารถตรวจหาความผันแปรทางพันธุกรรมเล็กน้อยระหว่างไอโซเลทและสามารถระบุสายพันธุ์ที่ไม่เลือกปฏิบัติ โดย rs-pcr .สี่ชนิดที่ตรวจพบโดยเฉพาะสายพันธุ์ PFGE ไม่ได้ถูกตรวจพบโดย rs-pcr . เมื่อใช้กับพิมพ์ที่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์ที่ระบาดจากหน่วยศัลยศาสตร์หลอดเลือดที่สถานพยาบาลทั่วไปที่ลีดส์ ผลลัพธ์ของ rs-pcr มีเหมือนกันที่ PFGE . ผลของเราแสดงให้เห็นว่า rs-pcr เป็นอย่างรวดเร็วราคาไม่แพง เทคนิคสูง และเกือบจะเป็นการเลือกปฏิบัติซึ่งเป็น PFGE สำหรับพิมพ์เชื้อ MRSA และควรเป็นประโยชน์ในการสืบสวนท้องถิ่นของเชื้อระบาด