BackgroundThe perception of bacteri

Background
The perception of bacteria and archaea as autonomous
single-celled organisms is steadily shifting as the capacity
to live within structured communities known as biofilms
is discovered in species spanning broad taxonomic groups
[1–3]. Biofilms are composed of many microbial cells,
often of multiple species, held within an extracellular
matrix (ECM) [4]. Because biofilms bring cells together in
close physical proximity, the process of biofilm formation
is coupled with additional social systems and mechanisms
fundamental to microbiology, including quorum sensing
(and other forms of cell-to-cell communication), horizontal
gene transfer (HGT) and the secretion of enzymes
that degrade complex material, causing the ECM to act
like a kind of shared external digestive system [3,5]. The
end result is a community lifestyle whereby cells may
benefit from the advantages of enhanced protection
from natural eukaryotic predators [6], other antagonistic
microbial species, chemicals, antibiotics or immune responses
[5,7,8]. Biofilms may aid in nutrient acquisition
and storage [5], facilitate accelerated rates of recombination
[9,10] and allow for coordinated multicellular behaviors
[11–15]. Direct analyses of aquatic ecosystems
have led to the realization that a majority of microbial
species in nature exist in biofilms [2,16–20].
General features of bacterial biofilms have been revealed
through the study of several key model species, including
Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus and
Bacillus subtilis. Chemical signals and other external
factors often regulate the biofilm lifecycle in bacteria, a
sequential process typified by initial attachment of planktonic
cells, microcolony formation, maturation into larger
structures innervated by aqueous pores or channels, and
eventual breakdown or dispersal [5,21,22]. Rather than
being simple aggregates of many cells, biofilms contain
microenvironments with physical and chemical gradients
that establish spatial and temporal genetic patterns
sometimes leading to differentiation into multiple cell
types [23–26]. Many genes involved in the production
and maintenance of matrix materials or extracellular
polymeric substances (EPSs) have also been identified
[5,27–29]. The principal components of bacterial matrices
are polysaccharides, extracellular DNA (eDNA) and amyloid
protein [5]. The exact composition, physical and chemical
properties, and amounts of these components varies in
different species and environmental conditions [4].
While biofilm formation is best characterized for bacterial
species [30,31], it has been demonstrated in a number
of archaeal groups within the phyla Crenarchaeota and
Euryarchaeota, such as Sulfolobus spp. [32–34], methanogens
[30], acidophilic thermoplasmatales [35], the cold-living
SM1 strain found in sulfuric springs [36,37] and halophilic
archaea [38]. A recent survey of biofilm formation
in haloarchaea (i.e., members of the class Halobacteria)conducted by Fröls and coworkers showed that a majority
of tested strains were able to adhere to glass and form
biofilms [38]. Species were categorized according to adhesion
strength and overall biofilm structure. Haloferax
volcanii fell within the highest adherence group, and
formed large surface associated aggregates, relative to
other species, including Halobacterium salinarum,
which formed smaller micro- and macrocolonies in
carpet-like layers [38].
We conducted a physiological analysis of biofilm formation
by H. volcanii DS2 due to several advantages of
using this species as a model for archaeal biofilm formation.
The wild-type H. volcanii DS2 strain was cultivated
from sediment from the Dead Sea in 1975 [39]: it is a
relatively fast-growing non-fastidious mesophile, requiring
no special equipment to grow in the laboratory [40,41] and
was the first archaeon to be artificially transformed [42].
H. volcanii DS2 has an available genome sequence [43] and
an expanding genetic and proteomic toolbox [42,44–49].
Haloarchaea also undergo promiscuous gene transfer in the
environment [50–52] and are excellent species for studying
evolutionary processes due to island-like distribution
[53–55]. We hypothesize that a cell-to-cell contactdependent
gene transfer mechanism in H. volcanii
[56–58] may be active when cells are contained within
biofilm communities. The available genetic system allowed
us to engineer a H. volcanii strain expressing GFP for
three-dimensional biofilm imaging by confocal laser scanning
microscopy (CLSM). Here we characterize key aspects
of H. volcanii biofilm structural development, composition,
dynamics and recombination frequency.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พื้นหลังการรับรู้ของแบคทีเรียและอาร์เคียเป็นเขตปกครองตนเองสิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวจะขยับเป็นกำลังการผลิตอย่างต่อเนื่องอยู่ในชุมชนมีโครงสร้างที่เรียกว่า biofilmsค้นพบในสายพันธุ์ซึ่งประกอบไปด้วยอนุกรมวิธานกลุ่มกว้าง[1-3] Biofilms จะประกอบด้วยหลายเซลล์จุลินทรีย์มักหลายพันธุ์ ขึ้นภายในตัว extracellularเมตริกซ์ (ECM) [4] เนื่องจาก biofilms นำเซลล์ในสะดวกทางกายภาพ การก่อตัว biofilmควบคู่กับระบบเพิ่มเติมสังคมและกลไกพื้นฐานของจุลชีววิทยา รวมทั้งการตรวจควอรัม(และแบบฟอร์มอื่น ๆ ของเซลล์ให้เซลล์สื่อสาร), แนวนอนการถ่ายโอนยีน (HGT) และหลั่งเอนไซม์ที่ย่อยสลายวัสดุที่ซับซ้อน ทำให้ ECM เพื่อดำเนินการเช่นชนิดของระบบการย่อยอาหารที่ภายนอกใช้ร่วมกัน [3,5] ที่วิถีชีวิตชุมชนโดยเซลล์อาจเป็นผลลัพธ์ได้รับประโยชน์จากข้อดีของกระบวนการคุ้มครองจากธรรมชาติ eukaryotic ล่า [6], อื่น ๆ ต่อต้านสายพันธุ์จุลินทรีย์ สารเคมี ยาปฏิชีวนะ หรือการตอบสนองภูมิคุ้มกัน[5,7,8] . Biofilms อาจช่วยซื้อธาตุอาหารและอัตราเร่งของ recombination ช่วยเก็บ [5],[9,10] และทำให้พฤติกรรมประสานสิ่ง[11-15] วิเคราะห์โดยตรงของระบบนิเวศทางน้ำได้นำไปสู่การรับรู้ที่ส่วนใหญ่ของจุลินทรีย์สปีชีส์ในธรรมชาติอยู่ใน biofilms [2,16-20]คุณสมบัติทั่วไปของแบคทีเรีย biofilms ได้ถูกเปิดเผยผ่านการศึกษาพันธุ์หลายรุ่นที่สำคัญ รวมถึงPseudomonas aeruginosa, Staphylococcus หมอเทศข้างลาย และคัด subtilis สัญญาณทางเคมีและภายนอกอื่น ๆปัจจัยควบคุมวงจร biofilm ในแบคทีเรีย มักจะเป็นกระบวนการตามลำดับ โดยเริ่มต้นที่แนบมาของ planktonic typifiedเซลล์ ผู้แต่ง microcolony พ่อแม่เป็นใหญ่โครงสร้างที่ innervated โดยอควีรูขุมขนหรือช่อง และในการแบ่งหรือ dispersal [5,21,22] Rather กว่าการเพิ่มเรื่องของเซลล์หลาย biofilms ประกอบด้วยmicroenvironments กับฟิสิกส์ และเคมีไล่ระดับสีที่สร้างรูปแบบทางพันธุกรรมปริภูมิ และขมับบางครั้งนำไปสู่การสร้างความแตกต่างเป็นหลายเซลล์ชนิด [23-26] ในยีนที่เกี่ยวข้องในการผลิตและบำรุงรักษาวัสดุและเมทริกซ์ หรือ extracellularระบุชนิดสาร (EPSs) ยัง[5,27-29] ส่วนประกอบหลักของเมทริกซ์แบคทีเรียมี polysaccharides ดีเอ็นเอ extracellular (เรื่อง) และแอมีลอยด์โปรตีน [5] องค์ประกอบแน่นอน ทางกายภาพ และเคมีคุณสมบัติ และจำนวนของส่วนประกอบเหล่านี้แตกต่างในสายพันธุ์ต่าง ๆ และสภาพแวดล้อม [4]ในขณะก่อตัว biofilm เป็นส่วนลักษณะสำหรับแบคทีเรียพันธุ์ [30,31], การแสดงในกลุ่ม archaeal ใน phyla Crenarchaeota และEuryarchaeota เช่น Sulfolobus โอ 32-34], methanogens[30], acidophilic thermoplasmatales [35], เย็นนั่งเล่นต้องใช้ SM1 พบในกำมะถันสปริง [36,37] และชอบเกลืออาร์เคีย [38] การสำรวจล่าสุดของผู้แต่ง biofilmใน haloarchaea (เช่น สมาชิกของคลาส Halobacteria) ดำเนินการ โดย Fröls และคณะพบว่าส่วนใหญ่ของสายพันธุ์ที่ผ่านการทดสอบก็สามารถยึดติดกับกระจกและแบบฟอร์มbiofilms [38] มีแบ่งชนิดตามยึดความแข็งแรงและโครงสร้าง biofilm โดยรวม Haloferaxvolcanii ตกภายในกลุ่มต่าง ๆ สูงสุด และเกิดผลผิวเกี่ยวข้องขนาดใหญ่ สัมพันธ์กับพันธุ์อื่น ๆ เช่น Halobacterium salinarumมีขนาดเล็กกว่าไมโครและ macrocolonies ในรูปที่เหมือนพรมชั้น [38]เราดำเนินการวิเคราะห์สรีรวิทยาของ biofilm ก่อโดย H. volcanii DS2 เนื่องจากข้อดีหลายประการของใช้ชนิดนี้เป็นแบบสำหรับก่อ biofilm archaealในป่าชนิด H. volcanii ต้องใช้ DS2 เป็นโลหะจากตะกอนจากทะเลเดดซีใน 1975 [39]: เป็นการค่อนข้างรวดเร็วเติบโต mesophile ไม่ fastidious ต้องการไม่มีอุปกรณ์พิเศษเพื่อเติบโตในห้องปฏิบัติการ [40,41] และมี archaeon แรกจะ สมยอมแปร [42]H. volcanii DS2 มีลำดับการใช้จีโนม [43] และการขยายพันธุกรรมแล้วมือ proteomic [42,44-49]Haloarchaea ยังรับโอนย้ายยีน promiscuous ในการสิ่งแวดล้อม [50-52] และมีสายพันธุ์ที่ดีสำหรับการศึกษากระบวนการวิวัฒนาการจากกระจายเหมือนเกาะ[53-55] เรา hypothesize ที่ contactdependent เซลล์ต่อเซลล์กลไกการถ่ายโอนยีนใน H. volcanii[56-58] อาจใช้งานอยู่เมื่อเซลล์อยู่ในชุมชน biofilm ระบบพันธุกรรมได้รับอนุญาตเราต้องใช้ volcanii H. แสดง GFP สำหรับวิศวกรภาพสามมิติ biofilm โดยเลเซอร์ confocal สแกนmicroscopy (CLSM) ที่นี่เรากำหนดลักษณะแง่มุมที่สำคัญH. volcanii biofilm โครงสร้างพัฒนา องค์ประกอบความถี่ dynamics และ recombination

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ประวัติความเป็นมา
การรับรู้ของเชื้อแบคทีเรียและเคีเป็นอิสระ
สิ่งมีชีวิตเซลล์เดียวอย่างต่อเนื่องขยับเป็นกำลังการผลิต
ที่จะอาศัยอยู่ในชุมชนที่มีโครงสร้างที่รู้จักกันเป็นไบโอฟิล์ม
ถูกค้นพบในสายพันธุ์ซึ่งประกอบไปด้วยกลุ่มอนุกรมวิธานกว้าง
[1-3] ไบโอฟิล์มที่มีองค์ประกอบของเซลล์จุลินทรีย์จำนวนมาก
มักจะของสายพันธุ์หลายจัดขึ้นภายในเซลล์
เมทริกซ์ (ECM) [4] เพราะไบโอฟิล์มนำเซลล์เข้าด้วยกันใน
ใกล้ชิดทางกายภาพใกล้กระบวนการของการสร้างไบโอฟิล์ม
เป็นคู่กับระบบสังคมเพิ่มเติมและกลไก
พื้นฐานทางจุลชีววิทยารวมทั้งการตรวจจับองค์ประชุม
(และรูปแบบอื่น ๆ ของการสื่อสารของเซลล์ไปยังเซลล์), แนวนอน
ถ่ายโอนยีน (HGT) และ การหลั่งของเอนไซม์
ที่ย่อยสลายวัสดุที่ซับซ้อนทำให้ ECM จะทำหน้าที่
เช่นเดียวกับชนิดของระบบย่อยอาหารภายนอกที่ใช้ร่วมกัน [3,5]
ผลลัพธ์ที่ได้คือวิถีชีวิตชุมชนโดยเซลล์ที่อาจ
ได้รับประโยชน์จากข้อได้เปรียบของการป้องกันที่เพิ่มขึ้น
จากการล่า eukaryotic ธรรมชาติ [6], อื่น ๆ ปฏิปักษ์
สายพันธุ์จุลินทรีย์, สารเคมี, ยาปฏิชีวนะหรือการตอบสนองภูมิคุ้มกัน
[5,7,8] ไบโอฟิล์มอาจช่วยในการเข้าซื้อกิจการของสารอาหาร
และการเก็บรักษาได้ [5], อำนวยความสะดวกในอัตราเร่งของการรวมตัวกันอีก
[9,10] และอนุญาตให้มีพฤติกรรมการประสานงานเซลล์
[11-15] การวิเคราะห์โดยตรงของระบบนิเวศทางน้ำ
ได้นำไปสู่การตระหนักว่าส่วนใหญ่ของจุลินทรีย์
สายพันธุ์ในธรรมชาติที่มีอยู่ในไบโอฟิล์ม [2,16-20].
คุณสมบัติทั่วไปของไบโอฟิล์มแบคทีเรียได้รับการเปิดเผย
ผ่านการศึกษาของสายพันธุ์ที่สำคัญหลายรูปแบบรวมทั้ง
เชื้อ Pseudomonas aeruginosa, เชื้อ Staphylococcus aureus และ
เชื้อ Bacillus subtilis สัญญาณทางเคมีและภายนอกอื่น ๆ
ปัจจัยที่มักจะควบคุมวงจรชีวิตของไบโอฟิล์มในแบคทีเรีย
กระบวนการลำดับตรึงตราเริ่มต้นของสิ่งที่แนบมา planktonic
เซลล์ก่อ microcolony, การเจริญเติบโตเป็นใหญ่
โครงสร้าง innervated โดยรูขุมขนน้ำหรือช่องทางและ
ความล้มเหลวในที่สุดหรือกระจาย [5,21,22 ] แทนที่จะ
เป็นมวลรวมที่เรียบง่ายของเซลล์หลายไบโอฟิล์มมี
microenvironments ที่มีการไล่ระดับสีกายภาพและทางเคมี
ที่สร้างรูปแบบพื้นที่และเวลาทางพันธุกรรม
บางครั้งนำไปสู่ความแตกต่างในเซลล์หลาย
ชนิด [23-26] ยีนต่างๆที่เกี่ยวข้องในการผลิต
และการบำรุงรักษาของวัสดุเมทริกซ์หรือสาร
สารพอลิเมอ (EPSs) ยังได้รับการระบุ
[5,27-29] ส่วนประกอบหลักของการฝึกอบรมแบคทีเรีย
เป็น polysaccharides ดีเอ็นเอ extracellular (เอ็ด) และ amyloid
โปรตีน [5] องค์ประกอบที่แน่นอนทางกายภาพและเคมี
คุณสมบัติและปริมาณขององค์ประกอบเหล่านี้แตกต่างกันไปใน
สายพันธุ์ที่แตกต่างกันและสภาพแวดล้อมได้ [4].
ในขณะที่การสร้างไบโอฟิล์มเป็นลักษณะที่ดีที่สุดสำหรับแบคทีเรีย
สายพันธุ์ [30,31] จะได้รับการแสดงให้เห็นในจำนวน
ของกลุ่ม archaeal ภายใน phyla Crenarchaeota และ
Euryarchaeota เช่น spp Sulfolobus [32-34], methanogens
[30], thermoplasmatales acidophilic [35], เย็นชีวิต
สายพันธุ์ที่พบใน SM1 น้ำพุกำมะถัน [36,37] และชอบเกลือ
เคีย [38] การสำรวจล่าสุดของการสร้างไบโอฟิล์ม
ใน haloarchaea (เช่นสมาชิกของชนชั้น Halobacteria) ดำเนินการโดยFrölsและเพื่อนร่วมงานพบว่าส่วนใหญ่
ของสายพันธุ์ที่มีความสามารถที่จะปฏิบัติตามแก้วและแบบ
ไบโอฟิล์ม [38] ชนิดแบ่งตามการยึดเกาะ
ความแข็งแรงและโครงสร้างไบโอฟิล์มโดยรวม Haloferax
volcanii ตกอยู่ในกลุ่มที่ยึดมั่นสูงสุดและ
เกิดขึ้นบนพื้นผิวขนาดใหญ่ที่เกี่ยวข้องมวลรวมเมื่อเทียบกับ
สายพันธุ์อื่น ๆ รวมทั้ง salinarum Halobacterium,
ซึ่งเป็นไมโครขนาดเล็กและ macrocolonies ใน
ชั้นพรมเหมือน [38].
เราดำเนินการวิเคราะห์ทางสรีรวิทยาของการสร้างไบโอฟิล์ม
โดย H. volcanii DS2 เนื่องจากข้อดีหลายประการของ
การใช้สายพันธุ์นี้เป็นแบบจำลองสำหรับการสร้างไบโอฟิล์ม archaeal.
ป่าชนิดสายพันธุ์เอช volcanii DS2 ได้รับการปลูกฝัง
จากตะกอนจากทะเลเดดซีในปี 1975 [39]: มันเป็น
ค่อนข้างที่เติบโตอย่างรวดเร็ว mesophile ที่ไม่จุกจิกต้อง
ไม่มีอุปกรณ์พิเศษที่จะเติบโตในห้องปฏิบัติการ [40,41] และ
ได้รับการ archaeon แรกที่จะถูกเปลี่ยนเทียม [42].
เอช volcanii DS2 มีลำดับจีโนมที่มีอยู่ [43] และ
ขยายกล่องทางพันธุกรรมและโปรตีน [42,44-49].
Haloarchaea ยังได้รับการถ่ายโอนยีนสำส่อนใน
สภาพแวดล้อมที่ [50-52] และเป็นสายพันธุ์ที่ดีเยี่ยมสำหรับการศึกษา
กระบวนการวิวัฒนาการอันเนื่องมาจากเกาะ กระจายเหมือน
[53-55] เราตั้งสมมติฐานว่าเซลล์ไปยังเซลล์ contactdependent
กลไกการถ่ายโอนยีนเอช volcanii
[56-58] อาจจะใช้งานเมื่อเซลล์มีอยู่ภายใน
ชุมชนไบโอฟิล์ม ระบบทางพันธุกรรมที่มีอยู่ได้รับอนุญาต
เราให้วิศวกรสายพันธุ์เอช volcanii แสดง GFP สำหรับ
การถ่ายภาพไบโอฟิล์มสามมิติโดยเลเซอร์สแกน confocal
กล้องจุลทรรศน์ (CLSM) ที่นี่เราลักษณะด้านที่สำคัญ
ของเอช volcanii พัฒนาโครงสร้างไบโอฟิล์ม, องค์ประกอบ,
พลวัตและความถี่ในการรวมตัวกันอีก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

พื้นหลัง
การรับรู้ของแบคทีเรียและอาร์เคียเป็นอิสระ
เดียว celled สิ่งมีชีวิตยังคงขยับที่ความจุ
อยู่ภายในโครงสร้างชุมชนที่เรียกว่าไบโอฟิล์ม
ถูกค้นพบในสายพันธุ์กว้างและครอบคลุมกลุ่ม
[ 1 - 1 ] ไบโอฟิล์มจะประกอบด้วยเซลล์ของจุลินทรีย์หลายชนิดหลาย
มักจะจัดขึ้นภายในเมทริกซ์ Extracellular
( ECM ) [ 4 ]เพราะไบโอฟิล์มนำเซลล์ด้วยกัน
ใกล้ชิดทางกายภาพ เช่น กระบวนการของการสร้างไบโอฟิล์ม
เป็นคู่กับระบบสังคมเพิ่มเติมและกลไก
พื้นฐานจุลชีววิทยา รวมทั้งตรวจจับ
องค์ประชุม ( และรูปแบบอื่น ๆของโทรศัพท์มือถือเพื่อการสื่อสารของเซลล์ ) , การถ่ายโอนยีนแนว
( HGT ) และการหลั่งของเอนไซม์ที่ย่อยสลายวัสดุ
ซับซ้อน ก่อให้เกิด ECM พระราชบัญญัติ
เหมือนใช้ร่วมกันภายนอกระบบการย่อยอาหาร [ จำนวน ] ผลลัพธ์สุดท้ายคือ วิถีชีวิตชุมชน โดย

เซลล์อาจได้รับประโยชน์จากข้อได้เปรียบของการป้องกันขั้นสูง
จากธรรมชาติเข้ามาล่า [ 6 ] อื่น ๆ , ปฏิปักษ์
จุลินทรีย์ชนิดสารเคมี ยาปฏิชีวนะ หรือตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน
[ 5,7,8 ] ไบโอฟิล์มอาจจะช่วยในการจัดเก็บและสารอาหาร
[ 5 ] , ช่วยเร่งอัตราการ
[ 9,10 ] และให้เพื่อมีพฤติกรรม
[ 11 – 15 ] โดยการวิเคราะห์ระบบนิเวศสัตว์น้ำ
ทำให้ได้ตระหนักว่าส่วนใหญ่ของจุลินทรีย์ชนิดในธรรมชาติมีอยู่ในไบโอฟิล์ม
[ 2,16 – 20 ] .
คุณสมบัติทั่วไปของแบคทีเรียไบโอฟิล์มได้รับการเปิดเผยจากการศึกษาชนิดของคีย์

แบบหลาย ได้แก่ Pseudomonas aeruginosa และ Staphylococcus aureus , Bacillus subtilis
.สัญญาณทางเคมี และปัจจัยภายนอกอื่น ๆมักจะควบคุมฟิล์ม

) ในแบคทีเรีย มีกระบวนการต่อเนื่อง typified โดยแนบเริ่มต้นของสิ่งมีชีวิตขนาดเล็กมากในน้ำ
เซลล์ การสร้าง microcolony การเจริญเติบโตในโครงสร้างขนาดใหญ่ โดยมีเส้นประสาทไปถึงรูน้ำหรือ

ในที่สุดช่อง เสียหรือการแพร่กระจาย [ 5,21,22 ] มากกว่า
ถูกง่าย มวลรวมของหลายเซลล์ ประกอบด้วย
ไบโอฟิล์มmicroenvironments กับทางกายภาพและทางเคมีที่สร้างพื้นที่และเวลาไล่

บางครั้งรูปแบบทางพันธุกรรมที่นำไปสู่การเป็นหลายเซลล์
ประเภท [ 23 – 26 ] ยีนหลายที่เกี่ยวข้องในการผลิตและการบำรุงรักษาของวัสดุหรือ

สารพอลิเมอร์เมทริกซ์ภายนอกเซลล์ ( EPSS ) ยังได้ระบุ 5,27 –
[ 29 ] ส่วนประกอบหลักของเมทริกซ์
แบคทีเรียเป็น polysaccharides และ DNA ( เอ็ดน่า ) และโปรตีนแอมีลอยด์
[ 5 ] องค์ประกอบที่แน่นอน ทางกายภาพและทางเคมี
คุณสมบัติและปริมาณของส่วนประกอบเหล่านี้จะแตกต่างกันใน
สายพันธุ์ที่แตกต่างกันและเงื่อนไข [ 4 ] สิ่งแวดล้อม ในขณะที่การสร้างไบโอฟิล์มเป็นลักษณะที่ดีที่สุด

สำหรับแบคทีเรียชนิด 30,31 [ ] , มันได้ถูกแสดงในตัวเลข
ของกลุ่ม archaeal ภายในไฟลัมครีนาร์เคียโ าและ
euryarchaeota เช่น sulfolobus spp . [ 32 – 34 ] , เมทาโนเจน
[ 30 ] คือ thermoplasmatales [ 35 ] , SM1 เย็นอยู่
สายพันธุ์ที่พบในกรดซัลฟูริกสปริง [ 36,37 ] และเอนไซม์
อาร์เคีย [ 38 ] การสำรวจล่าสุดของการสร้างไบโอฟิล์มใน haloarchaea
( เช่นสมาชิกของชั้นเรียน halobacteria ) โดย fr ö LS และเพื่อนร่วมงานพบว่าส่วนใหญ่
ทดสอบสายพันธุ์ สามารถยึดติดกับกระจกและ
แบบฟอร์มไบโอฟิล์ม [ 38 ] จำแนกตามชนิดแรงยึดเกาะ
และโครงสร้างไบโอฟิล์มโดยรวม haloferax
volcanii ลดลงในกลุ่มดังกล่าวมากที่สุด และมีพื้นผิวขนาดใหญ่ที่เกี่ยวข้อง

มวลรวม , เมื่อเทียบกับชนิดอื่น ๆ รวมทั้ง halobacterium salinarum
, ซึ่งเกิดขึ้น macrocolonies ขนาดเล็กและขนาดเล็กใน
พรมเหมือนเลเยอร์ [ 38 ] .
เราได้ทำการวิเคราะห์ทางสรีรวิทยาของ
การพัฒนาฟิล์มโดย volcanii DS2 เนื่องจากข้อดีหลายประการของการใช้ชนิดนี้
เป็นรูปแบบการสร้างไบโอฟิล์ม archaeal .
สายพันธุ์ของ H . volcanii DS2 ถูกปลูก
จากตะกอนจากทะเล Dead Sea ใน 1975 [ 39 ] : มันค่อนข้างโตเร็ว ไม่จุกจิก

โลหะที่ต้องการไม่มีอุปกรณ์พิเศษที่จะเติบโตในห้องปฏิบัติการ [ 40,41
] และเป็น archaeon แรกที่จะถูกแปลง [ 42 ] .
h volcanii DS2 มีลำดับจีโนมของ [ 43 ] และ
ขยายพันธุ และโปรตีนกล่องเครื่องมือ [ 42,44 – 49 ] .
haloarchaea ยังได้รับการถ่ายทอดยีนสำส่อนใน
สิ่งแวดล้อม [ 50 – 52 ] และเป็นสายพันธุ์ที่ดีสำหรับการเรียน
วิวัฒนาการกระบวนการ เนื่องจาก เกาะเหมือนกระจาย
[ 53 - 55 ]เราพบว่า เซลล์ contactdependent
การถ่ายโอนยีนกลไกในชั่วโมง volcanii
[ 56 58 – ] อาจจะใช้งานได้เมื่อเซลล์ที่มีอยู่ภายในชุมชนกล่าวคือ
. ระบบทางพันธุกรรมที่มีอยู่อนุญาต
เราวิศวกรเอช volcanii ความเครียดแสดง GFP สำหรับการถ่ายภาพด้วยฟิล์มสามมิติด้วย

ใช้เลเซอร์สแกน ( clsm ) ที่นี่เราเป็นลักษณะสำคัญด้าน
.การพัฒนาองค์ประกอบโครงสร้าง volcanii ฟิล์ม
, พลวัตและความถี่ recombination .